47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0743 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_0743  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 509 aa  1008    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.197884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3487  polysaccharide biosynthesis protein  31.28 
 
 		 424 aa  178  2e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0265796 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1344  polysaccharide biosynthesis protein  29.18 
 
 		 488 aa  170  6e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5347  polysaccharide biosynthesis protein  31.63 
 
 		 422 aa  168  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.775837  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0076  polysaccharide biosynthesis protein  28.13 
 
 		 499 aa  166  6.9999999999999995e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.160586  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0079  polysaccharide biosynthesis protein  28.13 
 
 		 499 aa  166  6.9999999999999995e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.75242  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3796  polysaccharide biosynthesis protein  29.98 
 
 		 478 aa  166  8e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1271  polysaccharide biosynthesis protein  28.61 
 
 		 429 aa  163  9e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.958308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2731  polysaccharide biosynthesis protein  29.83 
 
 		 419 aa  137  4e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3233  polysaccharide biosynthesis protein  24.57 
 
 		 473 aa  134  3e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1969  polysaccharide biosynthesis protein  24.11 
 
 		 488 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2229  polysaccharide transporter  23.86 
 
 		 488 aa  128  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0925528 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4394  polysaccharide biosynthesis protein  25.78 
 
 		 488 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.681509  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3973  polysaccharide biosynthesis protein  25.78 
 
 		 488 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3556  polysaccharide biosynthesis protein  25.54 
 
 		 488 aa  126  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.225239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0750  polysaccharide biosynthesis protein  27.01 
 
 		 468 aa  125  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1073  polysaccharide biosynthesis protein  25.86 
 
 		 492 aa  125  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.610845 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0694  polysaccharide biosynthesis family protein  24.57 
 
 		 488 aa  121  3e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.731179  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1706  polysaccharide biosynthesis family protein  24.07 
 
 		 488 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.974383  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0753  polysaccharide biosynthesis family protein  24.07 
 
 		 488 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3866  polysaccharide biosynthesis protein  26.02 
 
 		 488 aa  120  6e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.377761  normal  0.957657 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1665  polysaccharide biosynthesis family protein  24.19 
 
 		 484 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.702931  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1873  polysaccharide biosynthesis family protein  24.19 
 
 		 484 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0545  polysaccharide biosynthesis family protein  24.19 
 
 		 484 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2112  polysaccharide biosynthesis protein  25.06 
 
 		 498 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.306384 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2428  polysaccharide biosynthesis protein  24.19 
 
 		 484 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2289  polysaccharide biosynthesis protein  24.19 
 
 		 484 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3362  polysaccharide biosynthesis protein  26.02 
 
 		 488 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2518  polysaccharide exporter, (PST) family  26.7 
 
 		 486 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0230734 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4609  polysaccharide biosynthesis protein  24.82 
 
 		 488 aa  107  4e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.286147  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1791  polysaccharide biosynthesis protein  23.04 
 
 		 504 aa  74.3  0.000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1637  polysaccharide biosynthesis protein  21.03 
 
 		 504 aa  66.6  0.0000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1966  polysaccharide biosynthesis protein  21.46 
 
 		 507 aa  50.4  0.00007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2211  polysaccharide biosynthesis protein  19.41 
 
 		 494 aa  50.1  0.00009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.167884  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0040  polysaccharide biosynthesis protein  21.9 
 
 		 435 aa  50.1  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000125854  normal  0.0319641 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3995  polysaccharide biosynthesis protein  18.81 
 
 		 497 aa  48.5  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.495687  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0678  polysaccharide biosynthesis protein  21.87 
 
 		 499 aa  48.5  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1083  PST family polysaccharide exporter  23.66 
 
 		 467 aa  47  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5012  putative polysaccharide biosynthesis protein  18.73 
 
 		 499 aa  46.6  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0177  polysaccharide biosynthesis protein  22.86 
 
 		 446 aa  45.8  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.89066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2971  polysaccharide biosynthesis protein  20.1 
 
 		 475 aa  45.4  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.224966  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3093  O-antigen and teichoic acid-like export protein  20.76 
 
 		 507 aa  45.4  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.116162  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3440  polysaccharide biosynthesis protein, putative  20.51 
 
 		 504 aa  45.1  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0552602  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0645  polysaccharide biosynthesis protein  28.57 
 
 		 533 aa  45.1  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1814  polysaccharide biosynthesis protein  21.54 
 
 		 468 aa  44.3  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0446  putative polysaccharide export protein  25.93 
 
 		 360 aa  44.3  0.005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2367  membrane protein for polysaccharide transport  21.92 
 
 		 507 aa  43.9  0.007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>