More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0928 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_0928  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 383 aa  771    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.559929 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6616  FAD dependent oxidoreductase  60 
 
 		 389 aa  425  1e-118  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.144379 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6214  FAD dependent oxidoreductase  60 
 
 		 389 aa  426  1e-118  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6383  FAD dependent oxidoreductase  60 
 
 		 389 aa  425  1e-118  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0688  FAD dependent oxidoreductase  57.18 
 
 		 382 aa  412  1e-114  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.148887  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6006  FAD dependent oxidoreductase  32.24 
 
 		 386 aa  150  4e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0918  FAD dependent oxidoreductase  30.59 
 
 		 960 aa  146  5e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0721  FAD dependent oxidoreductase  28.35 
 
 		 983 aa  146  8.000000000000001e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3630  FAD dependent oxidoreductase  30.5 
 
 		 383 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.508922 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4733  FAD dependent oxidoreductase  30.5 
 
 		 383 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.233714  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6625  FAD dependent oxidoreductase  30.46 
 
 		 383 aa  142  7e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3210  FAD dependent oxidoreductase  29.65 
 
 		 378 aa  142  7e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.2962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0048  FAD dependent oxidoreductase  28.72 
 
 		 376 aa  142  9e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4345  FAD dependent oxidoreductase  31.56 
 
 		 376 aa  142  9e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.957412 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7056  FAD dependent oxidoreductase  29.52 
 
 		 393 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.370606 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6084  FAD dependent oxidoreductase  30.08 
 
 		 389 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.793169 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0151  FAD dependent oxidoreductase  28.29 
 
 		 389 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1890  FAD dependent oxidoreductase  29.86 
 
 		 390 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.125592  normal  0.229246 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4373  FAD dependent oxidoreductase  29.87 
 
 		 385 aa  138  1e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2709  hypothetical protein  29.37 
 
 		 390 aa  137  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.9016 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1501  FAD dependent oxidoreductase  29.44 
 
 		 389 aa  137  4e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.190283  normal  0.0251893 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5605  FAD dependent oxidoreductase  28.01 
 
 		 984 aa  137  4e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0255  oxidoreductase, FAD-binding protein  27.92 
 
 		 384 aa  135  9e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3400  FAD dependent oxidoreductase  27.81 
 
 		 394 aa  135  9e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0126015  normal  0.687523 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0781  putative FAD dependent oxidoreductase  29.3 
 
 		 391 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.740851 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2939  FAD dependent oxidoreductase  28.23 
 
 		 378 aa  134  3.9999999999999996e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3636  FAD dependent oxidoreductase  26.27 
 
 		 394 aa  133  6.999999999999999e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.295113  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3942  FAD dependent oxidoreductase  30 
 
 		 385 aa  130  3e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.741631  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4426  FAD dependent oxidoreductase  30.52 
 
 		 375 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.767277 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0595  FAD dependent oxidoreductase  25.06 
 
 		 390 aa  130  5.0000000000000004e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.140462  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2740  FAD dependent oxidoreductase  29.27 
 
 		 401 aa  125  1e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0112073  normal  0.18008 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3536  FAD dependent oxidoreductase  31.62 
 
 		 382 aa  125  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.13999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0207  FAD dependent oxidoreductase  29.75 
 
 		 388 aa  123  4e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.654488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0746  putative oxidoreductase  30.25 
 
 		 375 aa  122  7e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5371  FAD dependent oxidoreductase  31.35 
 
 		 382 aa  122  9e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.395195 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2330  FAD dependent oxidoreductase  30.79 
 
 		 394 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00484515  normal  0.869499 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0884  FAD dependent oxidoreductase  27.56 
 
 		 377 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6532  FAD dependent oxidoreductase  28.88 
 
 		 374 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.330707  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6585  FAD dependent oxidoreductase  27.73 
 
 		 389 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.19426 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4434  FAD dependent oxidoreductase  28.93 
 
 		 378 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.862237  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1830  SoxB protein  27.2 
 
 		 377 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.01775  normal  0.260331 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0303  FAD dependent oxidoreductase  27.72 
 
 		 376 aa  110  3e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1833  opine oxidase subunit B  28.65 
 
 		 378 aa  108  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.510651 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6497  oxidoreductase  27.78 
 
 		 380 aa  107  5e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2371  FAD dependent oxidoreductase  30.05 
 
 		 377 aa  102  9e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.781234 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0696  glycine oxidase  25.35 
 
 		 369 aa  101  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0640  glycine oxidase  25.63 
 
 		 369 aa  101  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0807  glycine oxidase ThiO  25.63 
 
 		 369 aa  101  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.35515e-47 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0730  glycine oxidase  25.35 
 
 		 369 aa  101  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5063  FAD dependent oxidoreductase  29.91 
 
 		 383 aa  102  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.200843 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1170  putative FAD dependent oxidoreductase  29.48 
 
