More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0915 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_2592  TonB-dependent receptor plug  60.95 
 
 		 885 aa  982    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.228044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0915  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 842 aa  1738    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0358402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1934  TonB-dependent receptor plug  47.69 
 
 		 813 aa  719    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.860003 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1586  TonB-dependent receptor plug  42.79 
 
 		 816 aa  622  1e-177  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0393  putative TonB-dependent siderophore receptor  44.52 
 
 		 847 aa  619  1e-176  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7322  TonB-dependent receptor  42.05 
 
 		 804 aa  617  1e-175  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.560264 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37490  putative TonB-dependent receptor  40.02 
 
 		 883 aa  594  1e-168  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0134389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0399  putative TonB-dependent siderophore receptor  40.8 
 
 		 818 aa  585  1e-166  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30590  putative outer membrane receptor protein  39.75 
 
 		 884 aa  568  1e-160  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.507511 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3011  TonB-dependent sideophore receptor, putative  35.09 
 
 		 821 aa  412  1e-113  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.659574  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2892  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor  34.96 
 
 		 815 aa  409  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2657  TonB-dependent receptor plug  34.02 
 
 		 811 aa  399  1e-109  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0512157  normal  0.824086 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3139  TonB-dependent receptor  33 
 
 		 795 aa  373  1e-102  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0252363  normal  0.788798 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01941  TonB-dependent outer membrane receptor  33.01 
 
 		 784 aa  366  1e-99  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1342  ferric enterobactin receptor  32.85 
 
 		 793 aa  365  2e-99  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.127602  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1277  TonB-dependent receptor  32.96 
 
 		 793 aa  362  2e-98  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0868326  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1693  TonB-dependent receptor  31.34 
 
 		 858 aa  360  4e-98  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.262661  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2484  TonB-dependent siderophore receptor, putative  32.59 
 
 		 800 aa  357  6.999999999999999e-97  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.104897  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2290  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor  32.86 
 
 		 800 aa  356  1e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000569019 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01938  TonB-dependent outer membrane Receptor  32.27 
 
 		 799 aa  353  5e-96  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3152  TonB-dependent receptor  31.87 
 
 		 811 aa  353  5e-96  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.248093  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2276  TonB-dependent receptor plug  31.65 
 
 		 873 aa  352  1e-95  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2607  TonB-dependent siderophore receptor, putative  31.26 
 
 		 832 aa  352  2e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0816697  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1279  TonB-dependent receptor  31.72 
 
 		 788 aa  344  4e-93  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  unclonable  0.0000000456142  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1344  ferric enterobactin receptor  31.72 
 
 		 788 aa  344  5e-93  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  unclonable  0.00000000120084  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3580  TonB-dependent receptor  30.78 
 
 		 835 aa  338  2.9999999999999997e-91  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01939  TonB-dependent outer membrane receptor  31.52 
 
 		 795 aa  332  2e-89  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04865  TonB-dependent outer membrane Receptor  31.55 
 
 		 811 aa  332  2e-89  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0935  TonB-dependent receptor, plug  31.98 
 
 		 961 aa  331  3e-89  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0932  TonB-dependent receptor, plug  32.05 
 
 		 840 aa  330  5.0000000000000004e-89  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3349  TonB-dependent receptor  32.3 
 
 		 815 aa  330  6e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.51089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3441  TonB-dependent receptor  30 
 
 		 843 aa  327  4.0000000000000003e-88  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00117935  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2507  TonB-dependent receptor  31.13 
 
 		 842 aa  327  8.000000000000001e-88  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2342  TonB-dependent receptor  31.65 
 
 		 795 aa  325  2e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.198134  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2260  TonB-dependent receptor  29.53 
 
 		 852 aa  322  1.9999999999999998e-86  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21630  TonB-dependent siderophore receptor  28.6 
 
 		 833 aa  307  4.0000000000000004e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.176382  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2509  TonB-dependent receptor  29.45 
 
 		 803 aa  305  3.0000000000000004e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0337373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5287  TonB-dependent receptor  28.98 
 
 		 933 aa  300  7e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.284266 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2621  TonB-dependent receptor  28.77 
 
 		 871 aa  300  8e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2417  TonB-dependent receptor, plug  29.44 
 
 		 823 aa  298  3e-79  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.599491 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2031  TonB-dependent receptor  28.82 
 
 		 849 aa  291  3e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2289  outer membrane protein  29.31 
 
 		 870 aa  286  9e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000176254  unclonable  0.000000033388 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2934  TonB-dependent receptor  27.6 
 
 		 987 aa  284  4.0000000000000003e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0517  TonB-dependent receptor  29.48 
 
 		 817 aa  282  2e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.069894  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0442  TonB-dependent receptor  29.35 
 
 		 797 aa  280  6e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0126161  normal  0.466854 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3715  TonB-dependent receptor  28.66 
 
 		 812 aa  280  1e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000223353  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2318  TonB-dependent receptor  28.76 
 
 		 879 aa  279  2e-73  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.488825 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0456  TonB-dependent receptor  29.59 
 
 		 797 aa  278  3e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000941597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0430  TonB-dependent receptor  29.65 
 
