More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0533 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_0533  glycine cleavage system H protein  100 
 
 		 121 aa  240  3.9999999999999997e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.412806 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1095  glycine cleavage system protein H  61.02 
 
 		 122 aa  153  8e-37  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.171201  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2681  glycine cleavage system protein H  55.46 
 
 		 122 aa  145  1.0000000000000001e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.341923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1851  glycine cleavage system protein H  58.68 
 
 		 123 aa  145  2.0000000000000003e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0324659  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1870  glycine cleavage system protein H  58.33 
 
 		 123 aa  145  2.0000000000000003e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.510899  normal  0.111412 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2684  glycine cleavage system H protein  57.14 
 
 		 123 aa  144  3e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.418167  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0726  glycine cleavage system protein H  57.5 
 
 		 122 aa  144  4.0000000000000006e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0680  glycine cleavage system protein H  57.5 
 
 		 122 aa  144  4.0000000000000006e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1285  glycine cleavage system protein H  57.63 
 
 		 121 aa  142  2e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.390609  normal  0.169764 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3527  glycine cleavage system protein H  59.83 
 
 		 120 aa  141  3e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.36925 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1619  glycine cleavage system protein H  55.93 
 
 		 121 aa  141  3e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.209831  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2695  glycine cleavage system protein H  55.83 
 
 		 123 aa  140  8e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3323  glycine cleavage system protein H  59.83 
 
 		 129 aa  137  3.9999999999999997e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1017  glycine cleavage system protein H  55.93 
 
 		 122 aa  137  4.999999999999999e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1183  glycine cleavage system protein H  55.56 
 
 		 120 aa  137  6e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.157974  normal  0.140639 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2253  glycine cleavage system protein H  57.26 
 
 		 120 aa  136  1e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0487645  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1867  glycine cleavage system H protein  54.55 
 
 		 122 aa  135  2e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0347749  normal  0.181057 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3863  glycine cleavage system protein H  52.5 
 
 		 122 aa  134  3.0000000000000003e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.394687  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1569  glycine cleavage system protein H  55.08 
 
 		 121 aa  134  4e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00108538 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4327  glycine cleavage system H protein  55.83 
 
 		 124 aa  134  5e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.124977  normal  0.0484045 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3739  glycine cleavage system protein H  54.55 
 
 		 121 aa  133  7.000000000000001e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0626114  normal  0.594072 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1732  glycine cleavage system protein H  54.24 
 
 		 121 aa  133  8e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0736  glycine cleavage system protein H  52.14 
 
 		 122 aa  133  9e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3063  glycine cleavage system protein H  58.12 
 
 		 129 aa  132  9.999999999999999e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02736  glycine cleavage system protein H  58.12 
 
 		 129 aa  132  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0429973  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0788  glycine cleavage system H protein  58.12 
 
 		 129 aa  132  9.999999999999999e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.471951  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1191  glycine cleavage system protein H  56.78 
 
 		 130 aa  132  9.999999999999999e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02699  hypothetical protein  58.12 
 
 		 129 aa  132  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0553776  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3325  glycine cleavage system protein H  58.12 
 
 		 129 aa  132  9.999999999999999e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3286  glycine cleavage system protein H  58.12 
 
 		 129 aa  132  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3391  glycine cleavage system protein H  58.12 
 
 		 129 aa  132  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.317969  normal  0.844228 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4195  glycine cleavage system protein H  58.12 
 
 		 129 aa  132  9.999999999999999e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3289  glycine cleavage system protein H  58.12 
 
 		 129 aa  132  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0805  glycine cleavage system protein H  58.12 
 
 		 129 aa  132  9.999999999999999e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0782061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0854  glycine cleavage system protein H  54.7 
 
 		 120 aa  132  9.999999999999999e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0728621  normal  0.0870942 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3224  glycine cleavage system protein H  58.12 
 
 		 129 aa  132  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.226187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3036  glycine cleavage system protein H  58.12 
 
 		 129 aa  132  9.999999999999999e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.197625  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3212  glycine cleavage system protein H  58.12 
 
 		 129 aa  132  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0254293  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5450  glycine cleavage system protein H  54.24 
 
 		 121 aa  131  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0749655 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2210  glycine cleavage system H protein  53.72 
 
 		 121 aa  132  1.9999999999999998e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.194358  normal  0.155334 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0712  glycine cleavage system protein H  52.14 
 
 		 122 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3231  glycine cleavage system protein H  57.26 
 
 		 129 aa  131  3e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.816191  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0813  glycine cleavage system protein H  54.7 
 
 		 120 aa  131  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.388148  normal  0.22287 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4386  glycine cleavage system protein H  53.78 
 
 		 121 aa  130  3.9999999999999996e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.548766  normal  0.706573 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2392  glycine cleavage system H protein  52.59 
 
 		 119 aa  131  3.9999999999999996e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.368043  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6034  glycine cleavage system protein H  53.04 
 
 		 120 aa  130  6e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0418539  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN00460  glycine dehydrogenase (decarboxylating), putative  54.62 
 
 		 160 aa  130  6.999999999999999e-30  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.528435  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0778  glycine cleavage system protein H  55.75 
 
 		 120 aa  130  7.999999999999999e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.068818 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3298  glycine cleavage system H protein  52.59 
 
