More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1228 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_1228  protein of unknown function DUF140  100 
 
 
383 aa  754    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.319892  normal  0.729356 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2445  hypothetical protein  48.95 
 
 
389 aa  300  2e-80  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3498  hypothetical protein  44.33 
 
 
382 aa  262  6e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.231207  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2414  hypothetical protein  44.48 
 
 
384 aa  248  9e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.77995  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4625  hypothetical protein  38.48 
 
 
376 aa  216  4e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.306336  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0670  hypothetical protein  37.5 
 
 
369 aa  213  5.999999999999999e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1962  hypothetical protein  38.56 
 
 
370 aa  206  4e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2637  hypothetical protein  39.68 
 
 
401 aa  205  1e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1058  protein of unknown function DUF140  41.54 
 
 
375 aa  203  4e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00141261  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1985  ABC transporter permease protein  38.16 
 
 
373 aa  202  8e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0038  protein of unknown function DUF140  39.54 
 
 
381 aa  196  8.000000000000001e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0468  protein of unknown function DUF140  36.42 
 
 
380 aa  180  2.9999999999999997e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1358  protein of unknown function DUF140  34.42 
 
 
413 aa  177  2e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3136  hypothetical protein  37.98 
 
 
386 aa  177  3e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.391014  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2512  hypothetical protein  33.69 
 
 
387 aa  169  9e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0475648 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1494  protein of unknown function DUF140  33.43 
 
 
375 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000338364  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1711  hypothetical protein  34.21 
 
 
369 aa  159  6e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000795041 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4717  protein of unknown function DUF140  32.54 
 
 
382 aa  157  4e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.819225  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0247  ABC transport system permease protein  37.05 
 
 
364 aa  153  4e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1681  hypothetical protein  27.66 
 
 
383 aa  153  4e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2749  ABC-type transport system, permease component  39.25 
 
 
386 aa  152  8.999999999999999e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1720  hypothetical protein  31.69 
 
 
366 aa  152  8.999999999999999e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.176851  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2809  ABC transporter, inner membrane subunit  33.53 
 
 
366 aa  152  1e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.59078  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1981  hypothetical protein  32.42 
 
 
378 aa  152  1e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1921  hypothetical protein  32 
 
 
388 aa  152  1e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2317  hypothetical protein  36 
 
 
364 aa  151  2e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.1978  normal  0.392221 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0299  protein of unknown function DUF140  29.52 
 
 
388 aa  151  2e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.675312  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1915  ABC transporter permease  34.35 
 
 
381 aa  150  3e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1322  protein of unknown function DUF140  38.86 
 
 
382 aa  150  4e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.619547  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0072  hypothetical protein  36.33 
 
 
376 aa  150  4e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1489  hypothetical protein  33.76 
 
 
366 aa  149  6e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.453578 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3668  hypothetical protein  31.68 
 
 
377 aa  149  7e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0702453 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22680  putative permease of ABC transporter  34.01 
 
 
381 aa  149  7e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00590843 
 
 
-
 
NC_004310  BR1019  toulene ABC transporter, permease protein, putative  30.53 
 
 
391 aa  149  1.0000000000000001e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1373  hypothetical protein  34.23 
 
 
378 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0182  hypothetical protein  33.82 
 
 
382 aa  149  1.0000000000000001e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0306  hypothetical protein  32.19 
 
 
375 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.45629  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1353  hypothetical protein  34.17 
 
 
378 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0168  protein of unknown function DUF140  31.59 
 
 
374 aa  147  3e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.710497 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2342  hypothetical protein  37 
 
 
406 aa  147  3e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.95036  hitchhiker  0.00549832 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0175  protein of unknown function DUF140  31.85 
 
 
374 aa  147  3e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2050  hypothetical protein  33.43 
 
 
384 aa  146  5e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.449343 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04780  ABC transporter protein  37.22 
 
 
382 aa  146  6e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0570805  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0365  hypothetical protein  30.29 
 
 
376 aa  146  7.0000000000000006e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1205  hypothetical protein  36.77 
 
 
377 aa  145  9e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.111508 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2030  hypothetical protein  29.77 
 
 
374 aa  145  1e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2025  hypothetical protein  30.32 
 
 
374 aa  145  2e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0230  hypothetical protein  31.2 
 
 
383 aa  144  3e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1893  ABC transporter membrane spanning protein  35.07 
 
 
376 aa  144  4e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.228416  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5750  putative ABC transporter (permease protein)  34.06 
 