 		 367 aa  99.8  7e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6003  FAD dependent oxidoreductase  27.63 
 
 		 385 aa  98.6  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.108074  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0640  glycine oxidase  25.07 
 
 		 369 aa  98.6  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1730  FAD dependent oxidoreductase  26.94 
 
 		 382 aa  98.2  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4955  FAD dependent oxidoreductase  26.09 
 
 		 442 aa  98.2  2e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.916041  normal  0.433563 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0139  glycine oxidase ThiO  27.54 
 
 		 376 aa  97.4  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6294  FAD dependent oxidoreductase  26.69 
 
 		 387 aa  96.7  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0787  glycine oxidase ThiO  24.44 
 
 		 369 aa  96.7  7e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.564699  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0800  glycine oxidase  24.72 
 
 		 369 aa  96.3  9e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6064  FAD dependent oxidoreductase  29.17 
 
 		 374 aa  95.5  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6548  FAD dependent oxidoreductase  29.44 
 
 		 374 aa  95.5  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.490591  normal  0.300453 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0884  glycine oxidase ThiO  24.44 
 
 		 369 aa  95.5  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00117191  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5700  FAD dependent oxidoreductase  29.17 
 
 		 374 aa  95.5  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4544  glycine oxidase ThiO  24.44 
 
 		 369 aa  95.5  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.569361 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2519  oxidoreductase, FAD-binding protein  28.97 
 
 		 394 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.105812  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7805  FAD dependent oxidoreductase  26.17 
 
 		 395 aa  95.1  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.436057  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2479  FAD dependent oxidoreductase  26.67 
 
 		 496 aa  95.5  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.113272  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1475  FAD dependent oxidoreductase  26.4 
 
 		 500 aa  94.7  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540838  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1751  FAD dependent oxidoreductase  24.46 
 
 		 382 aa  94.4  3e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.18751 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2644  FAD dependent oxidoreductase  26.91 
 
 		 396 aa  94  4e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.875281  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1379  FAD dependent oxidoreductase  26.4 
 
 		 500 aa  93.6  5e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.258536  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0271  FAD dependent oxidoreductase  23.6 
 
 		 373 aa  93.6  5e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4659  FAD dependent oxidoreductase  26.15 
 
 		 444 aa  92.4  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3709  FAD dependent oxidoreductase  26.15 
 
 		 444 aa  92.4  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.611519  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0274  FAD dependent oxidoreductase  25.34 
 
 		 381 aa  90.5  4e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1161  FAD dependent oxidoreductase  26.88 
 
 		 444 aa  90.5  5e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.309102 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0646  glycine oxidase ThiO  24.38 
 
 		 369 aa  90.1  6e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4423  FAD dependent oxidoreductase  26.78 
 
 		 372 aa  90.1  6e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.142284  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2308  FAD dependent oxidoreductase  25.41 
 
 		 395 aa  89.4  9e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5640  FAD dependent oxidoreductase  25.91 
 
 		 444 aa  89.4  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.738738  normal  0.548415 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0577  glycine oxidase ThiO  26.61 
 
 		 405 aa  89.4  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8303  D-nopaline dehydrogenase  29.34 
 
 		 356 aa  89  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.039629  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2099  glycine oxidase ThiO  26.91 
 
 		 374 aa  89.4  1e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.119028  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2539  agaE protein  26.42 
 
 		 442 aa  88.6  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.154835  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0617  glycine oxidase ThiO  24.38 
 
 		 369 aa  88.2  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1893  FAD dependent oxidoreductase  26.03 
 
 		 378 aa  88.2  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0219464  normal  0.437636 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2709  D-nopaline dehydrogenase  27.45 
 
 		 364 aa  87.4  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.933901  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2706  putative FAD dependent oxidoreductase  27.25 
 
 		 378 aa  87.4  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.384664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1023  FAD-dependent oxidoreductase  26.18 
 
 		 442 aa  87  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1294  hypothetical protein  26.18 
 
 		 442 aa  87  4e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1362  FAD-dependent oxidoreductase  26.18 
 
 		 442 aa  87  4e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0272  hypothetical protein  26.18 
 
 		 442 aa  87  4e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0655938  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0543  hypothetical protein  26.18 
 
 		 442 aa  87  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1284  FAD-dependent oxidoreductase  26.18 
 
 		 442 aa  86.3  7e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0204  FAD dependent oxidoreductase  27.91 
 
 		 385 aa  86.7  7e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.338423  normal  0.590226 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4376  FAD dependent oxidoreductase  27.25 
 
 		 383 aa  86.3  8e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4894  FAD dependent oxidoreductase  26.22 
 
 		 397 aa  86.3  9e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1933  FAD dependent oxidoreductase  25.41 
 
 		 369 aa  85.9  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3826  FAD dependent oxidoreductase  24.57 
 
 		 442 aa  84.3  0.000000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000037  nopaline dehydrogenase putative  24.44 
 
 		 365 aa  84.7  0.000000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>