More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1907 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_1907  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 368 aa  721    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.254929 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1265  histidine kinase  36.26 
 
 		 386 aa  168  1e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.99067 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0352  sensor histidine kinase, putative  31.94 
 
 		 359 aa  157  2e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4590  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.18 
 
 		 367 aa  156  6e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000214794 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0356  histidine kinase  30.92 
 
 		 359 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.143013  decreased coverage  0.0000000113905 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0257  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.42 
 
 		 404 aa  152  7e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.5208 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0184  putative signal transduction histidine kinase  32.97 
 
 		 390 aa  152  8.999999999999999e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.709555  normal  0.941469 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3505  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.61 
 
 		 363 aa  152  8.999999999999999e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0346  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.64 
 
 		 359 aa  152  8.999999999999999e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.35429  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0348  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.92 
 
 		 359 aa  151  2e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0353  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.64 
 
 		 359 aa  151  2e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0323  putative signal transduction histidine kinase  31.74 
 
 		 359 aa  146  7.0000000000000006e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3620  putative signal transduction histidine kinase  31.74 
 
 		 359 aa  144  2e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3817  putative signal transduction histidine kinase  31.44 
 
 		 359 aa  144  3e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0289  putative two-component system sensor kinase  45.14 
 
 		 423 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.159302  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3474  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  28.82 
 
 		 354 aa  139  7e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3872  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.06 
 
 		 376 aa  136  6.0000000000000005e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0238476  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01000  signal transduction histidine kinase  43.81 
 
 		 372 aa  133  6e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5201  sensor histidine kinase  27.22 
 
 		 376 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5598  sensor histidine kinase  27.22 
 
 		 376 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02210  signal transduction histidine kinase  31.1 
 
 		 372 aa  128  2.0000000000000002e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2544  putative signal transduction histidine kinase  32.57 
 
 		 363 aa  123  4e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.424204  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1721  histidine kinase  32.08 
 
 		 399 aa  123  4e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4837  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.31 
 
 		 420 aa  123  5e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.264093  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2958  histidine kinase  38.56 
 
 		 405 aa  122  7e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00418093  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5476  sensor histidine kinase  27.17 
 
 		 376 aa  122  7e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.412372  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5051  sensor histidine kinase  27.17 
 
 		 376 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4752  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.97 
 
 		 393 aa  122  9.999999999999999e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.251085 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5151  histidine kinase  26.82 
 
 		 376 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5445  sensor histidine kinase  27.17 
 
 		 376 aa  120  3e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5035  sensor histidine kinase  27.17 
 
 		 376 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5532  sensor histidine kinase  26.93 
 
 		 376 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5483  sensor histidine kinase  26.35 
 
 		 376 aa  119  6e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1587  histidine kinase  40.43 
 
 		 439 aa  119  6e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.230024  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0358  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  24.86 
 
 		 364 aa  119  7e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1679  Signal transduction histidine kinase-like protein  42.11 
 
 		 426 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.484765  normal  0.594324 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5476  sensor histidine kinase  27.09 
 
 		 376 aa  117  3e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.324928  hitchhiker  0.0000000000347721 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0888  sensor histidine kinase, putative  26.29 
 
 		 364 aa  115  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000307966  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2064  histidine kinase  35 
 
 		 400 aa  114  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.673954 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1623  histidine kinase  34.82 
 
 		 383 aa  112  8.000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0244207  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4573  histidine kinase  38.28 
 
 		 396 aa  112  8.000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.159455  normal  0.0817819 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3005  histidine kinase  38.65 
 
 		 386 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00188406  hitchhiker  0.0000457887 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3821  sensor histidine kinase, putative  29.43 
 
 		 380 aa  110  5e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0906  histidine kinase  39.78 
 
 		 381 aa  109  6e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.394153  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5480  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.73 
 
 		 404 aa  109  6e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.500623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0654  histidine kinase  29.88 
 
 		 385 aa  108  2e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03364  sensor histidine kinase, putative  28.12 
 
 		 422 aa  106  5e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0092  Signal transduction histidine kinase-like protein  35.68 
 
 		 726 aa  106  7e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0117  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  33.18 
 
 		 382 aa  104  2e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0493339  normal  0.135679 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03850  signal transduction histidine kinase  39.66 
 
 		 418 aa  105  2e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.147645  normal  0.231181 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1640  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.07 
 
