More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0734 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_0734  polysaccharide export protein  100 
 
 
192 aa  392  1e-108  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0580696  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0791  polysaccharide export protein  48.39 
 
 
216 aa  172  2.9999999999999996e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.22146  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1524  polysaccharide export protein  44.39 
 
 
196 aa  144  1e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3000  polysaccharide export protein  41.3 
 
 
186 aa  131  7.999999999999999e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.912736  normal  0.44921 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2696  polysaccharide export protein  40.41 
 
 
196 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.975578 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4708  polysaccharide export protein  42.48 
 
 
219 aa  124  9e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.655126  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1414  polysaccharide export protein  44.87 
 
 
234 aa  123  1e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.639365 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5320  polysaccharide export protein  43.71 
 
 
213 aa  121  6e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.884665  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1903  polysaccharide export protein  41.99 
 
 
221 aa  121  7e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4037  polysaccharide export protein  43.12 
 
 
235 aa  120  9e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0783  capsule polysaccharide export protein, putative  35.2 
 
 
195 aa  120  9.999999999999999e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.886397  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0776  putative capsule polysaccharide export protein  35.2 
 
 
196 aa  120  9.999999999999999e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0309  polysaccharide export protein  40.31 
 
 
195 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.313034  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1156  polysaccharide export protein  39.55 
 
 
187 aa  119  3.9999999999999996e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.508119  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2464  polysaccharide export protein  42.5 
 
 
235 aa  118  4.9999999999999996e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.719315  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7871  hypothetical protein  40.12 
 
 
238 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1809  polysaccharide export protein  45.75 
 
 
192 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1312  polysaccharide export protein  37.43 
 
 
191 aa  115  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1858  polysaccharide export protein  44.81 
 
 
192 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.210486  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2193  polysaccharide export protein  44.81 
 
 
192 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.136002  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1224  polysaccharide export protein  36.36 
 
 
191 aa  115  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5213  polysaccharide export protein  45.1 
 
 
190 aa  112  3e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.118373  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1665  polysaccharide export protein  37.08 
 
 
189 aa  112  4.0000000000000004e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1487  polysaccharide export protein  37.93 
 
 
193 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0270462  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4418  polysaccharide export protein  40.62 
 
 
220 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2957  polysaccharide export protein  44.81 
 
 
190 aa  109  3e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.836808  normal  0.0520803 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2506  polysaccharide export protein  35.47 
 
 
196 aa  109  3e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0853  polysaccharide export protein  41.06 
 
 
191 aa  108  5e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.317786 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4940  polysaccharide export protein  38 
 
 
247 aa  107  9.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.89418 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4819  polysaccharide export protein  33.77 
 
 
200 aa  103  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02478  polysaccharide export periplasmic protein  35.95 
 
 
153 aa  103  1e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0460  hypothetical protein  33.11 
 
 
175 aa  97.1  1e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3174  polysaccharide export protein  33.53 
 
 
185 aa  97.1  1e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1072  polysaccharide export protein  34.84 
 
 
178 aa  96.3  3e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.875269  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4531  polysaccharide export protein  36.18 
 
 
208 aa  94.7  7e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1384  polysaccharide export protein  35.58 
 
 
178 aa  94  1e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.121569  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2814  polysaccharide export protein  31.68 
 
 
177 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0586  polysaccharide export protein  31.25 
 
 
185 aa  90.9  1e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1795  polysaccharide export outer membrane protein  42.15 
 
 
264 aa  89.7  2e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3558  polysaccharide export protein  28.74 
 
 
185 aa  87.8  9e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1985  polysaccharide export protein  31.44 
 
 
208 aa  83.6  0.000000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.560938  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0458  polysaccharide biosynthesis/export protein  34.44 
 
 
193 aa  83.2  0.000000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2392  polysaccharide export protein  31.37 
 
 
210 aa  83.2  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1175  polysaccharide biosynthesis/export protein  36.31 
 
 
152 aa  82  0.000000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.265571  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0860  polysaccharide export protein  36 
 
 
437 aa  80.9  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0658  polysaccharide export protein  31.94 
 
 
188 aa  79.7  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.308974  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3311  polysaccharide export protein  37.21 
 
 
324 aa  80.1  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.328062 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4001  polysaccharide export protein  31.79 
 
 
192 aa  79  0.00000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0132  putative polysaccharide export protein, outer membrane  29.65 
 
 
206 aa  78.6  0.00000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.679141  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0835  polysaccharide export protein  37.04 
 
 
272 aa  78.6  0.00000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0895025 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05205  hypothetical protein  30.82 
 
 
177 aa  78.2  0.00000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0810  polysaccharide export protein  30.07 
 
