158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1230 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_1230  Mammalian cell entry related domain protein  100 
 
 
322 aa  634    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.16167  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2447  hypothetical protein  37.62 
 
 
323 aa  205  7e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.106785  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3499  hypothetical protein  37.07 
 
 
324 aa  194  1e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2416  hypothetical protein  33.24 
 
 
359 aa  172  9e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.186903  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1983  hypothetical protein  34.04 
 
 
343 aa  159  5e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.042136  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2072  Mammalian cell entry related domain protein  37.46 
 
 
341 aa  158  1e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.435744 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2635  hypothetical protein  29.97 
 
 
328 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1056  Mammalian cell entry related domain protein  33.13 
 
 
322 aa  133  3e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0040  Mammalian cell entry related domain protein  32 
 
 
327 aa  124  2e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0668  hypothetical protein  26.89 
 
 
330 aa  106  6e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1960  hypothetical protein  26.89 
 
 
327 aa  106  7e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0139154  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3376  hypothetical protein  27.42 
 
 
559 aa  104  2e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.166606  normal  0.0325483 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4623  hypothetical protein  30.26 
 
 
334 aa  101  2e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2000  Mammalian cell entry related domain protein  26.82 
 
 
558 aa  99  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.939676  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2221  Mammalian cell entry related domain protein  26.69 
 
 
556 aa  96.7  5e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000538523 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3138  hypothetical protein  30.06 
 
 
322 aa  93.2  6e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.448864  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1713  hypothetical protein  31.44 
 
 
356 aa  92.8  6e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000187754 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0363  paraquat-inducible protein B  25.81 
 
 
572 aa  91.3  2e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.364646  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4088  paraquat-inducible protein B  28.81 
 
 
508 aa  90.9  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.141129  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5506  hypothetical protein  35.18 
 
 
533 aa  90.9  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.286213  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3139  hypothetical protein  30 
 
 
546 aa  90.1  5e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.667877  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2577  hypothetical protein  30 
 
 
546 aa  89  9e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0122207  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2378  paraquat-inducible protein B  33.5 
 
 
553 aa  89  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.154964  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3382  paraquat-inducible protein  33.5 
 
 
551 aa  89  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0292  paraquat-inducible protein B  33.5 
 
 
551 aa  89  1e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1154  paraquat-inducible protein B  33.5 
 
 
551 aa  89  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3340  paraquat-inducible protein B  33.5 
 
 
551 aa  89  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.440052  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3374  mce family protein  33.5 
 
 
551 aa  89  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2561  mce family protein  33.5 
 
 
551 aa  89  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0403  hypothetical protein  31.53 
 
 
545 aa  87.8  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3288  hypothetical protein  30 
 
 
546 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1268  paraquat-inducible protein B  33.65 
 
 
551 aa  87.4  3e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0227  hypothetical protein  27.05 
 
 
539 aa  87.4  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0711  hypothetical protein  27.05 
 
 
539 aa  87.4  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0678  hypothetical protein  27.05 
 
 
539 aa  87.4  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0419217  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0709  Mammalian cell entry related domain protein  33.89 
 
 
552 aa  86.3  7e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.381837  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0626  hypothetical protein  26.71 
 
 
539 aa  85.9  9e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.735429  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0602  hypothetical protein  26.71 
 
 
539 aa  85.9  9e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.483664  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3799  hypothetical protein  26.71 
 
 
539 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.660029  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4000  putative paraquat-inducible protein  33.89 
 
 
552 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.113556  normal  0.829107 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3242  Mammalian cell entry related domain protein  26.16 
 
 
555 aa  83.2  0.000000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44090  PqiB family protein  33.17 
 
 
537 aa  82.8  0.000000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.760607  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2674  hypothetical protein  30.88 
 
 
539 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.531712  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0651  hypothetical protein  31.84 
 
 
534 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.1317  normal  0.879007 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1320  Mammalian cell entry related domain protein  25.15 
 
 
337 aa  80.5  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0517  Mammalian cell entry related domain protein  28.02 
 
 
547 aa  79.3  0.00000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0530  Mammalian cell entry related domain protein  28.02 
 
 
547 aa  79.3  0.00000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2535  hypothetical protein  30.73 
 
 
544 aa  79.3  0.00000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2893  Mammalian cell entry related domain protein  27.21 
 
 
548 aa  78.2  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.3428  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0601  hypothetical protein  27.83 
 
 
547 aa  77  0.0000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.184325  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0579  hypothetical protein  30.94 
 
 
546 aa  76.3  0.0000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.30623  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2127  putative paraquat-inducible transmembrane protein, PqiB  29.46 
 
