94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1562 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_1562  ferredoxin III, nif-specific  100 
 
 		 94 aa  186  8e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5917  ferredoxin-3 (ferredoxin III) (FdIII)  69.23 
 
 		 95 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.228089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0096  ferredoxin III 4(4Fe-4S) nif-specific  69.57 
 
 		 98 aa  115  1.9999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.418618  normal  0.870899 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0481  ferredoxin III, nif-specific  66.67 
 
 		 103 aa  112  2.0000000000000002e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.92658  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4902  ferredoxin III, nif-specific  63.64 
 
 		 97 aa  110  6e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.147996  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0977  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  55.56 
 
 		 103 aa  105  1e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.316671 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2282  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  55.06 
 
 		 101 aa  103  6e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6219  ferredoxin III 4(4Fe-4S) nif-specific  56.38 
 
 		 105 aa  102  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2104  ferredoxin III, nif-specific  54.32 
 
 		 97 aa  101  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000996016 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3989  ferredoxin III, nif-specific  58.33 
 
 		 179 aa  100  8e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0809121  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2186  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  56.99 
 
 		 100 aa  100  9e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0900342 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0534  putative dimeric ferredoxin (FdIII)  56.99 
 
 		 100 aa  100  9e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.165776  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5093  ferredoxin III, nif-specific  61.11 
 
 		 103 aa  100  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3542  ferredoxin III, nif-specific  57.29 
 
 		 104 aa  99  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.923414  hitchhiker  0.00998746 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1081  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  57.14 
 
 		 104 aa  99  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3624  ferredoxin III, nif-specific  57.61 
 
 		 105 aa  97.8  4e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.182851 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1512  ferredoxin  48.89 
 
 		 102 aa  97.4  6e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.560047  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1230  ferredoxin III, nif-specific  48.89 
 
 		 102 aa  97.4  6e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000308557 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4455  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  57.14 
 
 		 104 aa  96.7  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7733  ferredoxin III, nif-specific  46.43 
 
 		 100 aa  95.1  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1253  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  55.32 
 
 		 101 aa  95.1  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.908705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1885  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  49.46 
 
 		 99 aa  89.4  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.464709  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1354  ferredoxin III, nif-specific  49.45 
 
 		 102 aa  87.8  5e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2320  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  50 
 
 		 102 aa  80.9  0.000000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00672555  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4259  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  42.39 
 
 		 98 aa  80.9  0.000000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1802  ferredoxin III, nif-specific  48.89 
 
 		 97 aa  79  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1830  ferredoxin III, nif-specific  48.89 
 
 		 97 aa  79  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0633  ferredoxin III, nif-specific  42.35 
 
 		 89 aa  77.4  0.00000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3489  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  41.57 
 
 		 87 aa  76.3  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2643  ferredoxin III  46.59 
 
 		 97 aa  75.5  0.0000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.405945  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4805  ferredoxin III, nif-specific  46.74 
 
 		 98 aa  75.5  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.866548 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0238  ferredoxin, 4Fe-4S  43.18 
 
 		 102 aa  75.9  0.0000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.194696  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1475  hypothetical protein  46.07 
 
 		 101 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000320737 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1191  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  43.16 
 
 		 105 aa  73.9  0.0000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000682014 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2139  ferredoxin III, nif-specific  40 
 
 		 87 aa  70.9  0.000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00480151 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0445  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  46.74 
 
 		 97 aa  70.9  0.000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.16262 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2079  ferredoxin III, nif-specific  40 
 
 		 87 aa  70.9  0.000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0632  ferredoxin III, nif-specific  40.66 
 
 		 87 aa  67.4  0.00000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.531149  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1510  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  46.07 
 
 		 89 aa  65.9  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0672  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  37.35 
 
 		 87 aa  65.5  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.534446 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1203  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  38.37 
 
 		 87 aa  63.2  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0168328  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2804  ferredoxin family protein  34.48 
 
 		 87 aa  62  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2102  ferredoxin family protein  36.14 
 
 		 87 aa  60.1  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3025  ferredoxin III 4(4Fe-4S) nif-specific  34.57 
 
 		 87 aa  55.5  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3208  ferredoxin III, nif-specific  30.77 
 
 		 87 aa  54.7  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.478664  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1055  ferredoxin III, nif-specific  30.34 
 
 		 86 aa  54.7  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1972  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  30 
 
 		 229 aa  47.8  0.00006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.555312 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3563  aldo/keto reductase  35.38 
 
