More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1428 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_1428  L-aspartate oxidase  100 
 
 
518 aa  989    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2556  L-aspartate oxidase  54.51 
 
 
517 aa  454  1.0000000000000001e-126  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.819089  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4756  L-aspartate oxidase  53.66 
 
 
517 aa  438  9.999999999999999e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.127906  normal  0.41512 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0296  L-aspartate oxidase  55.28 
 
 
506 aa  421  1e-116  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.119811 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2216  L-aspartate oxidase  51.09 
 
 
516 aa  417  9.999999999999999e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.677644  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6034  L-aspartate oxidase  52.01 
 
 
519 aa  415  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.536224 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2425  L-aspartate oxidase  52.43 
 
 
509 aa  411  1e-113  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0629717 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3493  L-aspartate oxidase  52.25 
 
 
522 aa  409  1e-113  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.356511  normal  0.208619 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2820  L-aspartate oxidase  52.82 
 
 
506 aa  411  1e-113  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0921  L-aspartate oxidase  48.23 
 
 
512 aa  397  1e-109  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0169  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  52 
 
 
499 aa  388  1e-106  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.774631  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2645  L-aspartate oxidase  50.42 
 
 
509 aa  384  1e-105  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.363575 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0733  L-aspartate oxidase  48.81 
 
 
537 aa  383  1e-105  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2871  L-aspartate oxidase  50.75 
 
 
509 aa  381  1e-104  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.118629  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1044  L-aspartate oxidase  47.81 
 
 
512 aa  377  1e-103  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.938369  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2249  L-aspartate oxidase  47.48 
 
 
531 aa  374  1e-102  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0430  L-aspartate oxidase  51.22 
 
 
502 aa  374  1e-102  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7189  L-aspartate oxidase  51.63 
 
 
513 aa  372  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.901371  normal  0.0177841 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2768  L-aspartate oxidase  51.47 
 
 
509 aa  365  1e-99  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.583341  normal  0.352041 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4339  L-aspartate oxidase  44.29 
 
 
534 aa  365  1e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.348419  normal  0.0986789 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1228  L-aspartate oxidase  45.69 
 
 
539 aa  363  5.0000000000000005e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.653188 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1182  L-aspartate oxidase  51.05 
 
 
513 aa  362  1e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4590  L-aspartate oxidase  51.43 
 
 
500 aa  359  7e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.125336  normal  0.0648485 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1542  L-aspartate oxidase  53.88 
 
 
501 aa  355  1e-96  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.330022  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1106  L-aspartate oxidase  45.29 
 
 
540 aa  352  1e-95  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0700  L-aspartate oxidase  44.16 
 
 
532 aa  350  4e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.130926  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1246  L-aspartate oxidase  44.4 
 
 
538 aa  344  2.9999999999999997e-93  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4431  L-aspartate oxidase  45.81 
 
 
521 aa  340  2.9999999999999998e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3424  L-aspartate oxidase  44.01 
 
 
847 aa  332  1e-89  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.714369  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1433  L-aspartate oxidase  46.68 
 
 
532 aa  329  6e-89  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0213  L-aspartate oxidase  45.94 
 
 
548 aa  322  9.999999999999999e-87  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.145833 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0157  L-aspartate oxidase  40.68 
 
 
541 aa  321  1.9999999999999998e-86  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000204171  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1873  L-aspartate oxidase  42.5 
 
 
529 aa  321  1.9999999999999998e-86  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2445  L-aspartate oxidase  40.95 
 
 
571 aa  319  7e-86  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.848837 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0462  L-aspartate oxidase  43.24 
 
 
575 aa  318  1e-85  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1164  aspartate oxidase  42.23 
 
 
515 aa  317  4e-85  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000105405  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9157  Aspartate oxidase-like protein  42.91 
 
 
863 aa  316  5e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.15159  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2251  L-aspartate oxidase  37.19 
 
 
535 aa  317  5e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00695711 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4309  L-aspartate oxidase  49.25 
 
 
506 aa  316  5e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5464  L-aspartate oxidase  48.55 
 
 
507 aa  315  9.999999999999999e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.179513  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1193  L-aspartate oxidase  42.23 
 
 
515 aa  315  1.9999999999999998e-84  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00735813  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0678  L-aspartate oxidase  37.98 
 
 
525 aa  315  1.9999999999999998e-84  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0449  L-aspartate oxidase  41.96 
 
 
556 aa  314  2.9999999999999996e-84  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0392  L-aspartate oxidase  40.45 
 
 
565 aa  313  4.999999999999999e-84  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0242  aspartate oxidase  40 
 
 
543 aa  311  1e-83  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.032501  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2355  L-aspartate oxidase  37.16 
 
 
532 aa  309  6.999999999999999e-83  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.730681  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0753  L-aspartate oxidase  38.1 
 
 
542 aa  309  1.0000000000000001e-82  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0164  L-aspartate oxidase  39.45 
 
 
528 aa  308  2.0000000000000002e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0105  L-aspartate oxidase  39.88 
 
