More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0852 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_0852  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
257 aa  525  1e-148  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.242227  normal  0.57964 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3782  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  63.18 
 
 
258 aa  330  2e-89  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.143319  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0463  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.48 
 
 
257 aa  313  9.999999999999999e-85  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0919  putative oxidoreductase  61.09 
 
 
257 aa  304  9.000000000000001e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.902502  normal  0.888241 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2074  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.81 
 
 
257 aa  295  4e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00108701 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2445  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.81 
 
 
257 aa  295  5e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0154  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.7 
 
 
255 aa  268  4e-71  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.649375  normal  0.270956 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2062  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.86 
 
 
256 aa  268  5e-71  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.624972 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4974  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.81 
 
 
257 aa  266  2e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.563434  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0293  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.25 
 
 
257 aa  261  6e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.673149  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0264  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.08 
 
 
257 aa  257  1e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2695  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family protein  57.09 
 
 
277 aa  257  1e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2774  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.69 
 
 
271 aa  254  6e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1513  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family protein  56.69 
 
 
277 aa  254  1.0000000000000001e-66  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.729699 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2476  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55 
 
 
239 aa  253  3e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2865  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.57 
 
 
255 aa  247  1e-64  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2143  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.39 
 
 
251 aa  242  3.9999999999999997e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00162277  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2459  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.92 
 
 
264 aa  219  5e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6325  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.06 
 
 
254 aa  218  7.999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.251484  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2812  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.46 
 
 
255 aa  211  5.999999999999999e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.199732  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2785  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.46 
 
 
255 aa  211  7e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2829  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.46 
 
 
255 aa  211  7e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.150517  normal  0.215397 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4589  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.51 
 
 
254 aa  211  7.999999999999999e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.496264  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29820  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like  48.21 
 
 
261 aa  211  1e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2363  Short-chain dehydrogenase/reductase  47.66 
 
 
254 aa  210  2e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4175  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 
258 aa  209  4e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1024  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.27 
 
 
254 aa  207  9e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.824888  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2411  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  41.18 
 
 
255 aa  207  2e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1454  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.1 
 
 
256 aa  201  7e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.108685 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3034  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.71 
 
 
256 aa  200  1.9999999999999998e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.872247 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6105  short-chain dehydrogenase/reductase  45.77 
 
 
265 aa  192  3e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.542291  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1523  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.4 
 
 
269 aa  190  2e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3588  hypothetical protein  44.57 
 
 
254 aa  189  5e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.00208776  normal  0.410255 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0175  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  42.97 
 
 
247 aa  180  2e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2613  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.32 
 
 
254 aa  174  9e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0220  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.63 
 
 
247 aa  172  3.9999999999999995e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1662  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.76 
 
 
245 aa  171  9e-42  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2037  short chain dehydrogenase  43.7 
 
 
262 aa  170  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00988022  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0167  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  41.37 
 
 
245 aa  170  3e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.619009  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1433  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.6 
 
 
257 aa  169  5e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2450  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  43.6 
 
 
249 aa  168  8e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0180  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.56 
 
 
245 aa  168  9e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00307059  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2397  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  41.25 
 
 
254 aa  167  1e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0465114  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2492  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  40.16 
 
 
245 aa  167  1e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0634  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.41 
 
 
257 aa  166  5e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.34144  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1458  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.73 
 
 
270 aa  166  5e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.48093 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4047  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.6 
 
 
249 aa  165  5.9999999999999996e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2194  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.85 
 
 
255 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000131904  normal  0.0140674 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3124  short chain dehydrogenase  42.91 
 
 
262 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86346  peroxisomal 2,4- dienoyl-CoA reductase and sorbitol utilization protein  40.87 
 
 
285 aa  163  2.0000000000000002e-39  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0615  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.8 
 
 
257 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000368197  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3979  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.18 
 
 
246 aa  163  3e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00235885 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2101  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.08 
 
 
253 aa  163  3e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.044107  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2307  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.4 
 
 
247 aa  162  4.0000000000000004e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3438  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.87 
 
 
252 aa  162  5.0000000000000005e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4552  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.36 
 
 
246 aa  160  2e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3595  tropinone reductase  40.07 
 
 
258 aa  160  2e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.855153  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05081  3-oxoacyl-[acyl-carrier protein] reductase  41.15 
 
 
250 aa  160  2e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.162194 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3764  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.53 
 
 
251 aa  159  3e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000212417  normal  0.0482294 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0833  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.17 
 
 
264 aa  159  6e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.943755 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0465  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.74 
 
 
258 aa  158  7e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1785  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  40.77 
 
 
250 aa  158  8e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3338  tropinone reductase  40.24 
 
 
267 aa  158  9e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0617958 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1686  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.02 
 
 
257 aa  157  1e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2474  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.55 
 
 
263 aa  157  1e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.170949  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1754  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.02 
 
 
257 aa  157  1e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1802  gluconate 5-dehydrogenase  37.85 
 
 
260 aa  157  1e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2921  dehydrogenase  40.94 
 
 
261 aa  157  1e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.932836 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2206  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.94 
 
 
254 aa  156  2e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0824665  hitchhiker  0.00853535 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0934  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  37.25 
 
 
247 aa  157  2e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00491532  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0738  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.36 
 
 
280 aa  156  3e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1709  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.13 
 
 
266 aa  156  3e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2259  short chain dehydrogenase  42.13 
 
 
262 aa  156  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0792422  normal  0.0451006 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1779  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.7 
 
 
254 aa  156  4e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2335  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  40.16 
 
 
253 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1782  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.16 
 
 
244 aa  155  5.0000000000000005e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.788783  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1790  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.37 
 
 
255 aa  155  5.0000000000000005e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0755029  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0104  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.55 
 
 
246 aa  155  5.0000000000000005e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.650868  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3057  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  37.85 
 
 
246 aa  155  8e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.030998  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0131  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.55 
 
 
245 aa  155  9e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.120855  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2759  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.84 
 
 
261 aa  155  9e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC05340  d-arabinitol 2-dehydrogenase, putative  37.4 
 
 
355 aa  154  1e-36  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.656485  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1869  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.7 
 
 
263 aa  154  1e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6404  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  39.44 
 
 
246 aa  154  1e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1110  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.85 
 
 
246 aa  154  1e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2790  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.86 
 
 
269 aa  154  1e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1385  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.8 
 
 
248 aa  154  1e-36  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1138  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.97 
 
 
255 aa  154  2e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0979  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.25 
 
 
246 aa  153  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1875  tropinone reductase  40.68 
 
 
258 aa  153  2e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4672  putative 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  41.3 
 
 
253 aa  153  2e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.572467  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1940  tropinone reductase  40.68 
 
 
258 aa  153  2.9999999999999998e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.803191  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4308  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.43 
 
 
259 aa  153  2.9999999999999998e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1671  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.7 
 
 
246 aa  152  4e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2046  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.3 
 
 
263 aa  152  4e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00404736  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1897  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.48 
 
 
247 aa  152  5e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00100219 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1020  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.45 
 
 
246 aa  152  5e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0122832  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14920  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  41.37 
 
 
247 aa  152  5.9999999999999996e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1623  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.4 
 
 
244 aa  151  8e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000163996  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2515  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.9 
 
 
250 aa  151  8e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>