 
378 aa  143  5e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.728417 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0481  hypothetical protein  33.55 
 
 
368 aa  143  6e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.248573  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2845  hypothetical protein  32.53 
 
 
372 aa  142  8e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0986  putative toulene ABC transporter, permease protein  30.66 
 
 
365 aa  142  9.999999999999999e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03183  ABC transporter permease  30.1 
 
 
370 aa  142  9.999999999999999e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0313  hypothetical protein  31.33 
 
 
374 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0037  hypothetical protein  36.32 
 
 
382 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.151467  normal  0.178928 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2742  hypothetical protein  32.2 
 
 
365 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0803519 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1452  hypothetical protein  31.5 
 
 
377 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.212948  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4043  hypothetical protein  30.81 
 
 
378 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1224  ABC transporter, permease protein  32.76 
 
 
377 aa  140  3e-32  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3917  hypothetical protein  31.88 
 
 
376 aa  140  3e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.843162  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0741  ABC transporter permease protein  32.76 
 
 
377 aa  140  3e-32  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1154  protein of unknown function DUF140  37.22 
 
 
385 aa  140  4.999999999999999e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.201418  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1612  hypothetical protein  37.67 
 
 
384 aa  139  8.999999999999999e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3017  hypothetical protein  41.26 
 
 
362 aa  139  1e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.558408  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1206  hypothetical protein  32.88 
 
 
368 aa  138  2e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.699357 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1197  hypothetical protein  32.41 
 
 
382 aa  138  2e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.924507  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0102  protein of unknown function DUF140  25.59 
 
 
376 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0117  putative ABC transporter, permease protein (DUF140 domain protein)  28.31 
 
 
370 aa  137  3.0000000000000003e-31  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.591838  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1627  hypothetical protein  29.75 
 
 
383 aa  136  7.000000000000001e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.908289  normal  0.63791 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1636  hypothetical protein  29.66 
 
 
383 aa  136  7.000000000000001e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2195  protein of unknown function DUF140  32.15 
 
 
394 aa  135  8e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.130725  normal  0.119918 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1505  protein of unknown function DUF140  31.77 
 
 
430 aa  135  9e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0579  hypothetical protein  35.94 
 
 
396 aa  135  9.999999999999999e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0199346  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2901  hypothetical protein  34.09 
 
 
447 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.371031  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0648  ABC transporter, permease protein, putative  29.95 
 
 
378 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0798  protein of unknown function DUF140  29.95 
 
 
378 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.737521  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0205  hypothetical protein  32.03 
 
 
379 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2812  hypothetical protein  33.33 
 
 
374 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.221535  normal  0.381774 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5005  hypothetical protein  35.55 
 
 
344 aa  135  1.9999999999999998e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.238199  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2950  hypothetical protein  33.33 
 
 
374 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0628  ABC transporter permease  35.48 
 
 
372 aa  134  3e-30  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000296062  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6243  ABC transporter, inner membrane subunit  35.94 
 
 
374 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2910  hypothetical protein  35.94 
 
 
374 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1315  hypothetical protein  31.21 
 
 
377 aa  133  3.9999999999999996e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1074  hypothetical protein  31.45 
 
 
393 aa  133  5e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1433  stas domain-containing protein  30.77 
 
 
368 aa  133  5e-30  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.102521  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0524  protein of unknown function DUF140  35.94 
 
 
373 aa  133  6e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.830766  normal  0.234341 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2277  protein of unknown function DUF140  31.82 
 
 
371 aa  132  7.999999999999999e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4485  protein of unknown function DUF140  28.53 
 
 
383 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5085  hypothetical protein  32.33 
 
 
377 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.100412 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3564  hypothetical protein  29.61 
 
 
371 aa  131  2.0000000000000002e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.777285  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0158  hypothetical protein  32.12 
 
 
377 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.692711 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2006  ABC transporter permease  26.65 
 
 
369 aa  131  2.0000000000000002e-29  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1637  ABC transporter, permease protein, putative  26.95 
 
 
369 aa  130  3e-29  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0577  ABC transport system permease  24.47 
 
 
367 aa  130  3e-29  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0142  hypothetical protein  29.61 
 
 
377 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.20337 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0101  hypothetical protein  33.96 
 
 
357 aa  130  5.0000000000000004e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.218333  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2365  hypothetical protein  32.42 
 
 
373 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00138547  normal  0.583389 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1528  hypothetical protein  31.09 
 
 
373 aa  129  6e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>