 
539 aa  76.3  0.0000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.460028  normal  0.102127 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0257  hypothetical protein  23.41 
 
 
543 aa  75.5  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1127  paraquat-inducible protein B  25.56 
 
 
546 aa  74.7  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0201216  normal  0.953621 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5802  hypothetical protein  28.23 
 
 
531 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00328946  hitchhiker  0.0014272 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1323  Mammalian cell entry related domain protein  36.8 
 
 
561 aa  74.3  0.000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.404082  normal  0.550075 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4853  paraquat-inducible protein B  26.54 
 
 
547 aa  73.9  0.000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00098113 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5278  hypothetical protein  29.06 
 
 
531 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0366  paraquat-inducible protein B  27.01 
 
 
547 aa  73.9  0.000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.838729  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1173  paraquat-inducible protein B  25.19 
 
 
546 aa  73.2  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.371767  normal  0.608659 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1022  paraquat-inducible protein B  25.19 
 
 
546 aa  73.2  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00119913  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1139  paraquat-inducible protein B  25.19 
 
 
546 aa  73.2  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0102675  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2114  Mammalian cell entry related domain protein  29.21 
 
 
539 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1463  paraquat-inducible protein B  26.28 
 
 
545 aa  72.4  0.000000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0560595  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2932  hypothetical protein  28.7 
 
 
548 aa  72.4  0.000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2391  hypothetical protein  26.17 
 
 
545 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.931506  normal  0.945303 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2366  paraquat-inducible protein B  26.94 
 
 
546 aa  72  0.00000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.547013  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2008  hypothetical protein  24.49 
 
 
547 aa  72  0.00000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1105  paraquat-inducible protein B  25.19 
 
 
546 aa  72  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.486337  normal  0.0294366 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2580  hypothetical protein  28.57 
 
 
551 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.732971 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00955  paraquat-inducible protein B  26.94 
 
 
546 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000262354  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2692  Mammalian cell entry related domain protein  26.94 
 
 
546 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000610454  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2562  hypothetical protein  31.61 
 
 
558 aa  71.2  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0758211  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00962  hypothetical protein  26.94 
 
 
546 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000379419  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1060  paraquat-inducible protein B  26.94 
 
 
546 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012177  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1066  paraquat-inducible protein B  26.94 
 
 
546 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000823988  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1115  paraquat-inducible protein B  26.94 
 
 
546 aa  71.2  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000291875  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2645  paraquat-inducible protein B  26.94 
 
 
546 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000298494  hitchhiker  0.00000476211 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2168  paraquat-inducible protein B  26.94 
 
 
546 aa  71.2  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000764872  normal  0.254429 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3179  PqiB family protein  29.31 
 
 
559 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.360667  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3535  hypothetical protein  25.34 
 
 
531 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.128458  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0231  hypothetical protein  28.77 
 
 
228 aa  69.7  0.00000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0328  Mammalian cell entry related domain protein  23.13 
 
 
552 aa  69.7  0.00000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3045  PqiB family protein  28.74 
 
 
559 aa  69.3  0.00000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.114944  normal  0.0226159 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2679  hypothetical protein  31.11 
 
 
546 aa  69.3  0.00000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.331347  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1570  hypothetical protein  29.05 
 
 
538 aa  67.8  0.0000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0232  hypothetical protein  27.83 
 
 
228 aa  67.4  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02656  putative paraquat-inducible protein B  27.84 
 
 
555 aa  67.8  0.0000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.40052  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1445  Mammalian cell entry related domain protein  26.74 
 
 
547 aa  67.8  0.0000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.578149  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2549  paraquat-inducible protein B  31.52 
 
 
550 aa  67  0.0000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0824615  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1990  paraquat-inducible protein B  31.52 
 
 
550 aa  67  0.0000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2638  paraquat-inducible protein B  31.52 
 
 
550 aa  67  0.0000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1683  paraquat-inducible protein B  25.63 
 
 
548 aa  66.6  0.0000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6816  paraquat-inducible protein B'  27.36 
 
 
556 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.237593  normal  0.938789 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1652  paraquat-inducible protein B  28.46 
 
 
548 aa  66.2  0.0000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1746  paraquat-inducible protein B  27.87 
 
 
548 aa  65.9  0.0000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0445264  decreased coverage  0.000000731619 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2074  hypothetical protein  30.05 
 
 
550 aa  65.5  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0955309  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0178  Mammalian cell entry related domain protein  20.94 
 
 
305 aa  64.3  0.000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02851  hypothetical protein  24.77 
 
 
548 aa  65.1  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2831  hypothetical protein  25.95 
 
 
551 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>