More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1986 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_1986  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  100 
 
 
454 aa  907    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1560  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  52.78 
 
 
444 aa  407  1.0000000000000001e-112  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1747  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  47.71 
 
 
467 aa  389  1e-107  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.79617  normal  0.600328 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2110  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  48.01 
 
 
456 aa  368  1e-100  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.418405  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2028  coproporphyrinogen III oxidase  43.52 
 
 
450 aa  363  4e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3244  coproporphyrinogen III oxidase  46.14 
 
 
480 aa  361  2e-98  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0142288 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0541  coproporphyrinogen III oxidase  45.23 
 
 
454 aa  356  3.9999999999999996e-97  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6824  coproporphyrinogen III oxidase  45.21 
 
 
450 aa  356  5.999999999999999e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.979073  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2555  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  45.8 
 
 
451 aa  355  8.999999999999999e-97  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.674135 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4298  coproporphyrinogen III oxidase  43.91 
 
 
451 aa  352  1e-95  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6285  coproporphyrinogen III oxidase  43.69 
 
 
450 aa  347  2e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.180348  normal  0.950475 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3872  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  44.18 
 
 
470 aa  348  2e-94  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0948  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  47.07 
 
 
490 aa  345  7e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.105916  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0435  coproporphyrinogen III oxidase  46.92 
 
 
450 aa  342  8e-93  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3814  coproporphyrinogen III oxidase  42.89 
 
 
449 aa  340  2.9999999999999998e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.156886  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1485  coproporphyrinogen III oxidase  41.91 
 
 
449 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0666165  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1862  coproporphyrinogen III oxidase  41.46 
 
 
449 aa  337  2.9999999999999997e-91  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0501  coproporphyrinogen III oxidase  42.53 
 
 
460 aa  336  5.999999999999999e-91  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1362  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  43.24 
 
 
458 aa  335  7.999999999999999e-91  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.82538  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0635  coproporphyrinogen III oxidase  43.56 
 
 
456 aa  335  9e-91  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.603744 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3865  coproporphyrinogen III oxidase  42.14 
 
 
449 aa  335  1e-90  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.955864 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2504  coproporphyrinogen III oxidase  41.48 
 
 
469 aa  334  2e-90  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3273  coproporphyrinogen III oxidase  47.03 
 
 
448 aa  333  4e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0977  coproporphyrinogen III oxidase  41.2 
 
 
452 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.606099  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4393  coproporphyrinogen III oxidase  38.18 
 
 
472 aa  328  1.0000000000000001e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000149984 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1962  coproporphyrinogen III oxidase  41.29 
 
 
452 aa  327  3e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.429779  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0791  coproporphyrinogen III oxidase  44.82 
 
 
463 aa  327  3e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.680878  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0802  coproporphyrinogen III oxidase  44.59 
 
 
463 aa  327  3e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.519619  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1129  coproporphyrinogen III oxidase  41.54 
 
 
460 aa  327  4.0000000000000003e-88  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0669659  decreased coverage  0.00210018 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2643  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  41.78 
 
 
441 aa  326  6e-88  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1217  coproporphyrinogen III oxidase  40.62 
 
 
458 aa  326  7e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1148  coproporphyrinogen III oxidase  40.4 
 
 
458 aa  324  2e-87  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0884  coproporphyrinogen III oxidase  43.92 
 
 
463 aa  324  2e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.599698 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0317  coproporphyrinogen III oxidase  41.07 
 
 
452 aa  324  2e-87  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1089  coproporphyrinogen III oxidase  40.4 
 
 
458 aa  324  2e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0435  coproporphyrinogen III oxidase  43.69 
 
 
463 aa  322  8e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0914  coproporphyrinogen III oxidase  43.69 
 
 
463 aa  322  8e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.652481  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4018  coproporphyrinogen III oxidase  43.47 
 
 
463 aa  322  9.000000000000001e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.809241  normal  0.669249 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3828  coproporphyrinogen III oxidase  37.5 
 
 
460 aa  322  9.999999999999999e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0602  coproporphyrinogen III oxidase  43.92 
 
 
470 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3061  coproporphyrinogen III oxidase  43.05 
 
 
464 aa  320  3e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3829  coproporphyrinogen III oxidase  42.6 
 
 
460 aa  320  3e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.618416  normal  0.919193 
 
 
-
 
NC_004310  BR0655  coproporphyrinogen III oxidase  41.59 
 
 
444 aa  320  3.9999999999999996e-86  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.372227  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3786  coproporphyrinogen III oxidase  41.46 
 
 
460 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0810841  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2042  coproporphyrinogen III oxidase  43.05 
 
 
464 aa  319  5e-86  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.241644  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2571  coproporphyrinogen III oxidase  43.05 
 
 
464 aa  319  5e-86  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2171  coproporphyrinogen III oxidase  43.05 
 
 
464 aa  319  5e-86  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.467483  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0384  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  39.91 
 
 
457 aa  320  5e-86  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19920  coproporphyrinogen III oxidase  40 
 
 
458 aa  319  5e-86  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0738  coproporphyrinogen III oxidase  43.05 
 
 
464 aa  319  5e-86  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.507081  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0102  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  36.94 
 
