176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0952 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_0952  Carboxymuconolactone decarboxylase  100 
 
 
127 aa  248  3e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2188  carboxymuconolactone decarboxylase  36 
 
 
129 aa  86.7  9e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0089  carboxymuconolactone decarboxylase  34.43 
 
 
128 aa  86.3  1e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4266  carboxymuconolactone decarboxylase  34.43 
 
 
128 aa  86.3  1e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0086  Carboxymuconolactone decarboxylase  34.43 
 
 
128 aa  86.3  1e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0083  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  34.43 
 
 
128 aa  85.5  2e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2385  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  38.84 
 
 
132 aa  84  7e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1817  Carboxymuconolactone decarboxylase  39.5 
 
 
152 aa  84  7e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.291528 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2219  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein  38.84 
 
 
132 aa  84  7e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2257  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein  38.84 
 
 
132 aa  84  7e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.769981  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0089  carboxymuconolactone decarboxylase  33.61 
 
 
128 aa  83.6  8e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1373  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  38.84 
 
 
132 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.378973  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1863  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  38.84 
 
 
132 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0034  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  38.84 
 
 
132 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0633482  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1134  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  38.84 
 
 
132 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0083  carboxymuconolactone decarboxylase  33.61 
 
 
128 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2370  putative carboxymuconolactone decarboxylase  38.66 
 
 
148 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.006176  normal  0.29565 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6236  carboxymuconolactone decarboxylase  39.67 
 
 
144 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.291446  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1843  carboxymuconolactone decarboxylase  39.67 
 
 
144 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.19287  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1867  carboxymuconolactone decarboxylase  39.67 
 
 
144 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.159406  hitchhiker  0.000781215 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5144  carboxymuconolactone decarboxylase  39.67 
 
 
144 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0349025  normal  0.605964 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3680  Carboxymuconolactone decarboxylase  38.21 
 
 
152 aa  81.3  0.000000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1753  carboxymuconolactone decarboxylase  39.67 
 
 
144 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.165068 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2209  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  38.84 
 
 
132 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.231556  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0944  carboxymuconolactone decarboxylase  42.02 
 
 
132 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.292875  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1781  carboxymuconolactone decarboxylase  39.67 
 
 
144 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3139  putative 4-carboxymuconolactone decarboxylase  32.23 
 
 
132 aa  79  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.287088  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1568  carboxymuconolactone decarboxylase  43.88 
 
 
109 aa  77.8  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.630321 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1703  Carboxymuconolactone decarboxylase  37.19 
 
 
131 aa  78.2  0.00000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.232307  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1479  carboxymuconolactone decarboxylase  34.43 
 
 
133 aa  77  0.00000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2083  Carboxymuconolactone decarboxylase  42.72 
 
 
123 aa  77  0.00000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.995495 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2477  Carboxymuconolactone decarboxylase  43.3 
 
 
118 aa  76.3  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.333736 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4060  Carboxymuconolactone decarboxylase  39.25 
 
 
136 aa  75.9  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.735994  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7471  Carboxymuconolactone decarboxylase  37.19 
 
 
299 aa  75.5  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4049  carboxymuconolactone decarboxylase  33.06 
 
 
134 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2653  Carboxymuconolactone decarboxylase  36.67 
 
 
138 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1430  carboxymuconolactone decarboxylase  38.02 
 
 
145 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.346703  hitchhiker  0.00433375 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5696  carboxymuconolactone decarboxylase  33.61 
 
 
130 aa  71.6  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3873  carboxymuconolactone decarboxylase  30.58 
 
 
125 aa  72  0.000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001374  4-carboxymuconolactone decarboxylase  30.33 
 
 
125 aa  71.6  0.000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000000210016  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0016  carboxymuconolactone decarboxylase  37.04 
 
 
261 aa  71.6  0.000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2098  carboxymuconolactone decarboxylase  35.29 
 
 
295 aa  70.9  0.000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.327283  normal  0.0268513 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0837  putative carboxymuconolactone decarboxylase  40 
 
 
110 aa  70.1  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02340  Carboxymuconolactone decarboxylase  34.45 
 
 
138 aa  68.9  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0293457  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2473  Carboxymuconolactone decarboxylase  32.76 
 
 
260 aa  68.6  0.00000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.15664  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1856  carboxymuconolactone decarboxylase  35 
 
 
275 aa  65.9  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.519725  normal  0.376905 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2524  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  41.11 
 
 
136 aa  64.7  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.303227  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1186  carboxymuconolactone decarboxylase  41.11 
 
 
136 aa  64.7  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.396733  normal  0.385259 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1996  carboxymuconolactone decarboxylase  41.11 
 
 
136 aa  64.7  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0349754  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3780  carboxymuconolactone decarboxylase  33.9 
 
 
218 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.971956  normal  0.723827 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2239  gamma-carboxymuconolactone decarboxylase  29.2 
 
 
122 aa  59.3  0.00000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2236  carboxymuconolactone decarboxylase  33.61 
 
 
134 aa  58.9  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.32284 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3648  carboxymuconolactone decarboxylase  30.16 
 
