More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0612 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_0612  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
369 aa  686    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0881876 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1302  glycosyl transferase, group 1  52.51 
 
 
360 aa  233  3e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2124  glycosyl transferase group 1  40.22 
 
 
375 aa  200  3e-50  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0758  glycosyl transferase group 1  39.68 
 
 
371 aa  92.4  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.11154 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3851  glycosyl transferase, group 1  29.78 
 
 
353 aa  86.7  6e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.243477 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4495  glycosyl transferase group 1  31.5 
 
 
394 aa  85.9  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1960  glycosyl transferase group 1  34.8 
 
 
426 aa  85.9  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000390342  hitchhiker  0.00283274 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0726  glycosyl transferase, group 1  27.16 
 
 
373 aa  83.6  0.000000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.173519  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  32.86 
 
 
360 aa  83.6  0.000000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1737  glycosyl transferase, group 1  25.25 
 
 
395 aa  81.6  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0444  glycosyl transferase group 1  28.93 
 
 
387 aa  81.3  0.00000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.990869 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2078  glycosyl transferase group 1  23.26 
 
 
396 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  36.9 
 
 
382 aa  79.3  0.00000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2082  glycosyl transferase group 1  22.3 
 
 
378 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0183  glycosyl transferase, group 1  40.43 
 
 
476 aa  78.6  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0857  glycosyl transferase group 1  22.36 
 
 
355 aa  77.8  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.123894  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3293  glycosyl transferase group 1  36.51 
 
 
392 aa  77.4  0.0000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1638  glycosyl transferase group 1  25.68 
 
 
519 aa  77.4  0.0000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1795  phosphoheptose isomerase  36.54 
 
 
650 aa  77  0.0000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5430  glycosyl transferase group 1  23.13 
 
 
378 aa  77  0.0000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5426  glycosyl transferase group 1  21.89 
 
 
396 aa  77  0.0000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1586  glycosyl transferase, group 1  21.85 
 
 
355 aa  77  0.0000000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.381696  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4956  glycosyl transferase group 1  31.58 
 
 
340 aa  76.3  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1912  galactosyltransferase  27.39 
 
 
389 aa  76.3  0.0000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1804  glycosyl transferase group 1  28.26 
 
 
415 aa  75.9  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  29.35 
 
 
419 aa  75.1  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3120  glycosyl transferase, group 1  34.17 
 
 
366 aa  75.5  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0017817  unclonable  0.0000176244 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2958  glycosyl transferase group 1  33.85 
 
 
366 aa  75.1  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.298871  hitchhiker  0.000213048 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5593  glycosyl transferase group 1  34.46 
 
 
440 aa  74.3  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.420787 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3803  glycosyl transferase group 1  33.66 
 
 
437 aa  74.3  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4996  lipopolysaccharide 1,2-N-acetylglucosaminetransferase  22.01 
 
 
380 aa  74.3  0.000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0180671  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4880  glycosyl transferase group 1  33.66 
 
 
437 aa  74.3  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.240257  normal  0.0389994 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2637  glycosyl transferase, group 1  31.69 
 
 
421 aa  73.9  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.731543  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3360  glycosyl transferase, group 1  31.58 
 
 
355 aa  73.9  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.730903 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1668  glycogen synthase  33.68 
 
 
411 aa  73.9  0.000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0773  glycosyl transferase group 1  29.07 
 
 
457 aa  73.9  0.000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0202  glycosyl transferase, group 1  28.04 
 
 
369 aa  73.9  0.000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1089  glycosyl transferase group 1  22.33 
 
 
355 aa  73.6  0.000000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.221071  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0713  glycosyl transferase, group 1  40.31 
 
 
405 aa  73.6  0.000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0559363  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0793  glycogen synthase  37.74 
 
 
395 aa  73.6  0.000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3359  glycosyl transferase group 1  39.39 
 
 
434 aa  73.6  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2752  glycosyl transferase group 1  38.38 
 
 
435 aa  73.2  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.904634  hitchhiker  0.000312196 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0394  glycosyl transferase group 1  32.17 
 
 
374 aa  72.8  0.000000000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.538009  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  31.51 
 
 
423 aa  72.4  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  29.86 
 
 
353 aa  71.6  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3362  glycosyl transferase, group 1  29.88 
 
 
433 aa  71.6  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0581443 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3740  lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase  34.76 
 
 
349 aa  71.2  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.939916 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0151  glycosyl transferase group 1  30.1 
 
 
434 aa  71.2  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1914  glycosyl transferase group 1  31.39 
 
 
344 aa  71.6  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5204  group 1 glycosyl transferase  30.95 
 
 
364 aa  70.9  0.00000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1238  glycosyl transferase group 1  32.93 
 
