More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0438 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_0438  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  100 
 
 
254 aa  509  1e-143  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.114268  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0956  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  65.7 
 
 
268 aa  337  8e-92  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1771  Sec-independent protein translocase TatC  57.38 
 
 
323 aa  290  2e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1687  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  50.78 
 
 
275 aa  253  1.0000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1489  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  50 
 
 
275 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.299654  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2608  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  48.81 
 
 
263 aa  251  6e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2343  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  51.17 
 
 
274 aa  251  9.000000000000001e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0131452  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1804  Sec-independent protein translocase TatC  53.06 
 
 
288 aa  251  9.000000000000001e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.226534  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4415  putative Sec-independent protein translocase protein TatC  52.7 
 
 
271 aa  246  2e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.941523 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2666  SEC-independent protein translocase protein  49.43 
 
 
270 aa  246  2e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.341088  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0470  twin-arginine translocating C- subunit  50.81 
 
 
250 aa  244  8e-64  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.018127  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1166  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  52.5 
 
 
280 aa  241  1e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.316189  normal  0.143694 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3029  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  48.62 
 
 
272 aa  239  4e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.244306  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2788  Sec-independent protein translocase TatC  52.36 
 
 
267 aa  239  4e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.23913  normal  0.19411 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0560  Sec-independent protein translocase protein TatC  50.21 
 
 
249 aa  238  5.999999999999999e-62  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0570842  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0884  Sec-independent protein translocase protein TatC  50.58 
 
 
274 aa  237  1e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0875  twin arginine-targeting protein translocase TatC  50.58 
 
 
274 aa  237  1e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.965079  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1617  Sec-independent protein translocase TatC  52.07 
 
 
271 aa  237  1e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.050313  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2185  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  50.63 
 
 
264 aa  236  3e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.248674  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1777  sec-independent periplasmic protein translocase  52.67 
 
 
269 aa  236  3e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0307477  decreased coverage  0.00398359 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4405  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  51.23 
 
 
269 aa  236  3e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.632551  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1790  Sec-independent protein translocase TatC  53.14 
 
 
282 aa  235  5.0000000000000005e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.804208  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2762  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  49.6 
 
 
266 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0340743  normal  0.092649 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2743  Sec-independent protein translocase TatC  54.39 
 
 
272 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.225218  normal  0.269843 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0127  Sec-independent protein translocase TatC  47.29 
 
 
263 aa  232  4.0000000000000004e-60  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3187  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  52.07 
 
 
269 aa  231  7.000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.600412  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2703  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  50.99 
 
 
263 aa  230  1e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0909  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  48.79 
 
 
280 aa  229  4e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.12711  normal  0.120321 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3401  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  48.15 
 
 
266 aa  226  2e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2487  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  50.43 
 
 
263 aa  227  2e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.601581  normal  0.0448554 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3710  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  48.15 
 
 
266 aa  226  2e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.365386  normal  0.172298 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3592  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  48.15 
 
 
266 aa  226  2e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.793751 
 
 
-
 
NC_002978  WD0452  MttB family protein  48.55 
 
 
253 aa  226  4e-58  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2515  Sec-independent protein translocase TatC  53.14 
 
 
271 aa  225  5.0000000000000005e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.106541  normal  0.323596 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3171  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  47.1 
 
 
257 aa  219  1.9999999999999999e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000130103  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3117  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  45 
 
 
300 aa  218  7.999999999999999e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.443277  normal  0.120886 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1145  Sec-independent protein translocase TatC  49.19 
 
 
269 aa  211  1e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.504761 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1211  Sec-independent protein translocase TatC  45.17 
 
 
299 aa  208  6e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0587  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  48.61 
 
 
262 aa  208  6e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.851675 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1981  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  43.08 
 
 
287 aa  206  2e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.437038  normal  0.0428943 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1120  twin arginine-targeting protein translocase TatC  42.8 
 
 
251 aa  206  4e-52  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000124349  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2541  twin-arginine translocation system protein, TatC  41.09 
 
 
289 aa  203  2e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1201  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  41.09 
 
 
289 aa  203  2e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0527172 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1092  twin arginine-targeting protein translocase TatC  44.03 
 
 
241 aa  200  1.9999999999999998e-50  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3123  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  43.92 
 
 
264 aa  200  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0290973 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1096  Sec-independent protein translocase TatC  50.82 
 
