16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2077 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_2077  hypothetical protein  100 
 
 		 309 aa  630  1e-179  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.520614 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0677  hypothetical protein  58.8 
 
 		 314 aa  365  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2315  hypothetical protein  58.39 
 
 		 356 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2347  hypothetical protein  54.97 
 
 		 358 aa  324  9e-88  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0334  hypothetical protein  50.16 
 
 		 318 aa  311  7.999999999999999e-84  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.66391  normal  0.0124994 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1204  hypothetical protein  44.26 
 
 		 310 aa  271  9e-72  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.919148  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_10191  predicted protein  45.07 
 
 		 295 aa  258  9e-68  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.538025  normal  0.129963 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1707  Cupin domain protein  23.97 
 
 		 178 aa  47.8  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2254  Cupin 2 conserved barrel domain protein  21.88 
 
 		 370 aa  46.6  0.0005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2286  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.95 
 
 		 364 aa  45.8  0.0008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4624  cupin 2 domain-containing protein  25.83 
 
 		 344 aa  44.3  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2315  Cupin 2 conserved barrel domain protein  22.01 
 
 		 374 aa  43.9  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2818  TolC family type I secretion outer membrane protein  31.78 
 
 		 469 aa  43.1  0.006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.282777  normal  0.979363 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1994  cupin 2 domain-containing protein  26.97 
 
 		 181 aa  42.7  0.007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.663759  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0353  gentisate 1,2-dioxygenase  31.4 
 
 		 362 aa  42.7  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3276  cupin 2, barrel  25 
 
 		 324 aa  42.4  0.01  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.525696  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>