More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1211 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_1211  translocation protein TolB  100 
 
 		 462 aa  918    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.896355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2627  translocation protein TolB  47.57 
 
 		 436 aa  419  1e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2122  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  49.77 
 
 		 446 aa  417  9.999999999999999e-116  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.256883  normal  0.227077 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1311  translocation protein TolB  49.64 
 
 		 444 aa  412  1e-114  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1094  translocation protein TolB  49.53 
 
 		 443 aa  410  1e-113  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3200  translocation protein TolB  50.36 
 
 		 435 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3056  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  50.48 
 
 		 450 aa  407  1.0000000000000001e-112  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0557578  normal  0.412166 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4751  translocation protein TolB  45.57 
 
 		 450 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3512  translocation protein TolB  45.57 
 
 		 450 aa  408  1.0000000000000001e-112  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2899  TolB domain-containing protein  47.89 
 
 		 469 aa  405  1.0000000000000001e-112  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000201302  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3495  translocation protein TolB  48.85 
 
 		 435 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.594815  normal  0.174219 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2717  translocation protein TolB  47.96 
 
 		 450 aa  404  1e-111  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.599754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1812  translocation protein TolB  48.2 
 
 		 449 aa  403  1e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.431319  normal  0.360787 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4147  translocation protein TolB  48.44 
 
 		 449 aa  403  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1218  translocation protein TolB  51.09 
 
 		 443 aa  403  1e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.27228  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1697  translocation protein TolB  50.61 
 
 		 443 aa  399  9.999999999999999e-111  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1639  translocation protein TolB  50.85 
 
 		 443 aa  400  9.999999999999999e-111  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6881  translocation protein TolB  48.89 
 
 		 462 aa  395  1e-109  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0464057 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3621  translocation protein TolB  49.39 
 
 		 435 aa  394  1e-108  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.578468  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4427  translocation protein TolB  48.46 
 
 		 441 aa  390  1e-107  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.500534 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3171  translocation protein TolB  47.94 
 
 		 439 aa  385  1e-105  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0216692  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0270  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  46.13 
 
 		 448 aa  370  1e-101  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.989147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0144  translocation protein TolB  45.87 
 
 		 442 aa  362  1e-98  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1111  translocation protein TolB  44.71 
 
 		 446 aa  361  2e-98  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00131159  normal  0.386204 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5302  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  45.03 
 
 		 446 aa  359  6e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.842711 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3387  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  43.3 
 
 		 442 aa  354  2e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.413738  normal  0.777637 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0744  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  43.88 
 
 		 445 aa  353  5e-96  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.950557  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4760  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  45.39 
 
 		 446 aa  352  1e-95  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.577654  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5227  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  45.39 
 
 		 446 aa  352  1e-95  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.175544  normal  0.115662 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4436  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  44 
 
 		 442 aa  348  2e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.314306  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0975  translocation protein TolB  43.76 
 
 		 445 aa  345  7e-94  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0670772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0669  translocation protein TolB  44.74 
 
 		 444 aa  343  2.9999999999999997e-93  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.303969  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2322  translocation protein TolB  44.74 
 
 		 444 aa  343  2.9999999999999997e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0205331  normal  0.53419 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0562  translocation protein TolB  43.78 
 
 		 444 aa  341  2e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.271593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2133  translocation protein TolB  44.05 
 
 		 439 aa  339  5.9999999999999996e-92  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2365  translocation protein TolB  41.45 
 
 		 441 aa  332  6e-90  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0686  translocation protein TolB  41.5 
 
 		 461 aa  329  7e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.223253  normal  0.228867 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2416  TolB domain-containing protein  39.73 
 
 		 453 aa  315  9.999999999999999e-85  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0393  translocation protein TolB  42.09 
 
 		 451 aa  309  5.9999999999999995e-83  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0328  translocation protein TolB  42.08 
 
 		 454 aa  303  6.000000000000001e-81  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1017  translocation protein TolB  39.09 
 
 		 461 aa  293  6e-78  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.609487  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0038  translocation protein TolB  38.44 
 
 		 420 aa  291  2e-77  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0823662  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0467  TolB domain-containing protein  38.77 
 
 		 450 aa  291  2e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.84052  normal  0.495381 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1984  translocation protein TolB  36.62 
 
 		 426 aa  236  6e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.517365  normal  0.378967 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0067  tol-pal system beta propeller repeat protein TolB  36.23 
 
 		 422 aa  235  1.0000000000000001e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.518188  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0068  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  36.23 
 
 		 422 aa  235  1.0000000000000001e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1723  translocation protein TolB  35.54 
 
 		 443 aa  232  1e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0502645 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1011  translocation protein TolB  34.34 
 
 		 421 aa  230  5e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2050  translocation protein TolB  36.62 
 
