More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0818 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_0818  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
252 aa  505  9.999999999999999e-143  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.100065 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0884  dehydrogenase  62.26 
 
 
257 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1659  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.33 
 
 
251 aa  263  2e-69  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2627  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.24 
 
 
268 aa  258  9e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.335809  normal  0.150749 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2856  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.88 
 
 
255 aa  249  2e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.423234  normal  0.0918658 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4231  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.88 
 
 
255 aa  249  2e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1368  short chain dehydrogenase  50.99 
 
 
261 aa  243  1.9999999999999999e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1429  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.28 
 
 
256 aa  241  7.999999999999999e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0242  Short-chain alcohol dehydrogenase  46.25 
 
 
253 aa  238  8e-62  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1514  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50 
 
 
252 aa  238  9e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.411347  normal  0.744647 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1552  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.4 
 
 
255 aa  237  1e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.747318  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1545  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.2 
 
 
254 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.161777  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0729  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.8 
 
 
251 aa  233  2.0000000000000002e-60  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0262547  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4572  2,5-dichloro-2,5-cyclohexadiene-1,4-diol dehydrogenase  47.08 
 
 
258 aa  229  4e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1760  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51 
 
 
250 aa  228  5e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.141854 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3062  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.28 
 
 
255 aa  228  7e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.515672  normal  0.0696546 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4553  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.74 
 
 
255 aa  224  1e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.201856  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0875  short chain dehydrogenase  47.69 
 
 
259 aa  224  1e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0875261  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4649  short chain dehydrogenase  48.03 
 
 
261 aa  223  2e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.21279  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2259  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.61 
 
 
256 aa  219  3e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.654674 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2100  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.43 
 
 
250 aa  213  1.9999999999999998e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0527344  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6220  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.03 
 
 
252 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.621886  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3121  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.63 
 
 
267 aa  211  7e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.780645 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0883  putative dehydrogenase  47.53 
 
 
282 aa  211  9e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3472  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.22 
 
 
254 aa  210  1e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5463  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.41 
 
 
251 aa  209  3e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.230582  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1981  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.58 
 
 
246 aa  208  5e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1834  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.23 
 
 
252 aa  207  1e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2217  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.03 
 
 
258 aa  207  2e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0140674 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5564  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.64 
 
 
250 aa  207  2e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0387947  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1648  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.21 
 
 
269 aa  206  4e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.157293  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3460  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.82 
 
 
245 aa  203  2e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3544  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.78 
 
 
271 aa  202  5e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3804  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.41 
 
 
253 aa  201  7e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1080  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  43.82 
 
 
246 aa  201  8e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.38691  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5464  NAD-dependent epimerase/dehydratase:Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.27 
 
 
253 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.852927  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.22 
 
 
246 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1122  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  43.82 
 
 
246 aa  199  3e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0726405  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2728  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.66 
 
 
244 aa  198  6e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0373  Short-chain alcohol dehydrogenase  46.4 
 
 
243 aa  198  9e-50  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2508  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.45 
 
 
250 aa  197  1.0000000000000001e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.168106  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3281  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.05 
 
 
248 aa  196  3e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.846295 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6225  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.01 
 
 
252 aa  196  3e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3000  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.05 
 
 
248 aa  196  3e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.767749  normal  0.280666 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1954  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  43.82 
 
 
250 aa  194  9e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0909  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.69 
 
 
244 aa  194  1e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.271894  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1464  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.92 
 
 
262 aa  194  1e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.305305  normal  0.474897 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2711  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.18 
 
 
245 aa  194  1e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.561182  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2755  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.18 
 
 
245 aa  194  1e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1767  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.24 
 
 
246 aa  194  2e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000018635 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2741  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.18 
 
 
245 aa  193  2e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.67028  normal  0.072064 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3357  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.02 
 
 
253 aa  191  7e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00078495  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1576  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  46.56 
 
 
268 aa  191  8e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.29701  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1402  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.9 
 
 
249 aa  191  1e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2173  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.16 
 
 
254 aa  190  2e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1060  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.18 
 
 
263 aa  190  2e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0474443 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1963  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.85 
 
 
257 aa  189  4e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.922459 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0541  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.43 
 
 
251 aa  188  5.999999999999999e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0926  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.5 
 
 
249 aa  188  8e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.598625  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4505  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.2 
 
 
260 aa  188  9e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2515  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.98 
 
 
250 aa  186  3e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1783  glucose 1-dehydrogenase  39.04 
 
 
247 aa  186  4e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.88349  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1575  short chain dehydrogenase  40.32 
 
 
249 aa  185  5e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3466  glucose 1-dehydrogenase  39.29 
 
 
247 aa  185  6e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0764776  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1690  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.4 
 
 
248 aa  184  1.0000000000000001e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000504993 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5136  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.6 
 
 
254 aa  183  2.0000000000000003e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.708802  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3667  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.09 
 
 
259 aa  182  4.0000000000000006e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0671  putative short-chain dehydrogenase/reductase  44.02 
 
 
273 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.121073  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4593  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.03 
 
 
251 aa  181  7e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00700945 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1966  short chain dehydrogenase  42.29 
 
 
262 aa  181  8.000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.783196 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0109  short chain dehydrogenase  42.57 
 
 
251 aa  181  1e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3452  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.2 
 
 
250 aa  181  1e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.759326 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3507  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.75 
 
 
245 aa  180  2e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1771  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.19 
 
 
252 aa  179  2.9999999999999997e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3510  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.41 
 
 
251 aa  179  4e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.439576 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3720  short chain dehydrogenase  41.18 
 
 
262 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0906259  normal  0.2081 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4559  short chain dehydrogenase  41.18 
 
 
262 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3804  short chain dehydrogenase  41.18 
 
 
262 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.101152 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2226  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.78 
 
 
261 aa  178  8e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0121072  hitchhiker  0.00000459382 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3288  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.46 
 
 
264 aa  177  1e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.197949 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0512  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.02 
 
 
248 aa  177  1e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5536  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 
254 aa  177  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0819159 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2059  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.57 
 
 
252 aa  177  2e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1012  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.24 
 
 
251 aa  176  2e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0198691  normal  0.370278 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2292  short chain dehydrogenase  40.23 
 
 
262 aa  176  2e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.295109 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3603  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.92 
 
 
249 aa  176  3e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2131  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.22 
 
 
262 aa  176  3e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6823  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.2 
 
 
258 aa  175  5e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2751  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.55 
 
 
252 aa  175  6e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.995251  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0524  short chain dehydrogenase  41.25 
 
 
263 aa  175  7e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3894  short chain dehydrogenase  44.71 
 
 
253 aa  174  9e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.933722  normal  0.0806905 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1990  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.77 
 
 
249 aa  173  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2828  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.91 
 
 
252 aa  173  1.9999999999999998e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0610793 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1817  short chain dehydrogenase  44.31 
 
 
253 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6397  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.75 
 
 
259 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2914  short chain dehydrogenase  40.87 
 
 
255 aa  173  1.9999999999999998e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.892644  normal  0.135282 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1619  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.83 
 
 
253 aa  172  2.9999999999999996e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.901509  normal  0.0346671 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4933  short chain dehydrogenase  39.22 
 
 
262 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.545921 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1849  short chain dehydrogenase  43.7 
 
 
255 aa  172  3.9999999999999995e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.838313 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5514  cyclopentanol dehydrogenase  41.29 
 
 
264 aa  172  5.999999999999999e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>