More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1166 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_1166  fumarate hydratase, class II  100 
 
 		 482 aa  980    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4865  fumarate hydratase  67.22 
 
 		 485 aa  643    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.649966 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1545  fumarate hydratase  70.04 
 
 		 485 aa  700    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1440  fumarate lyase  68.35 
 
 		 482 aa  615  1e-175  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0425  fumarate hydratase  61.83 
 
 		 498 aa  608  1e-173  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1618  fumarate hydratase  60.59 
 
 		 485 aa  602  1.0000000000000001e-171  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1627  fumarate hydratase  60.65 
 
 		 468 aa  590  1e-167  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7115  fumarate hydratase, class II  62.58 
 
 		 487 aa  576  1.0000000000000001e-163  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.257416  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2731  fumarate hydratase, class II  57.11 
 
 		 471 aa  556  1e-157  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.799595  normal  0.207959 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1007  fumarate hydratase  57.77 
 
 		 463 aa  556  1e-157  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0281395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1328  fumarate hydratase  56.04 
 
 		 469 aa  557  1e-157  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.50715  normal  0.832729 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2866  fumarate hydratase  57.33 
 
 		 463 aa  551  1e-156  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3005  fumarate hydratase  57.11 
 
 		 464 aa  550  1e-155  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2334  fumarate hydratase  58.5 
 
 		 465 aa  548  1e-155  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00667023  normal  0.148736 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1238  fumarate hydratase  54.61 
 
 		 459 aa  548  1e-155  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1197  fumarate hydratase  54.61 
 
 		 459 aa  546  1e-154  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2918  fumarate hydratase, class II  58.02 
 
 		 464 aa  539  9.999999999999999e-153  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1452  fumarate hydratase  56.67 
 
 		 465 aa  540  9.999999999999999e-153  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.315875 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3201  fumarate hydratase, class II  58.02 
 
 		 464 aa  540  9.999999999999999e-153  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1908  fumarate hydratase  57.33 
 
 		 465 aa  540  9.999999999999999e-153  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.856676  normal  0.217565 
 
 
-
 
NC_002978  WD0492  fumarate hydratase  54.82 
 
 		 464 aa  536  1e-151  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.212311  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2138  fumarate hydratase  56.67 
 
 		 464 aa  535  1e-151  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.273045  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2129  fumarate hydratase  60 
 
 		 487 aa  536  1e-151  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  unclonable  0.000218779  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3242  fumarate hydratase, class II  56.36 
 
 		 465 aa  528  1e-149  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01700  fumarate hydratase, putative  55.1 
 
 		 510 aa  528  1e-149  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85745  fumarase  56.02 
 
 		 463 aa  531  1e-149  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1071  fumarate hydratase  56.18 
 
 		 465 aa  529  1e-149  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0083  fumarate hydratase  57.36 
 
 		 466 aa  529  1e-149  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0721  fumarate hydratase  56.67 
 
 		 464 aa  529  1e-149  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.764225 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0494  fumarate hydratase, class II  55.6 
 
 		 464 aa  531  1e-149  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.172647  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1449  fumarate hydratase  54.66 
 
 		 513 aa  526  1e-148  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.352432 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1724  fumarate hydratase  54.66 
 
 		 513 aa  525  1e-148  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.90897  decreased coverage  0.00664146 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2394  fumarate hydratase  55.14 
 
 		 462 aa  526  1e-148  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.344054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0812  fumarate hydratase  56.67 
 
 		 464 aa  525  1e-148  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.661312 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1667  fumarate hydratase  56.43 
 
 		 462 aa  524  1e-147  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0452593 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2445  fumarate hydratase  56.14 
 
 		 466 aa  523  1e-147  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.890321  normal  0.353648 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0637  fumarate hydratase  54.39 
 
 		 461 aa  523  1e-147  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.536555  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1696  fumarate hydratase  59.96 
 
 		 458 aa  523  1e-147  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.397787  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1576  fumarate hydratase  54.96 
 
 		 482 aa  523  1e-147  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0866386  normal  0.827447 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1686  fumarate hydratase  55.63 
 
 		 467 aa  521  1e-147  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.569967  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1279  fumarate hydratase  57.33 
 
 		 461 aa  518  1e-146  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74587  Fumarase converts fumaric acid to L-malic acid in the TCA cycle  54.68 
 
 		 492 aa  520  1e-146  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.595402 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1705  fumarate hydratase  55.41 
 
 		 467 aa  518  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0627343  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2970  fumarate hydratase  52.28 
 
 		 468 aa  520  1e-146  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0376  fumarate hydratase  54.17 
 
 		 461 aa  518  1e-146  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1578  fumarate hydratase  55.41 
 
 		 467 aa  518  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.952 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2040  fumarate hydratase  55.8 
 
 		 465 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.938947  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0192  fumarate hydratase  56.14 
 
 		 463 aa  516  1.0000000000000001e-145  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1874  fumarate hydratase  55.41 
 
 		 467 aa  517  1.0000000000000001e-145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0300838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0283  fumarate hydratase, class II  56.37 
 
