32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0562 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_0562  hypothetical protein  100 
 
 		 472 aa  959    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.123092  hitchhiker  0.000000108718 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2015  putative phage-related protein  28.02 
 
 		 446 aa  87.4  5e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0608266 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1645  putative phage-related protein  28.37 
 
 		 444 aa  77.8  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4115  peptidase U35, phage prohead HK97  23.1 
 
 		 649 aa  71.6  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2238  peptidase U35, phage prohead HK97  25.32 
 
 		 646 aa  70.9  0.00000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4080  peptidase U35 phage prohead HK97  23.59 
 
 		 659 aa  70.5  0.00000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5067  peptidase U35 phage prohead HK97  23.59 
 
 		 659 aa  70.1  0.00000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3877  hypothetical protein  28.51 
 
 		 490 aa  64.3  0.000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0282142 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1753  phage major capsid protein, HK97  29.33 
 
 		 435 aa  60.5  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.357661 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2358  phage phi-C31 gp36-like protein /HK97 family major capsid protein  26.06 
 
 		 420 aa  59.7  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.172606  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1619  HK97 family phage major capsid protein  25.46 
 
 		 437 aa  59.3  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.314426 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1622  hypothetical protein  28.44 
 
 		 439 aa  56.2  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.264122  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2834  phage major capsid protein, HK97 family  25.08 
 
 		 397 aa  54.7  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.174812  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0240  putative major head protein/prohead protease  23.36 
 
 		 469 aa  55.1  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1640  hypothetical protein  22.63 
 
 		 431 aa  54.7  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.891376  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1628  HK97 family phage major capsid protein  24.33 
 
 		 400 aa  54.3  0.000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0400  HK97 family phage major capsid protein  24.76 
 
 		 397 aa  54.3  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2892  putative prohead protease  22.55 
 
 		 645 aa  53.5  0.000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000204536 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2246  putative prohead protease  22.55 
 
 		 645 aa  53.5  0.000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000101798 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1539  putative prohead protease  22.55 
 
 		 645 aa  53.5  0.000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1254  HK97 family phage major capsid protein  22.82 
 
 		 399 aa  52.4  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1085  HK97 family major capsid protein  24.24 
 
 		 405 aa  51.6  0.00003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0369  peptidase U35 phage prohead HK97  28.76 
 
 		 624 aa  50.8  0.00006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1170  peptidase U35 phage prohead HK97  28.76 
 
 		 624 aa  50.1  0.00008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1150  hypothetical protein  28.76 
 
 		 624 aa  50.1  0.00009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0411  hypothetical protein  28.76 
 
 		 624 aa  50.1  0.00009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3652  phage phi-C31 gp36 major capsid-like protein  27.4 
 
 		 393 aa  49.3  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2613  peptidase U35 phage prohead HK97  23.99 
 
 		 661 aa  47.8  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.846097  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4282  peptidase U35 phage prohead HK97  23.99 
 
 		 661 aa  47.8  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1299  peptidase U35, phage prohead HK97  30.5 
 
 		 663 aa  46.2  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.284846 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1284  major capsid protein HK97  27.21 
 
 		 416 aa  45.8  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0461297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1466  HK97 family phage major capsid protein  25.3 
 
 		 312 aa  43.1  0.01  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000392324  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>