More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1481 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_1481  nitrogen regulatory protein P-II  100 
 
 		 112 aa  222  1e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.19711 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3058  nitrogen regulatory protein P-II  77.68 
 
 		 112 aa  182  1.0000000000000001e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4832  nitrogen regulatory protein P-II  79.46 
 
 		 112 aa  182  2.0000000000000003e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4248  nitrogen regulatory protein P-II  77.68 
 
 		 112 aa  181  4.0000000000000006e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.415508  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0808  nitrogen regulatory protein P-II  75.89 
 
 		 112 aa  180  6e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0899844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1074  nitrogen regulatory protein P-II  77.68 
 
 		 112 aa  180  6e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0148  nitrogen regulatory protein P-II  75.89 
 
 		 112 aa  180  7e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2085  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  78.57 
 
 		 112 aa  179  8.000000000000001e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4381  nitrogen regulatory protein P-II  76.79 
 
 		 117 aa  179  2e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.647425  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4404  nitrogen regulatory protein P-II  76.79 
 
 		 117 aa  179  2e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.795902  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4397  nitrogen regulatory protein P-II  75.89 
 
 		 112 aa  178  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.467345 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0428  nitrogen regulatory protein P-II  79.46 
 
 		 112 aa  177  2.9999999999999997e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3243  nitrogen regulatory protein P-II  78.57 
 
 		 112 aa  178  2.9999999999999997e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.669306  normal  0.422234 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3586  nitrogen regulatory protein P-II  75.89 
 
 		 112 aa  177  4e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0323305  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1836  nitrogen regulatory protein P-II  74.11 
 
 		 112 aa  176  7e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0337137  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1351  nitrogen regulatory protein P-II  74.11 
 
 		 112 aa  176  9e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000771293  hitchhiker  0.0000000000923382 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4580  nitrogen regulatory protein P-II  77.68 
 
 		 112 aa  176  1e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.495708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1779  nitrogen regulatory protein P-II  75.89 
 
 		 112 aa  176  1e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.903734 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0146  nitrogen regulatory protein P-II  75.89 
 
 		 112 aa  176  1e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.220304  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1345  nitrogen regulatory protein P-II  75.89 
 
 		 112 aa  176  1e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.934318 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1545  nitrogen regulatory protein P-II  76.79 
 
 		 112 aa  176  1e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1005  nitrogen regulatory protein P-II  75.89 
 
 		 112 aa  175  2e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1760  nitrogen regulatory protein P-II  75 
 
 		 112 aa  174  2e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.654192  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0971  nitrogen regulatory protein P-II  75.89 
 
 		 112 aa  175  2e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.650891  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2088  nitrogen regulatory protein P-II  75.89 
 
 		 112 aa  175  2e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0485  nitrogen regulatory protein P-II  74.11 
 
 		 112 aa  175  2e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.65619  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3314  nitrogen regulatory protein P-II  76.79 
 
 		 112 aa  174  3e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.431384  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1507  nitrogen regulatory protein P-II  78.57 
 
 		 112 aa  174  3e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2387  nitrogen regulatory protein P-II  75.89 
 
 		 112 aa  174  3e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.344208 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4461  nitrogen regulatory protein P-II  74.11 
 
 		 112 aa  174  3e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.188449  normal  0.905473 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2900  nitrogen regulatory protein P-II  76.79 
 
 		 112 aa  174  3e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0642579  normal  0.0916709 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1680  nitrogen regulatory protein P-II  73.21 
 
 		 112 aa  174  3e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000892392  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0591  nitrogen regulatory protein P-II  74.11 
 
 		 112 aa  174  4e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.307832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0429  nitrogen regulatory protein P-II 1  74.11 
 
 		 112 aa  174  4e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.398049  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1516  nitrogen regulatory protein P-II  75 
 
 		 112 aa  174  4e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.14536 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2330  nitrogen regulatory protein P-II  76.79 
 
 		 112 aa  174  4e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.678822  normal  0.202545 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1885  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  74.11 
 
 		 112 aa  174  5e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.614675  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2709  nitrogen regulatory protein P-II  77.68 
 
 		 112 aa  173  6e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000195324 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5130  nitrogen regulatory protein P-II  76.79 
 
 		 112 aa  173  6e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.179689  normal  0.884639 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2651  nitrogen regulatory protein P-II  76.79 
 
 		 112 aa  173  6e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.614169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2374  nitrogen regulatory protein P-II  76.79 
 
 		 112 aa  173  6e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.261828  normal  0.353669 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0939  nitrogen regulatory protein P-II, putative  75.89 
 
 		 112 aa  173  8e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6587  nitrogen regulatory protein P-II  76.79 
 
 		 112 aa  173  8e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.490351 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2559  nitrogen regulatory protein P-II  75.89 
 
 		 112 aa  173  8e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.32282  normal  0.488626 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0132  nitrogen regulatory protein P-II  74.11 
 
 		 112 aa  172  9.999999999999999e-43  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000199717  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1109  nitrogen regulatory protein P-II  78.57 
 
