More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1302 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_1302  nitrogen regulatory protein P-II  100 
 
 		 112 aa  221  2e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.54202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1130  nitrogen regulatory protein P-II  69.64 
 
 		 112 aa  166  1e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0523  nitrogen regulatory protein P-II  68.75 
 
 		 112 aa  163  8e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.278087  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0594  nitrogen regulatory protein P-II  69.64 
 
 		 112 aa  162  1.0000000000000001e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0433  nitrogen regulatory protein P-II  69.64 
 
 		 112 aa  161  2.0000000000000002e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0037358  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2406  nitrogen regulatory protein P-II  66.96 
 
 		 112 aa  162  2.0000000000000002e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2044  nitrogen regulatory protein P-II  68.75 
 
 		 112 aa  160  6e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0302  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 		 112 aa  160  8.000000000000001e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3656  nitrogen regulatory protein P-II  69.44 
 
 		 112 aa  159  1e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1060  nitrogen regulatory protein P-II 2  66.07 
 
 		 112 aa  158  2e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2865  nitrogen regulatory protein P-II 2  66.07 
 
 		 112 aa  158  2e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3078  nitrogen regulatory protein P-II 2  66.07 
 
 		 112 aa  158  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3057  nitrogen regulatory protein P-II 2  66.07 
 
 		 112 aa  158  2e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3039  nitrogen regulatory protein P-II 2  66.07 
 
 		 112 aa  158  2e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.437205 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3251  nitrogen regulatory protein P-II 2  66.07 
 
 		 112 aa  158  2e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.534488  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0080  nitrogen regulatory protein P-II  66.96 
 
 		 112 aa  159  2e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.416357  normal  0.780104 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3220  nitrogen regulatory protein P-II 2  66.07 
 
 		 112 aa  158  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00402  nitrogen assimilation regulatory protein for GlnL, GlnE, and AmtB  66.96 
 
 		 112 aa  157  4e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3159  nitrogen regulatory protein P-II  66.96 
 
 		 112 aa  157  4e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0486  nitrogen regulatory protein P-II 2  66.96 
 
 		 112 aa  157  4e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0494  nitrogen regulatory protein P-II 2  66.96 
 
 		 112 aa  157  4e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0527  nitrogen regulatory protein P-II 2  66.96 
 
 		 112 aa  157  4e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1109  nitrogen regulatory protein P-II 2  65.18 
 
 		 112 aa  157  4e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0216976  hitchhiker  0.00000214142 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0377  nitrogen regulatory protein P-II 2  66.96 
 
 		 112 aa  157  4e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0539  nitrogen regulatory protein P-II 2  66.96 
 
 		 112 aa  157  4e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.843641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3119  nitrogen regulatory protein P-II  66.96 
 
 		 112 aa  157  4e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00406  hypothetical protein  66.96 
 
 		 112 aa  157  4e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3165  nitrogen regulatory protein P-II 2  66.96 
 
 		 112 aa  157  4e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47790  Nitrogen regulatory protein P-II GlnK  66.96 
 
 		 112 aa  157  5e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.144153  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0232  nitrogen regulatory protein P-II  66.96 
 
 		 112 aa  157  6e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0312248  normal  0.530475 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2513  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 		 112 aa  157  7e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00284343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0918  nitrogen regulatory protein P-II 2  65.18 
 
 		 112 aa  156  8e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0053  nitrogen regulatory protein P-II  66.96 
 
 		 112 aa  155  1e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0041295  normal  0.377674 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0259  nitrogen regulatory protein P-II  68.22 
 
 		 112 aa  155  3e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0472  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 		 112 aa  154  3e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6030  nitrogen regulatory protein P-II 2  68.22 
 
 		 112 aa  155  3e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69810  nitrogen regulatory protein P-II 2  68.22 
 
 		 112 aa  155  3e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.194686  normal  0.241854 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2345  nitrogen regulatory P-II transcription regulator protein  67.86 
 
 		 112 aa  154  4e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.782832  normal  0.263317 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0506  nitrogen regulatory protein P-II 2  66.07 
 
