More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1963 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_1963  FolC bifunctional protein  100 
 
 
432 aa  845    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0844  FolC bifunctional protein  63.13 
 
 
437 aa  446  1.0000000000000001e-124  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0075  FolC bifunctional protein  50.12 
 
 
442 aa  356  3.9999999999999996e-97  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0673465  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2675  FolC bifunctional protein  50 
 
 
423 aa  356  5.999999999999999e-97  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0200  FolC bifunctional protein  48.64 
 
 
448 aa  348  8e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0475  FolC bifunctional protein  50.69 
 
 
441 aa  347  3e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.617675  hitchhiker  0.00760667 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0060  FolC bifunctional protein  48.95 
 
 
442 aa  346  5e-94  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0059  FolC bifunctional protein  46.48 
 
 
421 aa  345  7e-94  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.873383  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1988  FolC bifunctional protein  49.76 
 
 
422 aa  345  8.999999999999999e-94  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.362806  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0052  folylpolyglutamate synthetase  49.05 
 
 
442 aa  344  2e-93  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.170324 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4444  FolC bifunctional protein  49.54 
 
 
441 aa  338  9e-92  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.545059 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4908  FolC bifunctional protein  49.54 
 
 
441 aa  338  9e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.094704  normal  0.815295 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0632  FolC bifunctional protein  47.44 
 
 
448 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.423078 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4958  FolC bifunctional protein  49.31 
 
 
441 aa  335  9e-91  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.583341  normal  0.154774 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0132  folylpolyglutamate synthase  51.8 
 
 
422 aa  334  2e-90  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0094  putative folC protein  48.28 
 
 
447 aa  333  4e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1697  FolC bifunctional protein  50.59 
 
 
447 aa  332  8e-90  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000041019 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0930  folylpolyglutamate synthetase  48.93 
 
 
424 aa  331  1e-89  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0140  FolC bifunctional protein  48.61 
 
 
444 aa  332  1e-89  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2729  FolC bifunctional protein  49.29 
 
 
453 aa  330  4e-89  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.618576 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1623  FolC bifunctional protein  48.38 
 
 
441 aa  330  4e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3431  folylpolyglutamate synthetase  50.12 
 
 
435 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2985  FolC bifunctional protein  49.64 
 
 
412 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.110544 
 
 
-
 
NC_004310  BR2106  FolC bifunctional protein  45.1 
 
 
442 aa  326  6e-88  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0277055  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2022  FolC bifunctional protein  45.1 
 
 
442 aa  325  7e-88  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.000765521  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0389  FolC bifunctional protein  48.97 
 
 
447 aa  325  1e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.251585  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2589  FolC bifunctional protein  48.69 
 
 
424 aa  325  1e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.500866  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1404  FolC bifunctional protein  46.15 
 
 
438 aa  324  2e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.327079 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0814  FolC bifunctional protein  45.18 
 
 
430 aa  323  3e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3240  FolC bifunctional protein  47.03 
 
 
447 aa  320  3e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3380  FolC bifunctional protein  46.98 
 
 
441 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.873983  normal  0.347847 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4979  FolC bifunctional protein  49.18 
 
 
437 aa  310  2.9999999999999997e-83  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1986  FolC bifunctional protein  47.43 
 
 
438 aa  310  4e-83  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0400217 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0662  FolC bifunctional protein  47 
 
 
440 aa  304  2.0000000000000002e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0116745  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1061  FolC bifunctional protein  48.36 
 
 
443 aa  300  4e-80  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3957  FolC bifunctional protein  43.84 
 
 
442 aa  300  4e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.755042  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1352  folylpolyglutamate synthase  42.42 
 
 
440 aa  300  4e-80  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5701  FolC bifunctional protein  45.22 
 
 
467 aa  299  6e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.504133  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0024  folylpolyglutamate synthase  43.15 
 
 
470 aa  296  6e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4284  FolC bifunctional protein  43.38 
 
 
442 aa  293  5e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.045669  normal  0.825965 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1299  FolC bifunctional protein  45.58 
 
 
435 aa  286  5.999999999999999e-76  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1052  folylpolyglutamate synthase  37.9 
 
 
429 aa  280  4e-74  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.275241  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0353  folylpolyglutamate synthetase  38.65 
 
 
434 aa  264  3e-69  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0702  folylpolyglutamate synthase  37.92 
 
 
435 aa  261  2e-68  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0715  folylpolyglutamate synthase  36.83 
 
 
442 aa  259  5.0000000000000005e-68  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0088  FolC bifunctional protein  42.64 
 
 
397 aa  246  4e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2329  FolC bifunctional protein  40.49 
 
 
426 aa  238  1e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01530  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  40.06 
 
 
466 aa  224  2e-57  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0193239 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1671  FolC bifunctional protein  37.86 
 