 
349 aa  70.9  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0206606  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5868  glycosyl transferase group 1  38.78 
 
 
420 aa  70.9  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0761  glycosyl transferase group 1  33.18 
 
 
748 aa  70.9  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1661  glycosyl transferase, group 1  30.1 
 
 
366 aa  71.2  0.00000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000116715  hitchhiker  0.00132012 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2655  glycosyl transferase, group 1  32.77 
 
 
395 aa  70.9  0.00000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.268297  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1534  glycosyl transferase, group 1  28.7 
 
 
411 aa  70.9  0.00000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00818879  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0631  glycosyl transferase group 1  35.38 
 
 
394 aa  70.9  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0783  glycosyl transferase group 1  33.45 
 
 
394 aa  70.9  0.00000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.492233  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0741  glycosyl transferase group 1  37.17 
 
 
435 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  31.48 
 
 
377 aa  70.9  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4001  glycogen synthase  34.06 
 
 
382 aa  70.9  0.00000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0312479  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4075  glycogen synthase  34.06 
 
 
382 aa  70.9  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0832432  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2766  glycosyl transferase group 1  34.5 
 
 
413 aa  70.1  0.00000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.36427 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1092  glycosyl transferase group 1  21.48 
 
 
381 aa  70.1  0.00000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2445  glycosyl transferase group 1  31.66 
 
 
375 aa  69.7  0.00000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3576  glycosyl transferase group 1  27.27 
 
 
415 aa  70.1  0.00000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1488  glycosyl transferase group 1  32.62 
 
 
427 aa  69.7  0.00000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0380983  normal  0.669661 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0253  glycosyl transferase, group 1  28.35 
 
 
358 aa  69.3  0.00000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5250  glycosyl transferase group 1  35.47 
 
 
430 aa  69.7  0.00000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.01095 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  30.36 
 
 
415 aa  69.3  0.00000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1077  glycosyl transferase group 1  27.96 
 
 
402 aa  69.3  0.0000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000145174 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0017  glycosyl transferase group 1  34.13 
 
 
377 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0388  glycosyltransferase  28.26 
 
 
373 aa  69.3  0.0000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.230246  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3818  glycosyl transferase, group 1  22.15 
 
 
397 aa  68.9  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.406425 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2873  group 1 glycosyl transferase  46.15 
 
 
421 aa  69.3  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3682  glycosyl transferase group 1  35.15 
 
 
368 aa  69.3  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.558213  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4390  glycosyl transferase, group 1  33.65 
 
 
419 aa  68.2  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.907942  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1640  glycosyl transferase group 1  24.53 
 
 
384 aa  68.2  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6868  glycosyl transferase group 1  30.7 
 
 
424 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4050  glycosyl transferase, group 1  34.98 
 
 
458 aa  68.2  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1969  glycosyl transferase group 1  32.04 
 
 
372 aa  68.6  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3256  glycosyl transferase group 1  42.37 
 
 
414 aa  68.2  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0509523  normal  0.260834 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0379  glycosyl transferase group 1  35.75 
 
 
430 aa  68.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.273077  normal  0.0242737 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0285  glycosyl transferase group 1  27.35 
 
 
389 aa  67.4  0.0000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2920  glycosyl transferase group 1  32.11 
 
 
435 aa  67.8  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2376  glycosyl transferase group 1  32.58 
 
 
372 aa  67.8  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0539  glycosyl transferase group 1  33.52 
 
 
377 aa  67.8  0.0000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2150  glycosyl transferase, group 1  41.86 
 
 
397 aa  67.8  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0126  glycosyl transferase group 1  33.93 
 
 
371 aa  67.4  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3472  glycosyl transferase, group 1  33.19 
 
 
427 aa  67.4  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0837222 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0016  glycosyl transferase group 1  30 
 
 
361 aa  67.4  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1194  glycosyl transferase group 1  28.24 
 
 
355 aa  67.4  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1658  glycosyl transferase, group 1  30.42 
 
 
372 aa  67  0.0000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00025615  hitchhiker  0.00378247 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0690  glycosyl transferase, group 1  35.93 
 
 
394 aa  67.4  0.0000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4198  glycosyl transferase group 1  32.5 
 
 
405 aa  67  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0239  mannosyltransferase  26.11 
 
 
351 aa  67  0.0000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.205695  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1477  glycosyl transferase group 1  24.7 
 
 
406 aa  67  0.0000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3106  glycosyl transferase group 1  36.99 
 
 
435 aa  67  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4231  glycogen synthase  34.5 
 
 
382 aa  67  0.0000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.294207 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6400  glycosyl transferase group 1  35.11 
 
 
389 aa  67  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.469545 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>