 
184 aa  78.6  0.00000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0160  polysaccharide export protein  30.35 
 
 
208 aa  78.2  0.00000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4945  polysaccharide export protein  37.19 
 
 
422 aa  77.8  0.00000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.330229 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3135  polysaccharide export protein  39 
 
 
459 aa  77.4  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.248104  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0417  exopolysaccharide biosynthesis protein Bme11  34.78 
 
 
415 aa  77  0.0000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.125789  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3370  polysaccharide export protein  34.35 
 
 
415 aa  76.6  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0360  exopolysaccharide biosynthesis protein Bme11  34.78 
 
 
415 aa  77  0.0000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.459343  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3534  polysaccharide export protein  34.45 
 
 
435 aa  76.3  0.0000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001324  Capsular polysaccharide synthesis enzyme CpsC polysaccharide export  31.01 
 
 
177 aa  75.5  0.0000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.414025  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2738  polysaccharide export protein  31.87 
 
 
192 aa  75.5  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2833  polysaccharide export protein  31.87 
 
 
192 aa  75.5  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.173775  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1660  polysaccharide export protein  31.76 
 
 
214 aa  75.5  0.0000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.614311  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1536  polysaccharide export protein  28.64 
 
 
207 aa  74.7  0.0000000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.595422  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0148  capsular polysaccharide export protein, putative  30.15 
 
 
277 aa  73.9  0.000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.181094  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0242  polysaccharide export protein  35.29 
 
 
264 aa  74.3  0.000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3117  polysaccharide export protein  30.73 
 
 
209 aa  74.3  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.222433  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2650  polysaccharide export protein  30.53 
 
 
192 aa  74.3  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.28267  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2582  polysaccharide export protein  32.48 
 
 
205 aa  74.3  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3242  polysaccharide export protein  33.09 
 
 
212 aa  73.9  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.76534 
 
 
-
 
NC_002950  PG0437  BexD/CtrA/VexA family polysaccharide export protein  35.24 
 
 
307 aa  73.6  0.000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0250029 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5937  exopolysaccharide production protein  35.54 
 
 
426 aa  72  0.000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2257  putative outer membrane polysaccharide exporter  33.33 
 
 
384 aa  72  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2495  polysaccharide export protein  29.58 
 
 
212 aa  71.6  0.000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1877  polysaccharide export protein  39.13 
 
 
281 aa  71.2  0.000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3561  polysaccharide export protein  39.52 
 
 
441 aa  71.2  0.000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3871  polysaccharide export protein  33.33 
 
 
214 aa  71.2  0.000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.631942  normal  0.0416181 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4555  polysaccharide export protein  36.84 
 
 
452 aa  71.2  0.000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0428  polysaccharide export protein  30.97 
 
 
202 aa  69.7  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0542078 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1538  periplasmic polysaccharide export protein  31.39 
 
 
268 aa  69.7  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2734  capsular polysaccharide export protein, putative  39.29 
 
 
276 aa  70.5  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0365414 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2618  polysaccharide export protein  32.3 
 
 
193 aa  70.1  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.676482  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4241  polysaccharide export protein  33.15 
 
 
417 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.238114 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3407  polysaccharide export protein  32.74 
 
 
461 aa  69.7  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.531923 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0211  polysaccharide export protein  30.9 
 
 
201 aa  68.9  0.00000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6022  polysaccharide export protein  37.59 
 
 
384 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.113173  normal  0.244063 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5609  polysaccharide export protein  32.41 
 
 
419 aa  68.2  0.00000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0652  polysaccharide export protein  31.43 
 
 
427 aa  68.2  0.00000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2488  polysaccharide export protein  29.78 
 
 
196 aa  67.8  0.00000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.486389  normal  0.441144 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1455  polysaccharide export protein  35.59 
 
 
816 aa  67.4  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2529  polysaccharide export protein  31.18 
 
 
208 aa  67.4  0.0000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0819  polysaccharide export protein  29.05 
 
 
379 aa  67  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2182  polysaccharide export protein  31.5 
 
 
298 aa  66.2  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.977876 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1170  polysaccharide export protein  27.57 
 
 
211 aa  66.2  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6413  polysaccharide export protein  27.22 
 
 
438 aa  65.9  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0105958  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1118  polysaccharide export protein  31.87 
 
 
426 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3509  polysaccharide export protein  30.46 
 
 
213 aa  65.9  0.0000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000101119 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3695  polysaccharide export protein  37.78 
 
 
441 aa  65.5  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.597234  normal  0.443587 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6483  polysaccharide export protein  31.87 
 
 
426 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.45057 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4093  hypothetical protein  27.8 
 
 
356 aa  65.5  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.818341  normal  0.104815 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>