 
431 aa  221  1.9999999999999999e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.239696  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4359  FolC bifunctional protein  39.34 
 
 
427 aa  218  2e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.601802  normal  0.624925 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0325  FolC bifunctional protein  35.46 
 
 
438 aa  210  3e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0544  FolC bifunctional protein  36.45 
 
 
425 aa  207  3e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0738  folylpolyglutamate synthetase; dihydrofolate synthetase  36.95 
 
 
422 aa  206  5e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00754435  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2510  FolC bifunctional protein  41.57 
 
 
403 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000623947 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07720  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  36.65 
 
 
427 aa  199  9e-50  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.278263 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3683  folylpolyglutamate synthetase  36.1 
 
 
416 aa  197  4.0000000000000005e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2209  FolC bifunctional protein  32.61 
 
 
429 aa  194  2e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.791737  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0944  FolC bifunctional protein  36.1 
 
 
412 aa  193  4e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14370  Folylpolyglutamate synthase  36.41 
 
 
457 aa  191  2e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000137038  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1258  FolC bifunctional protein  43.79 
 
 
408 aa  191  2e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1160  FolC bifunctional protein  40.51 
 
 
425 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1236  FolC bifunctional protein  38.35 
 
 
428 aa  189  5.999999999999999e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0897  FolC bifunctional protein  38.42 
 
 
424 aa  188  2e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.54283e-31 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0119  FolC bifunctional protein  35.51 
 
 
447 aa  187  3e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.205687 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3348  FolC bifunctional protein  37.93 
 
 
424 aa  187  3e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0603  FolC bifunctional protein  33.72 
 
 
435 aa  186  5e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0351  FolC bifunctional protein  40.49 
 
 
414 aa  186  6e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.651098 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3277  FolC bifunctional protein  36.72 
 
 
424 aa  186  7e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0467  FolC bifunctional protein  34.96 
 
 
434 aa  185  1.0000000000000001e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000374021  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1603  FolC bifunctional protein  34.84 
 
 
420 aa  185  1.0000000000000001e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.119279  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2475  folylpolyglutamate synthetase  37.01 
 
 
424 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2605  FolC bifunctional protein  43.79 
 
 
408 aa  183  5.0000000000000004e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1685  FolC bifunctional protein  40.4 
 
 
437 aa  183  6e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2174  FolC bifunctional protein  29.98 
 
 
441 aa  182  1e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1909  FolC bifunctional protein  37.43 
 
 
442 aa  181  2e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0880  FolC bifunctional protein  32.86 
 
 
431 aa  180  4e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1384  FolC bifunctional protein  31.76 
 
 
428 aa  179  5.999999999999999e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2698  FolC bifunctional protein  43.22 
 
 
408 aa  179  8e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.713349  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2739  FolC bifunctional protein  36.93 
 
 
441 aa  179  8e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3070  FolC bifunctional protein  31.88 
 
 
428 aa  179  9e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0207  FolC bifunctional protein  31.57 
 
 
418 aa  179  1e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1911  folylpolyglutamate synthetase  38.64 
 
 
422 aa  178  2e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.553938 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0203  FolC bifunctional protein  31.33 
 
 
418 aa  177  2e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0053743 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0325  dihydropteroate synthase  37.85 
 
 
878 aa  178  2e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.899871  normal  0.0161218 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1885  FolC bifunctional protein  29.5 
 
 
441 aa  178  2e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2229  FolC bifunctional protein  36.93 
 
 
441 aa  178  2e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.369803  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1089  FolC bifunctional protein  37.9 
 
 
453 aa  178  2e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.457474 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_15  folylpolyglutamate synthetase  39.55 
 
 
437 aa  177  4e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1490  FolC bifunctional protein  32.49 
 
 
432 aa  177  5e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002876  dihydrofolate synthase/folylpolyglutamate synthase  31.72 
 
 
420 aa  176  6e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.394624  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1542  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase (folylpolyglutamate synthetase)  32.37 
 
 
429 aa  175  9.999999999999999e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0207441  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0782  FolC bifunctional protein  31.12 
 
 
435 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3755  FolC bifunctional protein  38.77 
 
 
461 aa  175  1.9999999999999998e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0263882  normal  0.48991 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0759  FolC bifunctional protein  31 
 
 
437 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4360  FolC bifunctional protein  34.93 
 
 
459 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03098  folylpolyglutamate synthase  32.3 
 
 
406 aa  174  1.9999999999999998e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0522  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  33.01 
 
 
421 aa  174  2.9999999999999996e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.250389  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4541  FolC bifunctional protein  40.56 
 
 
453 aa  174  3.9999999999999995e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.195738  normal  0.774158 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1278  folylpolyglutamate synthase  33.09 
 
 
427 aa  174  3.9999999999999995e-42  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2609  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  39.83 
 
 
422 aa  173  5e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>