279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2071 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_2071  ribosome-binding factor A  100 
 
 		 145 aa  286  6e-77  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.573719 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0226  ribosome-binding factor A  63.11 
 
 		 140 aa  159  1e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.435446  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3046  ribosome-binding factor A  50.81 
 
 		 141 aa  120  5e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3629  ribosome-binding factor A  48.36 
 
 		 140 aa  116  9.999999999999999e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.445652  normal  0.0497582 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3782  ribosome-binding factor A  48.31 
 
 		 164 aa  115  3e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0911878  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2166  ribosome-binding factor A  47.15 
 
 		 150 aa  109  1.0000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2078  ribosome-binding factor A  47.15 
 
 		 197 aa  109  1.0000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0263191  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0746  ribosome-binding factor A  46.34 
 
 		 150 aa  109  1.0000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.321784  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1046  ribosome-binding factor A  48.03 
 
 		 141 aa  109  1.0000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.12886  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0170  ribosome-binding factor A  47.11 
 
 		 137 aa  108  3e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0610976  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4066  ribosome-binding factor A  46.34 
 
 		 134 aa  107  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3442  ribosome-binding factor A  42.97 
 
 		 134 aa  107  4.0000000000000004e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.728771  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4386  ribosome-binding factor A  45.97 
 
 		 134 aa  105  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.4784 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3931  ribosome-binding factor A  46.67 
 
 		 133 aa  102  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.627477  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0058  ribosome-binding factor A  45.6 
 
 		 138 aa  101  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.649534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0292  ribosome-binding factor A  47.06 
 
 		 151 aa  99.4  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.887654  normal  0.0167928 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1106  ribosome-binding factor A  44.72 
 
 		 140 aa  97.8  4e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.811236  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1255  ribosome-binding factor A  46.28 
 
 		 148 aa  97.1  7e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2924  ribosome-binding factor A  43.9 
 
 		 165 aa  96.3  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.332986  normal  0.135151 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2768  ribosome-binding factor A  43.9 
 
 		 137 aa  95.9  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2799  ribosome-binding factor A  45.16 
 
 		 138 aa  95.1  3e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.285538  normal  0.747306 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2294  ribosome-binding factor A  41.6 
 
 		 155 aa  94.7  4e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.121706 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0613  ribosome-binding factor A  40.98 
 
 		 136 aa  94.4  5e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.440259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3041  ribosome-binding factor A  46.34 
 
 		 135 aa  92.8  1e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.603703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2818  ribosome-binding factor A  44.63 
 
 		 145 aa  93.2  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.259467  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2922  ribosome-binding factor A  43.8 
 
 		 145 aa  92  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0301917  normal  0.0601013 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2696  ribosome-binding factor A  43.8 
 
 		 145 aa  92  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.674256 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0086  ribosome-binding factor A  44.35 
 
 		 131 aa  92  2e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.744834  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4619  ribosome-binding factor A  43.8 
 
 		 135 aa  91.3  4e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.302767  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2610  ribosome-binding factor A  45 
 
 		 139 aa  90.5  7e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.191354 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0481  ribosome-binding factor A  42.98 
 
 		 137 aa  90.5  8e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.214856  normal  0.376721 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3815  ribosome-binding factor A  40.83 
 
 		 132 aa  89  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.104911  normal  0.0213018 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3726  ribosome-binding factor A  44.26 
 
 		 142 aa  89  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.879451  normal  0.0692072 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0032  ribosome-binding factor A  43.44 
 
 		 137 aa  89  2e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0025  ribosome-binding factor A  42.86 
 
 		 146 aa  85.1  3e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.129398 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2488  ribosome-binding factor A  40.87 
 
 		 135 aa  85.1  3e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.266682  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4036  ribosome-binding factor A  42.28 
 
 		 143 aa  82.8  0.000000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0439  ribosome-binding factor A  39.37 
 
 		 137 aa  81.6  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0038  ribosome-binding factor A  34.53 
 
 		 164 aa  80.5  0.000000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.623045  normal  0.446494 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0230  ribosome-binding factor A  42.24 
 
 		 136 aa  80.1  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00202036  normal  0.436051 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0601  ribosome-binding factor A  40.16 
 
 		 135 aa  79  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3725  ribosome-binding factor A  37.04 
 
 		 123 aa  76.6  0.00000000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1939  ribosome-binding factor A  36.45 
 
 		 116 aa  76.3  0.0000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1657  ribosome-binding factor A  36.45 
 
 		 116 aa  76.3  0.0000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1947  ribosome-binding factor A  48.48 
 
 		 130 aa  75.5  0.0000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0382472 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2049  ribosome-binding factor A  36.7 
 
 		 127 aa  73.9  0.0000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3552  ribosome-binding factor A  37.74 
 
 		 118 aa  72.8  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3570  ribosome-binding factor A  37.74 
 
 		 118 aa  72.8  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2451  ribosome-binding factor A  38.26 
 
