294 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0394 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_0394  preprotein translocase, YajC subunit  100 
 
 		 126 aa  254  4e-67  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.918235  normal  0.672603 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1765  protein translocase subunit yajC  47.46 
 
 		 143 aa  106  1e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.242653  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2337  preprotein translocase, YajC subunit  48.72 
 
 		 113 aa  105  3e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.539902  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0890  preprotein translocase, YajC subunit  46.15 
 
 		 113 aa  99  2e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0886  preprotein translocase, YajC subunit  46.55 
 
 		 113 aa  99  2e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4599  preprotein translocase, YajC subunit  45.63 
 
 		 110 aa  97.1  7e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0858963  normal  0.19415 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4229  preprotein translocase, YajC subunit  45.63 
 
 		 110 aa  97.1  7e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2777  preprotein translocase, YajC subunit  46.15 
 
 		 144 aa  95.9  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.209285  normal  0.314245 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1798  preprotein translocase, YajC subunit  45.13 
 
 		 133 aa  94  7e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.225845  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1182  preprotein translocase, YajC subunit  54.17 
 
 		 119 aa  93.2  1e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.714716  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2187  preprotein translocase, YajC subunit  42.45 
 
 		 111 aa  92.4  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.548502  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4407  protein translocase subunit yajC  44.25 
 
 		 118 aa  92.4  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.201974 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1173  preprotein translocase, YajC subunit  47.57 
 
 		 110 aa  92.4  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.441411  normal  0.139659 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1452  protein translocase subunit yajC  48.21 
 
 		 112 aa  91.7  3e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3213  protein translocase subunit yajC  39.83 
 
 		 133 aa  91.7  3e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1770  preprotein translocase subunit, YajC  44.14 
 
 		 133 aa  90.9  5e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.131308  decreased coverage  0.00406868 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1083  protein translocase subunit yajC  48.89 
 
 		 93 aa  90.1  9e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.452709  normal  0.0755092 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2074  protein translocase subunit yajC  43.48 
 
 		 109 aa  89  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.721534  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2548  preprotein translocase subunit YajC  46.67 
 
 		 110 aa  88.2  3e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0861289 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2958  preprotein translocase subunit YajC  46.67 
 
 		 110 aa  88.2  3e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2275  preprotein translocase, YajC subunit  51.85 
 
 		 110 aa  88.6  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.300335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1417  preprotein translocase, YajC subunit  45.05 
 
 		 110 aa  88.6  3e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.718681  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0534  preprotein translocase, YajC subunit  36.07 
 
 		 123 aa  87.4  5e-17  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1495  preprotein translocase, YajC subunit  43.69 
 
 		 115 aa  87.8  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.528936 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0995  protein translocase subunit yajC  42.71 
 
 		 94 aa  87.4  6e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0455  preprotein translocase, YajC subunit  51.14 
 
 		 109 aa  86.7  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0666222  normal  0.0413698 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1717  preprotein translocase, YajC subunit  41.9 
 
 		 106 aa  86.3  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.51746  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0443  preprotein translocase, YajC subunit  51.14 
 
 		 108 aa  85.9  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0153138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3035  preprotein translocase, YajC subunit  46 
 
 		 104 aa  85.9  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1797  protein translocase subunit yajC  51.14 
 
 		 108 aa  85.9  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.188227  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4748  preprotein translocase, YajC subunit  46.91 
 
 		 110 aa  85.5  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0608539 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1715  preprotein translocase, YajC subunit  43.48 
 
 		 178 aa  85.1  3e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2490  preprotein translocase, YajC subunit  42.72 
 
 		 111 aa  84.3  6e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.284595 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2778  preprotein translocase, YajC subunit  44.57 
 
 		 146 aa  83.6  8e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.414643  normal  0.627651 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2714  preprotein translocase subunit YajC  45.78 
 
 		 109 aa  83.2  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.191333 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0636  preprotein translocase subunit YajC  39.42 
 
 		 107 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3809  preprotein translocase subunit YajC  39.42 
 
 		 107 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1860  preprotein translocase subunit  46.07 
 
 		 105 aa  82.4  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.529455  normal  0.676503 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0237  preprotein translocase subunit YajC  39.42 
 
 		 107 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2665  preprotein translocase subunit YajC  39.42 
 
 		 107 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.423387 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0611  preprotein translocase subunit YajC  39.42 
 
 		 107 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0689  preprotein translocase subunit YajC  39.42 
 
 		 107 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.367207  normal  0.660097 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0721  preprotein translocase subunit YajC  39.42 
 
 		 107 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4308  preprotein translocase, YajC subunit  41.24 
 
 		 115 aa  80.5  0.000000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2112  preprotein translocase, YajC subunit  37.17 
 
 		 117 aa  80.5  0.000000000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000210725  normal  0.92109 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2854  preprotein translocase, YajC subunit  42.39 
 
 		 114 aa  80.5  0.000000000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.134392 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2733  preprotein translocase, YajC subunit  42.39 
 
 		 142 aa  80.1  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.400148 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0845  preprotein translocase, YajC subunit  40.2 
 
 		 143 aa  80.1  0.00000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000092041  normal  0.1511 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2618  preprotein translocase, YajC subunit  48.75 
 
