More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2208 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_2208  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 232 aa  444  1.0000000000000001e-124  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2154  two component transcriptional regulator  61.4 
 
 		 218 aa  246  2e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3815  two component transcriptional regulator  49.78 
 
 		 219 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.681737  normal  0.25062 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3088  two component transcriptional regulator  49.34 
 
 		 219 aa  219  1.9999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2735  two component transcriptional regulator  50.88 
 
 		 219 aa  216  2e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0224  two component transcriptional regulator  50 
 
 		 221 aa  215  4e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0104787  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3217  two component transcriptional regulator  50 
 
 		 221 aa  211  1e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.164246  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1287  two component transcriptional regulator  50.44 
 
 		 221 aa  209  3e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00449543  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6259  two component response regulator  46.7 
 
 		 220 aa  207  1e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.1188  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6029  two component transcriptional regulator  49.56 
 
 		 222 aa  204  1e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.167629 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5168  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  52.4 
 
 		 219 aa  201  6e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3094  two component transcriptional regulator, winged helix family  50 
 
 		 223 aa  200  9.999999999999999e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3399  two component transcriptional regulator  46.02 
 
 		 223 aa  199  3.9999999999999996e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0210  DNA-binding response regulator  45.13 
 
 		 225 aa  196  3e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1602  two component transcriptional regulator  50.44 
 
 		 223 aa  193  2e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.389685 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0784  DNA-binding response regulator  48.03 
 
 		 219 aa  191  9e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.42757  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0490  two component response regulator  48.03 
 
 		 219 aa  191  9e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.663456  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1977  DNA-binding response regulator  48.03 
 
 		 219 aa  191  9e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1624  DNA-binding response regulator  48.03 
 
 		 219 aa  191  9e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0176162  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0671  DNA-binding response regulator  48.03 
 
 		 219 aa  191  9e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.485657  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0559  DNA-binding response regulator  48.03 
 
 		 232 aa  191  9e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2074  DNA-binding response regulator  48.03 
 
 		 219 aa  191  9e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.401565  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4961  two component transcriptional regulator  47.81 
 
 		 220 aa  191  1e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.675974  normal  0.952404 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0903  DNA-binding response regulator  48.03 
 
 		 219 aa  190  1e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.604027  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5392  winged helix family two component transcriptional regulator  49.78 
 
 		 219 aa  189  2.9999999999999997e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.890679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3284  two component transcriptional regulator  47.35 
 
 		 219 aa  188  5.999999999999999e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0910618 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0699  two component transcriptional regulator  44.98 
 
 		 220 aa  186  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_7369  two component transcriptional regulator  46.02 
 
 		 219 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.175011  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3267  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.26 
 
 		 220 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.387524  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3285  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.45 
 
 		 224 aa  181  9.000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00225391  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5326  two component transcriptional regulator  45.65 
 
 		 221 aa  181  1e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.575046 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2815  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  42.98 
 
 		 218 aa  178  5.999999999999999e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.877458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0277  two component transcriptional regulator  43.78 
 
 		 235 aa  178  8e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.344057 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3680  histidine kinase A domain-containing protein  46.26 
 
 		 220 aa  178  8e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.894604 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1143  two component transcriptional regulator  47.01 
 
 		 224 aa  177  1e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.606905  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3105  two component transcriptional regulator  44.1 
 
 		 219 aa  177  1e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.136173  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3674  two component transcriptional regulator  44.54 
 
 		 219 aa  177  1e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3430  transcriptional regulator  47.14 
 
 		 221 aa  176  4e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.325979  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3075  two component transcriptional regulator  46.7 
 
 		 220 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0867071  normal  0.535547 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4760  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.64 
 
 		 227 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00176778  hitchhiker  0.0056462 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0469  two component transcriptional regulator  43.97 
 
 		 220 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.601273  normal  0.0513669 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3871  two component transcriptional regulator  44.35 
 
 		 230 aa  172  3.9999999999999995e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2384  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.98 
 
 		 219 aa  172  5.999999999999999e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23421  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03384  response regulator  38.6 
 
 		 221 aa  169  2e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000742618  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00402  putative two component response regulator transcription regulator protein  40.18 
 
 		 221 aa  169  4e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00497843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3443  two component transcriptional regulator  44.05 
 
 		 213 aa  169  4e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0278745 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1783  two component transcriptional regulator  42.48 
 
 		 220 aa  169  4e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1754  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.23 
 
 		 226 aa  169  5e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1953  two component transcriptional regulator  48.23 
 
 		 226 aa  169  5e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1597  two component transcriptional regulator  47.44 
 
 		 224 aa  168  6e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63150  two-component response regulator  41.52 
 
