More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1213 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_1213  protein TolR  100 
 
 		 147 aa  291  3e-78  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2901  biopolymer transport protein ExbD/TolR  60.9 
 
 		 147 aa  171  2.9999999999999996e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00149833  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2120  biopolymer transport TolR  55 
 
 		 152 aa  160  5.0000000000000005e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0523748  normal  0.245656 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3173  biopolymer transport protein ExbD/TolR  51.03 
 
 		 149 aa  148  2e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.673251  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1092  biopolymer transport protein ExbD/TolR  55.38 
 
 		 166 aa  147  5e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1216  biopolymer transport TolR  50.68 
 
 		 150 aa  145  2.0000000000000003e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.212808  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1699  ExbD/TolR family TonB system transport protein  52.74 
 
 		 150 aa  144  3e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1641  protein TolR  52.74 
 
 		 150 aa  144  3e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436956  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2629  biopolymer transport TolR  56.56 
 
 		 149 aa  143  9e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0746  protein TolR  53.28 
 
 		 148 aa  142  2e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3389  protein TolR  53.72 
 
 		 145 aa  140  4e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.436196  normal  0.250194 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4434  protein TolR  53.72 
 
 		 147 aa  140  7e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0620039  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5304  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  52.89 
 
 		 149 aa  138  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.159444  normal  0.423662 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3619  protein TolR  52.85 
 
 		 152 aa  138  1.9999999999999998e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4762  biopolymer transport protein ExbD/TolR  52.07 
 
 		 149 aa  137  3e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.718124  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5229  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  52.07 
 
 		 149 aa  137  3e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.334933  normal  0.0672636 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3203  protein TolR  51.64 
 
 		 151 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.349327  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3498  protein TolR  51.64 
 
 		 151 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.124794 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1617  protein TolR  51.91 
 
 		 153 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.776263  hitchhiker  0.0037279 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1619  protein TolR  51.91 
 
 		 153 aa  131  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.1444  normal  0.157176 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1899  protein TolR  51.91 
 
 		 153 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.937922 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4753  biopolymer transport protein ExbD/TolR  52.03 
 
 		 149 aa  131  3e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3058  biopolymer transport TolR  52.42 
 
 		 152 aa  131  3e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0312035  normal  0.159163 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2154  biopolymer transport protein ExbD/TolR  48.55 
 
 		 155 aa  130  7.999999999999999e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.8914  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0922  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  48.33 
 
 		 148 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.219154 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0527  protein TolR  50.78 
 
 		 155 aa  126  1.0000000000000001e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2418  biopolymer transport protein ExbD/TolR  48.55 
 
 		 144 aa  126  1.0000000000000001e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2135  biopolymer transport, TolR  47.86 
 
 		 167 aa  124  4.0000000000000003e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2215  biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.76 
 
 		 154 aa  124  4.0000000000000003e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3136  protein TolR  49.23 
 
 		 146 aa  124  5e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1396  protein TolR  53.23 
 
 		 156 aa  124  5e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.60771  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0470  biopolymer transport protein ExbD/TolR  47.2 
 
 		 141 aa  123  6e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.923665 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0684  biopolymer transport protein ExbD/TolR  46.56 
 
 		 154 aa  123  8.000000000000001e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.508331  normal  0.11063 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3166  protein TolR  53.28 
 
 		 158 aa  123  9e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1227  tolR protein  47.14 
 
 		 146 aa  123  1e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.165973  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0856  protein TolR  53.72 
 
 		 157 aa  120  6e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2367  biopolymer transport protein ExbD/TolR  50.81 
 
 		 162 aa  120  7e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1109  biopolymer transport TolR  49.18 
 
 		 134 aa  119  9.999999999999999e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00176605  normal  0.311844 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1701  biopolymer transport protein ExbD/TolR  45.07 
 
 		 148 aa  118  1.9999999999999998e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0404269  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2719  biopolymer transport protein ExbD/TolR  45.6 
 
 		 151 aa  118  3e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.746273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1851  biopolymer transport protein ExbD/TolR  43.26 
 
 		 145 aa  118  3e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4429  protein TolR  45.8 
 
 		 173 aa  115  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.681247 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0272  biopolymer transport protein ExbD/TolR  46.22 
 
 		 149 aa  114  3e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.512888  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2145  biopolymer transport protein ExbD/TolR  47.97 
 
 		 167 aa  114  3e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0330  biopolymer transport protein ExbD/TolR  49.6 
 
 		 173 aa  115  3e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.175992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0219  putative transport-related membrane protein  41.67 
 
 		 145 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.748949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3580  biopolymer transport protein ExbD/TolR  44.29 
 
 		 144 aa  114  6e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0971  biopolymer transport protein ExbD/TolR  49.17 
 
 		 137 aa  113  6.9999999999999995e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3514  biopolymer transport protein ExbD/TolR  45.6 
 
