More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1097 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_1097  pyrroline-5-carboxylate reductase  100 
 
 
273 aa  531  1e-150  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.616972  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2704  pyrroline-5-carboxylate reductase  50.97 
 
 
270 aa  197  1.0000000000000001e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3168  pyrroline-5-carboxylate reductase  46.4 
 
 
273 aa  197  2.0000000000000003e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.624032  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3281  pyrroline-5-carboxylate reductase  48.89 
 
 
274 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2538  pyrroline-5-carboxylate reductase  46.89 
 
 
278 aa  197  2.0000000000000003e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4871  pyrroline-5-carboxylate reductase  48.13 
 
 
268 aa  194  1e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.552368 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1743  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.76 
 
 
273 aa  192  5e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.126409 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2514  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.32 
 
 
301 aa  190  2e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.332545 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3106  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.15 
 
 
278 aa  189  5e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3882  pyrroline-5-carboxylate reductase  46.64 
 
 
281 aa  187  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2249  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.61 
 
 
274 aa  186  3e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4171  pyrroline-5-carboxylate reductase  46.64 
 
 
281 aa  185  7e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.539807 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2265  pyrroline-5-carboxylate reductase  46.56 
 
 
293 aa  185  8e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.739581 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4850  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.78 
 
 
277 aa  182  7e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1323  pyrroline-5-carboxylate reductase  47.97 
 
 
273 aa  181  1e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.709486  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4024  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.36 
 
 
276 aa  178  7e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.324563  normal  0.363297 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4063  pyrroline-5-carboxylate reductase  46.82 
 
 
277 aa  177  1e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.903054  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1406  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.4 
 
 
266 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.257606 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4946  pyrroline-5-carboxylate reductase  49.81 
 
 
277 aa  177  2e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.891745  hitchhiker  0.000000908822 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3018  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.24 
 
 
275 aa  177  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3963  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.96 
 
 
280 aa  176  4e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.93073  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2755  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.61 
 
 
275 aa  176  5e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3769  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.69 
 
 
277 aa  175  8e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.477016  normal  0.790636 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3328  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.95 
 
 
269 aa  174  9.999999999999999e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.639937 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3009  pyrroline-5-carboxylate reductase  46.86 
 
 
273 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.575876  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0782  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.96 
 
 
271 aa  172  3.9999999999999995e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0732  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.96 
 
 
271 aa  172  3.9999999999999995e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2645  pyrroline-5-carboxylate reductase  49.8 
 
 
273 aa  165  6.9999999999999995e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1258  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.44 
 
 
276 aa  165  6.9999999999999995e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00981476 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1362  pyrroline-5-carboxylate reductase  47.37 
 
 
272 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.65645  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3364  pyrroline-5-carboxylate reductase  46.39 
 
 
255 aa  162  8.000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0881  pyrroline-5-carboxylate reductase  47.37 
 
 
277 aa  161  1e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.120962  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0623  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.12 
 
 
271 aa  160  2e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.648438 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1138  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.57 
 
 
273 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00268881 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2198  pyrroline-5-carboxylate reductase  47.19 
 
 
267 aa  154  2e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00651972  normal  0.884064 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2417  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.83 
 
 
271 aa  153  2e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0151  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.3 
 
 
269 aa  152  5e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.779735  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9249  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.6 
 
 
300 aa  152  7e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0562195  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4151  pyrroline-5-carboxylate reductase  40 
 
 
273 aa  150  2e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5474  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.34 
 
 
273 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0601  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.79 
 
 
280 aa  146  3e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0337  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.09 
 
 
282 aa  146  3e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000202087  hitchhiker  0.00000000614659 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5047  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.81 
 
 
272 aa  147  3e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.518044  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3701  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.15 
 
 
274 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0929  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.85 
 
 
273 aa  146  4.0000000000000006e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.117445  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0946  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.73 
 
 
276 aa  145  6e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1785  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.63 
 
 
289 aa  145  7.0000000000000006e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07387  Pyrroline-5-carboxylate reductase (EC 1.5.1.2) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q96WX7]  34.74 
 
 
283 aa  145  8.000000000000001e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2260  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.21 
 
 
293 aa  143  3e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.423593  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0340  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.91 
 
 
275 aa  143  3e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0129  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.35 
 
 
280 aa  143  3e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000153189  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0381  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.27 
 
 
288 aa  142  4e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0372  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.27 
 
 
288 aa  142  5e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.338962  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5062  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.35 
 
 
285 aa  142  7e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25166  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3656  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.07 
 
 
270 aa  142  7e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.443187  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1502  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.59 
 
 
289 aa  142  8e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.829406 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5145  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.26 
 
 
272 aa  142  9e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2167  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.29 
 
 
284 aa  140  1.9999999999999998e-32  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2901  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.41 
 
 
270 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000081741  unclonable  0.000000152537 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5320  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.75 
 
 
272 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.219682 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3093  pyrroline-5-carboxylate reductase  40 
 
 
273 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0431736  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2416  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.03 
 
 
272 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03070  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.96 
 
 
272 aa  140  1.9999999999999998e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0995956  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5003  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.2 
 
 
264 aa  139  4.999999999999999e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.102233  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1997  hypothetical protein  40.58 
 
 
262 aa  139  6e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3885  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.13 
 
 
270 aa  139  6e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0846425  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3642  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.9 
 
 
285 aa  138  8.999999999999999e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4968  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.11 
 
 
272 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3055  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.64 
 
 
274 aa  138  1e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.145614  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5095  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.11 
 
 
272 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.364055  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0370  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.11 
 
 
272 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05150  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.23 
 
 
273 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.59347  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0193  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.21 
 
 
267 aa  136  5e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1535  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.36 
 
 
274 aa  136  5e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4472  pyrroline-5-carboxylate reductase  40 
 
 
268 aa  135  6.0000000000000005e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.432942  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0581  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.7 
 
 
271 aa  135  6.0000000000000005e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.948649  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_181  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.83 
 
 
267 aa  135  6.0000000000000005e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.136848  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0476  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.94 
 
 
272 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0759  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.46 
 
 
273 aa  135  8e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0439  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.6 
 
 
275 aa  135  8e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000148938 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0262  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.6 
 
 
275 aa  135  8e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.777137  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2109  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.71 
 
 
269 aa  135  9e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.663148  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2802  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.34 
 
 
278 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2947  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.17 
 
 
272 aa  134  9.999999999999999e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.810347  hitchhiker  0.0042807 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2508  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.11 
 
 
274 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0493  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.23 
 
 
273 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0761  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.4 
 
 
292 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1992  hypothetical protein  39.13 
 
 
262 aa  134  1.9999999999999998e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3002  Delta 1-pyrroline-5-carboxylate reductase  37.87 
 
 
278 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0160  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.94 
 
 
267 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0764  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.75 
 
 
280 aa  134  1.9999999999999998e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.253499 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2684  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.37 
 
 
274 aa  133  3e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.280791 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3795  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.1 
 
 
269 aa  132  5e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0831544  normal  0.322832 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3451  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.69 
 
 
273 aa  132  9e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00381464  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4031  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.8 
 
 
273 aa  131  1.0000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00394027 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1383  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.4 
 
 
263 aa  130  2.0000000000000002e-29  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1287  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.41 
 
 
270 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1839  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.44 
 
 
282 aa  130  2.0000000000000002e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0139  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.97 
 
 
273 aa  131  2.0000000000000002e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00280777 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2920  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.86 
 
 
275 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.495585  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>