More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1549 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_1549  aldo/keto reductase  100 
 
 
326 aa  670    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.886416  normal  0.340196 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1683  aldo/keto reductase  83.08 
 
 
325 aa  573  1.0000000000000001e-162  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.891662  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6431  aldo/keto reductase  77.02 
 
 
324 aa  521  1e-147  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3544  aldo/keto reductase  73.23 
 
 
326 aa  511  1e-144  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.889794  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1746  putative oxidoreductase  75.46 
 
 
327 aa  508  1e-143  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0734648  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3835  aldo/keto reductase  73.23 
 
 
326 aa  509  1e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.256524  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2263  aldo/keto reductase  74.46 
 
 
326 aa  504  9.999999999999999e-143  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6739  aldo/keto reductase  72.42 
 
 
331 aa  499  1e-140  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4529  aldo/keto reductase  71.08 
 
 
326 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1321  aldo/keto reductase  70.86 
 
 
326 aa  489  1e-137  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.446153 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3336  aldo/keto reductase  72.62 
 
 
326 aa  485  1e-136  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0844  putative aldo/keto reductase  70.46 
 
 
326 aa  484  1e-135  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.76714  normal  0.025561 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1578  aldo/keto reductase  72.62 
 
 
326 aa  481  1e-135  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0491792  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4628  aldo/keto reductase  72 
 
 
326 aa  478  1e-134  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0836973  normal  0.048745 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5093  aldo/keto reductase  72 
 
 
326 aa  478  1e-134  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.271262  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0779  aldo/keto reductase  69.75 
 
 
326 aa  472  1e-132  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5167  aldo/keto reductase  72 
 
 
326 aa  473  1e-132  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3379  aldo/keto reductase  69.23 
 
 
325 aa  468  1.0000000000000001e-131  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.279162 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3956  aldo/keto reductase  68.92 
 
 
326 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.50864  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4419  aldo/keto reductase  69.23 
 
 
326 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216632  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3716  aldo/keto reductase  67.69 
 
 
322 aa  464  1e-129  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3842  aldo/keto reductase  70.15 
 
 
326 aa  462  1e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4526  aldo/keto reductase  70.15 
 
 
326 aa  462  1e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.150764  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2963  aldo/keto reductase  66.36 
 
 
331 aa  463  1e-129  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.947943 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4809  aldo/keto reductase  68 
 
 
330 aa  463  1e-129  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.419234  normal  0.447394 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5778  aldo/keto reductase  70.15 
 
 
326 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4129  aldo/keto reductase  71.17 
 
 
326 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0121527  normal  0.129693 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3370  aldo/keto reductase family oxidoreductase  66.06 
 
 
331 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.0071932  normal  0.188879 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1077  aldo/keto reductase  66.77 
 
 
324 aa  451  1.0000000000000001e-126  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000399165 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2388  aldo/keto reductase  66.06 
 
 
331 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0305  aldo/keto reductase  66.15 
 
 
346 aa  452  1.0000000000000001e-126  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0991975 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1790  aldo/keto reductase  64.24 
 
 
331 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0366045 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2556  aldo/keto reductase  65.76 
 
 
331 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1975  aldo/keto reductase  66.15 
 
 
332 aa  444  1e-123  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1876  aldo/keto reductase  64.62 
 
 
342 aa  441  1e-123  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3819  aldo/keto reductase  65.83 
 
 
326 aa  438  9.999999999999999e-123  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3082  aldo/keto reductase  63.83 
 
 
343 aa  439  9.999999999999999e-123  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0228208  normal  0.204358 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0110  aldo/keto reductase  65.35 
 
 
325 aa  437  1e-121  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.199403 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3237  aldo/keto reductase  63.58 
 
 
326 aa  435  1e-121  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3190  aldo/keto reductase  61.23 
 
 
324 aa  417  1e-116  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0455  aldo/keto reductase family oxidoreductase  61.23 
 
 
324 aa  418  1e-116  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3214  aldo/keto reductase  61.23 
 
 
324 aa  417  1e-116  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000166082 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00367  predicted oxidoreductase, NAD(P)-binding  60.92 
 
 
324 aa  414  9.999999999999999e-116  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0450  aldo/keto reductase family oxidoreductase  60.92 
 
 
324 aa  414  9.999999999999999e-116  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0502  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  60.92 
 
 
324 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00371  hypothetical protein  60.92 
 
 
324 aa  414  9.999999999999999e-116  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0340  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  60.92 
 
 
324 aa  416  9.999999999999999e-116  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0886  aldo/keto reductase  61.85 
 
 
324 aa  414  1e-114  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.472535  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0490  aldo/keto reductase family oxidoreductase  60.31 
 
 
324 aa  413  1e-114  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1994  aldo/keto reductase  62.42 
 
 
349 aa  409  1e-113  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000673515  normal  0.0830186 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6073  aldo/keto reductase  62.35 
 