 
533 aa  306  7e-82  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2375  L-aspartate oxidase  41.45 
 
 
559 aa  305  2.0000000000000002e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2883  L-aspartate oxidase  44.21 
 
 
867 aa  305  2.0000000000000002e-81  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.401949  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00630  L-aspartate oxidase  37.77 
 
 
532 aa  304  3.0000000000000004e-81  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4485  L-aspartate oxidase  44.2 
 
 
545 aa  303  7.000000000000001e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2309  L-aspartate oxidase  41.81 
 
 
507 aa  303  7.000000000000001e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.114896  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2250  L-aspartate oxidase  40.52 
 
 
522 aa  302  9e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1881  L-aspartate oxidase  41.23 
 
 
550 aa  300  3e-80  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.756332  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0636  L-aspartate oxidase  41.24 
 
 
609 aa  299  8e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.174596 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31990  L-aspartate oxidase  40.82 
 
 
577 aa  299  1e-79  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0917  L-aspartate oxidase  40.55 
 
 
513 aa  298  2e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2531  L-aspartate oxidase  38.14 
 
 
516 aa  296  6e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1974  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  37.79 
 
 
472 aa  295  1e-78  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1213  L-aspartate oxidase  36.84 
 
 
538 aa  295  1e-78  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0621913  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3479  L-aspartate oxidase  37.27 
 
 
534 aa  294  3e-78  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0695  L-aspartate oxidase  39.33 
 
 
557 aa  292  8e-78  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8381  L-aspartate oxidase  41.01 
 
 
557 aa  292  8e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.613382  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0723  L-aspartate oxidase  39.19 
 
 
558 aa  293  8e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.223761  normal  0.156975 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0122  L-aspartate oxidase  41.08 
 
 
538 aa  291  1e-77  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.028832  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0198  L-aspartate oxidase  41.54 
 
 
598 aa  290  4e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.512672 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0702  L-aspartate oxidase  37.57 
 
 
531 aa  289  8e-77  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000765394  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4548  L-aspartate oxidase  36.42 
 
 
509 aa  288  1e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000596043  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0637  L-aspartate oxidase  44.66 
 
 
572 aa  287  2.9999999999999996e-76  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.420562  normal  0.605731 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0687  L-aspartate oxidase  36.22 
 
 
509 aa  287  4e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.258293  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1270  L-aspartate oxidase  38.43 
 
 
545 aa  286  5.999999999999999e-76  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4280  L-aspartate oxidase  41.99 
 
 
572 aa  284  2.0000000000000002e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.293184 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0811  L-aspartate oxidase  37.3 
 
 
531 aa  284  2.0000000000000002e-75  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00614841  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1306  L-aspartate oxidase  40 
 
 
533 aa  283  4.0000000000000003e-75  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.821759  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0790  L-aspartate oxidase  42.08 
 
 
547 aa  283  4.0000000000000003e-75  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0247057 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2477  L-aspartate oxidase  43.38 
 
 
503 aa  283  5.000000000000001e-75  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0634  L-aspartate oxidase  43.09 
 
 
558 aa  282  9e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4982  L-aspartate oxidase  43.96 
 
 
872 aa  282  9e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.139304  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1773  L-aspartate oxidase  43.84 
 
 
556 aa  282  9e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0853691  normal  0.2283 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2296  L-aspartate oxidase  41.89 
 
 
550 aa  281  2e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000882824 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2374  L-aspartate oxidase  39.32 
 
 
558 aa  281  2e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.919868  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4327  L-aspartate oxidase  36.09 
 
 
509 aa  280  3e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000167292  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4662  L-aspartate oxidase  36.09 
 
 
509 aa  280  3e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0290416  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0565  L-aspartate oxidase  36.04 
 
 
537 aa  280  4e-74  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.222565 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0525  L-aspartate oxidase  37.77 
 
 
531 aa  280  4e-74  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.191357  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1756  L-aspartate oxidase  44.62 
 
 
502 aa  280  5e-74  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.863927  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4276  L-aspartate oxidase  35.98 
 
 
519 aa  280  5e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000385581  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01161  L-aspartate oxidase  35.82 
 
 
555 aa  280  6e-74  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.546098  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02181  L-aspartate oxidase  38.3 
 
 
556 aa  280  6e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4510  L-aspartate oxidase  36.14 
 
 
509 aa  278  1e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.191844 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4175  L-aspartate oxidase  35.24 
 
 
509 aa  279  1e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00304289  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01151  L-aspartate oxidase  35.63 
 
 
555 aa  278  1e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4563  L-aspartate oxidase  36.27 
 
 
509 aa  277  3e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4164  L-aspartate oxidase  35.81 
 
 
509 aa  277  4e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1322  L-aspartate oxidase  38.28 
 
 
532 aa  276  4e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1793  L-aspartate oxidase  38.35 
 
 
483 aa  277  4e-73  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.406  normal  0.410879 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3067  L-aspartate oxidase  42.2 
 
 
548 aa  276  9e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.117293  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3127  L-aspartate oxidase  42.2 
 
 
548 aa  276  9e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.513503 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>