 		 106 aa  79  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3279  preprotein translocase subunit YajC  41 
 
 		 108 aa  79  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.198543  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2526  preprotein translocase subunit YajC  38.46 
 
 		 109 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3173  preprotein translocase, YajC subunit  41.3 
 
 		 146 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.407254  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0523  preprotein translocase, YajC subunit  40.24 
 
 		 154 aa  78.2  0.00000000000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2809  preprotein translocase subunit YajC  43.27 
 
 		 108 aa  77.4  0.00000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1000  preprotein translocase, YajC subunit  40.22 
 
 		 111 aa  77.8  0.00000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.492649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1797  protein translocase subunit yajC  42.71 
 
 		 111 aa  77.4  0.00000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.422373  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3867  preprotein translocase, YajC subunit  43.37 
 
 		 91 aa  77  0.00000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2659  preprotein tranlocase protein  46.59 
 
 		 123 aa  77  0.00000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.32408  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1790  preprotein translocase, YajC subunit  40.38 
 
 		 108 aa  77  0.00000000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.645433  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1008  preprotein translocase, YajC subunit  33.33 
 
 		 125 aa  76.6  0.0000000000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.868301  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3356  preprotein translocase, YajC subunit  43.53 
 
 		 110 aa  75.9  0.0000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4006  protein translocase subunit yajC  43.53 
 
 		 109 aa  76.3  0.0000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1277  preprotein translocase subunit YajC  42.17 
 
 		 108 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2298  preprotein translocase, YajC subunit  37.76 
 
 		 118 aa  75.5  0.0000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000341875  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0700  preprotein translocase subunit YajC  39.42 
 
 		 109 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3991  preprotein translocase subunit YajC  39.42 
 
 		 120 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.340437  normal  0.209525 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1900  protein translocase subunit yajC  43.02 
 
 		 113 aa  75.5  0.0000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.743684  normal  0.257956 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1274  preprotein translocase, YajC subunit  41.86 
 
 		 95 aa  75.9  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0485  preprotein translocase, YajC subunit  42.11 
 
 		 112 aa  75.5  0.0000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2483  preprotein translocase subunit YajC  34.29 
 
 		 110 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000329003  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3363  preprotein translocase subunit YajC  42.17 
 
 		 108 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2386  preprotein translocase subunit YajC  42.17 
 
 		 108 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2572  preprotein translocase subunit YajC  42.17 
 
 		 108 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.933871  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3329  preprotein translocase subunit YajC  42.17 
 
 		 108 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.211385  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3372  preprotein translocase subunit YajC  42.17 
 
 		 108 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0108  hypothetical protein  35.71 
 
 		 118 aa  74.7  0.0000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4646  protein translocase subunit yajC  44.05 
 
 		 94 aa  74.7  0.0000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.479824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0302  preprotein translocase subunit YajC  42.17 
 
 		 108 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1164  preprotein translocase subunit YajC  42.17 
 
 		 108 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2348  preprotein translocase, YajC subunit  37.04 
 
 		 118 aa  74.3  0.0000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0276  protein translocase subunit yajC  40.43 
 
 		 108 aa  74.3  0.0000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.865381  normal  0.0326765 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0853  protein translocase subunit yajC  42 
 
 		 106 aa  74.3  0.0000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2945  preprotein translocase subunit YajC  41.35 
 
 		 108 aa  73.9  0.0000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1507  preprotein translocase, YajC subunit  40.7 
 
 		 108 aa  73.6  0.0000000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3408  preprotein translocase subunit YajC  37.65 
 
 		 108 aa  73.6  0.0000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.327995  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0542  preprotein translocase, YajC subunit  57.14 
 
 		 133 aa  73.2  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0292946 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1783  preprotein translocase, YajC subunit  46.84 
 
 		 105 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000873095 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1801  preprotein translocase, YajC subunit  39.25 
 
 		 112 aa  73.2  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0543558  hitchhiker  0.0000220066 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1571  preprotein translocase subunit YajC  32.38 
 
 		 110 aa  72.8  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000298712  hitchhiker  0.0000000623922 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2881  preprotein translocase subunit YajC  32.38 
 
 		 110 aa  72.8  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000118136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1218  preprotein translocase, YajC subunit  44.09 
 
 		 109 aa  72.8  0.000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000169115  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2434  preprotein translocase, YajC subunit  46.84 
 
 		 106 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.966428  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2786  preprotein translocase subunit YajC  32.38 
 
 		 110 aa  72.8  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000000416487  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2806  preprotein translocase subunit YajC  32.38 
 
 		 110 aa  72.8  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000242137  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1240  preprotein translocase, YajC subunit  44.19 
 
 		 114 aa  73.6  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.659198  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2055  preprotein translocase, YajC subunit  38.37 
 
 		 102 aa  72  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.34976  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1817  protein translocase subunit yajC  39.18 
 
 		 119 aa  72.4  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0910437  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0343  preprotein translocase, YajC subunit  39.76 
 
 		 127 aa  72.8  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.23698 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1698  preprotein translocase, YajC subunit  36.36 
 
 		 123 aa  72.4  0.000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2458  protein translocase subunit yajC  33.67 
 
 		 117 aa  72.4  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.107187  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>