 
279 aa  200  1.9999999999999998e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1808  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  42.47 
 
 
468 aa  198  7e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1795  Sec-independent protein translocase TatC  42.91 
 
 
296 aa  198  7.999999999999999e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0386851  normal  0.066575 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1345  sec-independent protein translocase  39.59 
 
 
346 aa  194  1e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.634552  normal  0.127965 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1952  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  42.8 
 
 
257 aa  194  1e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.88032  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3050  Sec-independent protein translocase TatC  39.68 
 
 
268 aa  191  1e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.927956  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2659  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  39.68 
 
 
268 aa  191  1e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3928  Sec-independent protein translocase TatC  50 
 
 
255 aa  189  2.9999999999999997e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4183  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  43.2 
 
 
259 aa  189  5e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.335663  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4362  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  43.2 
 
 
259 aa  189  5e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4206  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  43.2 
 
 
259 aa  189  5e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4302  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  43.2 
 
 
259 aa  189  5e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.901815  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4255  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  43.2 
 
 
259 aa  189  5e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1468  Sec-independent protein translocase TatC  43.7 
 
 
368 aa  186  3e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0443024  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5157  sec-independent protein translocase TatC  41.34 
 
 
266 aa  185  5e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0991  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  41.34 
 
 
324 aa  184  8e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0395989  hitchhiker  0.000851053 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0382  Sec-independent periplasmic protein translocase  40.94 
 
 
266 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3910  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  43.25 
 
 
255 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3758  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  42.63 
 
 
253 aa  183  2.0000000000000003e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.428108  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1453  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  41.13 
 
 
253 aa  183  3e-45  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.381621  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0470  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  40.87 
 
 
248 aa  183  3e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0692  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  42.57 
 
 
257 aa  182  3e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.299574  normal  0.13691 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3001  sec-independent protein translocase protein TatC  41.43 
 
 
251 aa  182  4.0000000000000006e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.87318  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3043  Sec-independent periplasmic protein translocation protein TatC  39.29 
 
 
252 aa  182  6e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0094  Sec-independent protein translocase TatC  42.06 
 
 
250 aa  181  8.000000000000001e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0230182  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3378  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  38.89 
 
 
251 aa  181  8.000000000000001e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.865812  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5068  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  38.34 
 
 
262 aa  181  8.000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.57281  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5809  twin arginine-targeting protein translocase TatC  40.55 
 
 
267 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0501  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  39.44 
 
 
249 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1575  twin arginine-targeting protein translocase TatC  37.05 
 
 
247 aa  179  4e-44  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0380  Sec-independent periplasmic protein translocase  38.58 
 
 
264 aa  179  4e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.117601 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0456  Sec-independent protein translocase TatC  39.92 
 
 
261 aa  179  4e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66980  sec-independent protein translocase TatC  40.55 
 
 
267 aa  179  4e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0332914  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0447  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  40.32 
 
 
263 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.497745  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5018  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  39.92 
 
 
262 aa  178  5.999999999999999e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4892  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  39.92 
 
 
262 aa  178  5.999999999999999e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.418116  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0253  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  40.91 
 
 
256 aa  178  7e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.3231 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2494  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  40 
 
 
252 aa  178  7e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0400  Sec-independent protein translocase TatC  39.92 
 
 
249 aa  178  8e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3556  Sec-independent protein translocase TatC  40.64 
 
 
249 aa  177  1e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03731  TatABCE protein translocation system subunit  38.34 
 
 
258 aa  176  2e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4141  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  38.34 
 
 
258 aa  176  2e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4242  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  40.96 
 
 
249 aa  176  2e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4221  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  38.34 
 
 
258 aa  176  2e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00142004 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0414  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  37.55 
 
 
251 aa  177  2e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4359  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  38.34 
 
 
258 aa  176  2e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5279  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  38.34 
 
 
258 aa  176  2e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.613586  normal  0.20665 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3900  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  37.55 
 
 
251 aa  177  2e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4062  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  38.34 
 
 
258 aa  176  2e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4310  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  38.34 
 
 
258 aa  176  2e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0440  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  37.55 
 
 
251 aa  176  2e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.289196 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4170  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  38.34 
 
 
258 aa  176  2e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00164858 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0426  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  37.55 
 
 
251 aa  177  2e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000454537 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03680  hypothetical protein  38.34 
 
 
258 aa  176  2e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3940  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  39.44 
 
 
258 aa  176  3e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>