 		 151 aa  113  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.262132  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0391  biopolymer transport protein ExbD/TolR  49.19 
 
 		 159 aa  112  2.0000000000000002e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5307  biopolymer transport protein ExbD  44.53 
 
 		 142 aa  111  3e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.153689 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5216  biopolymer transport protein ExbD  44.53 
 
 		 142 aa  111  3e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.421083 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0695  protein TolR  41.13 
 
 		 150 aa  111  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0661  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.13 
 
 		 150 aa  111  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.602006  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0696  protein TolR  41.13 
 
 		 150 aa  111  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.76246  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3640  biopolymer transport protein ExbD/TolR  43.15 
 
 		 150 aa  111  4.0000000000000004e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10620  TonB system transport protein ExbD  43.38 
 
 		 141 aa  110  5e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.160821  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0506  biopolymer transport protein ExbD/TolR  43.2 
 
 		 154 aa  110  7.000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.529067  hitchhiker  0.000695312 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5355  biopolymer transport protein ExbD  43.8 
 
 		 142 aa  110  8.000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.610359  normal  0.681563 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0244  biopolymer transport protein ExbD/TolR  43.97 
 
 		 149 aa  110  8.000000000000001e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1525  biopolymer transport protein ExbD/TolR  43.17 
 
 		 144 aa  110  9e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0168753  normal  0.844163 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3580  protein TolR  41.41 
 
 		 139 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0753  biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.54 
 
 		 144 aa  109  1.0000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0347505  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3511  protein TolR  40.6 
 
 		 139 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0114553  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4404  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.73 
 
 		 153 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0822226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51740  TolR protein  38.03 
 
 		 146 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0101841  hitchhiker  0.0000169267 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4538  TolR protein  38.03 
 
 		 146 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1015  biopolymer transport protein ExbD/TolR  47.9 
 
 		 150 aa  108  2.0000000000000002e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.228328  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0146  protein TolR  44.09 
 
 		 150 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0800  ExbD/TolR family transport energizing protein  45.45 
 
 		 140 aa  108  3e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1803  biopolymer ExbD/TolR family transporter  45.45 
 
 		 142 aa  108  3e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.831218  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0520  ExbD/TolR family transport energizing protein  45.45 
 
 		 142 aa  108  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0166  biopolymer transport protein ExbD  43.8 
 
 		 142 aa  108  3e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0981914 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0617  ExbD/TolR family transport energizing protein  45.45 
 
 		 142 aa  108  3e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.843085  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1930  biopolymer ExbD/TolR family transporter  45.45 
 
 		 142 aa  108  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3597  TonB system transport protein ExbD  41.18 
 
 		 139 aa  108  3e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1092  ExbD/TolR family transport energizing protein  45.45 
 
 		 142 aa  108  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2064  ExbD/TolR family transport energizing protein  45.45 
 
 		 142 aa  108  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.132783  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0281  biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.86 
 
 		 139 aa  108  3e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.149561  hitchhiker  0.000106063 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1076  biopolymer transport protein ExbD/TolR  43.8 
 
 		 143 aa  108  3e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0027  TolR protein  41.04 
 
 		 139 aa  107  5e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.200658  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2324  biopolymer transport protein ExbD/TolR  45.45 
 
 		 156 aa  107  6e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0663066  normal  0.292388 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0671  ExbD/TolR family protein  45.45 
 
 		 156 aa  107  6e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.045773  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1908  ExbD/TolR family protein  41.27 
 
 		 141 aa  107  6e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0204  biopolymer transport protein ExbD  41.91 
 
 		 141 aa  106  8.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0412  TolR  39.57 
 
 		 147 aa  106  8.000000000000001e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.127174  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1762  protein TolR  39.57 
 
 		 147 aa  106  8.000000000000001e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2212  biopolymer transport TolR  45.16 
 
 		 140 aa  106  9.000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000000948089  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0143  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.96 
 
 		 148 aa  106  1e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2026  biopolymer ExbD/TolR family transporter  44.63 
 
 		 142 aa  106  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.597145  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2531  biopolymer transport protein  40.88 
 
 		 142 aa  106  1e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000400528  normal  0.955868 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2363  protein TolR  42.14 
 
 		 139 aa  106  1e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.372464 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2231  TolR protein  42.54 
 
 		 148 aa  105  2e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0564  protein TolR  41.67 
 
 		 150 aa  105  2e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.434395  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2977  TolR protein  42.22 
 
 		 144 aa  105  2e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4210  TonB system transport protein ExbD type-1  40.62 
 
 		 142 aa  105  2e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0705  biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.14 
 
 		 152 aa  105  2e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.105618  normal  0.350278 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36660  TolR protein  39.04 
 
 		 150 aa  105  2e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0583237  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3974  tolR protein  40.14 
 
 		 154 aa  104  3e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0054859  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1413  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.14 
 
 		 154 aa  104  3e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.039355  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>