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for query gene Gdia_1674 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



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Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_1674  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 
204 aa  406  1e-113  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0809  transcriptional regulator, TetR family  59.9 
 
 
214 aa  241  5e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3409  TetR family transcriptional regulator  53.08 
 
 
212 aa  228  6e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1603  transcriptional regulator, TetR family  51.74 
 
 
213 aa  215  4e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18450  transcriptional regulator, TetR family  61.71 
 
 
179 aa  212  2.9999999999999995e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3357  TetR family transcriptional regulator  55.5 
 
 
211 aa  211  9e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0594456 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0064  TetR family transcriptional regulator  54.82 
 
 
210 aa  209  2e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1527  TetR family transcriptional regulator  54.59 
 
 
212 aa  207  1e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4476  TetR family transcriptional regulator  48.1 
 
 
220 aa  207  1e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000182515 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25370  Transcriptional regulatory protein, TetR  56.02 
 
 
209 aa  206  2e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2754  regulatory protein, TetR  52.36 
 
 
219 aa  202  2e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.396057  normal  0.0231562 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5462  TetR family transcriptional regulator  55.5 
 
 
212 aa  202  4e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5400  TetR family transcriptional regulator  55.5 
 
 
212 aa  202  4e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00236367 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2638  TetR family transcriptional regulator  50.24 
 
 
210 aa  201  5e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0765  transcriptional regulator, TetR family protein  48.29 
 
 
222 aa  197  6e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0251  TetR family transcriptional regulator  54.45 
 
 
212 aa  197  7e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.714148  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4749  TetR family transcriptional regulator  45.89 
 
 
207 aa  194  6e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.590058  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4743  TetR family transcriptional regulator  53.93 
 
 
212 aa  194  6e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4870  TetR family transcriptional regulator  55.87 
 
 
186 aa  192  3e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.318456  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5288  TetR family transcriptional regulator  54.75 
 
 
186 aa  187  9e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0083  TetR family transcriptional regulator  49.5 
 
 
219 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.201393  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0730  TetR family transcriptional regulator  41.62 
 
 
214 aa  173  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1435  TetR family regulatory protein  49.5 
 
 
219 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0803  TetR family transcriptional regulator  43.68 
 
 
196 aa  161  5.0000000000000005e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0770  TetR family transcriptional regulator  41.58 
 
 
196 aa  160  9e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4778  transcriptional regulator, TetR family  47.18 
 
 
227 aa  156  2e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0545614  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2969  hypothetical protein  50.68 
 
 
162 aa  155  4e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0448916  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2215  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 
215 aa  153  2e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3088  transcriptional regulator of TetR family protein  39.46 
 
 
198 aa  148  6e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.119848 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0127  transcriptional regulator, TetR family  37.78 
 
 
193 aa  144  8.000000000000001e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2518  TetR family transcriptional regulator  41.07 
 
 
221 aa  138  3.9999999999999997e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.382378  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0436  TetR/AcrR family transcriptional regulator  37.22 
 
 
193 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00014648  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0480  transcriptional regulator, TetR family  35.64 
 
 
205 aa  119  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.318214 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0187  TetR family transcriptional regulator  31.02 
 
 
202 aa  113  2.0000000000000002e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.458714  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3038  transcriptional regulator, TetR family  39.66 
 
 
209 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.051717 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1025  transcriptional regulator, TetR family  36.11 
 
 
192 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5089  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 
198 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0208  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 
191 aa  107  1e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1967  TetR family transcriptional regulator  32.57 
 
 
202 aa  104  1e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0316  TetR family transcriptional regulator  35.4 
 
 
176 aa  94.4  1e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36300  TetR family transcriptional regulator  32.8 
 
 
194 aa  92.8  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.564712  normal  0.0790295 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3100  putative transcriptional regulator  32.6 
 
 
194 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.209779  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4102  TetR family transcriptional regulator  33.15 
 
 
211 aa  88.2  8e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.680562  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0962  TetR family transcriptional regulator  33.9 
 
 
200 aa  88.2  8e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2361  transcriptional regulator, TetR family  31.64 
 
 
199 aa  87.8  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000141293  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2203  TetR family transcriptional regulator  29.33 
 
 
206 aa  87.4  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0627793  hitchhiker  0.000036044 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1991  transcriptional regulator, TetR family  31.64 
 
 
199 aa  86.7  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000115862  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1549  TetR family transcriptional regulator  31.64 
 
 
199 aa  87  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0178403  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1841  transcriptional regulator, TetR family  31.64 
 
 
199 aa  86.7  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.170954  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2231  TetR family transcriptional regulator  33.71 
 
 
194 aa  87  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.558633  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1726  TetR family transcriptional regulator  31.64 
 
 
199 aa  86.7  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.716564  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1980  TetR family transcriptional regulator  31.64 
 
 
199 aa  86.7  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00264568  hitchhiker  0.00106159 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0287  TetR family transcriptional regulator  29.57 
 
 
200 aa  86.3  3e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000147212 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3888  TetR family transcriptional regulator  34.09 
 