 		 129 aa  129  1.0000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.123967  normal  0.480249 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3300  glycine cleavage system H protein  54.31 
 
 		 123 aa  129  1.0000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.906564  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0290  glycine cleavage system protein H  52.1 
 
 		 130 aa  128  3e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.148153  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0050  glycine cleavage system H protein  53.85 
 
 		 124 aa  128  3e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.968123  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1903  glycine cleavage system protein H  52.1 
 
 		 130 aa  128  3e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1353  glycine cleavage system H protein  51.75 
 
 		 125 aa  127  3e-29  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0396  glycine cleavage system H protein  53.33 
 
 		 123 aa  126  1.0000000000000001e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4267  glycine cleavage system H protein  50 
 
 		 120 aa  126  1.0000000000000001e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.231851  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1432  glycine cleavage system protein H  52.89 
 
 		 124 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0390  glycine cleavage system H protein  52.5 
 
 		 123 aa  125  3e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.927773 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1944  glycine cleavage system H protein  49.15 
 
 		 130 aa  125  3e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000190356 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1719  glycine cleavage system H protein  56.41 
 
 		 130 aa  125  3e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.891721 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0689  glycine cleavage system protein H  48.31 
 
 		 125 aa  124  5e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.904294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1890  glycine cleavage system protein H  51.28 
 
 		 120 aa  124  6e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0467152  hitchhiker  0.00604337 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3020  glycine cleavage system H protein  49.59 
 
 		 124 aa  124  6e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.29213  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2298  glycine cleavage system protein H  53.45 
 
 		 118 aa  124  6e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3915  glycine cleavage system H protein  54.7 
 
 		 128 aa  123  7e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1740  glycine cleavage system H protein  51.67 
 
 		 124 aa  123  8.000000000000001e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.403182  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1497  glycine cleavage system H protein  49.14 
 
 		 126 aa  123  8.000000000000001e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1937  glycine cleavage system H protein  51.67 
 
 		 124 aa  123  8.000000000000001e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2758  glycine cleavage system protein H  54.7 
 
 		 130 aa  123  9e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2092  glycine cleavage system protein H  51.28 
 
 		 120 aa  123  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.206967  normal  0.370959 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0832  glycine cleavage system protein H  46.55 
 
 		 126 aa  122  1e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00486711  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0849  glycine cleavage system protein H  46.55 
 
 		 126 aa  122  1e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000024227  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1516  glycine cleavage system H protein  49.14 
 
 		 125 aa  122  1e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0307602  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2200  glycine cleavage system protein H  49.58 
 
 		 125 aa  122  2e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.330883 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2194  glycine cleavage system protein H  52.59 
 
 		 118 aa  121  3e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0869  glycine cleavage system protein H  52.59 
 
 		 118 aa  121  3e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.731856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0734  glycine cleavage system protein H  53.57 
 
 		 124 aa  121  4e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.5619  normal  0.0299013 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1711  glycine cleavage system H protein  53.04 
 
 		 126 aa  120  7e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.147296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3608  glycine cleavage system H protein  49.15 
 
 		 140 aa  120  9e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.039586  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0485  glycine cleavage system protein H  45.69 
 
 		 126 aa  119  9.999999999999999e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1560  glycine cleavage system H protein  52.07 
 
 		 124 aa  119  9.999999999999999e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4374  glycine cleavage system protein H  56.9 
 
 		 121 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.44648  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3830  glycine cleavage system H protein  47.41 
 
 		 126 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.741858 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23430  glycine cleavage system H protein  45.38 
 
 		 128 aa  119  1.9999999999999998e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000556712  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3183  glycine cleavage system protein H  53.33 
 
 		 126 aa  118  1.9999999999999998e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.0000000182392  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0447  glycine cleavage system H protein  47.83 
 
 		 126 aa  118  3e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.197212  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3436  glycine cleavage system protein H  52.14 
 
 		 135 aa  118  3e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0231  glycine cleavage system protein H  47.46 
 
 		 126 aa  117  3.9999999999999996e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3958  glycine cleavage system H protein  53.39 
 
 		 124 aa  118  3.9999999999999996e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0639572 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27674  predicted protein  49.12 
 
 		 134 aa  117  3.9999999999999996e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2004  glycine cleavage system H protein  51.3 
 
 		 127 aa  117  4.9999999999999996e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.829681  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4038  glycine cleavage system H protein  48.72 
 
 		 128 aa  117  4.9999999999999996e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0664903  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2577  glycine cleavage system protein H  52.54 
 
 		 130 aa  117  4.9999999999999996e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0304435  normal  0.0181641 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2720  glycine cleavage system protein H  52.14 
 
 		 129 aa  117  4.9999999999999996e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0615009  normal  0.778842 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2036  glycine cleavage system protein H  46.55 
 
 		 129 aa  117  6e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01205  glycine cleavage system protein H  45.3 
 
 		 125 aa  117  7e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0862464  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3310  glycine cleavage system protein H  49.57 
 
 		 136 aa  116  9e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0721  glycine cleavage system H protein  47.41 
 
 		 126 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0780  glycine cleavage system protein H  52.99 
 
 		 129 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0620  glycine cleavage system protein H  50.85 
 
 		 127 aa  115  1.9999999999999998e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>