126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0454 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_0454  protein of unknown function DUF985  100 
 
 
158 aa  314  2e-85  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2020  hypothetical protein  60.84 
 
 
154 aa  163  1.0000000000000001e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.345006  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2382  hypothetical protein  55.24 
 
 
150 aa  153  8e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.377093 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0068  hypothetical protein  56.83 
 
 
145 aa  152  1e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0507  hypothetical protein  54.35 
 
 
147 aa  147  8e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0225677 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0429  hypothetical protein  55.97 
 
 
144 aa  145  1.0000000000000001e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.232501 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0092  hypothetical protein  55.73 
 
 
142 aa  144  6e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.965626  normal  0.113138 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0372  hypothetical protein  54.48 
 
 
135 aa  143  9e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.671361 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0615  protein of unknown function DUF985  55.04 
 
 
133 aa  142  2e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.199543  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0449  protein of unknown function DUF985  53.57 
 
 
148 aa  140  6e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.300455  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4037  hypothetical protein  52.21 
 
 
143 aa  139  9.999999999999999e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1577  hypothetical protein  51.77 
 
 
144 aa  138  1.9999999999999998e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.925208  normal  0.213807 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1833  hypothetical protein  54.07 
 
 
145 aa  137  4.999999999999999e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0854594  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5124  hypothetical protein  55.64 
 
 
142 aa  137  7e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0660127  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2062  hypothetical protein  52.52 
 
 
147 aa  137  7e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.126654  hitchhiker  0.00909943 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4997  protein of unknown function DUF985  53.24 
 
 
146 aa  137  7.999999999999999e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0465  hypothetical protein  52.24 
 
 
136 aa  136  1e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4537  hypothetical protein  54.14 
 
 
146 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.140442 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3876  protein of unknown function DUF985  50.72 
 
 
140 aa  134  6.0000000000000005e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0772957 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5050  protein of unknown function DUF985  52.17 
 
 
146 aa  134  7.000000000000001e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.727084 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1157  hypothetical protein  52.99 
 
 
140 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3583  protein of unknown function DUF985  50.72 
 
 
140 aa  132  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.128737 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2490  hypothetical protein  52.99 
 
 
140 aa  131  5e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.0065112  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1897  protein of unknown function DUF985  52.17 
 
 
155 aa  130  6e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2553  hypothetical protein  54.01 
 
 
154 aa  127  7.000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7610  hypothetical protein  62.62 
 
 
112 aa  124  6e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.139657  normal  0.0983824 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0377  hypothetical protein  50.77 
 
 
154 aa  119  1.9999999999999998e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08145  DUF985 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_5G11860)  47.74 
 
 
170 aa  117  6e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0917143 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2149  putative cupin  48.44 
 
 
146 aa  109  2.0000000000000002e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.928679 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0925  hypothetical protein  43.06 
 
 
156 aa  108  4.0000000000000004e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.587426 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3282  hypothetical protein  47.06 
 
 
155 aa  107  8.000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2689  hypothetical protein  42 
 
 
271 aa  107  9.000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.539086  normal  0.271655 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0173  hypothetical protein  47.01 
 
 
174 aa  107  1e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2146  protein of unknown function DUF985  44.03 
 
 
157 aa  105  2e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.0000712763  decreased coverage  0.00382026 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2900  hypothetical protein  45.19 
 
 
146 aa  102  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.725365 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3686  hypothetical protein  45.95 
 
 
176 aa  100  6e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.949248  normal  0.863338 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3205  hypothetical protein  45.86 
 
 
170 aa  100  7e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4808  protein of unknown function DUF985  45.59 
 
 
286 aa  100  8e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0694  hypothetical protein  42.74 
 
 
157 aa  100  9e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0709  hypothetical protein  42.74 
 
 
157 aa  100  9e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.353114  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0945  protein of unknown function DUF985  42.86 
 
 
169 aa  97.8  5e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6476  protein of unknown function DUF985  44.27 
 
 
143 aa  97.1  8e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00452762  normal  0.099609 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2358  protein of unknown function DUF985  40.94 
 
 
173 aa  96.7  1e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1581  hypothetical protein  39.86 
 
 
164 aa  94.7  4e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.254567  normal  0.0129859 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1284  hypothetical protein  41.04 
 
 
170 aa  94  7e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3266  hypothetical protein  43.61 
 
 
147 aa  94  7e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.422669  normal  0.0398981 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0862  protein of unknown function DUF985  41.61 
 
 
148 aa  93.2  1e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0577579  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04051  hypothetical protein  38.17 
 
 
155 aa  93.6  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1803  hypothetical protein  43.57 
 