 		 221 aa  168  8e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.388672  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02110  two-component response regulator transcription regulator protein  40.76 
 
 		 246 aa  166  2e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2913  two component transcriptional regulator  42.31 
 
 		 224 aa  167  2e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.605644 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5497  DNA-binding response regulator  41.07 
 
 		 221 aa  167  2e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.553345  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1465  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.46 
 
 		 223 aa  166  2e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.556647  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0675  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.61 
 
 		 219 aa  166  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3459  DNA-binding transcriptional regulator QseB  40.17 
 
 		 219 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.469494  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5326  two component transcriptional regulator  39.92 
 
 		 235 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0644  two component transcriptional regulator  39.21 
 
 		 222 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.553024  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0933  two component transcriptional regulator  44.26 
 
 		 253 aa  165  5e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6226  two component transcriptional regulator  43.72 
 
 		 221 aa  165  5.9999999999999996e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.344594  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02897  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with QseC  40.71 
 
 		 219 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.203771  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02847  hypothetical protein  40.71 
 
 		 219 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.196232  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3203  DNA-binding transcriptional regulator QseB  40.17 
 
 		 219 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3314  DNA-binding transcriptional regulator QseB  40.71 
 
 		 219 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.11461 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4334  DNA-binding transcriptional regulator QseB  40.71 
 
 		 219 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4239  two component transcriptional regulator  40.71 
 
 		 220 aa  164  1.0000000000000001e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0202421  normal  0.361244 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0672  DNA-binding transcriptional regulator QseB  40.71 
 
 		 219 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.033173 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4863  two component transcriptional regulator, winged helix family  40 
 
 		 244 aa  163  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.494797 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3610  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.19 
 
 		 221 aa  163  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4876  two component transcriptional regulator  42.92 
 
 		 221 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.292661  normal  0.262349 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6335  two component transcriptional regulator  42.67 
 
 		 223 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.923263 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1765  DNA-binding response regulator  43.97 
 
 		 255 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.003723  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3786  two component transcriptional regulator, winged helix family  40 
 
 		 279 aa  163  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.898509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4687  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.19 
 
 		 221 aa  163  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.195761 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3110  two component transcriptional regulator  42.86 
 
 		 224 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.178244 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3252  two component transcriptional regulator  41.92 
 
 		 220 aa  162  3e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4632  two component transcriptional regulator  41.81 
 
 		 239 aa  162  3e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.920872  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1183  two component transcriptional regulator  42.86 
 
 		 228 aa  162  3e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3293  two component transcriptional regulator  41.23 
 
 		 221 aa  163  3e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2298  two component transcriptional regulator  40.43 
 
 		 221 aa  162  4.0000000000000004e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0500017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5798  winged helix family two component transcriptional regulator  40.33 
 
 		 242 aa  162  5.0000000000000005e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0751826 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0830  DNA-binding response regulator  43.97 
 
 		 220 aa  162  6e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0346205  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0050  DNA-binding response regulator  43.97 
 
 		 220 aa  162  6e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000526726  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2208  response regulator protein  43.97 
 
 		 220 aa  162  6e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000167641  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0958  DNA-binding response regulator  43.97 
 
 		 220 aa  162  6e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000129968  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0866  DNA-binding response regulator  43.97 
 
 		 220 aa  162  6e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.775386  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1570  DNA-binding response regulator  43.97 
 
 		 220 aa  162  6e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00189564  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4177  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.7 
 
 		 223 aa  161  7e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.622163  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2647  two component transcriptional regulator  44.1 
 
 		 224 aa  161  8.000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2618  two component transcriptional regulator  44.1 
 
 		 220 aa  161  8.000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5866  two component transcriptional regulator  43.67 
 
 		 221 aa  161  9e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5019  two component transcriptional regulator  44.35 
 
 		 221 aa  161  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14757  normal  0.102893 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3792  two component transcriptional regulator  39.38 
 
 		 227 aa  160  1e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.358087  normal  0.612342 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1312  transcriptional regulatory protein  37.66 
 
 		 232 aa  161  1e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0158381  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4829  DNA-binding response regulator  41.59 
 
 		 235 aa  160  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00101292  normal  0.0130353 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0680  two component transcriptional regulator  44.1 
 
 		 225 aa  160  2e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.982653 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1372  transcriptional regulatory protein  37.66 
 
 		 223 aa  160  2e-38  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000461157  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4039  winged helix family two component transcriptional regulator  39.74 
 
 		 221 aa  160  2e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4978  winged helix family two component transcriptional regulator  39.74 
 
 		 221 aa  160  2e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.140502  normal  0.541541 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>