 		 429 aa  229  6e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3406  translocation protein TolB  36.06 
 
 		 438 aa  226  9e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.569267 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1981  translocation protein TolB  36.77 
 
 		 440 aa  225  1e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0242  translocation protein TolB  34.04 
 
 		 428 aa  224  3e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2092  translocation protein TolB  34.09 
 
 		 425 aa  223  7e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.626129  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3394  translocation protein TolB  37.01 
 
 		 441 aa  221  1.9999999999999999e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0076717 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0728  translocation protein TolB  34.85 
 
 		 434 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00650912  normal  0.160751 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4053  translocation protein TolB  35.28 
 
 		 437 aa  220  5e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2692  translocation protein TolB  37.11 
 
 		 408 aa  219  8.999999999999998e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.319845  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0735  translocation protein TolB  34.25 
 
 		 432 aa  218  2e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.9087  normal  0.380909 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2229  translocation protein TolB  31.48 
 
 		 435 aa  217  2.9999999999999998e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0795  translocation protein TolB  35.16 
 
 		 450 aa  217  2.9999999999999998e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0145  translocation protein TolB  34.91 
 
 		 434 aa  217  2.9999999999999998e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0566  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  32.93 
 
 		 428 aa  217  4e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.22163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0536  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  31.12 
 
 		 435 aa  215  9.999999999999999e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00175631  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2339  TolB-like protein  34.82 
 
 		 415 aa  215  9.999999999999999e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000041462  normal  0.0677463 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1346  translocation protein TolB  36.74 
 
 		 421 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2675  translocation protein TolB  34.91 
 
 		 446 aa  213  7e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.202485  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3119  translocation protein TolB  34.07 
 
 		 439 aa  212  1e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2206  translocation protein TolB  33.95 
 
 		 427 aa  212  1e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00281817 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1853  translocation protein TolB  32.78 
 
 		 428 aa  212  1e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0898  TolB-like  30.49 
 
 		 432 aa  211  2e-53  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000336659  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0025  tolB protein  32.11 
 
 		 432 aa  210  4e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0382531  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01564  translocation protein TolB  32.43 
 
 		 439 aa  210  5e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188797  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1944  translocation protein TolB  33.08 
 
 		 427 aa  209  7e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.526613 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0759  translocation protein TolB  32 
 
 		 430 aa  209  8e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.397862  normal  0.413932 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3920  translocation protein TolB  31.78 
 
 		 430 aa  208  2e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0501302 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2081  translocation protein TolB  34.46 
 
 		 433 aa  207  3e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0684  translocation protein TolB  34.6 
 
 		 434 aa  207  3e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.672983  normal  0.603997 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2661  translocation protein TolB  34.46 
 
 		 431 aa  207  3e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.622452  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0782  translocation protein TolB  34.94 
 
 		 425 aa  207  3e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0181245  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1949  translocation protein TolB  34.46 
 
 		 433 aa  207  3e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0827  translocation protein TolB  34.46 
 
 		 463 aa  207  4e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2587  translocation protein TolB  32 
 
 		 431 aa  206  5e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3323  WD40 domain-containing protein  32.13 
 
 		 435 aa  206  7e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000401957  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3540  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  33.62 
 
 		 429 aa  206  1e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.0000000000000050948  normal  1 
 
 
 
NC_010622  Bphy_2455  translocation protein TolB  31.78 
 
 		 430 aa  204  2e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.328002  normal  0.860267 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3241  translocation protein TolB  34.2 
 
 		 430 aa  204  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.786429  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3203  translocation protein TolB  34.2 
 
 		 430 aa  204  2e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.95129  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1229  translocation protein TolB  33.57 
 
 		 424 aa  204  3e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.910184  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3256  translocation protein TolB  34.2 
 
 		 463 aa  204  3e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1699  translocation protein TolB  31.25 
 
 		 442 aa  203  4e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.182328  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2529  translocation protein TolB  30.43 
 
 		 445 aa  203  5e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000000320948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0275  translocation protein TolB  31.16 
 
 		 436 aa  203  6e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00839364  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1415  translocation protein TolB  31.54 
 
 		 433 aa  202  8e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00100672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02684  translocation protein TolB  29.56 
 
 		 451 aa  201  1.9999999999999998e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0273488  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3972  tolB protein  31.54 
 
 		 433 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0956227  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4402  translocation protein TolB  31.51 
 
 		 414 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.145947  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2975  TolB protein  32.49 
 
 		 443 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.508751  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0694  translocation protein TolB  31.56 
 
 		 431 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.125399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0203  WD40 domain-containing protein  32.37 
 
 		 427 aa  201  3e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000381605  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0317  translocation protein TolB  33.33 
 
 		 431 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0520547  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>