More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2010 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_2010  peptidase C26  100 
 
 
243 aa  484  1e-136  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0361829  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1477  peptidase C26  65.69 
 
 
237 aa  318  5e-86  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0651  glutamine amidotransferase class-I  63.03 
 
 
242 aa  304  1.0000000000000001e-81  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.64648  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0076  peptidase C26  50.45 
 
 
236 aa  182  5.0000000000000004e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.484929  normal  0.0652283 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0076  peptidase C26  49.77 
 
 
236 aa  179  4.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0094  peptidase C26  49.77 
 
 
236 aa  178  4.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000432288  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0082  peptidase C26  49.32 
 
 
236 aa  177  1e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.831872  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2164  peptidase C26  41.74 
 
 
233 aa  159  4e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000115799  hitchhiker  0.0000699279 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3195  peptidase C26  44.23 
 
 
241 aa  150  2e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1349  peptidase C26  37.97 
 
 
240 aa  150  2e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000385212  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1878  hypothetical protein  42.45 
 
 
230 aa  148  9e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1848  peptidase C26  42.37 
 
 
251 aa  143  3e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.845506 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0361  peptidase C26  40.35 
 
 
253 aa  142  6e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1017  putative glutamine amidotransferase  40.65 
 
 
238 aa  140  9.999999999999999e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2465  peptidase C26  41.49 
 
 
247 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000302907  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1964  peptidase C26  37.97 
 
 
239 aa  140  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.918763 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2162  peptidase C26  36.56 
 
 
238 aa  137  2e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000124945  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2893  peptidase C26  38.86 
 
 
233 aa  136  4e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.220365  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2155  peptidase C26  38.91 
 
 
250 aa  135  5e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000159832 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2528  glutamine amidotransferase, class I  38.91 
 
 
250 aa  135  5e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4227  peptidase C26  40.49 
 
 
260 aa  134  9.999999999999999e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.135339  normal  0.255877 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2261  peptidase C26  33.22 
 
 
312 aa  134  9.999999999999999e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0121  peptidase C26  37.82 
 
 
407 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.808568 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2077  peptidase C26  42.13 
 
 
233 aa  131  7.999999999999999e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1378  peptidase C26  35.34 
 
 
253 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.735257  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2428  peptidase C26  38.6 
 
 
248 aa  129  4.0000000000000003e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0394761 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04810  predicted glutamine amidotransferase  37.39 
 
 
279 aa  129  4.0000000000000003e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00756632  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3742  peptidase C26  37.13 
 
 
237 aa  129  5.0000000000000004e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00011892  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12875  amidotransferase  38.8 
 
 
272 aa  128  9.000000000000001e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.853598  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4207  peptidase C26  40.91 
 
 
298 aa  127  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.914824 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2584  peptidase C26  41.08 
 
 
237 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0482191  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21880  peptidase C26  33.47 
 
 
231 aa  127  2.0000000000000002e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0730  peptidase C26  33.33 
 
 
238 aa  127  2.0000000000000002e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1963  peptidase C26  40.72 
 
 
254 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.153313  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0982  glutamine amidotransferase, class I  36.03 
 
 
278 aa  126  3e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2816  peptidase C26  37.19 
 
 
255 aa  126  3e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0921  glutamine amidotransferase, class I  36.03 
 
 
278 aa  126  3e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.216457  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1757  peptidase C26  40.99 
 
 
231 aa  126  4.0000000000000003e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.721348  normal  0.077261 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0143  peptidase C26  44.5 
 
 
238 aa  125  4.0000000000000003e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3050  peptidase C26  38.43 
 
 
250 aa  125  7e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4408  peptidase C26  43.48 
 
 
262 aa  124  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3356  peptidase C26  34.2 
 
 
238 aa  124  2e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.95955  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1636  peptidase C26  40.98 
 
 
252 aa  123  3e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.370641  normal  0.14821 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2021  peptidase C26  39.64 
 
 
250 aa  122  4e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2523  peptidase C26  37.25 
 
 
252 aa  122  6e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.186536 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2887  peptidase C26  39.65 
 
 
268 aa  122  7e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2279  peptidase C26  44.24 
 
 
280 aa  121  9e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.249131 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2450  peptidase C26  36.49 
 
 
409 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.210353  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4415  peptidase C26  39.33 
 
 
255 aa  120  9.999999999999999e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.663907 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3248  peptidase C26  37.8 
 
 
251 aa  121  9.999999999999999e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3249  peptidase C26  39.09 
 
