More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1713 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_1713  2-dehydropantoate 2-reductase  100 
 
 
306 aa  620  1e-176  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5770  2-dehydropantoate 2-reductase  50 
 
 
307 aa  286  2e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3118  2-dehydropantoate 2-reductase  46.73 
 
 
312 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.782034 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4552  2-dehydropantoate 2-reductase  48.68 
 
 
307 aa  277  2e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0186  2-dehydropantoate 2-reductase  46.05 
 
 
306 aa  269  4e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0016  2-dehydropantoate 2-reductase  46.1 
 
 
307 aa  268  1e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2936  2-dehydropantoate 2-reductase  45.42 
 
 
312 aa  265  8.999999999999999e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.178942 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3162  2-dehydropantoate 2-reductase  45.75 
 
 
312 aa  264  2e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.396021  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0163  2-dehydropantoate 2-reductase  45.07 
 
 
306 aa  263  2e-69  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0313  2-dehydropantoate 2-reductase  47.04 
 
 
307 aa  263  3e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.82281 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0018  2-dehydropantoate 2-reductase  46.38 
 
 
306 aa  263  3e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0729  2-dehydropantoate 2-reductase  45.21 
 
 
306 aa  258  9e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.691763  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4498  2-dehydropantoate 2-reductase  43.93 
 
 
312 aa  257  2e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.646734  normal  0.399113 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2669  2-dehydropantoate 2-reductase  44.88 
 
 
310 aa  257  2e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0588922  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6167  2-dehydropantoate 2-reductase  48.01 
 
 
314 aa  256  3e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0021  2-dehydropantoate 2-reductase  44.74 
 
 
306 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2967  2-dehydropantoate 2-reductase  43.46 
 
 
311 aa  253  2.0000000000000002e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.53344  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6687  2-dehydropantoate 2-reductase  45.75 
 
 
312 aa  251  1e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2600  2-dehydropantoate 2-reductase  45.39 
 
 
311 aa  248  9e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.11896 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0743  ketopantoate reductase ApbA/PanE  40.72 
 
 
311 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.786977  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4726  2-dehydropantoate 2-reductase  44.77 
 
 
315 aa  242  6e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.14221 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0191  2-dehydropantoate 2-reductase  45.07 
 
 
305 aa  240  2e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4423  2-dehydropantoate 2-reductase  40.72 
 
 
311 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.852681 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5461  2-dehydropantoate 2-reductase  44.23 
 
 
315 aa  239  4e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.853784  normal  0.141843 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0882  2-dehydropantoate 2-reductase  43.51 
 
 
315 aa  239  5e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.277426 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3781  2-dehydropantoate 2-reductase  45.71 
 
 
312 aa  238  1e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0449567 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3545  2-dehydropantoate 2-reductase  43.91 
 
 
315 aa  236  3e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.16372  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4822  2-dehydropantoate 2-reductase  43.91 
 
 
315 aa  236  3e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.117223 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4203  2-dehydropantoate 2-reductase  44.59 
 
 
315 aa  235  7e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.379422  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4116  2-dehydropantoate 2-reductase  42.38 
 
 
308 aa  231  1e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.605632 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2408  2-dehydropantoate 2-reductase  40.46 
 
 
306 aa  231  1e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0790989 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0085  2-dehydropantoate 2-reductase  45.78 
 
 
314 aa  224  1e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0174  2-dehydropantoate 2-reductase  41.31 
 
 
313 aa  221  9.999999999999999e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.170216 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0600  2-dehydropantoate 2-reductase  38.28 
 
 
314 aa  219  3.9999999999999997e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000137771  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3518  2-dehydropantoate 2-reductase  42.36 
 
 
305 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06250  2-dehydropantoate 2-reductase  43.89 
 
 
305 aa  218  7e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1918  2-dehydropantoate 2-reductase  38.25 
 
 
314 aa  217  2e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000931177 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1964  2-dehydropantoate 2-reductase  36.84 
 
 
314 aa  211  1e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00305796  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1877  2-dehydropantoate 2-reductase  37.54 
 
 
314 aa  210  2e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0355332  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3467  2-dehydropantoate 2-reductase  37.54 
 
 
314 aa  211  2e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000905297  hitchhiker  8.32908e-18 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1746  2-dehydropantoate 2-reductase  36.49 
 
 
314 aa  210  3e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1884  2-dehydropantoate 2-reductase  36.49 
 
 
314 aa  210  3e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1991  2-dehydropantoate 2-reductase  37.19 
 
 
314 aa  210  3e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000310773  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02788  2-dehydropantoate 2-reductase  39.66 
 
 
312 aa  209  6e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1107  2-dehydropantoate 2-reductase  41.61 
 
 
319 aa  209  7e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2980  Ketopantoate reductase ApbA/PanE domain protein  39.06 
 
 
323 aa  208  8e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1738  2-dehydropantoate 2-reductase  38.25 
 
 
314 aa  208  9e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0314725  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1696  2-dehydropantoate 2-reductase  36.49 
 
 
314 aa  206  3e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.231571  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1405  2-dehydropantoate 2-reductase  38.28 
 
 
307 aa  204  2e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3883  2-dehydropantoate 2-reductase  40.78 
 
