64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0668 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_0668  protein of unknown function DUF1330  100 
 
 
95 aa  195  2.0000000000000003e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0495537  normal  0.0136421 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4211  protein of unknown function DUF1330  71.28 
 
 
95 aa  141  4e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.365151 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7348  hypothetical protein  68.09 
 
 
95 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.310793  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6158  hypothetical protein  67.02 
 
 
95 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6638  hypothetical protein  67.02 
 
 
95 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5793  hypothetical protein  67.02 
 
 
95 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3966  protein of unknown function DUF1330  59.57 
 
 
95 aa  112  1.0000000000000001e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7719  hypothetical protein  62.96 
 
 
84 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0105  hypothetical protein  56.38 
 
 
110 aa  104  3e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.771179 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0727  hypothetical protein  50 
 
 
98 aa  97.4  6e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3241  protein of unknown function DUF1330  48.94 
 
 
98 aa  96.7  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.386279  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0722  protein of unknown function DUF1330  38.55 
 
 
102 aa  62.4  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3743  hypothetical protein  34.34 
 
 
98 aa  50.8  0.000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.679918 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4587  protein of unknown function DUF1330  35.23 
 
 
95 aa  50.1  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.226521 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0008  hypothetical protein  32.56 
 
 
94 aa  48.9  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00922624  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4583  hypothetical protein  28.72 
 
 
115 aa  48.9  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.165656 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4324  protein of unknown function DUF1330  34.09 
 
 
95 aa  47.4  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0785  hypothetical protein  34.88 
 
 
95 aa  47.4  0.00007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.560924  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2403  hypothetical protein  34.52 
 
 
96 aa  47  0.00009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.79558  normal  0.741886 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3354  hypothetical protein  33.33 
 
 
73 aa  47  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.10898  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1076  hypothetical protein  33.77 
 
 
99 aa  46.6  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.262747  normal  0.355591 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2669  hypothetical protein  36.14 
 
 
96 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0199077  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5042  hypothetical protein  28.92 
 
 
88 aa  45.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.662041  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2337  protein of unknown function DUF1330  35.63 
 
 
100 aa  46.2  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6409  protein of unknown function DUF1330  30.77 
 
 
97 aa  45.4  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4815  protein of unknown function DUF1330  30.23 
 
 
114 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.353052  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2630  hypothetical protein  30.23 
 
 
114 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.152361 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3539  hypothetical protein  32.95 
 
 
95 aa  44.7  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2285  hypothetical protein  31.58 
 
 
96 aa  44.7  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0613201  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2129  hypothetical protein  34.88 
 
 
95 aa  44.3  0.0006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.140278  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0913  protein of unknown function DUF1330  32.98 
 
 
96 aa  44.3  0.0006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2045  hypothetical protein  34.88 
 
 
95 aa  44.3  0.0006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0164673  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1042  hypothetical protein  29.17 
 
 
97 aa  43.9  0.0007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.797208  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1655  protein of unknown function DUF1330  25.26 
 
 
96 aa  43.9  0.0007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3229  hypothetical protein  31.58 
 
 
95 aa  43.9  0.0007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1336  hypothetical protein  29.41 
 
 
96 aa  43.9  0.0008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000449884 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3183  hypothetical protein  30.85 
 
 
96 aa  43.9  0.0008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.614337  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1844  hypothetical protein  36.36 
 
 
101 aa  43.5  0.0009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3445  protein of unknown function DUF1330  28.72 
 
 
96 aa  43.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0714  hypothetical protein  34.15 
 
 
102 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.168478  normal  0.457903 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0724  hypothetical protein  36.71 
 
 
129 aa  43.1  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0345  hypothetical protein  32.56 
 
 
96 aa  43.5  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0272597  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1325  hypothetical protein  31.91 
 
 
96 aa  43.5  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0734  hypothetical protein  34.15 
 
 
102 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.129876 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0720  hypothetical protein  34.15 
 
 
102 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4723  hypothetical protein  32.99 
 
 
102 aa  42.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.153219  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0450  hypothetical protein  36.71 
 
 
96 aa  42.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0386  hypothetical protein  36.47 
 
 
103 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0092  protein of unknown function DUF1330  25.26 
 
 
96 aa  42.4  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.273128  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0684  hypothetical protein  27.38 
 
 
97 aa  42.4  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2103  hypothetical protein  36.71 
 
 
96 aa  42.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.40869  normal  0.72885 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1504  hypothetical protein  28.57 
 
 
127 aa  42  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3708  hypothetical protein  33.33 
 
 
98 aa  42  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.738458 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2076  hypothetical protein  29.47 
 
 
95 aa  42  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.501523 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4055  hypothetical protein  31.52 
 
 
112 aa  42  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.150808 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1957  hypothetical protein  32.93 
 
 
97 aa  42  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0569002  normal  0.325909 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3445  hypothetical protein  37.5 
 
 
110 aa  41.2  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2483  hypothetical protein  29.07 
 
 
97 aa  41.2  0.005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1090  hypothetical protein  26.32 
 
 
97 aa  40.8  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0176  protein of unknown function DUF1330  25.93 
 
 
112 aa  40.8  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1901  hypothetical protein  28.72 
 
 
106 aa  40.8  0.006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00121592  normal  0.870164 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6641  protein of unknown function DUF1330  28.42 
 
 
95 aa  40.4  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3403  hypothetical protein  29.59 
 
 
106 aa  40.4  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1673  hypothetical protein  30.95 
 
 
92 aa  40  0.01  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.688038  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>