More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1389 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_1389  aminotransferase class V  100 
 
 		 491 aa  988    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2103  aminotransferase, class V  60.54 
 
 		 474 aa  520  1e-146  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0409  aminotransferase, class V  57.06 
 
 		 473 aa  493  9.999999999999999e-139  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.950818 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3637  aminotransferase class V  44.21 
 
 		 570 aa  384  1e-105  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1443  aminotransferase class V  42.52 
 
 		 557 aa  382  1e-104  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2695  aminotransferase, class V  43.15 
 
 		 570 aa  354  2e-96  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.370695  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0469  aminotransferase, class V  42.97 
 
 		 551 aa  317  3e-85  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3497  aminotransferase class V  43.87 
 
 		 573 aa  314  1.9999999999999998e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3433  aminotransferase class V  44.09 
 
 		 568 aa  314  2.9999999999999996e-84  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3351  aminotransferase, putative  43.87 
 
 		 570 aa  312  6.999999999999999e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2548  aminotransferase class V  37.26 
 
 		 499 aa  311  2e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3419  aminotransferase class V  41.7 
 
 		 571 aa  309  8e-83  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.421633  normal  0.0439943 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1625  aminotransferase class V  34.8 
 
 		 499 aa  284  2.0000000000000002e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39592  predicted protein  41.12 
 
 		 495 aa  284  2.0000000000000002e-75  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.342463  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2795  aminotransferase, class V  32.84 
 
 		 495 aa  270  4e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.691488  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3990  aminotransferase, class V  32.27 
 
 		 494 aa  268  2e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.941199  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2014  aminotransferase, class V  32.22 
 
 		 502 aa  265  1e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3175  aminotransferase class V  34.03 
 
 		 492 aa  264  3e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0634  aminotransferase class V  33.26 
 
 		 421 aa  227  4e-58  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0214  putative aminotransferase  33.18 
 
 		 441 aa  220  3.9999999999999997e-56  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0398  tetrahydrodipicolinate N-succinyltransferase  32.12 
 
 		 442 aa  216  8e-55  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1236  putative aminotransferase  29.75 
 
 		 426 aa  208  2e-52  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0160  putative aminotransferase  31.69 
 
 		 442 aa  207  3e-52  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.73602  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0593  conserved hypothetical protein, putative NifS-like aminotransferase  31.35 
 
 		 421 aa  200  6e-50  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000000269729  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1221  aminotransferase, putative  30.28 
 
 		 422 aa  192  1e-47  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0882  aminotransferase, putative  30.05 
 
 		 422 aa  189  1e-46  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0812  aminotransferase, putative  30.05 
 
 		 422 aa  188  2e-46  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.4562  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0080  putative aminotransferase  29.18 
 
 		 433 aa  183  6e-45  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0692072  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2656  Cysteine desulfurase  30.7 
 
 		 501 aa  164  4.0000000000000004e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.596375  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20010  Cysteine desulfurase  26.57 
 
 		 442 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000584034  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1448  aminotransferase, class V  26.63 
 
 		 428 aa  115  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.457541  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1720  aminotransferase, class V  26.91 
 
 		 428 aa  113  6e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.116446  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0811  Cysteine desulfurase  26.88 
 
 		 452 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1295  aminotransferase class V  30.63 
 
 		 430 aa  108  3e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.35338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2429  cysteine desulfurase  25.37 
 
 		 470 aa  105  1e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2356  SufS subfamily cysteine desulfurase  31.44 
 
 		 406 aa  105  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1465  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.4 
 
 		 413 aa  102  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.204095  normal  0.0534707 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1322  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.4 
 
 		 439 aa  103  1e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1249  cysteine desulfurase  28.61 
 
 		 406 aa  102  1e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.491768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1778  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.13 
 
 		 413 aa  102  1e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.169204  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3970  SufS subfamily cysteine desulfurase  31.48 
 
 		 403 aa  102  1e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.615432  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0536  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.08 
 
 		 416 aa  102  1e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0431  putative selenocysteine lyase  30.63 
 
 		 406 aa  101  3e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2088  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.63 
 
 		 406 aa  100  5e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.519115 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0653  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.12 
 
 		 408 aa  99.8  1e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3072  cysteine desulfurase, SufS subfamily  26.49 
 
 		 406 aa  99  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0735  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.08 
 
 		 403 aa  98.2  3e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2103  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.17 
 
 		 413 aa  98.2  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.105912 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2389  Cysteine desulfurase  28.47 
 
 		 472 aa  97.8  4e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000376862 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.82 
 