 
250 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1852  peptidase C26  38.46 
 
 
238 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.197074  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0075  peptidase C26  35.53 
 
 
244 aa  119  3.9999999999999996e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.70164  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0813  peptidase C26  33.47 
 
 
264 aa  118  7.999999999999999e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.540694  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4064  peptidase C26  38.89 
 
 
256 aa  118  9e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.529097  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0616  peptidase C26  37.89 
 
 
245 aa  118  9e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.206585  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0438  peptidase C26  37.73 
 
 
255 aa  117  9.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35287  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0053  peptidase C26  36.15 
 
 
256 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1701  glutamine amidotransferase, class II/dipeptidase  34.29 
 
 
602 aa  117  1.9999999999999998e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.176176 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2532  peptidase C26  33.48 
 
 
267 aa  116  3e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1082  peptidase C26  38.5 
 
 
259 aa  116  3e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.3752 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0349  peptidase C26  36.49 
 
 
273 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.232683  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08940  predicted glutamine amidotransferase  39.42 
 
 
244 aa  115  5e-25  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0342497  normal  0.666279 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0416  peptidase C26  38.24 
 
 
264 aa  115  6.9999999999999995e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0393355  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3159  peptidase C26  34.88 
 
 
261 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3375  peptidase C26  38.54 
 
 
259 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.290232 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3677  Gamma-glutamyl-gamma-aminobutyrate hydrolase  38.18 
 
 
259 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.272698 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1072  peptidase C26  35.15 
 
 
259 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0444  glutamine amidotransferase class I  34.3 
 
 
241 aa  114  2.0000000000000002e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000517  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2058  peptidase C26  42.65 
 
 
251 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2041  peptidase C26  42.65 
 
 
240 aa  113  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.755428  normal  0.5084 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2718  peptidase C26  31.39 
 
 
242 aa  114  2.0000000000000002e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0577548  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2104  peptidase C26  42.65 
 
 
240 aa  113  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.297238  normal  0.0236912 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0175  peptidase C26  39.81 
 
 
249 aa  112  5e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000212098 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1822  peptidase C26  36.14 
 
 
245 aa  112  5e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0803389 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0794  hypothetical protein  32.89 
 
 
267 aa  112  5e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1831  peptidase C26  37.4 
 
 
261 aa  112  6e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0150811 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0063  peptidase C26  36.54 
 
 
242 aa  110  1.0000000000000001e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.542911  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19230  predicted glutamine amidotransferase  32.62 
 
 
273 aa  110  1.0000000000000001e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0453236 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0954  peptidase C26  35.6 
 
 
264 aa  110  2.0000000000000002e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.000028221  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0319  peptidase C26  37.91 
 
 
233 aa  110  2.0000000000000002e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.783639 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2536  peptidase C26  29.75 
 
 
237 aa  110  2.0000000000000002e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0388  putative glutamine amidotransferase  34.92 
 
 
250 aa  110  3e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.55028  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5207  peptidase C26  38.89 
 
 
255 aa  109  3e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.639045  normal  0.381902 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4215  peptidase C26  32.42 
 
 
253 aa  109  4.0000000000000004e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2671  peptidase C26  33.15 
 
 
229 aa  108  5e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0625878 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0799  peptidase C26  36.25 
 
 
235 aa  108  1e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5298  peptidase C26  38.43 
 
 
255 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.880812  normal  0.49084 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5346  peptidase C26  38.89 
 
 
255 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.176756 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03870  putative glutamine amidotransferase  34.76 
 
 
250 aa  106  3e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3194  peptidase C26  34.75 
 
 
253 aa  106  4e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0388042 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1106  peptidase C26  34.75 
 
 
253 aa  106  4e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00657887  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1164  peptidase C26  34.75 
 
 
253 aa  106  4e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.399023  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0847  peptidase C26  39.42 
 
 
246 aa  106  4e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1197  peptidase C26  34.75 
 
 
253 aa  106  4e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0734619  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0837  peptidase C26  36.29 
 
 
277 aa  106  4e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.347165  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2706  glutamine amidotransferase  38.25 
 
 
249 aa  105  5e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.078896  normal  0.0560665 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1940  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyrate hydrolase  35.32 
 
 
250 aa  105  5e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.343934 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2669  peptidase C26  37.04 
 
 
288 aa  105  6e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0275908  normal  0.209518 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3002  peptidase C26  33.07 
 
 
253 aa  105  6e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00604755  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>