More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1135 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_1135  protease Do  100 
 
 		 535 aa  1053    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2201  peptidase S1C, Do  49.7 
 
 		 508 aa  445  1.0000000000000001e-124  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2778  protease Do  49.8 
 
 		 511 aa  430  1e-119  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.725165  normal  0.242961 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2461  protease Do  47.49 
 
 		 487 aa  428  1e-118  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.282198 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0704  protease Do  49.36 
 
 		 500 aa  426  1e-118  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.762947  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1086  protease Do  48.83 
 
 		 501 aa  419  1e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0760064 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2725  peptidase S1C, Do  49.17 
 
 		 497 aa  421  1e-116  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2656  protease Do  48.58 
 
 		 511 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.419635 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2883  protease Do  48.58 
 
 		 511 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1394  serine protease Do, putative  47.29 
 
 		 524 aa  414  1e-114  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1797  protease Do  47.88 
 
 		 520 aa  413  1e-114  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2346  peptidase S1C, Do  47.6 
 
 		 496 aa  411  1e-113  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.466246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1350  putative serine protease Do  47.09 
 
 		 524 aa  410  1e-113  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1733  protease Do  43.43 
 
 		 522 aa  405  1.0000000000000001e-112  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.613226  hitchhiker  0.00274873 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6094  putative Serine protease do-like precursor  47.6 
 
 		 498 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0606  protease Do  46.53 
 
 		 523 aa  402  1e-111  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0210206 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4529  protease Do  48.44 
 
 		 516 aa  402  1e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.366084 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4002  protease Do  49.47 
 
 		 501 aa  403  1e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2812  serine protease  46.76 
 
 		 528 aa  402  1e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.498431  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1661  protease Do  49.36 
 
 		 498 aa  405  1e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.179012 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1746  protease Do  48.01 
 
 		 471 aa  403  1e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3259  peptidase S1C, Do  48.28 
 
 		 497 aa  398  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.324344  normal  0.259222 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0943  protease Do  46.15 
 
 		 491 aa  393  1e-108  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.250261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3349  peptidase S1C, Do  48.74 
 
 		 499 aa  393  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.181903 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2733  protease do precursor  45.68 
 
 		 501 aa  387  1e-106  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0138399  normal  0.054673 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2041  peptidase S1C, Do  48.61 
 
 		 498 aa  387  1e-106  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0922  protease Do family protein  45.89 
 
 		 496 aa  380  1e-104  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.726985  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2798  protease Do  54.08 
 
 		 588 aa  378  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.83064  normal  0.454962 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1999  protease Do  47 
 
 		 506 aa  376  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0697759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0887  protease Do  46.07 
 
 		 493 aa  376  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0626906  normal  0.172287 
 
 
-
 
NC_004310  BR0611  serine protease  45.66 
 
 		 513 aa  373  1e-102  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0355  serine protease  46.6 
 
 		 493 aa  375  1e-102  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.459558  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0610  serine protease  45.66 
 
 		 513 aa  373  1e-102  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2539  protease Do  54.72 
 
 		 578 aa  374  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.874075 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2014  protease Do  44.35 
 
 		 502 aa  365  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5052  protease Do  44.47 
 
 		 520 aa  369  1e-100  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.610685  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3077  putative serine protease do-like precursor  45.8 
 
 		 527 aa  366  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1382  protease Do  43.13 
 
 		 514 aa  364  2e-99  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.490263  normal  0.542535 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2667  protease Do  44.77 
 
 		 520 aa  364  3e-99  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2235  protease Do  44.53 
 
 		 529 aa  363  3e-99  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.355037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0637  protease Do  42.57 
 
 		 517 aa  363  4e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.136267  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2022  protease Do  44.57 
 
 		 459 aa  363  6e-99  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.303504 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1953  peptidase S1C, Do  44.44 
 
 		 499 aa  360  3e-98  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.100212  normal  0.0596559 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2140  protease Do  44.33 
 
 		 523 aa  359  7e-98  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.750781  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1019  peptidase S1C, Do  45.21 
 
 		 525 aa  354  2.9999999999999997e-96  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1841  peptidase S1C, Do  44.35 
 
 		 528 aa  353  5e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1441  peptidase S1C, Do  44.01 
 
 		 523 aa  353  5.9999999999999994e-96  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2011  peptidase S1C, Do  44.33 
 
 		 526 aa  352  7e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.963752 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3443  peptidase S1C, Do  44.14 
 