 
328 aa  406  1.0000000000000001e-112  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.114042  normal  0.744467 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5669  aldo/keto reductase  61.85 
 
 
322 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.192891 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0481  putative aryl-alcohol dehydrogenase W  60.31 
 
 
324 aa  404  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0460  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  60.31 
 
 
324 aa  403  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0523  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  60 
 
 
324 aa  402  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6681  aldo/keto reductase  60.37 
 
 
349 aa  402  1e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.210539  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0462  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  60.31 
 
 
324 aa  403  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0468  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  60 
 
 
324 aa  400  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6124  aldo/keto reductase  62.61 
 
 
326 aa  400  9.999999999999999e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.516846  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02340  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  61.11 
 
 
336 aa  397  1e-109  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2761  aldo/keto reductase  60.49 
 
 
323 aa  393  1e-108  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0108  aldo/keto reductase  60 
 
 
334 aa  393  1e-108  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00484238 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3311  aldo/keto reductase  58.77 
 
 
322 aa  390  1e-107  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.917987  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3045  aldo/keto reductase  58.72 
 
 
326 aa  391  1e-107  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.686286  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5690  aldo/keto reductase  59.88 
 
 
326 aa  387  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0442358  normal  0.528688 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3378  aldo/keto reductase  58.61 
 
 
337 aa  385  1e-106  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6288  putative oxidoreductase  59.57 
 
 
324 aa  386  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128393  normal  0.0609657 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2324  aldo/keto reductase  59.52 
 
 
326 aa  381  1e-104  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.7501  hitchhiker  0.00552953 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1464  aldo/keto reductase  57.72 
 
 
326 aa  375  1e-103  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000207795  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4540  aldo/keto reductase  55.89 
 
 
332 aa  372  1e-102  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0617  aldo/keto reductase  56.84 
 
 
326 aa  368  1e-101  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.376815  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3129  aldo/keto reductase  55.69 
 
 
325 aa  366  1e-100  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0500  aldo/keto reductase  56.97 
 
 
332 aa  367  1e-100  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3381  aldo/keto reductase  55.96 
 
 
326 aa  358  5e-98  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.374111 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2226  aldo/keto reductase  54.89 
 
 
323 aa  352  4e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.555031 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42050  putative oxidoreductase  54.75 
 
 
323 aa  335  5.999999999999999e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18200  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  48.62 
 
 
351 aa  325  9e-88  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2991  aldo/keto reductase  52.6 
 
 
325 aa  320  3e-86  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2826  aldo/keto reductase  50.15 
 
 
340 aa  318  7.999999999999999e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3357  aldo/keto reductase  50.46 
 
 
326 aa  316  3e-85  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.152362  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1550  aldo/keto reductase  51.67 
 
 
324 aa  313  1.9999999999999998e-84  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2475  aldo/keto reductase  51.38 
 
 
327 aa  312  3.9999999999999997e-84  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2706  aldo/keto reductase  50.76 
 
 
325 aa  313  3.9999999999999997e-84  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.315446  normal  0.0513811 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6932  aldo/keto reductase  50.15 
 
 
345 aa  310  2e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.933917  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0434  aldo/keto reductase  52.13 
 
 
323 aa  310  2e-83  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0430  aldo/keto reductase  48.5 
 
 
326 aa  309  4e-83  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.542765  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2362  aldo/keto reductase  49.54 
 
 
324 aa  308  9e-83  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.167956 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2469  aldo/keto reductase  49.54 
 
 
348 aa  305  8.000000000000001e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1650  aldo/keto reductase  46.6 
 
 
339 aa  303  3.0000000000000004e-81  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1722  aldo/keto reductase family oxidoreductase  46.6 
 
 
339 aa  303  3.0000000000000004e-81  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0414871  hitchhiker  0.00103465 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1541  aldo/keto reductase family oxidoreductase  46.6 
 
 
339 aa  303  3.0000000000000004e-81  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0471  aldo/keto reductase  47.32 
 
 
337 aa  301  7.000000000000001e-81  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00023215  normal  0.05091 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3239  aldo/keto reductase  55.02 
 
 
364 aa  300  2e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.13922  normal  0.0117807 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0320  aldo/keto reductase  47.08 
 
 
337 aa  295  6e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1418  aldo/keto reductase  47.71 
 
 
324 aa  293  3e-78  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2875  aldo/keto reductase  49.24 
 
 
323 aa  293  3e-78  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.536931  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1533  aldo/keto reductase  49.24 
 
 
322 aa  290  3e-77  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.666942 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_09474  aldo-keto reductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G11260)  45.16 
 
 
348 aa  285  9e-76  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.266976  normal  0.0773831 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1005  aldo/keto reductase  48.47 
 
 
340 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1164  aldo/keto reductase  47.85 
 
 
323 aa  282  6.000000000000001e-75  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.123786 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>