More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0692 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_2422  Integrase catalytic region  99.39 
 
 
330 aa  682  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2721  Integrase catalytic region  99.7 
 
 
330 aa  685  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.562875  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3258  Integrase catalytic region  100 
 
 
330 aa  686  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0692  Integrase catalytic region  100 
 
 
330 aa  688  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.229145  normal  0.133209 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1668  Integrase catalytic region  100 
 
 
330 aa  688  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.412192  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2291  Integrase catalytic region  99.7 
 
 
348 aa  683  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.152349 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1875  Integrase catalytic region  99.7 
 
 
355 aa  683  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0702445 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0481  integrase catalytic region  68.56 
 
 
463 aa  471  1e-131  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2918  integrase, catalytic region  68.18 
 
 
316 aa  461  1e-129  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.423404 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2899  integrase, catalytic region  68.18 
 
 
327 aa  462  1e-129  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0219368 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0308  integrase, catalytic region  68.09 
 
 
316 aa  460  1e-128  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1296  integrase, catalytic region  68.09 
 
 
316 aa  460  1e-128  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1717  integrase, catalytic region  68.09 
 
 
316 aa  460  1e-128  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0171721  normal  0.307075 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2225  integrase, catalytic region  68.09 
 
 
316 aa  458  1e-128  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00213091  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2818  integrase, catalytic region  68.09 
 
 
316 aa  460  1e-128  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2917  integrase, catalytic region  68.58 
 
 
321 aa  460  1e-128  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.437302 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1097  integrase, catalytic region  68.09 
 
 
316 aa  460  1e-128  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.495543  normal  0.303219 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0481  integrase, catalytic region  68.09 
 
 
316 aa  460  1e-128  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.791017  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3743  hypothetical protein  65.65 
 
 
319 aa  437  1e-121  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0053  integrase catalytic subunit  65.65 
 
 
319 aa  437  1e-121  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.142705  normal  0.776199 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1814  integrase catalytic subunit  65.65 
 
 
319 aa  437  1e-121  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0485004  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3839  hypothetical protein  65.65 
 
 
319 aa  437  1e-121  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.247548  normal  0.0595051 
 
 
-
 
NC_002978  WD0176  transposase, putative  59.63 
 
 
320 aa  422  1e-117  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1293  integrase, catalytic region  67.89 
 
 
329 aa  411  1e-114  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.345302  normal  0.407109 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0366  integrase, catalytic region  67.89 
 
 
329 aa  410  1e-113  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.680873 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5447  Integrase catalytic region  65.28 
 
 
277 aa  374  1e-102  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.681137  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0952  hypothetical protein  56.43 
 
 
320 aa  358  5e-98  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2400  integrase catalytic subunit  53.8 
 
 
316 aa  350  2e-95  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.61618  normal  0.0278741 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1353  integrase catalytic subunit  53.8 
 
 
316 aa  350  2e-95  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.4232  normal  0.0729626 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1780  integrase catalytic subunit  53.8 
 
 
316 aa  350  2e-95  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0228632  normal  0.851382 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1767  integrase catalytic subunit  53.8 
 
 
316 aa  350  2e-95  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.417793 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1054  integrase catalytic subunit  53.8 
 
 
316 aa  350  2e-95  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.161609  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0224  integrase catalytic subunit  53.8 
 
 
316 aa  350  2e-95  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1273  hypothetical protein  54.63 
 
 
314 aa  349  5e-95  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0999856 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0554  hypothetical protein  53.61 
 
 
314 aa  345  7e-94  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    unclonable  2.79647e-10 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3372  integrase catalytic region  55.05 
 
 
321 aa  345  7e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2850  integrase, catalytic region  66 
 
 
329 aa  335  4e-91  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0838  integrase, catalytic region  66 
 
 
286 aa  335  6e-91  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.204021  hitchhiker  0.00436144 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1176  hypothetical protein  54.48 
 
 
284 aa  317  2e-85  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.118975 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0122  integrase, catalytic region  71.92 
 
 
221 aa  306  3e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7134  Integrase catalytic core  67.09 
 
 
303 aa  303  2e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25530  Integrase, catalytic domain-containing protein  53.96 
 
 
265 aa  292  5e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3474  hypothetical protein  69.54 
 
 
206 aa  280  2e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.180544 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2557  integrase, catalytic region  77.42 
 
 
188 aa  249  5e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.805017  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0529  integrase, catalytic core  53.33 
 
 
259 aa  248  7e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1515  integrase catalytic region  67.61 
 
 
178 aa  241  1e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.60322  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2839  integrase, catalytic region  59.04 
 
 
153 aa  194  2e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.489873  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0142  integrase, catalytic region  82.73 
 