 
193 aa  85.9  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0944552  normal  0.0941974 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4221  TetR family transcriptional regulator  30.39 
 
 
206 aa  85.9  4e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.360052  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2558  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 
190 aa  85.5  5e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0971  TetR family transcriptional regulator  29.84 
 
 
200 aa  85.1  6e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.325702 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3721  transcriptional regulator, TetR family  31.38 
 
 
196 aa  84.7  7e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0437946 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1797  TetR family transcriptional regulator  30.86 
 
 
199 aa  84  0.000000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0497705  normal  0.0268872 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1860  TetR family transcriptional regulator  31.07 
 
 
199 aa  83.6  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0204447  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4097  transcriptional regulator, TetR family  30.86 
 
 
194 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4292  TetR family transcriptional regulator  31.49 
 
 
206 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4468  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 
198 aa  82.8  0.000000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5954  TetR family transcriptional regulator  30.94 
 
 
206 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.419182  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0272  TetR family transcriptional regulator  32.18 
 
 
198 aa  82.8  0.000000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0264  TetR family transcriptional regulator  32.18 
 
 
198 aa  82.8  0.000000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3964  TetR family transcriptional regulator  30.94 
 
 
206 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1097  TetR family transcriptional regulator  31.72 
 
 
196 aa  83.2  0.000000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4403  TetR family transcriptional regulator  30.94 
 
 
206 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.504175 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0272  TetR family transcriptional regulator  32.18 
 
 
198 aa  82.8  0.000000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1606  TetR family transcriptional regulator  31.49 
 
 
206 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0686792  normal  0.0717181 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1763  TetR family transcriptional regulator  30.93 
 
 
199 aa  82.4  0.000000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000139552  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2564  TetR family transcriptional regulator  30.93 
 
 
199 aa  82.4  0.000000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000186036  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1872  TetR family transcriptional regulator  30.93 
 
 
199 aa  82.4  0.000000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0047199  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0262  TetR family transcriptional regulator  32.34 
 
 
198 aa  82  0.000000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000117006 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2475  TetR family transcriptional regulator  31.07 
 
 
197 aa  80.9  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.000212819  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1607  TetR family transcriptional regulator  31.07 
 
 
199 aa  80.9  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1906  TetR family transcriptional regulator  31.07 
 
 
199 aa  80.9  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1547  TetR family transcriptional regulator  31.07 
 
 
199 aa  80.9  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.58457  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1534  transcriptional regulator, TetR family  31.07 
 
 
199 aa  81.3  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.239413  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3824  TetR family transcriptional regulator  30.94 
 
 
206 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.472754 
 
 
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NC_011149  SeAg_B1737  transcriptional regulator, TetR family  31.07 
 
 
199 aa  80.9  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.151738  n/a   
 
 
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NC_011663  Sbal223_0268  transcriptional regulator, TetR family  31.61 
 
 
198 aa  79.7  0.00000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_008321  Shewmr4_0261  TetR family transcriptional regulator  31.74 
 
 
198 aa  79.3  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00036521 
 
 
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NC_008322  Shewmr7_3760  TetR family transcriptional regulator  31.74 
 
 
198 aa  79.3  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_008463  PA14_53410  transcriptional regulator  29.79 
 
 
196 aa  79.7  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.733487  normal  0.037637 
 
 
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NC_009438  Sputcn32_0378  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 
202 aa  79  0.00000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_009656  PSPA7_4681  transcriptional regulator  28.04 
 
 
196 aa  79  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_003295  RSc1201  transcription regulator protein  32.57 
 
 
209 aa  78.6  0.00000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.582864  normal  0.871194 
 
 
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NC_007969  Pcryo_1014  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 
212 aa  78.2  0.00000000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_007298  Daro_1100  TetR family transcriptional regulator  30.6 
 
 
194 aa  76.6  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0669836  normal  0.61487 
 
 
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NC_007954  Sden_1388  regulatory protein, TetR  31.98 
 
 
196 aa  77  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_013093  Amir_4395  transcriptional regulator, TetR family  36.93 
 
 
196 aa  76.6  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.724029  n/a   
 
 
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NC_008781  Pnap_0162  TetR family transcriptional regulator  30.39 
 
 
201 aa  77  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
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CP001509  ECD_01619  predicted DNA-binding transcriptional regulator  32.05 
 
 
171 aa  76.3  0.0000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00000798557  n/a   
 
 
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NC_010172  Mext_4360  regulatory protein TetR  32.57 
 
 
200 aa  76.3  0.0000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_012892  B21_01609  hypothetical protein  32.05 
 
 
171 aa  76.3  0.0000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00000476829  n/a   
 
 
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NC_007435  BURPS1710b_A2293  TetR family transcriptional regulator  31.67 
 
 
247 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.887651  n/a   
 
 
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NC_008835  BMA10229_0121  TetR family transcriptional regulator  33.94 
 
 
200 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_009078  BURPS1106A_A0974  TetR family transcriptional regulator  33.94 
 
 
200 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.543907  n/a   
 
 
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