 
148 aa  93.6  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.875954  normal  0.792787 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4627  protein of unknown function DUF985  40.69 
 
 
172 aa  91.7  4e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0728086  normal  0.0128085 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4495  protein of unknown function DUF985  40.69 
 
 
172 aa  91.7  4e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0206455  normal  0.273262 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4717  hypothetical protein  42.65 
 
 
193 aa  90.9  6e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0305  hypothetical protein  48.91 
 
 
152 aa  90.5  8e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.275629  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1954  protein of unknown function DUF985  39.86 
 
 
168 aa  90.5  8e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000157588  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4382  hypothetical protein  43.61 
 
 
148 aa  90.5  9e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4469  hypothetical protein  43.61 
 
 
148 aa  90.5  9e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.174279 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4763  hypothetical protein  43.61 
 
 
148 aa  90.5  9e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.687182  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1899  hypothetical protein  41.18 
 
 
162 aa  90.1  1e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.000990864  normal  0.472298 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4946  hypothetical protein  44.03 
 
 
148 aa  89.7  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0479653 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0287  hypothetical protein  39.04 
 
 
176 aa  89.4  2e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0553  hypothetical protein  40.65 
 
 
180 aa  89.4  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.640029 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3278  protein of unknown function DUF985  40.88 
 
 
149 aa  89  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.873622  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2202  protein of unknown function DUF985  41.04 
 
 
171 aa  88.6  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.189002 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0612  hypothetical protein  35.86 
 
 
168 aa  89  3e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.38377  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01404  hypothetical protein  43.08 
 
 
153 aa  88.2  4e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.807362  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2150  hypothetical protein  39.73 
 
 
185 aa  87.8  6e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3403  protein of unknown function DUF985  41.18 
 
 
172 aa  87  9e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0591897  normal  0.076686 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0323  hypothetical protein  36.92 
 
 
158 aa  86.3  1e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.683265  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2957  hypothetical protein  37.16 
 
 
171 aa  86.7  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0202309  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0462  hypothetical protein  40.74 
 
 
166 aa  87  1e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2608  hypothetical protein  38.52 
 
 
170 aa  86.7  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.100551 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1501  hypothetical protein  44.88 
 
 
133 aa  86.3  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0425367  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03601  hypothetical protein  43.75 
 
 
157 aa  85.9  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.928684 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0323  hypothetical protein  30.56 
 
 
166 aa  85.5  2e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5986  hypothetical protein  41.54 
 
 
168 aa  85.9  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0874  hypothetical protein  35.29 
 
 
156 aa  85.9  2e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00437397  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03971  hypothetical protein  37.31 
 
 
155 aa  85.5  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.283111  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0364  hypothetical protein  37.31 
 
 
155 aa  84.7  4e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3999  hypothetical protein  41.54 
 
 
168 aa  85.1  4e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4368  hypothetical protein  41.54 
 
 
168 aa  85.1  4e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0738  protein of unknown function DUF985  37.23 
 
 
166 aa  84.7  4e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1205  hypothetical protein  40.56 
 
 
162 aa  84.3  5e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01699  hypothetical protein  39.1 
 
 
172 aa  84.3  7e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3029  hypothetical protein  41.54 
 
 
156 aa  84  8e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.111246  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5607  protein of unknown function DUF985  38.81 
 
 
164 aa  83.2  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2335  protein of unknown function DUF985  37.25 
 
 
195 aa  83.2  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.408522 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03981  hypothetical protein  35.25 
 
 
155 aa  83.2  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1672  hypothetical protein  34.07 
 
 
167 aa  83.6  0.000000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000193822  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3937  protein of unknown function DUF985  38.85 
 
 
168 aa  82.4  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4251  hypothetical protein  43.08 
 
 
168 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.408223  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3190  hypothetical protein  38.71 
 
 
160 aa  82  0.000000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3777  hypothetical protein  42.31 
 
 
168 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.489554  normal  0.192224 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1054  hypothetical protein  37.78 
 
 
168 aa  80.9  0.000000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000335957  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1589  hypothetical protein  31.25 
 
 
166 aa  79.7  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.391871  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4253  hypothetical protein  42.31 
 
 
168 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.180495  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1649  hypothetical protein  39.23 
 
 
168 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.218017  normal  0.110553 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0879  protein of unknown function DUF985  36.5 
 
 
168 aa  79  0.00000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0646  hypothetical protein  39.52 
 
 
156 aa  78.6  0.00000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3596  protein of unknown function DUF985  39.52 
 
 
156 aa  78.6  0.00000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3662  hypothetical protein  39.52 
 
 
156 aa  78.6  0.00000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>