 
312 aa  204  2e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.535579 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0059  2-dehydropantoate 2-reductase  39.35 
 
 
321 aa  202  6e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0067  2-dehydropantoate 2-reductase  39.35 
 
 
321 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4737  ketopantoate reductase ApbA/PanE  40.46 
 
 
310 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0294  2-dehydropantoate 2-reductase  33.68 
 
 
307 aa  169  4e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.220777  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1913  ketopantoate reductase ApbA/PanE  34.02 
 
 
304 aa  160  3e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5181  2-dehydropantoate 2-reductase  30.88 
 
 
307 aa  150  4e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000000387537  normal  0.288245 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0535  2-dehydropantoate 2-reductase  30.53 
 
 
307 aa  149  8e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000195412  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0328  2-dehydropantoate 2-reductase  31.5 
 
 
315 aa  130  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0244641  normal  0.0158618 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0713  2-dehydropantoate 2-reductase  29.17 
 
 
306 aa  129  8.000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2226  2-dehydropantoate 2-reductase  30.48 
 
 
336 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0858  2-dehydropantoate 2-reductase  30.77 
 
 
311 aa  122  7e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00149615  normal  0.0154258 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1736  2-dehydropantoate 2-reductase  26.37 
 
 
309 aa  120  3.9999999999999996e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0419891 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4927  2-dehydropantoate 2-reductase  29.17 
 
 
306 aa  119  7e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0332007  normal  0.934837 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0270  2-dehydropantoate 2-reductase  28.16 
 
 
318 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.267073 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0218  2-dehydropantoate 2-reductase  30.54 
 
 
300 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6482  2-dehydropantoate 2-reductase  25.83 
 
 
301 aa  110  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.201709  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0050  2-dehydropantoate 2-reductase  27.39 
 
 
335 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5042  2-dehydropantoate 2-reductase  28.66 
 
 
301 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6528  2-dehydropantoate 2-reductase  27.06 
 
 
316 aa  108  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2865  2-dehydropantoate 2-reductase  27.68 
 
 
311 aa  107  2e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5729  2-dehydropantoate 2-reductase  25.5 
 
 
301 aa  107  3e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.807147  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4479  2-dehydropantoate 2-reductase  25.83 
 
 
337 aa  106  5e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6243  2-dehydropantoate 2-reductase  27.36 
 
 
316 aa  106  6e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0603  2-dehydropantoate 2-reductase  28.52 
 
 
299 aa  105  7e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2099  2-dehydropantoate 2-reductase  28.75 
 
 
335 aa  105  9e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.531117  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1859  2-dehydropantoate 2-reductase  28.38 
 
 
311 aa  105  1e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.540128  normal  0.594276 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5508  2-dehydropantoate 2-reductase  29.05 
 
 
323 aa  104  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.723336  normal  0.36356 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2523  2-dehydropantoate 2-reductase  27.21 
 
 
312 aa  103  5e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2416  2-dehydropantoate 2-reductase  29.3 
 
 
335 aa  102  7e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.483923  normal  0.193956 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2139  2-dehydropantoate 2-reductase  29.3 
 
 
335 aa  102  7e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.147044  normal  0.399133 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2153  2-dehydropantoate 2-reductase  26.56 
 
 
326 aa  101  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.998843  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2998  2-dehydropantoate 2-reductase, putative  28.24 
 
 
315 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0207469 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3881  2-dehydropantoate 2-reductase  32.71 
 
 
310 aa  100  4e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.564166  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4507  2-dehydropantoate 2-reductase  25.5 
 
 
335 aa  100  4e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.28047  normal  0.622175 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2023  2-dehydropantoate 2-reductase  26.1 
 
 
324 aa  99.8  5e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.607439  normal  0.396245 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1850  2-dehydropantoate 2-reductase  25.3 
 
 
353 aa  99.4  7e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.9641 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1861  2-dehydropantoate 2-reductase  28.1 
 
 
317 aa  98.6  1e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3431  2-dehydropantoate 2-reductase  26.73 
 
 
324 aa  98.2  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.990914  normal  0.0502044 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2816  2-dehydropantoate 2-reductase  23.81 
 
 
305 aa  97.8  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5528  2-dehydropantoate 2-reductase  28.23 
 
 
316 aa  97.8  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2695  2-dehydropantoate 2-reductase  27.91 
 
 
315 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.120286  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6131  2-dehydropantoate 2-reductase  30.81 
 
 
341 aa  97.4  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5892  2-dehydropantoate 2-reductase  28.23 
 
 
316 aa  97.8  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.700658  normal  0.998449 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2839  2-dehydropantoate 2-reductase  23.81 
 
 
305 aa  97.1  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.748115 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1546  2-dehydropantoate 2-reductase  28.67 
 
 
312 aa  97.1  3e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2776  2-dehydropantoate 2-reductase  23.71 
 
 
305 aa  97.1  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2951  2-dehydropantoate 2-reductase  23.71 
 
 
305 aa  95.9  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2735  2-dehydropantoate 2-reductase  23.37 
 
 
305 aa  95.9  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0788  2-dehydropantoate 2-reductase  24.4 
 
 
307 aa  95.5  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1998  2-dehydropantoate 2-reductase  29.93 
 
 
310 aa  95.5  1e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>