More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2164 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_2164  ornithine carbamoyltransferase  100 
 
 
331 aa  669    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2540  ornithine carbamoyltransferase  62.58 
 
 
313 aa  387  1e-106  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5258  ornithine carbamoyltransferase  59.34 
 
 
309 aa  365  1e-100  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.802222  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3276  ornithine carbamoyltransferase  63.28 
 
 
308 aa  365  1e-100  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0643  ornithine carbamoyltransferase  60.33 
 
 
308 aa  363  3e-99  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.652034  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0514  ornithine carbamoyltransferase  59.28 
 
 
308 aa  360  1e-98  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.746027 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0403  ornithine carbamoyltransferase  60.06 
 
 
313 aa  360  2e-98  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0302  ornithine carbamoyltransferase  56.77 
 
 
312 aa  358  9e-98  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0625047  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0896  ornithine carbamoyltransferase  56.29 
 
 
316 aa  357  9.999999999999999e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0760  ornithine carbamoyltransferase  58.88 
 
 
308 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0705377 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0315  ornithine carbamoyltransferase  56.44 
 
 
312 aa  357  1.9999999999999998e-97  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0128  ornithine carbamoyltransferase  55.78 
 
 
303 aa  355  5.999999999999999e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.673784 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0186  ornithine carbamoyltransferase  57.38 
 
 
304 aa  355  5.999999999999999e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.347949 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0784  ornithine carbamoyltransferase  57.47 
 
 
328 aa  355  7.999999999999999e-97  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.107467 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0176  ornithine carbamoyltransferase  57.05 
 
 
304 aa  354  1e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0395  ornithine carbamoyltransferase  55.78 
 
 
312 aa  354  1e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7456  ornithine carbamoyltransferase  58.44 
 
 
314 aa  353  2e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.196856  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4915  ornithine carbamoyltransferase  56.44 
 
 
310 aa  352  5.9999999999999994e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.23727 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1291  ornithine carbamoyltransferase  54.79 
 
 
310 aa  350  2e-95  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6535  ornithine carbamoyltransferase  57.74 
 
 
314 aa  350  2e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.326081  normal  0.847113 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4557  ornithine carbamoyltransferase  57.96 
 
 
316 aa  350  2e-95  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.343587  normal  0.899268 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0151  ornithine carbamoyltransferase  57.33 
 
 
319 aa  348  6e-95  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.950528 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4443  ornithine carbamoyltransferase  57.32 
 
 
316 aa  348  8e-95  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4076  ornithine carbamoyltransferase  57.32 
 
 
330 aa  347  1e-94  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0008  ornithine carbamoyltransferase  56.25 
 
 
302 aa  345  5e-94  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2317  ornithine carbamoyltransferase  58.15 
 
 
326 aa  344  8.999999999999999e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0914956 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0479  ornithine carbamoyltransferase  55.56 
 
 
305 aa  342  5.999999999999999e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0719  ornithine carbamoyltransferase  55.74 
 
 
308 aa  340  2e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.435466  normal  0.386471 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2009  ornithine carbamoyltransferase  55.41 
 
 
308 aa  338  7e-92  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0831  ornithine carbamoyltransferase  55.59 
 
 
317 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0129727 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0796  ornithine carbamoyltransferase  56.07 
 
 
308 aa  337  1.9999999999999998e-91  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0926644  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3106  ornithine carbamoyltransferase  53.97 
 
 
328 aa  335  5e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0562517 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1219  ornithine carbamoyltransferase  53.29 
 
 
309 aa  332  8e-90  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.309397  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1232  ornithine carbamoyltransferase  54.1 
 
 
311 aa  330  2e-89  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0126503 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2039  ornithine carbamoyltransferase  54.28 
 
 
308 aa  327  2.0000000000000001e-88  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0482539 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0666  ornithine carbamoyltransferase  53.11 
 
 
308 aa  325  8.000000000000001e-88  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.829817 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1408  ornithine carbamoyltransferase  53.29 
 
 
309 aa  317  2e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.300751  normal  0.250922 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2080  ornithine carbamoyltransferase  53.62 
 
 
298 aa  315  8e-85  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1023  ornithine carbamoyltransferase  52.63 
 
 
308 aa  309  4e-83  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.459772  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18610  ornithine carbamoyltransferase  51.3 
 
 
305 aa  302  6.000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0309685 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2465  ornithine carbamoyltransferase  53.14 
 
 
300 aa  301  1e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1609  ornithine carbamoyltransferase  50.65 
 
 
305 aa  300  2e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1101  ornithine carbamoyltransferase  52.96 
 
 
303 aa  300  3e-80  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3140  ornithine carbamoyltransferase  51.97 
 
 
311 aa  299  5e-80  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.47021  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0999  ornithine carbamoyltransferase  49.02 
 
 
309 aa  298  7e-80  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0647018  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1227  ornithine carbamoyltransferase  48.29 
 
 
355 aa  298  9e-80  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.786262  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1869  ornithine carbamoyltransferase  47.1 
 
 
307 aa  297  1e-79  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0569  ornithine carbamoyltransferase  52.46 
 
 
311 aa  297  1e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0405  ornithine carbamoyltransferase  52.46 
 
