More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1419 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_1419  Methyltransferase type 11  100 
 
 
256 aa  508  1e-143  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2088  methyltransferase type 11  52.42 
 
 
258 aa  262  4.999999999999999e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1550  methyltransferase type 11  53.19 
 
 
254 aa  251  6e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.326399 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2014  hypothetical protein  54.24 
 
 
253 aa  249  4e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00388646  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1891  Methyltransferase type 11  49.39 
 
 
255 aa  248  5e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.742505  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1987  UbiE/COQ5 family methlytransferase  52.34 
 
 
254 aa  248  8e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.199411  hitchhiker  0.00854034 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0336  methyltransferase type 11  54.03 
 
 
261 aa  246  4e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.549644  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1518  methyltransferase type 11  52.34 
 
 
254 aa  244  6.999999999999999e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.349113  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5294  Methyltransferase type 11  55.14 
 
 
259 aa  244  8e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.570437 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3772  methyltransferase type 11  51.27 
 
 
254 aa  243  3e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4752  methyltransferase type 11  55.14 
 
 
259 aa  242  3e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.302185  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0249  Methyltransferase type 11  52.42 
 
 
260 aa  242  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0220437  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3293  Methyltransferase type 11  45.31 
 
 
257 aa  241  7e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5219  Methyltransferase type 11  55.14 
 
 
259 aa  241  7e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0306756 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1891  UbiE/COQ5 methyltransferase  48.97 
 
 
255 aa  240  2e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249773  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2729  SAM-dependent methyltransferase  49.03 
 
 
264 aa  239  2.9999999999999997e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.88464  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5564  methyltransferase type 11  58.55 
 
 
258 aa  236  2e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.917981  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1008  methyltransferase type 11  49.59 
 
 
256 aa  234  8e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0529  methyltransferase type 11  49.79 
 
 
256 aa  233  2.0000000000000002e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.544475  hitchhiker  0.0000501952 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0215  UbiE/COQ5 family methlytransferase  48.51 
 
 
256 aa  232  6e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.383656  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0224  UbiE/COQ5 family methlytransferase  48.51 
 
 
256 aa  231  6e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.234424  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02611  methyltransferase in menaquinone/biotin biosynthesis  49.18 
 
 
261 aa  231  7.000000000000001e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0744  methyltransferase type 11  47.88 
 
 
256 aa  231  8.000000000000001e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0214  UbiE/COQ5 family methlytransferase  48.09 
 
 
256 aa  230  2e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00594444  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0289  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  47.88 
 
 
256 aa  229  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.911114 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0282  UbiE/COQ5 family methyltransferase  47.46 
 
 
256 aa  229  4e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.986318 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0284  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  47.88 
 
 
256 aa  228  7e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0222  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  48.09 
 
 
256 aa  228  1e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.188409  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3440  Methyltransferase type 11  46.47 
 
 
256 aa  227  2e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0303  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  47.46 
 
 
256 aa  227  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0297  UbiE/COQ5 family methyltransferase  47.46 
 
 
256 aa  226  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.378405  normal  0.771638 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1067  Methyltransferase type 11  48.93 
 
 
250 aa  218  5e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3930  Methyltransferase type 11  52.05 
 
 
250 aa  219  5e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.56855 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4043  Methyltransferase type 11  52.05 
 
 
250 aa  219  5e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2181  methyltransferase type 11  50.21 
 
 
250 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0100856 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2361  methyltransferase type 11  50.61 
 
 
254 aa  212  5.999999999999999e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0504616  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0870  UbiE/COQ5 family methlytransferase  50 
 
 
251 aa  211  9e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.61862  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3413  putative methyltransferase  49.79 
 
 
250 aa  211  9e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.673339  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2431  methyltransferase type 11  48.93 
 
 
250 aa  210  1e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.508094 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5754  UbiE/COQ5 methyltransferase  49.36 
 
 
250 aa  211  1e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.767556 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1815  methyltransferase type 11  48.93 
 
 
250 aa  210  2e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2427  methyltransferase type 11  48.93 
 
 
250 aa  210  2e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.992518  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0587  UbiE/COQ5 methyltransferase  47.22 
 
 
261 aa  209  3e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.846793  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0623  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  47.44 
 
 
254 aa  208  8e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0774  Methyltransferase type 11  47.44 
 
 
254 aa  208  8e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2470  methyltransferase type 11  48.5 
 
 
250 aa  205  5e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.28485  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0867  methyltransferase type 11  48.5 
 
 
250 aa  204  8e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.873465  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2336  methyltransferase type 11  47.21 
 
 
250 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.223131 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1227  UbiE/COQ5 family methlytransferase  49.58 
 