 
111 aa  192  8e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1128  integrase catalytic subunit  48.28 
 
 
280 aa  187  2e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2660  integrase catalytic subunit  38.64 
 
 
323 aa  178  9e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.271661 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1401  integrase catalytic subunit  38.39 
 
 
323 aa  176  6e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1251  integrase catalytic subunit  36.01 
 
 
333 aa  175  9e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.093017 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4152  transposase ISRme5 (copy d)  36.01 
 
 
321 aa  175  9e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.29962  normal  0.334182 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1301  integrase catalytic subunit  36.01 
 
 
321 aa  175  9e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.117909 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1280  integrase catalytic subunit  35.9 
 
 
463 aa  174  1e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.722165  normal  0.296416 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1424  integrase catalytic subunit  38.39 
 
 
323 aa  175  1e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2535  integrase catalytic subunit  38.1 
 
 
323 aa  171  2e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.557756 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3549  integrase catalytic region  46.03 
 
 
216 aa  168  1e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.032093 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3709  Integrase catalytic region  36.05 
 
 
325 aa  166  4e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal  0.108327 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0344  Integrase catalytic region  35.86 
 
 
325 aa  164  1e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  8.45152e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3472  hypothetical protein  50 
 
 
170 aa  163  3e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.119399 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0793  putative integrase  35.91 
 
 
343 aa  161  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.638394 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0021  putative integrase  35.91 
 
 
332 aa  160  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.468061 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1631  Integrase catalytic region  34.15 
 
 
329 aa  160  3e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0120  hypothetical protein  32.53 
 
 
497 aa  152  8e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2493  transposase, putative  32.53 
 
 
325 aa  152  9e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2250  putative transposase  32.53 
 
 
333 aa  151  1e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2194  putative transposase  32.53 
 
 
329 aa  152  1e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2179  transposase  32.53 
 
 
325 aa  152  1e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0917  transposase  32.53 
 
 
327 aa  152  1e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2728  putative transposase  32.53 
 
 
441 aa  152  1e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1782  putative integrase  32.23 
 
 
325 aa  150  3e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1378  putative integrase  32.23 
 
 
325 aa  150  3e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00372186  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7791  Integrase catalytic region  32.18 
 
 
323 aa  144  1e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.562755  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5037  Integrase catalytic region  35.59 
 
 
274 aa  137  3e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4022  Integrase catalytic region  32.18 
 
 
330 aa  125  7e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.500717  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2447  integrase catalytic subunit  36.89 
 
 
238 aa  125  1e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0443  integrase, catalytic region  70 
 
 
83 aa  118  1e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.818125 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1371  Fis family transcriptional regulator  44.85 
 
 
179 aa  107  2e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0199142  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33450  integrase, catalytic core  58.75 
 
 
185 aa  106  5e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00518  transposase  39.71 
 
 
216 aa  105  1e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01280  transposase  39.71 
 
 
216 aa  105  1e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0995831  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0252  transposase (class I)  69.12 
 
 
83 aa  104  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3767  hypothetical protein  55.91 
 
 
128 aa  101  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5325  hypothetical protein  77.59 
 
 
197 aa  100  5e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.969651  normal  0.742207 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0733  transposase, putative  30.7 
 
 
229 aa  89.4  8e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1101  putative transposase  75 
 
 
53 aa  86.7  5e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.32913 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6848  integrase catalytic subunit  26.35 
 
 
316 aa  85.9  8e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8690  putative integrase  36.03 
 
 
157 aa  85.5  1e-15  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0801  integrase catalytic region  26.03 
 
 
316 aa  84.3  3e-15  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5566  integrase catalytic region  26.03 
 
 
316 aa  84.3  3e-15  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0200505  normal  0.0677233 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3295  integrase catalytic subunit  26.03 
 
 
316 aa  83.6  4e-15  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.102565  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4870  integrase catalytic subunit  26.03 
 
 
316 aa  83.6  4e-15  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1603  transcriptional regulator, putative  39.69 
 
 
302 aa  82.4  1e-14  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2839  transcriptional regulator, putative  39.53 
 
 
289 aa  81.3  2e-14  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2732  transcriptional regulator, putative  39.53 
 
 
289 aa  81.3  2e-14  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1327  transcriptional regulator, putative  36.97 
 
 
289 aa  81.6  2e-14  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2665  transcriptional regulator, putative  39.53 
 
 
289 aa  80.9  3e-14  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6859  integrase catalytic region  25.48 
 
 
316 aa  79.3  7e-14  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0984063  normal  0.439407 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2762  Integrase catalytic region  29.67 
 
 
381 aa  77.8  2e-13  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>