 		 468 aa  517  1.0000000000000001e-145  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.136542 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1818  fumarate hydratase  55.84 
 
 		 467 aa  515  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0435049  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1637  fumarate hydratase  55.41 
 
 		 467 aa  517  1.0000000000000001e-145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.799774 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0355  fumarate hydratase  57.08 
 
 		 463 aa  515  1.0000000000000001e-145  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0771995  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1627  fumarate hydratase class II  57.52 
 
 		 463 aa  514  1.0000000000000001e-145  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2341  fumarate hydratase  55.58 
 
 		 465 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1568  fumarate hydratase  55.41 
 
 		 467 aa  517  1.0000000000000001e-145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.366448  normal  0.0865298 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08707  fumarate hydratase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G02470)  54.11 
 
 		 544 aa  511  1e-144  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2032  fumarate hydratase, class II  55.63 
 
 		 467 aa  513  1e-144  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000761073  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1873  fumarate hydratase  55.36 
 
 		 465 aa  511  1e-144  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0104019  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2881  fumarate hydratase  57.14 
 
 		 468 aa  514  1e-144  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4014  fumarate hydratase  57.02 
 
 		 475 aa  513  1e-144  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0174  fumarate hydratase  55.92 
 
 		 478 aa  514  1e-144  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.000137978  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3022  fumarate hydratase  55.48 
 
 		 463 aa  513  1e-144  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2019  fumarate hydratase  55.63 
 
 		 467 aa  512  1e-144  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2320  fumarate hydratase  55.63 
 
 		 467 aa  513  1e-144  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.109369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1796  fumarate hydratase  55.63 
 
 		 467 aa  513  1e-144  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.114122  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2270  fumarate hydratase  55.36 
 
 		 465 aa  511  1e-144  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3664  fumarate hydratase  54.68 
 
 		 462 aa  513  1e-144  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3367  fumarate hydratase  55.12 
 
 		 463 aa  513  1e-144  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.328502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6106  fumarate hydratase  55.48 
 
 		 474 aa  513  1e-144  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01580  fumarate hydratase  55.41 
 
 		 467 aa  510  1e-143  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.191338  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2664  fumarate hydratase, class II  56.58 
 
 		 472 aa  510  1e-143  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.613599  normal  0.60037 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01570  hypothetical protein  55.41 
 
 		 467 aa  510  1e-143  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.24852  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2151  fumarate hydratase, class II  57.55 
 
 		 467 aa  510  1e-143  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0733926 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2237  fumarate hydratase  54.92 
 
 		 463 aa  511  1e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.416397 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1589  fumarate hydratase  55.41 
 
 		 467 aa  509  1e-143  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.194502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0240  fumarate hydratase  57.36 
 
 		 466 aa  511  1e-143  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2891  fumarate hydratase, class II  56.58 
 
 		 472 aa  509  1e-143  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.104385 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1685  fumarate hydratase  56.33 
 
 		 464 aa  509  1e-143  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2030  fumarate hydratase  57.3 
 
 		 472 aa  511  1e-143  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.212557 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2077  fumarate hydratase  55.58 
 
 		 463 aa  508  1e-143  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2655  fumarate hydratase  55.46 
 
 		 463 aa  511  1e-143  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0321342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2016  fumarate hydratase  55.36 
 
 		 463 aa  511  1e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1901  fumarate hydratase  55.8 
 
 		 470 aa  508  9.999999999999999e-143  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.687119  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0889  fumarate hydratase  55.68 
 
 		 464 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.445127  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2137  fumarate hydratase  56.33 
 
 		 465 aa  508  9.999999999999999e-143  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2826  fumarate hydratase  55.68 
 
 		 464 aa  504  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.841054  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2279  fumarate hydratase  55.14 
 
 		 465 aa  506  9.999999999999999e-143  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.108005 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0493  fumarate hydratase  55.68 
 
 		 464 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4127  fumarate hydratase  55.36 
 
 		 461 aa  507  9.999999999999999e-143  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.542273  normal  0.221641 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4239  fumarate hydratase  55.36 
 
 		 461 aa  507  9.999999999999999e-143  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2940  fumarate hydratase  55.68 
 
 		 464 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00014001  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1120  fumarate hydratase  54.27 
 
 		 456 aa  508  9.999999999999999e-143  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0424  fumarate hydratase  51.42 
 
 		 463 aa  505  9.999999999999999e-143  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0259  fumarate hydratase  55.68 
 
 		 464 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.389024  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4795  fumarate hydratase, class II  57.17 
 
 		 464 aa  506  9.999999999999999e-143  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2515  fumarate hydratase  55.68 
 
 		 464 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.324013  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1832  fumarate hydratase  55.36 
 
 		 464 aa  506  9.999999999999999e-143  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.87946  hitchhiker  0.00222416 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1985  fumarate hydratase  54.92 
 
 		 465 aa  508  9.999999999999999e-143  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1174  fumarate hydratase  54.39 
 
 		 462 aa  506  9.999999999999999e-143  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.715277  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>