 
251 aa  195  7e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.177857  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1074  UbiE/COQ5 family methlytransferase  49.58 
 
 
251 aa  195  7e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1068  UbiE/COQ5 family methlytransferase  49.15 
 
 
251 aa  192  3e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2997  UbiE/COQ5 family methlytransferase  48.73 
 
 
251 aa  191  1e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1602  UbiE/COQ5 family methlytransferase  48.73 
 
 
251 aa  191  1e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2288  UbiE/COQ5 family methlytransferase  48.73 
 
 
251 aa  191  1e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.508663  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0726  UbiE/COQ5 family methlytransferase  48.73 
 
 
251 aa  191  1e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.195115  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23770  putative biotin synthesis protein  54.19 
 
 
187 aa  188  5.999999999999999e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0761957 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3398  Methyltransferase type 11  47.69 
 
 
207 aa  187  2e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00203  predicted S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  47.18 
 
 
207 aa  186  4e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.224373  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00208  hypothetical protein  47.18 
 
 
207 aa  186  4e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.203955  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3455  methyltransferase type 11  46.67 
 
 
207 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.915003  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3145  hypothetical protein  45.56 
 
 
204 aa  179  4.999999999999999e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.725921  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0206  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  45.64 
 
 
207 aa  178  5.999999999999999e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3296  hypothetical protein  45.56 
 
 
212 aa  177  2e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.114197  normal  0.0687983 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3284  methyltransferase type 11  47.24 
 
 
173 aa  168  8e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.859694  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2695  UbiE/COQ5 family methlytransferase  32.73 
 
 
258 aa  144  1e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0592543  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2644  methyltransferase  32.73 
 
 
261 aa  144  1e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0423484  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2890  UbiE/COQ5 family methlytransferase  32.73 
 
 
258 aa  144  1e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.143428  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2621  methyltransferase  32.27 
 
 
261 aa  144  2e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.548426  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2893  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  33.66 
 
 
261 aa  142  4e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000234775 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2339  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  31.28 
 
 
261 aa  142  8e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00260847 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2906  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  31.28 
 
 
261 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2929  UbiE/COQ5 family methlytransferase  33.66 
 
 
261 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00250227  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2941  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  31.82 
 
 
261 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000113284  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2697  methyltransferase type 11  32.88 
 
 
264 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.147687  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1066  putative methyltransferase  32.5 
 
 
273 aa  122  5e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000495873  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0301  UbiE/COQ5 family methlytransferase  31.63 
 
 
257 aa  103  3e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0798  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.86 
 
 
259 aa  88.6  8e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.350389 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4556  methyltransferase type 11  41.13 
 
 
253 aa  80.1  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.197949 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0167  Methyltransferase type 11  37.68 
 
 
281 aa  74.3  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2332  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  37.93 
 
 
245 aa  73.9  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4343  Methyltransferase type 11  41.24 
 
 
415 aa  73.9  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.414925  normal  0.473204 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1168  Methyltransferase type 11  41.01 
 
 
267 aa  72.8  0.000000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0164  UbiE/COQ5 family methlytransferase  29.66 
 
 
207 aa  72.4  0.000000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1338  methyltransferase type 11  33.13 
 
 
182 aa  72.4  0.000000000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.632057  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2395  Methyltransferase type 11  39.06 
 
 
208 aa  71.6  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000965249  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1848  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  35.15 
 
 
282 aa  71.2  0.00000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.329247 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0272  methyltransferase type 11  37.24 
 
 
182 aa  71.6  0.00000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3572  Methyltransferase type 11  40.43 
 
 
270 aa  71.6  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1327  methyltransferase  33.33 
 
 
258 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0582471  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1228  arsenite S-adenosylmethyltransferase  34.86 
 
 
277 aa  70.1  0.00000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0364  methyltransferase type 11  28.93 
 
 
211 aa  70.1  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.617778  normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12248  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.7 
 
 
244 aa  69.7  0.00000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0461  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  33.33 
 
 
251 aa  69.3  0.00000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3752  Methyltransferase type 11  33.71 
 
 
259 aa  69.7  0.00000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.51014  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0475  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  38.1 
 
 
251 aa  69.7  0.00000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1190  methyltransferase type 11  35.65 
 
 
209 aa  69.3  0.00000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776895  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0168  UbiE/COQ5 family methlytransferase  28.81 
 
 
207 aa  68.9  0.00000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1420  arsenite S-adenosylmethyltransferase  35.58 
 
 
280 aa  68.6  0.00000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1202  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  35.24 
 
 
277 aa  68.2  0.0000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0762  arsenite S-adenosylmethyltransferase  33.33 
 
 
266 aa  68.2  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000040613  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>