More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1844 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_1844  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 279 aa  543  1e-154  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.649512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0427  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.04 
 
 		 256 aa  151  1e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0286  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.59 
 
 		 267 aa  150  2e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3014  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  39.84 
 
 		 257 aa  144  1e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.698047  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2291  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  44.14 
 
 		 262 aa  142  4e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.448302  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3288  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  44.14 
 
 		 262 aa  142  4e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0537  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  44.14 
 
 		 262 aa  142  4e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.618923  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2168  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  44.14 
 
 		 262 aa  142  4e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.408948  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1063  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  44.14 
 
 		 262 aa  142  4e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3273  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  44.14 
 
 		 262 aa  142  4e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3237  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  43.36 
 
 		 262 aa  137  2e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.85457  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1220  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.6 
 
 		 267 aa  137  2e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0396452 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3871  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.33 
 
 		 263 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0749  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.25 
 
 		 261 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0780  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.37 
 
 		 251 aa  135  9e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1148  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.08 
 
 		 261 aa  133  3.9999999999999996e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0372396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0099  short chain dehydrogenase  36.76 
 
 		 265 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1339  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  40.17 
 
 		 261 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.789963  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0130  short chain dehydrogenase  35.29 
 
 		 265 aa  120  3e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.727225  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0946  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.2 
 
 		 255 aa  116  3e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.841301 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2618  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.34 
 
 		 260 aa  113  3e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2539  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.7 
 
 		 275 aa  113  3e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0247795  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0085  gluconate 5-dehydrogenase  34.76 
 
 		 256 aa  113  4.0000000000000004e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2467  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.96 
 
 		 255 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0928322 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2762  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.7 
 
 		 255 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.836425  normal  0.228083 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0297  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.6 
 
 		 236 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.450899  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2904  short chain dehydrogenase  36.58 
 
 		 261 aa  111  1.0000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000166666  decreased coverage  0.000436169 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3307  short chain dehydrogenase  36.58 
 
 		 261 aa  111  1.0000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0864591  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2621  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.24 
 
 		 223 aa  109  5e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1727  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.44 
 
 		 265 aa  109  6e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.218017  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1942  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.9 
 
 		 255 aa  107  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.678089  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0320  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.29 
 
 		 257 aa  105  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.25395  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0185  short chain dehydrogenase  34.23 
 
 		 256 aa  104  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0729  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.43 
 
 		 259 aa  104  2e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.503076  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1178  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.54 
 
 		 239 aa  103  3e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.300792  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5291  short chain dehydrogenase  33.06 
 
 		 260 aa  103  4e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2676  short chain dehydrogenase  31.05 
 
 		 264 aa  102  9e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.989358 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1537  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.37 
 
 		 255 aa  101  1e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3914  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.51 
 
 		 258 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1167  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.25 
 
 		 266 aa  100  2e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3539  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.36 
 
 		 271 aa  100  3e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1398  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.38 
 
 		 249 aa  100  3e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.646056  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2453  short chain dehydrogenase  32.05 
 
 		 261 aa  99.8  5e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1168  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.87 
 
 		 266 aa  99.8  5e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1238  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.87 
 
 		 266 aa  99  7e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0375  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 		 254 aa  99  7e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.187579 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3997  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.15 
 
 		 253 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.895675 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01815  short chain dehydrogenase  31.62 
 
 		 241 aa  97.8  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1362  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.31 
 
 		 282 aa  97.1  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.390824  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6048  short chain dehydrogenase  33.2 
 
 		 266 aa  96.7  4e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.549002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1490  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.88 
 
 		 239 aa  96.3  5e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0727  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.13 
 
 		 245 aa  95.9  6e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.00978147  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1440  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.52 
 
 		 277 aa  95.1  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.313918 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0142  short chain dehydrogenase  33.33 
 
 		 266 aa  94  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2785  short chain dehydrogenase  32.68 
 
 		 254 aa  94  2e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.73728  normal  0.939169 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1175  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.87 
 
 		 254 aa  94.7  2e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2097  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.86 
 
 		 238 aa  94.7  2e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.434652  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2469  TonB-dependent receptor  29.69 
 
 		 265 aa  93.6  3e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1455  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.66 
 
 		 260 aa  93.2  4e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.271159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3863  short chain dehydrogenase  31.37 
 
 		 260 aa  92.8  5e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.331172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1481  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.86 
 
 		 240 aa  92.8  5e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1619  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.64 
 
 		 277 aa  92.4  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.44916 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01434  Short chain dehydrogenase family protein  30.04 
 
 		 239 aa  91.7  1e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0813  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  34.26 
 
 		 253 aa  91.7  1e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1484  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.24 
 
 		 260 aa  91.3  1e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.591298  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2712  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.42 
 
 		 275 aa  90.5  2e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4248  short chain dehydrogenase  33.06 
 
 		 259 aa  91.3  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.215124 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0016  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37 
 
 		 260 aa  90.9  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0407  short chain dehydrogenase  35.18 
 
 		 259 aa  90.5  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.317505  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3096  short chain dehydrogenase  35.18 
 
 		 259 aa  90.5  3e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0087  short chain dehydrogenase  35.18 
 
 		 259 aa  90.5  3e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2288  short chain dehydrogenase  35.18 
 
 		 259 aa  90.5  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0589  short chain dehydrogenase  35.18 
 
 		 259 aa  90.5  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2000  short chain dehydrogenase  35.18 
 
 		 259 aa  90.5  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0352  short chain dehydrogenase  35.43 
 
 		 259 aa  90.1  4e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003864  oxidoreductase short-chain dehydrogenase/reductase family  30.16 
 
 		 241 aa  90.1  4e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.013707  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0134  short chain dehydrogenase  32.61 
 
 		 266 aa  89.7  4e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3209  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.78 
 
 		 266 aa  89.4  6e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.857449 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1222  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.66 
 
 		 258 aa  89.4  7e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.461582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0427  short chain dehydrogenase  34.78 
 
 		 259 aa  89.4  7e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2775  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.45 
 
 		 238 aa  89  9e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.88847  normal  0.739494 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1311  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.78 
 
 		 266 aa  88.2  1e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.978372 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3052  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.04 
 
 		 266 aa  88.6  1e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2754  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.8 
 
 		 275 aa  88.2  1e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.433019  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0185  short chain dehydrogenase  34.48 
 
 		 267 aa  87.4  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0151  short chain dehydrogenase  31.1 
 
 		 261 aa  87.8  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4895  short chain dehydrogenase  30.89 
 
 		 258 aa  87.4  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000739396  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3487  short chain dehydrogenase  30.35 
 
 		 270 aa  87.8  2e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3066  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.2 
 
 		 266 aa  87.8  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0463  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 		 264 aa  86.7  4e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0852  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.6 
 
 		 286 aa  86.3  5e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.068211 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4129  short chain dehydrogenase  29.96 
 
 		 270 aa  86.3  6e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3806  short chain dehydrogenase  32.24 
 
 		 260 aa  85.9  7e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.187681 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3000  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.15 
 
 		 241 aa  85.9  7e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5225  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.62 
 
 		 257 aa  85.9  7e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0470  short chain dehydrogenase  31.45 
 
 		 259 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.382263 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3382  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  29.04 
 
 		 266 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3371  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.1 
 
 		 239 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0408  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.44 
 
 		 240 aa  85.1  0.000000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2964  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.27 
 
 		 260 aa  84.7  0.000000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.166977 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>