 		 112 aa  154  5.0000000000000005e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0512  nitrogen regulatory protein P-II 2  66.07 
 
 		 112 aa  154  5.0000000000000005e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0522  nitrogen regulatory protein P-II 2  66.07 
 
 		 112 aa  154  5.0000000000000005e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.869463  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0565  nitrogen regulatory protein P-II 2  66.07 
 
 		 112 aa  154  5.0000000000000005e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.941752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1918  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  154  5.0000000000000005e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0503  nitrogen regulatory protein P-II 2  66.07 
 
 		 112 aa  154  5.0000000000000005e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0597213  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5499  nitrogen regulatory protein P-II  66.96 
 
 		 112 aa  154  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.118454 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0171  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 		 112 aa  154  6e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.138781  normal  0.605066 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0623  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 		 112 aa  153  6e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000846933  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0183  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  153  7e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.320277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3163  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 		 112 aa  153  7e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.105283  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0218  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  153  7e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.601689  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2137  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  152  1e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.573897  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0995  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 112 aa  152  1e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.882952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0693  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 		 112 aa  152  1e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.333555  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1818  nitrogen regulatory protein P-II  68.22 
 
 		 112 aa  152  1e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.900474  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3770  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 		 116 aa  153  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.929056 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4094  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 		 116 aa  153  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.52607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3942  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 		 112 aa  152  1e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2733  nitrogen regulatory protein P-II  66.04 
 
 		 112 aa  152  2e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.122931 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5234  nitrogen regulatory protein P-II  67.29 
 
 		 112 aa  152  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0256  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 		 112 aa  151  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0163  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  152  2e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.814781 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0217  nitrogen regulatory protein P-II  67.29 
 
 		 112 aa  152  2e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.531374  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0190  nitrogen regulatory protein P-II  67.29 
 
 		 112 aa  152  2e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0291  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  152  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5506  nitrogen regulatory protein P-II  67.29 
 
 		 112 aa  152  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.851812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0233  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 		 112 aa  152  2e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0238  nitrogen regulatory protein P-II  67.29 
 
 		 112 aa  152  2e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0928138  normal  0.898368 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5143  nitrogen regulatory protein P-II  67.29 
 
 		 112 aa  152  2e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2530  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 		 112 aa  152  2e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5295  nitrogen regulatory protein P-II  67.29 
 
 		 112 aa  152  2e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2915  nitrogen regulatory protein P-II 2  65.18 
 
 		 112 aa  152  2e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0326538  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4190  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 		 112 aa  151  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.959597 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0181  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  152  2e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.153981  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0525  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 		 112 aa  151  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.887906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0120  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  151  2e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0723912 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0342  nitrogen regulatory P-II transcription regulator protein  65.18 
 
 		 112 aa  151  2.9999999999999998e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4239  nitrogen regulatory protein PII  66.96 
 
 		 116 aa  151  2.9999999999999998e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2866  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 136 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00138557  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3314  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  151  2.9999999999999998e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.258343  normal  0.0812118 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3237  nitrogen regulatory protein P-II  67.86 
 
 		 112 aa  151  2.9999999999999998e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3218  P-II family regulatory protein  64.29 
 
 		 112 aa  150  4e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.472285  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0651  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  150  4e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.888486  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0468  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  150  4e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.409463  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0407  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  150  4e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.32852  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0487  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  150  4e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.188054  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0193  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  150  4e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.431486  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2827  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  150  4e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.994537  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2346  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  65.18 
 
 		 112 aa  150  4e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.235899 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1400  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  150  4e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2783  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  150  5e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.190051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2043  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 		 112 aa  150  5e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.242523  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0437  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  150  5e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6195  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 136 aa  150  5e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3241  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  150  5e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.302793  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2252  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  150  5e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0233324  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2877  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  150  5e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.58077  normal  0.596742 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2921  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  150  5e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0772673  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1760  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  150  5.9999999999999996e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.654192  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2590  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 		 112 aa  150  5.9999999999999996e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0198  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  150  5.9999999999999996e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.485304 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>