 		 112 aa  172  9.999999999999999e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0303979  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1217  nitrogen regulatory protein P-II  75 
 
 		 112 aa  172  1.9999999999999998e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.967639 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1903  nitrogen regulatory protein P-II  75.89 
 
 		 112 aa  172  1.9999999999999998e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.88445  normal  0.529222 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3366  nitrogen regulatory protein P-II  75.89 
 
 		 112 aa  172  1.9999999999999998e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1291  nitrogen regulatory protein P-II  72.32 
 
 		 112 aa  171  2.9999999999999996e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.230659 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1388  nitrogen regulatory protein P-II  75.89 
 
 		 112 aa  171  2.9999999999999996e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.258506  normal  0.939142 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2376  nitrogen regulatory protein PII  75 
 
 		 112 aa  171  2.9999999999999996e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0285666  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1879  nitrogen regulatory protein P-II  71.43 
 
 		 112 aa  171  2.9999999999999996e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000257329  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7409  nitrogen regulatory protein P-II  75.89 
 
 		 112 aa  171  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.394693  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3649  nitrogen regulatory protein P-II 1  73.21 
 
 		 112 aa  171  3.9999999999999995e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0694  nitrogen regulatory protein P-II  75 
 
 		 112 aa  171  3.9999999999999995e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.804518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3078  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 		 112 aa  171  3.9999999999999995e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000004264  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1183  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 		 112 aa  171  3.9999999999999995e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000414961 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2233  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  75 
 
 		 112 aa  170  5e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0532084  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0234  nitrogen regulatory protein P-II  72.32 
 
 		 112 aa  170  5.999999999999999e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000834653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0472  nitrogen regulatory protein P-II  73.21 
 
 		 112 aa  169  9e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0782781  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1737  nitrogen regulatory protein P-II  75 
 
 		 112 aa  169  9e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0595912  normal  0.82137 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1090  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 		 112 aa  169  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0228645  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1155  nitrogen regulatory protein P-II 1  72.32 
 
 		 112 aa  169  1e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.717243  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0742  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 		 112 aa  169  1e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0306564  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3013  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 		 112 aa  169  1e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00180505  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2767  nitrogen regulatory protein P-II  73.21 
 
 		 112 aa  169  1e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1243  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 		 112 aa  169  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.50478  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2271  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 		 112 aa  169  1e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1262  nitrogen regulatory protein P-II 1  72.32 
 
 		 112 aa  169  1e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.297918  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0883  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 		 112 aa  169  1e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3631  nitrogen regulatory protein P-II 1  72.32 
 
 		 112 aa  169  1e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1921  nitrogen regulatory protein P-II  74.11 
 
 		 112 aa  169  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1085  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 		 112 aa  169  1e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.260987  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1584  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 		 112 aa  169  1e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.138814  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1331  nitrogen regulatory protein P-II  72.32 
 
 		 112 aa  169  2e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.311288  normal  0.632434 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3048  nitrogen regulatory protein P-II 1  72.32 
 
 		 112 aa  167  3e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1831  nitrogen regulatory protein P-II  72.32 
 
 		 114 aa  168  3e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1118  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 		 112 aa  167  3e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0472  nitrogen regulatory protein P-II  72.32 
 
 		 112 aa  167  4e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1086  nitrogen regulatory protein P-II  72.32 
 
 		 112 aa  167  4e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1227  nitrogen regulatory protein P-II 1  71.43 
 
 		 112 aa  167  5e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1206  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 		 112 aa  167  5e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0969  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 		 112 aa  167  5e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.916041  hitchhiker  0.000334887 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0047  nitrogen regulatory protein P-II  67.86 
 
 		 112 aa  167  6e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000287221  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1069  nitrogen regulatory protein P-II  69.64 
 
 		 112 aa  166  7e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.607168  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0232  nitrogen regulatory protein P-II  71.43 
 
 		 112 aa  166  7e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0312248  normal  0.530475 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1133  nitrogen regulatory protein P-II  69.64 
 
 		 112 aa  166  7e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3223  nitrogen regulatory protein P-II  69.64 
 
 		 112 aa  166  7e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.808026  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3519  nitrogen regulatory protein P-II 1  70.54 
 
 		 112 aa  166  8e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3124  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 		 112 aa  166  8e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.473866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2945  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 		 112 aa  166  8e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0214654  normal  0.391037 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3027  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 		 112 aa  166  8e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.749503 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0080  nitrogen regulatory protein P-II  68.75 
 
 		 112 aa  166  8e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.416357  normal  0.780104 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1303  nitrogen regulatory protein P-II  69.64 
 
 		 112 aa  166  1e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.539571 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1071  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 		 112 aa  166  1e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0291  nitrogen regulatory protein P-II  69.64 
 
 		 112 aa  166  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0523  nitrogen regulatory protein P-II  69.64 
 
 		 112 aa  166  1e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.278087  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0935  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 		 112 aa  166  1e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0360863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2866  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 		 136 aa  166  1e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00138557  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>