70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1223 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_1223  RDD domain containing protein  100 
 
 		 202 aa  415  9.999999999999999e-116  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1788  RDD domain containing protein  34.71 
 
 		 187 aa  91.3  1e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0098202  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1148  RDD domain containing protein  34.66 
 
 		 185 aa  89.7  2e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00101829  hitchhiker  0.000000000000525817 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1364  RDD domain-containing protein  32.95 
 
 		 186 aa  86.3  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000121263  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0170  RDD domain-containing protein  32.16 
 
 		 145 aa  85.9  4e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.00000000534855  decreased coverage  0.00967799 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1706  RDD  32.54 
 
 		 170 aa  85.5  4e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.305495  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0277  RDD domain containing protein  36.69 
 
 		 217 aa  83.2  0.000000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.666159  normal  0.0986894 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0075  RDD domain-containing protein  34.39 
 
 		 185 aa  79.3  0.00000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0306278  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3583  MJ0042 family finger-like protein  33.53 
 
 		 295 aa  74.7  0.0000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.040814  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3590  RDD domain containing protein  28.24 
 
 		 310 aa  72.4  0.000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2289  RDD domain-containing protein  32.76 
 
 		 202 aa  67.8  0.0000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1213  RDD  39.78 
 
 		 176 aa  67.4  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0799296  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0171  RDD domain-containing protein  43.42 
 
 		 140 aa  66.2  0.0000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000000652856  decreased coverage  0.0096302 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3591  hypothetical protein  36.59 
 
 		 133 aa  64.7  0.0000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.157612  normal  0.0949488 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2608  RDD domain-containing protein  31.58 
 
 		 456 aa  62  0.000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.107491 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1340  serine/threonine protein kinase  32.93 
 
 		 536 aa  61.6  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.975368 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2416  hypothetical protein  44.87 
 
 		 270 aa  60.8  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2609  serine/threonine protein kinase  35.56 
 
 		 415 aa  60.1  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.101255 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3457  RDD domain containing protein  41.67 
 
 		 205 aa  58.9  0.00000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.052067 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4623  RDD domain-containing protein  30.06 
 
 		 169 aa  58.9  0.00000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.846019 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0824  RDD domain containing protein  36.36 
 
 		 590 aa  55.1  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0333571  normal  0.0552944 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3024  branched-chain amino acid aminotransferase I  29.55 
 
 		 167 aa  54.3  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000160975 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4968  YxaI  43.24 
 
 		 77 aa  53.5  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0891  RDD domain-containing protein  36.17 
 
 		 152 aa  53.1  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.98299 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14930  hypothetical protein  29.48 
 
 		 361 aa  52.8  0.000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.279632  normal  0.10633 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0678  RDD domain-containing protein  35.48 
 
 		 157 aa  51.2  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.416032  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04050  RDD family protein  27.57 
 
 		 424 aa  51.2  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1489  RDD domain containing protein  32.32 
 
 		 155 aa  49.7  0.00003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.126204  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1918  RDD protein  31.58 
 
 		 154 aa  49.7  0.00003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.002418  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1940  RDD domain-containing protein  27.17 
 
 		 246 aa  49.3  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000546955  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0769  RDD protein  25.6 
 
 		 163 aa  49.3  0.00004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0105114  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1175  RDD domain-containing protein  33.33 
 
 		 166 aa  49.3  0.00004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4809  RDD  32.58 
 
 		 261 aa  49.3  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000284972  normal  0.915687 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0399  RDD domain-containing protein  34.52 
 
 		 278 aa  48.9  0.00005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0177068 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0098  RDD domain containing protein  32.91 
 
 		 204 aa  48.9  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8545  membrane protein/domain-like protein  31.86 
 
 		 175 aa  47.8  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1145  hypothetical protein  33.85 
 
 		 166 aa  47.8  0.0001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0238  RDD domain-containing protein  38.37 
 
 		 164 aa  47  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2120  RDD domain containing protein  38.89 
 
 		 157 aa  46.2  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0628  hypothetical protein  29.03 
 
 		 154 aa  46.2  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0572979  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0355  hypothetical protein  32.63 
 
 		 198 aa  44.3  0.001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0701  RDD domain containing protein  32.81 
 
 		 373 aa  44.3  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0712  RDD domain-containing protein  30.12 
 
 		 634 aa  44.3  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.226192 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1981  RDD domain containing protein  34.72 
 
 		 357 aa  43.5  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2713  RDD domain containing protein  27.06 
 
 		 159 aa  43.1  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1509  hypothetical protein  33.33 
 
 		 375 aa  43.5  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3447  RDD domain-containing protein  31.93 
 
 		 254 aa  43.1  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.492648 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0141  RDD domain-containing protein  42 
 
 		 327 aa  42.7  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1422  RDD domain-containing protein  30 
 
 		 257 aa  42.7  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000176176  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1364  hypothetical protein  32.05 
 
 		 166 aa  42.7  0.004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.356558  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3078  hypothetical protein  30.88 
 
 		 406 aa  42.4  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1844  RDD  32.14 
 
 		 173 aa  42.7  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.353991  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1247  RDD domain containing protein  28.3 
 
 		 137 aa  42.7  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0396  RDD  31.87 
 
 		 196 aa  42.4  0.005  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.476249  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0643  RDD family protein  31.87 
 
 		 195 aa  42.4  0.005  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1722  RDD domain-containing protein  27.17 
 
 		 403 aa  42.4  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000166004 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1602  hypothetical protein  35.56 
 
 		 152 aa  42  0.006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16490  hypothetical protein  38.82 
 
 		 144 aa  42  0.006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.829051  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1683  RDD domain-containing protein  30.11 
 
 		 424 aa  42  0.006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0350832  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2045  RDD domain-containing protein  34.25 
 
 		 167 aa  42  0.007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.000733999  normal  0.318359 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1562  RDD domain-containing protein  29.49 
 
 		 449 aa  42  0.007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0211691 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1568  RDD domain-containing protein  29.49 
 
 		 448 aa  42  0.007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.957894  normal  0.02442 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1700  RDD domain containing protein  29.49 
 
 		 415 aa  41.6  0.008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.6304  hitchhiker  0.00000345448 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3769  RDD domain containing protein  39.19 
 
 		 258 aa  41.6  0.008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.469918 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2763  RDD domain-containing protein  29.49 
 
 		 412 aa  41.6  0.008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.136751  hitchhiker  0.000413792 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2684  RDD domain-containing protein  29.49 
 
 		 415 aa  41.6  0.008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0059123  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1501  RDD domain-containing protein  29.49 
 
 		 444 aa  41.6  0.009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.561992  hitchhiker  0.000145013 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2662  RDD domain-containing protein  29.49 
 
 		 412 aa  41.6  0.009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09620  RDD domain containing protein  26.02 
 
 		 302 aa  41.2  0.009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0431  RDD domain-containing protein  42.42 
 
 		 151 aa  41.2  0.01  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>