 		 413 aa  97.8  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00682669 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1896  aminotransferase, class V  28.31 
 
 		 404 aa  97.8  4e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2656  cysteine desulfurase  28.77 
 
 		 470 aa  97.4  4e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0497  SufS subfamily cysteine desulfurase  25.53 
 
 		 414 aa  97.8  4e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2006  cysteine desulphurases, SufS  27.78 
 
 		 395 aa  97.4  5e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2252  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.08 
 
 		 414 aa  97.4  6e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.766677  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1696  cysteine desulfurase, SufS subfamily  26.84 
 
 		 417 aa  95.9  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2844  cysteine desulfurase  26.44 
 
 		 460 aa  95.9  2e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0988  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.56 
 
 		 410 aa  95.5  2e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.699231  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3352  cysteine desulfurase, SufS subfamily  25.52 
 
 		 415 aa  95.5  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.143815 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2440  aminotransferase  27.86 
 
 		 416 aa  95.1  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2777  aminotransferase, class V  28.53 
 
 		 409 aa  95.5  2e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1041  aminotransferase, class V  27.13 
 
 		 878 aa  95.5  2e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.31514  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3281  cysteine desulfurase, SufS subfamily  26.7 
 
 		 429 aa  94.7  3e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.30955  normal  0.0478783 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2267  cysteine desulfurase, SufS subfamily  26.61 
 
 		 418 aa  94.7  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.53875 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0698  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.89 
 
 		 414 aa  95.1  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.13787  normal  0.199911 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1122  hypothetical protein  29.28 
 
 		 879 aa  94.7  3e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5845  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.89 
 
 		 413 aa  94.4  4e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.187018  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0101  SufS subfamily cysteine desulfurase  25.98 
 
 		 414 aa  94.4  4e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.724967 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4466  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.64 
 
 		 419 aa  94.4  4e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.523936 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2921  cysteine desulfurase, SufS subfamily  26.6 
 
 		 406 aa  94.4  4e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0220  aminotransferase (class V), putative  27.46 
 
 		 410 aa  94  5e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2068  aminotransferase, class V  23.96 
 
 		 392 aa  93.6  7e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2036  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  24.16 
 
 		 408 aa  93.6  7e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0813  cysteine desulfurase SufS  27.47 
 
 		 414 aa  93.6  7e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0265605  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1968  cysteine desulfurase  26.8 
 
 		 421 aa  93.6  8e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.187156 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1623  cysteine desulfurase  26.51 
 
 		 406 aa  93.6  8e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0344832 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3154  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.86 
 
 		 417 aa  93.6  8e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0928  aminotransferase, class V  27.89 
 
 		 414 aa  92.8  1e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.870705  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0934  aminotransferase, class V  28.16 
 
 		 414 aa  92.8  1e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.603819  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0087  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.94 
 
 		 420 aa  93.2  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.595541  normal  0.828259 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3037  cysteine desulfurase, SufS subfamily  26.51 
 
 		 404 aa  93.2  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0138624 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2355  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.24 
 
 		 407 aa  92.4  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.331891  normal  0.378457 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0143  selenocysteine lyase  28.46 
 
 		 410 aa  91.3  3e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2959  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.64 
 
 		 433 aa  91.7  3e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2506  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.21 
 
 		 421 aa  91.3  4e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2570  cysteine desulfurase  27.72 
 
 		 422 aa  91.3  4e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1144  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.57 
 
 		 432 aa  91.3  4e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0048  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.55 
 
 		 413 aa  90.9  4e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3259  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.76 
 
 		 414 aa  90.9  4e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.797453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2054  aminotransferase, class V  29.27 
 
 		 880 aa  90.9  5e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.754406 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  26.77 
 
 		 429 aa  90.5  6e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.825531  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0892  cysteine desulfurase, SufS subfamily  26.73 
 
 		 429 aa  90.5  6e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1112  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  26.41 
 
 		 417 aa  90.5  6e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.966588  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5106  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.83 
 
 		 413 aa  90.5  7e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0201229 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002694  cysteine desulfurase  26.39 
 
 		 403 aa  90.5  7e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4340  aminotransferase class V  27.68 
 
 		 403 aa  89.4  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.390649  normal  0.485462 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2219  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  30.91 
 
 		 885 aa  89.7  1e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.911418 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1215  aminotransferase class V  26.5 
 
 		 393 aa  89.4  1e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0845  SufS subfamily cysteine desulfurase  24.27 
 
 		 413 aa  89  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0861  SufS subfamily cysteine desulfurase  24.27 
 
 		 413 aa  89  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.762782  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>