More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0826 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_0826  cytochrome c oxidase subunit III  100 
 
 
215 aa  431  1e-120  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.648896  normal  0.196045 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0805  cytochrome c oxidase, subunit III  39.05 
 
 
209 aa  154  1e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0853  cytochrome c oxidase subunit III  38.1 
 
 
209 aa  150  2e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0857  cytochrome c oxidase subunit III  38.1 
 
 
209 aa  150  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1586  cytochrome c oxidase subunit III  37.16 
 
 
234 aa  149  2e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0231  cytochrome c oxidase subunit III  37.32 
 
 
226 aa  147  9e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38618  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1520  cytochrome c oxidase subunit III  36.03 
 
 
259 aa  147  1.0000000000000001e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.34828  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2994  cytochrome c oxidase, subunit III  35.14 
 
 
229 aa  146  3e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.153495 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1246  cytochrome/quinol oxidase subunit 3  35.51 
 
 
214 aa  145  4.0000000000000006e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0224  cytochrome c oxidase subunit III  39.6 
 
 
229 aa  142  6e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.933417  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0168  cytochrome c oxidase subunit III  39.6 
 
 
229 aa  141  9e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0413962 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1036  cytochrome c oxidase subunit III  39.09 
 
 
219 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0806413 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5815  cytochrome c oxidase subunit III  39.42 
 
 
225 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.186525  hitchhiker  0.0033512 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0850  cytochrome c oxidase subunit III  36.02 
 
 
211 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6884  cytochrome c oxidase subunit III  36.87 
 
 
215 aa  129  3e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0044  cytochrome c oxidase subunit III  37.43 
 
 
199 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.388042  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1602  cytochrome c oxidase subunit III  37.62 
 
 
234 aa  127  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0896497  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1678  cytochrome c oxidase subunit III  37.62 
 
 
234 aa  126  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4437  cytochrome c oxidase, subunit III  40.62 
 
 
209 aa  126  3e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.424494  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0026  cytochrome c oxidase subunit III  40 
 
 
229 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.471967 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4178  cytochrome c oxidase, subunit III  36.71 
 
 
211 aa  125  4.0000000000000003e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.304449  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6231  cytochrome c oxidase subunit III  40.31 
 
 
225 aa  123  2e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.211629  normal  0.107946 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2273  cytochrome c oxidase, subunit III  36.63 
 
 
235 aa  123  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.545672  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2704  cytochrome c oxidase subunit III  37.62 
 
 
224 aa  122  3e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.343343  normal  0.321582 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5946  cytochrome c oxidase subunit III  38.54 
 
 
211 aa  118  6e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2421  cytochrome c oxidase subunit III  30.45 
 
 
262 aa  112  5e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0162196  normal  0.448728 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0407  cytochrome c oxidase, subunit III  38.38 
 
 
196 aa  111  8.000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0220  cytochrome c oxidase, subunit III  36.22 
 
 
200 aa  105  4e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0043  cytochrome c oxidase subunit III  38.89 
 
 
199 aa  105  5e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000712999 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1346  cytochrome c oxidase, subunit III  35.05 
 
 
209 aa  105  5e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0703851  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3105  cytochrome c oxidase subunit I  32.83 
 
 
819 aa  99.8  3e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0786  cytochrome c oxidase subunit I  35 
 
 
832 aa  98.6  6e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0454101  normal  0.689784 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2527  caa3-type cytochrome c oxidase, subunit III  38.07 
 
 
201 aa  96.3  4e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00772107  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0250  cytochrome c oxidase, subunit III  36.84 
 
 
200 aa  95.1  7e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.256401  normal  0.022866 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1540  cytochrome c oxidase subunit III  39 
 
 
199 aa  92.4  5e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2248  cytochrome c oxidase subunit I  32.28 
 
 
825 aa  91.7  8e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2428  cytochrome c oxidase subunit III  32.04 
 
 
240 aa  91.3  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1824  cytochrome c oxidase, subunit III  34.48 
 
 
199 aa  90.5  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.240701  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1813  cytochrome c oxidase, subunit III  31.75 
 
 
194 aa  89.4  4e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0535  cytochrome c oxidase subunit III  35.03 
 
 
198 aa  87.4  1e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.177568 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2591  cytochrome c oxidase subunit III  29.61 
 
 
239 aa  86.3  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0750722  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1777  cytochrome c oxidase, subunit III  31.07 
 
 
211 aa  86.3  3e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.723591  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1250  cytochrome c oxidase, subunit III  29.03 
 
 
197 aa  85.9  5e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.287461  hitchhiker  0.0000975001 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2265  cytochrome c oxidase, subunit III  30.7 
 
 
202 aa  84.7  9e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3895  cytochrome c oxidase subunit III  31.07 
 
 
240 aa  84.3  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1788  cytochrome c oxidase subunit III  29.09 
 
 
208 aa  84.3  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4932  cytochrome c oxidase, subunit III  32.49 
 
 
193 aa  84.3  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.318049  normal  0.0324373 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3556  cytochrome c oxidase subunit III  30.09 
 
 
203 aa  83.6  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.14687 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1918  cytochrome c oxidase subunit III family protein  28.31 
 
 
204 aa  83.6  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3958  cytochrome c oxidase subunit III  32.83 
 
 
234 aa  84  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.178096 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2956  cytochrome c oxidase, subunit III  30.1 
 