 		 315 aa  47  0.00009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000709753  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1091  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  34.78 
 
 		 437 aa  46.6  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.566886  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1717  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  34.09 
 
 		 369 aa  46.2  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.682287  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2122  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  31.33 
 
 		 421 aa  45.1  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00612142  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1695  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  46.77 
 
 		 67 aa  44.7  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0398493  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14300  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  36.11 
 
 		 331 aa  44.7  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  4.06573e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2297  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.33 
 
 		 378 aa  43.9  0.0007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3918  pyruvate flavodoxin/ferredoxin oxidoreductase domain protein  34.67 
 
 		 1212 aa  43.9  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0943  pyruvate-formate lyase-activating enzyme  33.33 
 
 		 318 aa  43.5  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0115559  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0685  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32.53 
 
 		 133 aa  43.1  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0694  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  33.8 
 
 		 267 aa  43.1  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.600892  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0531  pyruvate flavodoxin/ferredoxin oxidoreductase domain protein  31.51 
 
 		 1184 aa  42.4  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2376  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.23 
 
 		 984 aa  42.4  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1868  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  30.59 
 
 		 214 aa  42.7  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3966  pyruvate ferredoxin/flavodoxin oxidoreductase  31.08 
 
 		 1212 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0010778 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2333  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.23 
 
 		 984 aa  42.4  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4369  pyruvate flavodoxin/ferredoxin oxidoreductase domain protein  27.85 
 
 		 1193 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.278517 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0010  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.84 
 
 		 86 aa  42.4  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0811  heterodisulfide reductase subunit  31.94 
 
 		 659 aa  42  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000746765 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0708  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.88 
 
 		 393 aa  41.6  0.003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.748005 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0207  glycyl-radical activating family protein  37.1 
 
 		 306 aa  41.6  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1328  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  29.33 
 
 		 1007 aa  41.2  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0847  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  30.59 
 
 		 206 aa  41.6  0.004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.879675  normal  0.609652 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1261  pyruvate flavodoxin/ferredoxin oxidoreductase domain protein  32.88 
 
 		 1222 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0806  pyruvate flavodoxin/ferredoxin oxidoreductase domain-containing protein  32.39 
 
 		 1185 aa  41.6  0.004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0120918 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1210  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  28.38 
 
 		 393 aa  41.6  0.004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1208  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  38.16 
 
 		 252 aa  41.2  0.004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.226249  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1848  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  29.33 
 
 		 604 aa  41.6  0.004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.154193 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1334  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  29.41 
 
 		 368 aa  41.2  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0262596 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2127  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32.39 
 
 		 427 aa  41.2  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0285  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit F  34.72 
 
 		 340 aa  41.2  0.005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0862622  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2418  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.51 
 
 		 652 aa  41.2  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0799  pyruvate flavodoxin/ferredoxin oxidoreductase domain protein  32.14 
 
 		 1192 aa  41.2  0.005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.000076441  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1096  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  41.43 
 
 		 266 aa  40.8  0.006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0514529  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0639  NADH dehydrogenase I, 23 kDa subunit  29.41 
 
 		 200 aa  40.8  0.006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1569  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.48 
 
 		 431 aa  40.8  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.433482  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0774  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  26.39 
 
 		 394 aa  40.8  0.007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.290777  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3120  pyruvate flavodoxin/ferredoxin oxidoreductase-like protein  36.67 
 
 		 1178 aa  40.8  0.007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1309  dihydropyrimidine dehydrogenase  34.33 
 
 		 432 aa  40.8  0.007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01510  nitrogen fixation (4Fe-4S) ferredoxin-like protein  46.88 
 
 		 51 aa  40.8  0.007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.41732  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1924  NADH dehydrogenase subunit G  31.87 
 
 		 820 aa  40.4  0.007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0018513  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1556  NADH dehydrogenase subunit I  37.14 
 
 		 213 aa  40.4  0.008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000101443  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2219  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  28.24 
 
 		 373 aa  40.4  0.009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0300  pyruvate ferredoxin/flavodoxin oxidoreductase  33.33 
 
 		 1189 aa  40.4  0.009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0464  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.51 
 
 		 987 aa  40  0.01  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0625  aldo/keto reductase  33.33 
 
 		 377 aa  40  0.01  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0356812  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0477  hydrogenase large subunit  32.35 
 
 		 478 aa  40  0.01  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>