More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1638 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_1638  endonuclease III  100 
 
 		 228 aa  462  1e-129  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.104677  normal  0.333144 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2500  endonuclease III  62.61 
 
 		 240 aa  268  4e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0666144  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0153  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  64.08 
 
 		 237 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2991  endonuclease III  60.19 
 
 		 233 aa  263  1e-69  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3568  endonuclease III  58.49 
 
 		 214 aa  260  1e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0006  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  59.05 
 
 		 231 aa  259  2e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.179819  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2745  endonuclease III  59.62 
 
 		 222 aa  258  6e-68  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.637576 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0203  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  57.69 
 
 		 218 aa  254  8e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.419558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0176  endonuclease III  60.39 
 
 		 249 aa  254  8e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.809108  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1735  endonuclease III  57.21 
 
 		 215 aa  254  9e-67  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.61574  normal  0.277364 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4758  endonuclease III  58.9 
 
 		 248 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0812049  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2297  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  59.13 
 
 		 212 aa  253  1.0000000000000001e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2655  endonuclease III  58.65 
 
 		 212 aa  253  2.0000000000000002e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1155  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  56.67 
 
 		 210 aa  252  4.0000000000000004e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1046  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  55.77 
 
 		 214 aa  249  2e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2021  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  60.59 
 
 		 229 aa  249  2e-65  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1314  endonuclease III  57.67 
 
 		 230 aa  249  3e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0570319  normal  0.296572 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0970  endonuclease III  59.69 
 
 		 214 aa  249  4e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.99745  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4249  endonuclease III  58.9 
 
 		 249 aa  247  8e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.884041  normal  0.624306 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1931  endonuclease III  59.69 
 
 		 214 aa  247  9e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.514789  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1175  endonuclease III  59.69 
 
 		 214 aa  247  9e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1336  endonuclease III  59.69 
 
 		 214 aa  247  9e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.70217  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1183  endonuclease III  59.69 
 
 		 214 aa  247  9e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.123601  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1022  endonuclease III  59.69 
 
 		 214 aa  247  9e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.99743  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0305  endonuclease III  59.69 
 
 		 214 aa  247  9e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.77155  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0843  endonuclease III  59.69 
 
 		 214 aa  247  9e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.667209  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1005  endonuclease III protein  58.16 
 
 		 214 aa  247  1e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.248668  normal  0.180711 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0197  endonuclease III  56.19 
 
 		 214 aa  247  1e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0159  endonuclease III  57.75 
 
 		 260 aa  246  2e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.939047  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1316  endonuclease III  59.39 
 
 		 252 aa  246  2e-64  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2517  endonuclease III  57.21 
 
 		 216 aa  246  3e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0166  endonuclease III  57.28 
 
 		 248 aa  246  3e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2747  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  55.77 
 
 		 212 aa  246  3e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.81262  normal  0.488762 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1665  endonuclease III  56.73 
 
 		 228 aa  245  4e-64  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.628404  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0936  endonuclease III  57.14 
 
 		 214 aa  245  4.9999999999999997e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0591838 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2097  endonuclease III  59.18 
 
 		 214 aa  244  6e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.161318 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1031  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  56.19 
 
 		 214 aa  244  6e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.474778  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2246  endonuclease III  58.67 
 
 		 214 aa  244  6e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.769441 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2350  endonuclease III  58.67 
 
 		 214 aa  244  6.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.103385 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0439  endonuclease III  57.87 
 
 		 254 aa  244  6.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.45571  normal  0.92859 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2366  endonuclease III  58.67 
 
 		 214 aa  244  8e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.249238  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2692  endonuclease III  56.19 
 
 		 214 aa  244  9e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.841587  normal  0.269141 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0871  endonuclease III  56.63 
 
 		 214 aa  244  9e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.348794 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1715  endonuclease III  58.67 
 
 		 214 aa  244  9e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.104745  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2327  endonuclease III  58.67 
 
 		 214 aa  244  9e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5669  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  58.67 
 
 		 214 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.40748  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3170  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  56.73 
 
 		 216 aa  244  9.999999999999999e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.999623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1610  endonuclease III  56.25 
 
 		 228 aa  243  1.9999999999999999e-63  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0950  endonuclease III  58.67 
 
 		 214 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.066309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3311  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  58.16 
 
 		 214 aa  242  3e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0346  endonuclease III  56.6 
 
 		 261 aa  242  3.9999999999999997e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0360921  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0724  endonuclease III  60.71 
 
