More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2285 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_2285  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 287 aa  559  1e-158  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.61649  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1736  transcriptional regulator, LysR family  85.71 
 
 		 287 aa  489  1e-137  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5916  LysR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 286 aa  205  6e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.746301 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7468  LysR family transcriptional regulator  44.16 
 
 		 307 aa  194  2e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.559388  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1258  transcriptional regulator, LysR family  36.17 
 
 		 315 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1815  LysR family transcriptional regulator  40.49 
 
 		 307 aa  181  1e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00510599  hitchhiker  0.000707933 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2767  LysR family transcriptional regulator  36.97 
 
 		 296 aa  179  4e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26150  putative transcriptional regulator  38.98 
 
 		 308 aa  178  1e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0621134  normal  0.16506 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5693  LysR family transcriptional regulator  40.69 
 
 		 307 aa  176  4e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.45057 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6527  LysR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 307 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.226284 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3977  LysR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 309 aa  172  5e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.416539  normal  0.0154243 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6037  LysR family transcriptional regulator  42.76 
 
 		 307 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.264299 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5673  LysR family transcriptional regulator  42.76 
 
 		 307 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3744  transcriptional regulator, LysR family  34.52 
 
 		 294 aa  170  3e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3962  LysR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 288 aa  167  1e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3779  transcriptional regulator, LysR family  36.05 
 
 		 288 aa  167  1e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0489  LysR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 288 aa  168  1e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2844  transcriptional regulator, LysR family  39.46 
 
 		 295 aa  166  2.9999999999999998e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2927  LysR family transcriptional regulator  36.93 
 
 		 308 aa  165  8e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0073  LysR family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 303 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1729  LysR family transcriptional regulator  36.82 
 
 		 296 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0102  LysR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 298 aa  161  9e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00248307 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0084  LysR family transcriptional regulator  37.72 
 
 		 298 aa  161  1e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00162977 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0698  LysR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 305 aa  161  1e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.587126  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0099  LysR family transcriptional regulator  37.98 
 
 		 298 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000782403 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1981  LysR family transcriptional regulator  39.93 
 
 		 312 aa  160  2e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3431  transcriptional regulator, LysR family  37.64 
 
 		 294 aa  160  3e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0731  LysR family transcriptional regulator  34.16 
 
 		 305 aa  160  3e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.733406  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0157  trpBA operon transcriptional activator  37.24 
 
 		 302 aa  159  4e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0035  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  36.64 
 
 		 318 aa  159  4e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0099  LysR family transcriptional regulator  37.72 
 
 		 298 aa  159  4e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0731  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 305 aa  159  5e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.742738  normal  0.12881 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0530  LysR family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 288 aa  159  6e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0529  trpba operon transcriptional activator  35.66 
 
 		 294 aa  158  8e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1106  transcriptional regulator LysR family  34.63 
 
 		 306 aa  158  1e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5351  LysR family transcriptional regulator  41.64 
 
 		 292 aa  156  4e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.071611 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02110  trpBA operon transcriptional regulator, LysR family; TrpI  38.83 
 
 		 318 aa  155  9e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.625987  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0102  LysR family transcriptional regulator  37.13 
 
 		 305 aa  154  1e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00460  transcriptional regulator TrpI  40.54 
 
 		 295 aa  154  1e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.347028 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5256  LysR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 316 aa  154  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2229  putative transcriptional regulator  38.18 
 
 		 309 aa  154  2e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4486  LysR family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 304 aa  152  8.999999999999999e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.906105  normal  0.839188 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0039  transcriptional regulator TrpI  37.37 
 
 		 297 aa  149  4e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0653039  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5907  transcriptional regulator LysR family  33.22 
 
 		 305 aa  149  5e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5641  LysR family transcriptional regulator  35.69 
 
 		 294 aa  148  1.0000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.245303  hitchhiker  0.0021835 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4417  DNA-binding transcriptional activator GcvA  34.6 
 
 		 307 aa  144  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.838235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1845  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 292 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00465511 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3735  LysR family transcriptional regulator  40.27 
 
 		 311 aa  142  5e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3007  DNA-binding transcriptional activator GcvA  36.15 
 
 		 294 aa  140  3e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1674  LysR family transcriptional regulator  32.07 
 