 		 369 aa  105  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03390  signal transduction histidine kinase  42.17 
 
 		 388 aa  104  3e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06330  signal transduction histidine kinase  35.56 
 
 		 399 aa  104  3e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02860  signal transduction histidine kinase  37.56 
 
 		 408 aa  103  4e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1809  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.46 
 
 		 389 aa  103  4e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.13648 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1938  histidine kinase  39.53 
 
 		 363 aa  103  4e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0504  histidine kinase  40.43 
 
 		 407 aa  103  5e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.991268 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0287  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  36.82 
 
 		 370 aa  101  2e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.260696  normal  0.144944 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0213  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.18 
 
 		 397 aa  99.8  7e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0690  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  39.58 
 
 		 699 aa  99  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4661  histidine kinase  28.83 
 
 		 380 aa  96.7  6e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.249963  hitchhiker  0.00746099 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2769  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  31.62 
 
 		 786 aa  95.5  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.355603  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0194  putative signal transduction histidine kinase  40.72 
 
 		 398 aa  95.9  1e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.141704 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0762  histidine kinase  38.72 
 
 		 437 aa  95.9  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.332583 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8145  Signal transduction histidine kinase-like protein  33.33 
 
 		 581 aa  94.7  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.876501  normal  0.690137 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3655  histidine kinase  35.6 
 
 		 611 aa  94  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00917925 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0310  hypothetical protein  24.08 
 
 		 361 aa  91.7  2e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.720618  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1510  histidine kinase  31.91 
 
 		 378 aa  91.3  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0382398 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3184  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.43 
 
 		 398 aa  90.9  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29930  signal transduction histidine kinase  32.92 
 
 		 451 aa  89.7  6e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.293273  normal  0.79172 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26850  signal transduction histidine kinase  31.82 
 
 		 441 aa  89.7  7e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.479367  normal  0.194015 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2036  histidine kinase  29.37 
 
 		 381 aa  89.7  8e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.103366 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5479  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.79 
 
 		 434 aa  89.4  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4333  Signal transduction histidine kinase-like protein  42.48 
 
 		 458 aa  87.8  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.494897  normal  0.710238 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3023  response regulator  28.15 
 
 		 597 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000011368  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4056  Signal transduction histidine kinase-like protein  39.63 
 
 		 351 aa  88.2  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.022218 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1382  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.53 
 
 		 363 aa  88.2  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000104287  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1409  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  25.53 
 
 		 363 aa  88.2  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00593294  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1400  histidine kinase  26.87 
 
 		 413 aa  88.6  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.558809 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1291  sensor histidine kinase  27.81 
 
 		 364 aa  87.8  3e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000227861  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4131  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  34.36 
 
 		 401 aa  87.8  3e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.771261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11520  Histidine kinase  31.77 
 
 		 364 aa  87.8  3e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.10079  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1524  Signal transduction histidine kinase-like protein  27.78 
 
 		 370 aa  87.4  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750952  normal  0.0186176 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7438  Signal transduction histidine kinase-like protein  36.92 
 
 		 744 aa  86.7  7e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6050  histidine kinase  32.29 
 
 		 442 aa  85.9  9e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1551  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.79 
 
 		 407 aa  85.5  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.538677  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0589  histidine kinase  38.19 
 
 		 386 aa  85.5  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.307449  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0235  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.22 
 
 		 402 aa  84.3  0.000000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1141  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.02 
 
 		 445 aa  84.3  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.697723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4063  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 372 aa  84  0.000000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0607  histidine kinase  37.06 
 
 		 413 aa  83.2  0.000000000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7104  histidine kinase  30.05 
 
 		 462 aa  82.8  0.000000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.999935  normal  0.409362 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1928  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.8 
 
 		 652 aa  82.8  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.18674  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3248  histidine kinase  32.09 
 
 		 403 aa  81.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.298805  normal  0.646005 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3420  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.37 
 
 		 440 aa  81.6  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0662145 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4858  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.95 
 
 		 382 aa  81.3  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.935263  normal  0.172343 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7008  histidine kinase  32.31 
 
 		 402 aa  80.9  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.432266  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0284  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  31.67 
 
 		 443 aa  80.5  0.00000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1797  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  33.83 
 
 		 406 aa  80.5  0.00000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00220  signal transduction histidine kinase  31.51 
 
 		 391 aa  80.1  0.00000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.208854 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>