 		 797 aa  278  3e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000261093  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2718  TonB-dependent receptor  28.84 
 
 		 803 aa  277  6e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000743296 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3540  TonB-dependent receptor  28.54 
 
 		 812 aa  277  6e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000560682  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3801  TonB-dependent receptor  28.9 
 
 		 800 aa  275  2.0000000000000002e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3884  TonB-dependent receptor  29.17 
 
 		 797 aa  276  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000140414  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0415  TonB-dependent receptor  28.54 
 
 		 812 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0145049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0349  TonB-dependent receptor  28.87 
 
 		 850 aa  274  6e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1412  TonB-dependent receptor  28.44 
 
 		 847 aa  273  9e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02222  putative TonB-dependent receptor  27.71 
 
 		 853 aa  266  1e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0959  TonB-dependent receptor  28.4 
 
 		 858 aa  263  1e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0153  TonB-dependent receptor plug  27.03 
 
 		 918 aa  261  3e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3218  putative TonB-dependent receptor for Fe  28.77 
 
 		 848 aa  260  6e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1028  TonB-dependent receptor  28.19 
 
 		 861 aa  258  2e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.518933  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2466  TonB-dependent receptor  27.86 
 
 		 887 aa  253  1e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2896  putative TonB-dependent outer membrane receptor  28.42 
 
 		 867 aa  252  2e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000792676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2180  TonB-dependent receptor  27.72 
 
 		 869 aa  247  6e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.225635  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01565  putative TonB-dependent receptor  28.44 
 
 		 874 aa  246  1.9999999999999999e-63  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0773704  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02748  putative TonB-dependent outer membrane receptor  26 
 
 		 856 aa  244  3e-63  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1723  TonB-dependent receptor  27.12 
 
 		 868 aa  243  1e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00128023  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2818  TonB-dependent receptor  27.64 
 
 		 853 aa  240  5.999999999999999e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.141379  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5926  TonB-dependent receptor  26.58 
 
 		 924 aa  236  1.0000000000000001e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.61038 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0702  TonB-dependent receptor  27.31 
 
 		 948 aa  233  2e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.861146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2160  TonB-dependent receptor, plug  26.56 
 
 		 797 aa  232  2e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00475664  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2586  TonB-dependent receptor plug  28.44 
 
 		 924 aa  231  3e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.427488  normal  0.0373084 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2320  TonB-dependent receptor  27.69 
 
 		 947 aa  231  5e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.500689  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1708  TonB-dependent receptor  28.41 
 
 		 817 aa  224  6e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1378  TonB-dependent receptor  24.46 
 
 		 872 aa  221  5e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.571563  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01460  TonB-dependent receptor, putative  26.03 
 
 		 864 aa  211  3e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1490  TonB-dependent receptor, plug  26.96 
 
 		 948 aa  174  6.999999999999999e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1061  TonB-dependent receptor  28.59 
 
 		 867 aa  171  4e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.797975 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3331  TonB-dependent receptor  29.43 
 
 		 867 aa  170  1e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3081  TonB-dependent receptor  29.77 
 
 		 857 aa  169  1e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3096  TonB-dependent receptor  29.79 
 
 		 851 aa  166  2.0000000000000002e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2931  TonB-dependent receptor  29.79 
 
 		 870 aa  160  8e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000063349  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02745  putative TonB-dependent outer membrane receptor  26.29 
 
 		 1015 aa  154  7e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2036  TonB-dependent receptor  25.81 
 
 		 841 aa  139  3.0000000000000003e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.519963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1838  TonB-dependent receptor, putative  25.71 
 
 		 839 aa  137  9.999999999999999e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000660835  normal  0.0669762 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0162  TonB-dependent receptor  26.07 
 
 		 817 aa  133  1.0000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.539362  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2565  TonB-dependent receptor  26.19 
 
 		 843 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0458531 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2074  TonB-dependent receptor  26.09 
 
 		 836 aa  128  4.0000000000000003e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3992  TonB-dependent receptor plug  26.76 
 
 		 877 aa  127  8.000000000000001e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000578647  normal  0.249271 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2416  TonB-dependent receptor  24.65 
 
 		 842 aa  121  3.9999999999999996e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2045  TonB-dependent receptor plug  24.86 
 
 		 853 aa  120  7.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0699598  hitchhiker  0.00000000333969 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3509  TonB-dependent receptor  24.18 
 
 		 904 aa  120  7.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4698  TonB-dependent receptor  23.38 
 
 		 893 aa  119  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.644067 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1520  TonB-dependent receptor  24.36 
 
 		 1055 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3632  TonB-dependent receptor  24.06 
 
 		 904 aa  119  3e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2418  TonB-dependent receptor plug  24.72 
 
 		 853 aa  119  3e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0641681  hitchhiker  0.00118555 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2302  TonB-dependent receptor plug  24.72 
 
 		 853 aa  119  3e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.780014  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3438  TonB-dependent receptor  25.11 
 
 		 904 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2044  TonB-dependent receptor, plug  25.47 
 
 		 709 aa  116  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0644838  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0855  TonB-dependent receptor  24.76 
 
 		 904 aa  116  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>