 
465 aa  319  6e-86  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0099  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  36.94 
 
 
465 aa  319  6e-86  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.98373 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1511  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  42.6 
 
 
462 aa  319  7e-86  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.641455  hitchhiker  0.00827535 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3122  coproporphyrinogen III oxidase  43.05 
 
 
464 aa  319  7e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3096  coproporphyrinogen III oxidase  43.05 
 
 
464 aa  319  7e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1993  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  42.53 
 
 
460 aa  318  1e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0376675  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44470  coproporphyrinogen III oxidase  41.4 
 
 
460 aa  318  1e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.063876  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2477  coproporphyrinogen III oxidase  42.95 
 
 
482 aa  317  2e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.99297  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0797  coproporphyrinogen III oxidase  36.38 
 
 
451 aa  318  2e-85  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1509  coproporphyrinogen III oxidase  42.23 
 
 
464 aa  317  3e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0230115  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0531  coproporphyrinogen III oxidase  41.44 
 
 
450 aa  317  4e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.44156 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1813  coproporphyrinogen III oxidase  40.71 
 
 
460 aa  316  5e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2613  coproporphyrinogen III oxidase  41.99 
 
 
460 aa  316  7e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0494061  normal  0.675142 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1072  coproporphyrinogen III oxidase  36.84 
 
 
451 aa  315  8e-85  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.202644  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0648  coproporphyrinogen III oxidase  41.36 
 
 
444 aa  315  8e-85  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.308464  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1010  coproporphyrinogen III oxidase  36.84 
 
 
451 aa  315  9.999999999999999e-85  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0750771  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1131  coproporphyrinogen III oxidase  36.34 
 
 
451 aa  315  9.999999999999999e-85  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2633  coproporphyrinogen III oxidase  40.79 
 
 
444 aa  315  9.999999999999999e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1464  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  36.42 
 
 
462 aa  315  1.9999999999999998e-84  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000299867  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3582  coproporphyrinogen III oxidase  42.92 
 
 
460 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.308056  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3386  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  36.67 
 
 
460 aa  313  2.9999999999999996e-84  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00479262  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4264  coproporphyrinogen III oxidase  42.38 
 
 
460 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3483  coproporphyrinogen III oxidase  42.06 
 
 
494 aa  313  4.999999999999999e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.331416  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1851  coproporphyrinogen III oxidase  40.74 
 
 
451 aa  313  5.999999999999999e-84  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.532026  normal  0.685684 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0601  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  41.05 
 
 
471 aa  312  6.999999999999999e-84  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0115  coproporphyrinogen III oxidase  41.86 
 
 
465 aa  311  1e-83  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1269  coproporphyrinogen III oxidase  39.29 
 
 
463 aa  311  1e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3156  coproporphyrinogen III oxidase  41.61 
 
 
494 aa  311  1e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.574693 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1604  coproporphyrinogen III oxidase  42.16 
 
 
460 aa  311  1e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0967735  normal  0.0165321 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0606  coproporphyrinogen III oxidase  37.76 
 
 
455 aa  310  2.9999999999999997e-83  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.219505  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3323  coproporphyrinogen III oxidase  42.99 
 
 
489 aa  309  8e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2354  coproporphyrinogen III oxidase  40.36 
 
 
450 aa  308  9e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.148404 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2603  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  38.51 
 
 
469 aa  308  1.0000000000000001e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1199  coproporphyrinogen III oxidase  40.27 
 
 
450 aa  308  1.0000000000000001e-82  Brucella suis 1330  Bacteria  decreased coverage  0.00110576  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3423  coproporphyrinogen III oxidase  41.86 
 
 
461 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0620392 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3122  coproporphyrinogen III oxidase  43.18 
 
 
461 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0878  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  40.58 
 
 
461 aa  308  2.0000000000000002e-82  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1101  coproporphyrinogen III oxidase  40.23 
 
 
450 aa  308  2.0000000000000002e-82  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00147181  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0026  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  39.01 
 
 
468 aa  306  3e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0699  coproporphyrinogen III oxidase  40.14 
 
 
450 aa  306  5.0000000000000004e-82  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1208  coproporphyrinogen III oxidase  42.06 
 
 
462 aa  305  9.000000000000001e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.710207  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1695  coproporphyrinogen III oxidase  37.06 
 
 
452 aa  304  2.0000000000000002e-81  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0855  coproporphyrinogen III oxidase  42.79 
 
 
461 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3474  coproporphyrinogen III oxidase  41.42 
 
 
500 aa  305  2.0000000000000002e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4779  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  38.29 
 
 
465 aa  304  2.0000000000000002e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0897448 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2548  coproporphyrinogen III oxidase  39.82 
 
 
451 aa  303  3.0000000000000004e-81  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.963821  normal  0.259779 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1372  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  39.22 
 
 
478 aa  304  3.0000000000000004e-81  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.292242  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2483  coproporphyrinogen III oxidase  37.5 
 
 
484 aa  303  6.000000000000001e-81  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00279185  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0159  coproporphyrinogen III oxidase  37.47 
 
 
453 aa  301  1e-80  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.219729  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1048  coproporphyrinogen III oxidase  39.19 
 
 
471 aa  301  2e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>