 
311 aa  297  1e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.38298  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1108  ornithine carbamoyltransferase  52.32 
 
 
306 aa  295  6e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0726  ornithine carbamoyltransferase  53.11 
 
 
300 aa  295  9e-79  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.853376  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2430  ornithine carbamoyltransferase  51.68 
 
 
304 aa  294  1e-78  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2915  ornithine carbamoyltransferase  47.12 
 
 
305 aa  293  2e-78  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.595203  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0945  ornithine carbamoyltransferase  50.49 
 
 
304 aa  294  2e-78  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0836212  normal  0.0898024 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0276  ornithine carbamoyltransferase  48.84 
 
 
315 aa  293  2e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3389  ornithine carbamoyltransferase  49.01 
 
 
301 aa  292  5e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.345181  normal  0.187028 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3342  ornithine carbamoyltransferase  51.84 
 
 
306 aa  292  6e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0493063  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1079  ornithine carbamoyltransferase  51.51 
 
 
306 aa  292  7e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1120  ornithine carbamoyltransferase  51.17 
 
 
306 aa  291  1e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.105458  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1542  ornithine carbamoyltransferase  45.98 
 
 
308 aa  290  2e-77  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4333  ornithine carbamoyltransferase  50.84 
 
 
306 aa  289  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0343  ornithine carbamoyltransferase  50.65 
 
 
309 aa  289  5.0000000000000004e-77  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3742  ornithine carbamoyltransferase  48.03 
 
 
303 aa  288  9e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0158  ornithine carbamoyltransferase  50.33 
 
 
306 aa  288  1e-76  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3637  ornithine carbamoyltransferase  47.37 
 
 
303 aa  286  2e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3901  ornithine carbamoyltransferase  50.5 
 
 
306 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2286  ornithine carbamoyltransferase  47.08 
 
 
314 aa  286  2.9999999999999996e-76  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.102156 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0246  ornithine carbamoyltransferase  47.84 
 
 
298 aa  286  2.9999999999999996e-76  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0532  ornithine carbamoyltransferase  46.05 
 
 
302 aa  285  5.999999999999999e-76  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0521808  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2441  ornithine carbamoyltransferase  48.69 
 
 
303 aa  285  5.999999999999999e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.617876  normal  0.127265 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3743  ornithine carbamoyltransferase  49.37 
 
 
321 aa  285  5.999999999999999e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000875067 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1358  ornithine carbamoyltransferase  50 
 
 
307 aa  285  8e-76  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.553218  normal  0.446838 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4527  ornithine carbamoyltransferase  49.83 
 
 
307 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.145065 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0781  ornithine carbamoyltransferase  46.53 
 
 
306 aa  285  1.0000000000000001e-75  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0769217  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1163  ornithine carbamoyltransferase  47.06 
 
 
309 aa  285  1.0000000000000001e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.100026  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4164  ornithine carbamoyltransferase  50.5 
 
 
306 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0323  ornithine carbamoyltransferase  48.4 
 
 
309 aa  284  2.0000000000000002e-75  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0077  ornithine carbamoyltransferase  44.16 
 
 
303 aa  283  2.0000000000000002e-75  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.448058  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3573  ornithine carbamoyltransferase  46.82 
 
 
329 aa  283  2.0000000000000002e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.510034  normal  0.18722 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14030  ornithine carbamoyltransferase  49.17 
 
 
308 aa  283  2.0000000000000002e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0742  ornithine carbamoyltransferase  46.38 
 
 
312 aa  283  3.0000000000000004e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0375  ornithine carbamoyltransferase  47.87 
 
 
309 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0957  ornithine carbamoyltransferase  45.54 
 
 
307 aa  283  3.0000000000000004e-75  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1073  ornithine carbamoyltransferase  47.87 
 
 
309 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0124  ornithine carbamoyltransferase  47.87 
 
 
309 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0757  ornithine carbamoyltransferase  47.71 
 
 
309 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1057  ornithine carbamoyltransferase  45.57 
 
 
301 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0917  ornithine carbamoyltransferase  47.87 
 
 
309 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0675  ornithine carbamoyltransferase  47.87 
 
 
309 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2510  ornithine carbamoyltransferase  47.87 
 
 
309 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0921  ornithine carbamoyltransferase  47.87 
 
 
309 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3149  ornithine carbamoyltransferase  47.04 
 
 
303 aa  283  4.0000000000000003e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5885  ornithine carbamoyltransferase  47.87 
 
 
309 aa  282  5.000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.718044 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0743  ornithine carbamoyltransferase  47.54 
 
 
309 aa  282  5.000000000000001e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.511035 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0227  ornithine carbamoyltransferase  46.73 
 
 
305 aa  282  5.000000000000001e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1942  ornithine carbamoyltransferase  47.87 
 
 
309 aa  281  8.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2553  ornithine carbamoyltransferase  47.87 
 
 
309 aa  281  8.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2577  ornithine carbamoyltransferase  47.87 
 
 
309 aa  281  9e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3172  ornithine carbamoyltransferase  47.56 
 
 
305 aa  281  1e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0370415  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2472  ornithine carbamoyltransferase  47.87 
 
 
309 aa  280  2e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.893068  normal  0.0170187 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>