 		 123 aa  73.6  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0315755  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1157  ribosome-binding factor A  34.86 
 
 		 126 aa  73.2  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000826248  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1445  ribosome-binding factor A  34.78 
 
 		 131 aa  73.2  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000145103  normal  0.2265 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1052  ribosome-binding factor A  30.77 
 
 		 132 aa  72.4  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000164371  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2463  ribosome-binding factor A  36.11 
 
 		 118 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0350107  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3849  ribosome-binding factor A  36.11 
 
 		 118 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0909  ribosome-binding factor A  38.74 
 
 		 121 aa  71.2  0.000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3822  ribosome-binding factor A  36.11 
 
 		 118 aa  71.2  0.000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.3299500000000005e-63 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3662  ribosome-binding factor A  36.11 
 
 		 118 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.118279  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3948  ribosome-binding factor A  36.11 
 
 		 118 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3858  ribosome-binding factor A  35.85 
 
 		 118 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000036841  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42810  ribosome-binding factor A  37.29 
 
 		 129 aa  69.7  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1335  ribosome-binding factor A  35.85 
 
 		 118 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0231832  hitchhiker  0.00144693 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3909  ribosome-binding factor A  35.85 
 
 		 118 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.391027  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3633  ribosome-binding factor A  35.85 
 
 		 118 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0539851  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2030  ribosome-binding factor A  33.9 
 
 		 123 aa  69.3  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0111953  normal  0.0437908 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2773  ribosome-binding factor A  32.11 
 
 		 136 aa  68.2  0.00000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1693  ribosome-binding factor A  37.38 
 
 		 141 aa  67.8  0.00000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0101873  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2027  ribosome-binding factor A  32.2 
 
 		 122 aa  67.4  0.00000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.373244  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3680  ribosome-binding factor A  33.33 
 
 		 127 aa  67  0.00000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00259102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0990  ribosome-binding factor A  30.91 
 
 		 123 aa  66.6  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.645083  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2980  ribosome-binding factor A  29.09 
 
 		 119 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.06185e-26 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5461  ribosome-binding factor A  35.04 
 
 		 128 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.74875  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1466  ribosome-binding factor A  37.74 
 
 		 139 aa  65.9  0.0000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4711  ribosome-binding factor A  35.9 
 
 		 132 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.31631 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4711  ribosome-binding factor A  35.9 
 
 		 132 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.165962  hitchhiker  0.00698134 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4576  ribosome-binding factor A  35.9 
 
 		 132 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.63413  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62740  ribosome-binding factor A  34.19 
 
 		 129 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.232446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1304  ribosome-binding factor A  28.18 
 
 		 119 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0293197  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0722  ribosome-binding factor A  35.9 
 
 		 132 aa  64.7  0.0000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.041956 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3675  ribosome-binding factor A  37.61 
 
 		 125 aa  64.3  0.0000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1661  ribosome-binding factor A  36.94 
 
 		 121 aa  64.3  0.0000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.661527  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0477  ribosome-binding factor A  36.13 
 
 		 126 aa  64.3  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00670849  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0068  ribosome-binding factor A  39.25 
 
 		 125 aa  64.3  0.0000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00108757  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2119  ribosome-binding factor A  38.46 
 
 		 127 aa  63.5  0.0000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.328304  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0458  ribosome-binding factor A  28.97 
 
 		 117 aa  63.9  0.0000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3607  ribosome-binding factor A  33.9 
 
 		 129 aa  63.5  0.0000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.858095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0780  ribosome-binding factor A  33.33 
 
 		 133 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000489115  normal  0.0558247 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0818  ribosome-binding factor A  32.74 
 
 		 119 aa  62.8  0.000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1356  ribosome-binding factor A  29.73 
 
 		 116 aa  62.4  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.348543  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1330  ribosome-binding factor A  29.73 
 
 		 130 aa  62  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.285304  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4489  ribosome-binding factor A  33.33 
 
 		 138 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0856583  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1863  ribosome-binding factor A  35.51 
 
 		 126 aa  61.2  0.000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0837  ribosome-binding factor A  27.36 
 
 		 116 aa  61.2  0.000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4179  ribosome-binding factor A  33.33 
 
 		 138 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.308306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1587  ribosome-binding factor A  30 
 
 		 118 aa  60.8  0.000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00540002  normal  0.129345 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01304  ribosome-binding factor A  39.24 
 
 		 115 aa  60.5  0.000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.435847  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0998  ribosome-binding factor A  35.34 
 
 		 126 aa  60.5  0.000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00108919  normal  0.25507 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0610  ribosome-binding factor A  28.45 
 
 		 128 aa  60.1  0.000000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0012936  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1004  ribosome-binding factor A  36.45 
 
 		 129 aa  59.7  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.439697  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1226  ribosome-binding factor A  34.86 
 
 		 122 aa  60.1  0.00000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.333897  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0564  ribosome-binding factor A  34.26 
 
 		 119 aa  60.1  0.00000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>