 		 528 aa  351  2e-95  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.203092  normal  0.0980299 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0188  protease Do  44.89 
 
 		 524 aa  349  6e-95  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.463194 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3170  peptidase S1C, Do  43.01 
 
 		 515 aa  348  1e-94  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.963921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1195  peptidase S1C, Do  45.17 
 
 		 516 aa  347  2e-94  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0871  protease Do  43.53 
 
 		 500 aa  347  3e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0434  protease Do family protein  38.96 
 
 		 505 aa  346  5e-94  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0763  protease Do  42.74 
 
 		 501 aa  346  6e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3140  hypothetical protein  45.82 
 
 		 483 aa  343  5e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.673481  normal  0.234219 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0924  protease Do  40.7 
 
 		 527 aa  342  7e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.010153  normal  0.0275633 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1368  serine protease DO-like protease  41.03 
 
 		 491 aa  339  9e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.200414  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5235  protease Do  44.61 
 
 		 501 aa  338  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1073  protease Do  40.49 
 
 		 527 aa  338  1.9999999999999998e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.952362 
 
 
-
 
NC_002978  WD0833  protease DO  40.43 
 
 		 497 aa  337  2.9999999999999997e-91  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0653734  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1014  peptidase S1C, Do  45.18 
 
 		 476 aa  337  2.9999999999999997e-91  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5428  protease Do  44.66 
 
 		 508 aa  333  4e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.025142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2354  protease Do  44.08 
 
 		 518 aa  333  4e-90  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3242  putative trypsin-like serine protease  44.4 
 
 		 483 aa  333  7.000000000000001e-90  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.263085  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3978  protease Do  44.19 
 
 		 483 aa  332  9e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0104728  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5887  protease Do  41.75 
 
 		 504 aa  331  2e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.685816  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6504  protease Do  40.76 
 
 		 502 aa  330  3e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1208  protease Do  43.07 
 
 		 475 aa  329  7e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0118678  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5157  protease Do  44.42 
 
 		 503 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0527663 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4692  protease Do  43.99 
 
 		 503 aa  328  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.601387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3516  protease Do  41.67 
 
 		 537 aa  325  9e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.277095 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0308  protease Do  42.83 
 
 		 481 aa  325  1e-87  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.582048 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0901  protease Do  44.26 
 
 		 509 aa  325  1e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.24208  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5124  protease Do  45.69 
 
 		 496 aa  324  2e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.38057 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3827  protease Do  43.53 
 
 		 496 aa  324  3e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1467  serine protease, MucD  39.57 
 
 		 473 aa  323  6e-87  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.627151  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3083  trypsin-like serine protease  45.17 
 
 		 462 aa  322  7e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2470  serine protease, MucD  40.47 
 
 		 502 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1793  serine protease, MucD  40.47 
 
 		 502 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.455589  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2811  serine protease, MucD  40.47 
 
 		 502 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5274  protease Do  40.93 
 
 		 501 aa  322  9.999999999999999e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2174  protease Do  42.46 
 
 		 490 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.281026 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0837  protease Do  42.77 
 
 		 476 aa  321  1.9999999999999998e-86  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.134567  normal  0.708087 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4136  protease Do  42.24 
 
 		 496 aa  318  1e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0837  protease Do  41.92 
 
 		 502 aa  318  2e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0984  protease Do  41.54 
 
 		 485 aa  317  2e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1611  protease Do  43.33 
 
 		 482 aa  318  2e-85  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.4051  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0228  protease Do  42.98 
 
 		 457 aa  318  2e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1010  protease Do  42.83 
 
 		 499 aa  317  5e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.644369  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0539  serine protease, MucD  40.49 
 
 		 461 aa  316  6e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.794345  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1088  protease Do  40.73 
 
 		 498 aa  316  8e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.648763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1130  protease Do  40.73 
 
 		 498 aa  316  8e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3362  peptidase S1C, Do  42.4 
 
 		 464 aa  316  8e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000016609  decreased coverage  0.00312332 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0650  peptidase S1C, Do  40.73 
 
 		 498 aa  316  8e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1006  protease Do  42.62 
 
 		 499 aa  316  9e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.836835  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1726  serine protease, MucD  40.37 
 
 		 485 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1773  protease Do  40.76 
 
 		 489 aa  314  2.9999999999999996e-84  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000225032  hitchhiker  0.000850393 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4295  protease Do  41.01 
 
 		 466 aa  314  2.9999999999999996e-84  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000836052  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2898  peptidase  40.38 
 
 		 485 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>