 		 213 aa  241  7e-63  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.155914  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1235  endonuclease III  57.65 
 
 		 214 aa  240  1e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.649386 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0381  endonuclease III  56.13 
 
 		 258 aa  239  2e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3567  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  57.62 
 
 		 268 aa  239  2e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0201  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  56.37 
 
 		 274 aa  239  4e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2824  endonuclease III  54.81 
 
 		 250 aa  238  4e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.105195 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3238  endonuclease III  58.13 
 
 		 213 aa  238  6.999999999999999e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.27706  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0809  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  54.55 
 
 		 211 aa  238  8e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.631495 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3289  endonuclease III  59.69 
 
 		 240 aa  236  2e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0133312 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1632  endonuclease III  64.4 
 
 		 359 aa  236  2e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.43019  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0162  endonuclease III  53.92 
 
 		 262 aa  236  2e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.562877  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2079  endonuclease III  53.74 
 
 		 214 aa  235  3e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.29657 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1499  endonuclease III  52.4 
 
 		 219 aa  236  3e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2607  endonuclease III  54.33 
 
 		 217 aa  235  4e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3023  endonuclease III  52.86 
 
 		 214 aa  235  4e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.296739  normal  0.295544 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1014  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  55.1 
 
 		 214 aa  235  5.0000000000000005e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0604012  normal  0.969692 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00782  endonuclease III  52.94 
 
 		 236 aa  234  6e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0572206  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01603  DNA glycosylase and apyrimidinic (AP) lyase (endonuclease III)  54.46 
 
 		 211 aa  234  8e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00133572  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2008  endonuclease III  54.46 
 
 		 211 aa  234  8e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00632932  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1842  endonuclease III  54.46 
 
 		 211 aa  234  8e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000960215  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1996  endonuclease III  54.46 
 
 		 211 aa  234  8e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0209025  normal  0.0823674 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1822  endonuclease III  54.46 
 
 		 211 aa  234  8e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.692656  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01593  hypothetical protein  54.46 
 
 		 211 aa  234  8e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0014654  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1709  endonuclease III  54.46 
 
 		 211 aa  234  8e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00510464  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1566  endonuclease III  54.46 
 
 		 211 aa  234  8e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.263059  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2306  endonuclease III  56.25 
 
 		 220 aa  233  1.0000000000000001e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2682  endonuclease III  56.25 
 
 		 220 aa  233  1.0000000000000001e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3741  endonuclease III  54.71 
 
 		 260 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2319  endonuclease III  54.11 
 
 		 211 aa  233  1.0000000000000001e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1889  endonuclease III  54.46 
 
 		 211 aa  233  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3842  endonuclease III  52.86 
 
 		 254 aa  233  2.0000000000000002e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.561189  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1563  endonuclease III  53.96 
 
 		 211 aa  233  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0700228  normal  0.157438 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0880  endonuclease III  52.34 
 
 		 231 aa  233  2.0000000000000002e-60  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000630803  hitchhiker  0.000000662064 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2345  endonuclease III  53.96 
 
 		 211 aa  232  3e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0106344  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2793  endonuclease III  52.13 
 
 		 211 aa  232  4.0000000000000004e-60  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1721  endonuclease III  53.96 
 
 		 211 aa  231  5e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.161227  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1623  endonuclease III  53.96 
 
 		 211 aa  231  5e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.475261  normal  0.347988 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1551  endonuclease III  53.96 
 
 		 211 aa  231  5e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.651941  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2160  endonuclease III  54 
 
 		 211 aa  231  6e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.615191  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2633  endonuclease III  56.63 
 
 		 225 aa  231  7.000000000000001e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.232895  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3375  endonuclease III  54.3 
 
 		 236 aa  230  1e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1562  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  54.41 
 
 		 226 aa  229  2e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.888667 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0339  endonuclease III  55.02 
 
 		 256 aa  229  2e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0561  endonuclease III  59.51 
 
 		 233 aa  230  2e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.1956 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2571  endonuclease III  52.4 
 
 		 215 aa  229  3e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.563306  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2939  endonuclease III  51.66 
 
 		 211 aa  229  3e-59  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2451  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  51.13 
 
 		 247 aa  229  3e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.452204  normal  0.144793 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2019  endonuclease III  53.47 
 
 		 211 aa  229  3e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.734703  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1629  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  53.43 
 
 		 219 aa  229  3e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.204448  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>