 
220 aa  82.8  0.000000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0112346  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0263  cytochrome c oxidase subunit I  30.32 
 
 
827 aa  82.8  0.000000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0374509  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3302  cytochrome c oxidase, subunit III  31.63 
 
 
203 aa  82  0.000000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.639722  normal  0.219398 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3791  cytochrome c oxidase, subunit III  31.41 
 
 
198 aa  82  0.000000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0359951  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3353  cytochrome c oxidase, subunit III  31.63 
 
 
203 aa  82  0.000000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.176455  normal  0.0560155 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3864  cytochrome c oxidase, subunit III  31.41 
 
 
198 aa  82  0.000000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.00290565  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2361  cytochrome c oxidase subunit III  28.9 
 
 
241 aa  82  0.000000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2265  cytochrome c oxidase subunit III  28.64 
 
 
239 aa  82  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.06442  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0606  cytochrome c oxidase subunit III  32.67 
 
 
201 aa  81.6  0.000000000000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.184913  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1900  Cytochrome-c oxidase  30.77 
 
 
208 aa  81.6  0.000000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.910491  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4073  cytochrome c oxidase subunit III  30.66 
 
 
214 aa  80.9  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3557  cytochrome c oxidase, subunit III  30.1 
 
 
220 aa  81.3  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.294632 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2604  cytochrome c oxidase subunit III  32.41 
 
 
195 aa  80.5  0.00000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.204507 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4575  cytochrome c oxidase, subunit III  28.92 
 
 
200 aa  80.5  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.383719 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5384  cytochrome c oxidase, subunit III  30.1 
 
 
197 aa  79.7  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2809  cytochrome c oxidase, subunit III  30.61 
 
 
197 aa  80.1  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5349  cytochrome c oxidase, subunit III  30.1 
 
 
197 aa  79.3  0.00000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3795  cytochrome c oxidase, subunit III  31.58 
 
 
198 aa  79.3  0.00000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.478856  normal  0.908261 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0729  cytochrome c oxidase, subunit III  29.5 
 
 
236 aa  79.3  0.00000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5662  cytochrome c oxidase, subunit III  30.1 
 
 
197 aa  79.3  0.00000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0819  cytochrome c oxidase, subunit III  30.65 
 
 
203 aa  79.3  0.00000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3712  cytochrome c oxidase, subunit III  30.1 
 
 
197 aa  79.3  0.00000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.386532  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3635  cytochrome-C oxidase subunit III oxidoreductase protein  29.44 
 
 
231 aa  79  0.00000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.074977  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3291  cytochrome c oxidase, subunit III  32.09 
 
 
180 aa  79  0.00000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.482439  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7359  Heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase subunit 3-like  31.82 
 
 
239 aa  78.2  0.00000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.617384 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3151  cytochrome c oxidase, subunit III  35.33 
 
 
270 aa  78.2  0.00000000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.874863 
 
 
-
 
NC_004310  BR0044  ubiquinol oxidase subunit III  30.99 
 
 
209 aa  78.2  0.0000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1809  cytochrome c oxidase subunit III  27.48 
 
 
212 aa  77.4  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0920236 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0530  cytochrome c oxidase subunit III  29.58 
 
 
207 aa  77.4  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0998  cytochrome c oxidase, subunit III  30.85 
 
 
209 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4757  cytochrome c oxidase, subunit III  34.55 
 
 
193 aa  77  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0954288  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1541  cytochrome c oxidase, subunit III family protein  30.85 
 
 
209 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1163  cytochrome c oxidase, subunit III family protein  30.85 
 
 
209 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.322361  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0077  cytochrome c oxidase, subunit III family protein  30.85 
 
 
209 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0129097  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0050  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  30.58 
 
 
209 aa  77.4  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0163303  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2238  cytochrome c oxidase, subunit III family protein  30.85 
 
 
209 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.394617  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5939  cytochrome c oxidase subunit III  31.31 
 
 
240 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4376  cytochrome c oxidase, subunit III  34.55 
 
 
193 aa  77  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265005  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0911  cytochrome c oxidase, subunit III  30.85 
 
 
209 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0276  cytochrome c oxidase, subunit III  32.49 
 
 
204 aa  76.6  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.18856  normal  0.0430335 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6212  cytochrome c oxidase, subunit III  31.31 
 
 
240 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4463  cytochrome c oxidase, subunit III  34.55 
 
 
193 aa  77  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.327335  normal  0.0356516 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3187  nitric oxide reductase E protein  31.61 
 
 
184 aa  76.3  0.0000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0044  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  30.99 
 
 
209 aa  76.6  0.0000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.240035  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2070  cytochrome c oxidase subunit III  28.64 
 
 
204 aa  75.9  0.0000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.515134 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3521  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit III  27.67 
 
 
204 aa  75.9  0.0000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0560  putative additional subunit of nitric oxide reductase (Nor) complex, membrane protein  36.41 
 
 
197 aa  75.9  0.0000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0830367  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4300  cytochrome c oxidase subunit III  30.1 
 
 
204 aa  75.9  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000246716  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12221  cytochrome C oxidase subunit III ctaE  30.61 
 
 
203 aa  75.9  0.0000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3575  cytochrome c oxidase  30.81 
 
 
206 aa  75.5  0.0000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>