 		 295 aa  140  3e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.126025  normal  0.261555 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2706  transcriptional regulator, LysR family  32.07 
 
 		 295 aa  140  3e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.173124  hitchhiker  0.000000993281 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1637  LysR family transcriptional regulator  32.07 
 
 		 295 aa  140  3e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0994273  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1652  LysR family transcriptional regulator  32.07 
 
 		 295 aa  140  3e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.287567  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6790  DNA-binding transcriptional activator GcvA  33.68 
 
 		 305 aa  139  6e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0668323  hitchhiker  0.00000431754 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2922  DNA-binding transcriptional activator GcvA  35.86 
 
 		 294 aa  139  7e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.554203 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3057  DNA-binding transcriptional activator GcvA  35.86 
 
 		 294 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2639  LysR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 296 aa  138  1e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2614  LysR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 320 aa  137  2e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000028926 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2452  LysR family transcriptional regulator  32.07 
 
 		 320 aa  137  2e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000228881 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2522  LysR family transcriptional regulator  32.07 
 
 		 320 aa  137  2e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00304048  unclonable  0.0000288017 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06604  transcriptional regulator  34.36 
 
 		 288 aa  137  2e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6358  DNA-binding transcriptional activator GcvA  35.17 
 
 		 294 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.478035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0253  DNA-binding transcriptional activator GcvA  35.84 
 
 		 293 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.208187  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1256  LysR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 310 aa  135  9.999999999999999e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.196796  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3031  DNA-binding transcriptional activator GcvA  36.76 
 
 		 294 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2847  LysR family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 297 aa  133  3e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3012  DNA-binding transcriptional activator GcvA  36.76 
 
 		 294 aa  133  3e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1529  LysR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 301 aa  134  3e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2398  DNA-binding transcriptional activator GcvA  36.76 
 
 		 294 aa  133  3e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.273893  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0477  DNA-binding transcriptional activator GcvA  34.95 
 
 		 293 aa  132  6e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0293  DNA-binding transcriptional activator GcvA  34.95 
 
 		 293 aa  132  6e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0281  DNA-binding transcriptional activator GcvA  34.95 
 
 		 293 aa  132  6e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5716  transcriptional regulator LysR family  34.24 
 
 		 299 aa  130  2.0000000000000002e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0340323  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1584  LysR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 295 aa  128  9.000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.534905  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6525  LysR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 301 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6674  LysR family transcriptional regulator  35.69 
 
 		 296 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.143364 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6198  LysR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 296 aa  127  3e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0533844 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5831  LysR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 296 aa  127  3e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2465  LysR family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 309 aa  127  3e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000370846 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5754  LysR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 300 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4215  DNA-binding transcriptional activator GcvA  34.11 
 
 		 322 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0501  DNA-binding transcriptional activator GcvA  34 
 
 		 322 aa  126  5e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0370633 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5998  LysR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 300 aa  125  7e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.123891  normal  0.186417 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1990  LysR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 298 aa  125  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.288797  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5893  LysR family transcriptional regulator  34.6 
 
 		 295 aa  124  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0112  LysR family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 320 aa  123  3e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0089776 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0214  DNA-binding transcriptional activator GcvA  33.55 
 
 		 334 aa  123  4e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2960  LysR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 327 aa  122  5e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4194  transcriptional regulator, LysR family  32.78 
 
 		 302 aa  122  5e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0402435 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2946  transcriptional regulator, LysR family  32.99 
 
 		 292 aa  122  6e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.601984 
 
 
-
 
NC_003296  RS01684  DNA-binding transcriptional activator GcvA  33.11 
 
 		 313 aa  122  8e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3066  LysR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 296 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.249094  hitchhiker  0.00377983 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3953  LysR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 321 aa  121  1.9999999999999998e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.386735  normal  0.188606 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0414  DNA-binding transcriptional activator GcvA  33.11 
 
 		 348 aa  120  3e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0376293  normal  0.0295817 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1268  LysR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 317 aa  119  3.9999999999999996e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3604  LysR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 323 aa  119  4.9999999999999996e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2479  LysR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 316 aa  119  6e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.102884  hitchhiker  0.0063597 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4008  transcriptional regulator, LysR family  30.96 
 
 		 292 aa  119  7e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2171  LysR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 304 aa  119  7e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0734  LysR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 314 aa  118  9e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>