 
129 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00963465  normal  0.158809 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1188  carboxymuconolactone decarboxylase  35.96 
 
 
128 aa  57.8  0.00000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.373506  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2082  carboxymuconolactone decarboxylase  30.16 
 
 
129 aa  57.8  0.00000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.984068 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2260  carboxymuconolactone decarboxylase  31.45 
 
 
129 aa  57  0.00000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2296  4-carboxymuconolactone decarboxylase  32 
 
 
123 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0265397  normal  0.659303 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2255  carboxymuconolactone decarboxylase  30.65 
 
 
129 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.344767  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4934  carboxymuconolactone decarboxylase  28.81 
 
 
150 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.249654  decreased coverage  0.00938968 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2568  carboxymuconolactone decarboxylase  31.82 
 
 
132 aa  54.7  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.136392 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3442  4-carboxymuconolactone decarboxylase  29.17 
 
 
127 aa  53.5  0.0000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.222691  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0521  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  28.93 
 
 
127 aa  53.5  0.000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.66457 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4016  3-oxoadipate enol-lactonase  32.79 
 
 
392 aa  52.4  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00993372  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0755  carboxymuconolactone decarboxylase  32.58 
 
 
124 aa  52  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.152085  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3347  3-oxoadipate enol-lactonase  34.52 
 
 
391 aa  52  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000820278  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3235  4-carboxymuconolactone decarboxylase  27.5 
 
 
129 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.621974  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2504  4-carboxymuconolactone decarboxylase  30.1 
 
 
129 aa  51.6  0.000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3046  carboxymuconolactone decarboxylase  31.87 
 
 
106 aa  51.2  0.000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0655  Carboxymuconolactone decarboxylase  33.33 
 
 
398 aa  50.4  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.47766  normal  0.236933 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5081  Carboxymuconolactone decarboxylase  37.08 
 
 
122 aa  50.4  0.000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3850  4-carboxymuconolactone decarboxylase  38.67 
 
 
161 aa  50.1  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1701  4-carboxymuconolactone decarboxylase  31.82 
 
 
393 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0186237  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1011  4-carboxymuconolactone decarboxylase  31.45 
 
 
402 aa  50.1  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.101506  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1729  4-carboxymuconolactone decarboxylase  31.82 
 
 
393 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1745  4-carboxymuconolactone decarboxylase  31.82 
 
 
393 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1679  4-carboxymuconolactone decarboxylase  31.82 
 
 
393 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.412767  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0527  4-carboxymuconolactone decarboxylase  31.82 
 
 
393 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.556905  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1806  Carboxymuconolactone decarboxylase  36.25 
 
 
255 aa  50.1  0.00001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0201167 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1069  Carboxymuconolactone decarboxylase  30.69 
 
 
118 aa  49.3  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00016362  normal  0.935882 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0563  4-carboxymuconolactone decarboxylase  31.82 
 
 
393 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.260619  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1323  carboxymuconolactone decarboxylase  31.33 
 
 
137 aa  49.3  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.376227  normal  0.0337516 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2114  Carboxymuconolactone decarboxylase  33.33 
 
 
107 aa  48.9  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000414856 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2707  gamma-carboxymuconolactone decarboxylase subunit-like protein  31.13 
 
 
139 aa  48.5  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0608  Carboxymuconolactone decarboxylase  32.58 
 
 
99 aa  48.1  0.00004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2322  4-carboxymuconolactone decarboxylase  29.41 
 
 
129 aa  48.1  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.254356  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2126  carboxymuconolactone decarboxylase  28.46 
 
 
132 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.191574  normal  0.330128 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32360  Carboxymuconolactone decarboxylase protein  31.87 
 
 
256 aa  47.8  0.00005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0381  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  26.72 
 
 
131 aa  47.8  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.07667  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2511  Carboxymuconolactone decarboxylase  32.95 
 
 
281 aa  47.8  0.00006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.955694  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0976  putative gamma carboxymuconolactone decarboxylase  27.27 
 
 
131 aa  47.4  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.602862 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0448  carboxymuconolactone decarboxylase  26.72 
 
 
131 aa  47.8  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2342  4-carboxymuconolactone decarboxylase  27.05 
 
 
132 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3215  carboxymuconolactone decarboxylase  27.87 
 
 
124 aa  47.4  0.00007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2974  4-carboxymuconolactone decarboxylase  25.6 
 
 
125 aa  47.4  0.00007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2144  carboxymuconolactone decarboxylase  32.32 
 
 
268 aa  47.4  0.00008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000390984 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2361  hypothetical protein  31.9 
 
 
127 aa  47  0.00009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.850012 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1216  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  27.48 
 
 
132 aa  47  0.00009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0658576  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5797  carboxymuconolactone decarboxylase  27.87 
 
 
131 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.10545  normal  0.0382532 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0830  carboxymuconolactone decarboxylase  27.5 
 
 
126 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2061  4-carboxymuconolactone decarboxylase  34.78 
 
 
132 aa  46.2  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>