42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1231 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_1231  protein of unknown function DUF330  100 
 
 		 202 aa  396  1e-109  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.228197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2448  hypothetical protein  32.11 
 
 		 201 aa  77.4  0.0000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.136482  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3500  hypothetical protein  42.15 
 
 		 212 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0404  hypothetical protein  33.77 
 
 		 203 aa  62  0.000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4087  hypothetical protein  32.14 
 
 		 188 aa  60.5  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00226644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4001  hypothetical protein  31.58 
 
 		 250 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2220  protein of unknown function DUF330  32.21 
 
 		 197 aa  58.2  0.00000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000082506 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2634  hypothetical protein  29.35 
 
 		 212 aa  58.2  0.00000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0652  hypothetical protein  30.46 
 
 		 196 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.049729  normal  0.69496 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1444  hypothetical protein  29.23 
 
 		 208 aa  56.6  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.753012  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0041  putative lipoprotein  36.57 
 
 		 206 aa  57  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.240026  normal  0.251629 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5507  hypothetical protein  28.89 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0625  hypothetical protein  34.59 
 
 		 240 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1982  putative lipoprotein  32.62 
 
 		 195 aa  55.1  0.0000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0024934  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0601  hypothetical protein  33.83 
 
 		 242 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.391552  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0710  hypothetical protein  32.06 
 
 		 238 aa  53.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0226  hypothetical protein  32.06 
 
 		 238 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0677  hypothetical protein  32.06 
 
 		 239 aa  53.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0204159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2417  hypothetical protein  31.03 
 
 		 204 aa  52.4  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0242841  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44160  hypothetical protein  31.51 
 
 		 192 aa  52.4  0.000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.266274  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0364  putative lipoprotein  30.25 
 
 		 201 aa  52  0.000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.14709  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1353  putative lipoprotein  29.2 
 
 		 192 aa  50.4  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000000161061  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3798  hypothetical protein  31.3 
 
 		 240 aa  50.1  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.860154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5279  hypothetical protein  28.73 
 
 		 233 aa  50.1  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2126  putative lipoprotein  30.05 
 
 		 233 aa  48.9  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0863972  normal  0.08915 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5692  hypothetical protein  28.09 
 
 		 236 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0256  hypothetical protein  27.27 
 
 		 205 aa  47  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0710  protein of unknown function DUF330  31.58 
 
 		 248 aa  47  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2892  protein of unknown function DUF330  30.43 
 
 		 210 aa  47  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.529816  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5803  hypothetical protein  32.33 
 
 		 236 aa  46.6  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000107973  hitchhiker  0.000892453 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2680  putative lipoprotein  31.13 
 
 		 207 aa  46.6  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.208689  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65590  hypothetical protein  27.53 
 
 		 236 aa  45.1  0.0008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2001  protein of unknown function DUF330  32.21 
 
 		 196 aa  44.3  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.142199  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0504  hypothetical protein  27.96 
 
 		 237 aa  44.7  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0320775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3046  hypothetical protein  29 
 
 		 207 aa  43.9  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.796041  normal  0.0181531 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2675  hypothetical protein  28.24 
 
 		 243 aa  43.9  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.681553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1055  protein of unknown function DUF330  29.8 
 
 		 198 aa  43.9  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02852  hypothetical protein  23.13 
 
 		 189 aa  42.4  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43450  hypothetical protein  26.39 
 
 		 242 aa  42.7  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.140988  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0041  protein of unknown function DUF330  30.43 
 
 		 197 aa  42.4  0.005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2536  hypothetical protein  28.57 
 
 		 233 aa  41.6  0.009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3180  lipoprotein, putative  36.36 
 
 		 207 aa  41.2  0.009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.131862  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>