More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0346 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_0346  peptide deformylase  100 
 
 		 179 aa  357  6e-98  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0716574  normal  0.0241659 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0409  peptide deformylase  58.62 
 
 		 188 aa  208  3e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3146  peptide deformylase  50.3 
 
 		 171 aa  174  5e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.107781  normal  0.346577 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1035  peptide deformylase  48.8 
 
 		 187 aa  172  1.9999999999999998e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0976  peptide deformylase  48.8 
 
 		 187 aa  172  1.9999999999999998e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.428714  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1344  peptide deformylase  46.99 
 
 		 175 aa  167  1e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0054  peptide deformylase  48.19 
 
 		 174 aa  166  2e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.847323  hitchhiker  0.000416121 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0072  peptide deformylase  48.19 
 
 		 171 aa  166  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0055  peptide deformylase  47.62 
 
 		 171 aa  165  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0323144 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0466  peptide deformylase  48.81 
 
 		 174 aa  165  2.9999999999999998e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3305  peptide deformylase  48.19 
 
 		 172 aa  162  3e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0514769  normal  0.598206 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0394  peptide deformylase  49.69 
 
 		 177 aa  161  4.0000000000000004e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0803  peptide deformylase  52.47 
 
 		 175 aa  160  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.605811 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1598  peptide deformylase  48.45 
 
 		 171 aa  159  2e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.24157  normal  0.0664949 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7337  peptide deformylase  50.3 
 
 		 175 aa  159  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0872  peptide deformylase  49.11 
 
 		 177 aa  159  3e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2532  peptide deformylase  49.11 
 
 		 177 aa  159  3e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0298154  normal  0.981037 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0625  peptide deformylase  47.59 
 
 		 175 aa  157  6e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.276668  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0148  peptide deformylase  50 
 
 		 177 aa  157  6e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.317383  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1918  peptide deformylase  49.09 
 
 		 171 aa  157  8e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.232205  normal  0.101143 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1636  peptide deformylase  49.09 
 
 		 171 aa  157  8e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.171966  normal  0.104834 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1128  peptide deformylase  48.17 
 
 		 196 aa  155  3e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0994442 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0647  peptide deformylase  52.94 
 
 		 173 aa  155  4e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.895591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0542  peptide deformylase  49.36 
 
 		 176 aa  154  5.0000000000000005e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3064  peptide deformylase  49.1 
 
 		 187 aa  153  1e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.518814 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0673  peptide deformylase  48.15 
 
 		 175 aa  153  1e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.478073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0496  peptide deformylase  46.75 
 
 		 193 aa  153  1e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.215202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3693  peptide deformylase  49.1 
 
 		 175 aa  152  2e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0081  peptide deformylase  46.99 
 
 		 175 aa  152  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.364538  normal  0.0628749 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1319  peptide deformylase  43.93 
 
 		 182 aa  151  5e-36  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0179  peptide deformylase  45.78 
 
 		 187 aa  150  8.999999999999999e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.340419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2580  peptide deformylase  48.19 
 
 		 174 aa  149  2e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.341575  hitchhiker  0.00000672564 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4045  peptide deformylase  47.37 
 
 		 177 aa  148  3e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.606485 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0251  peptide deformylase  46.59 
 
 		 180 aa  147  6e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.142586 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2628  peptide deformylase  49.7 
 
 		 178 aa  147  6e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.790989  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3585  peptide deformylase  46.47 
 
 		 170 aa  147  1.0000000000000001e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00170  peptide deformylase  48.48 
 
 		 168 aa  146  1.0000000000000001e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.221595  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0019  peptide deformylase  46.95 
 
 		 168 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0084  peptide deformylase  47.59 
 
 		 168 aa  145  3e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.669645  decreased coverage  0.00000000000000447721 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0087  peptide deformylase  47.59 
 
 		 168 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.68939  hitchhiker  0.00000133405 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0177  polypeptide deformylase  46.95 
 
 		 168 aa  144  5e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4240  peptide deformylase  50.91 
 
 		 173 aa  144  5e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.003685 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0017  peptide deformylase  46.99 
 
 		 168 aa  144  9e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000267775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0084  peptide deformylase  46.99 
 
 		 168 aa  143  1e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.424252 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0068  peptide deformylase  46.99 
 
 		 168 aa  143  1e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00204301  unclonable  0.00000040176 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3350  peptide deformylase  53.33 
 
 		 172 aa  143  1e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.954138  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2896  peptide deformylase  41.9 
 
 		 188 aa  143  1e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.277064  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4749  peptide deformylase  50.91 
 
 		 173 aa  143  1e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.135374  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2843  polypeptide deformylase  48.78 
 
 		 178 aa  143  2e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4082  peptide deformylase  48.82 
 
 		 170 aa  142  2e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.364663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0055  peptide deformylase  45.78 
 
 		 168 aa  142  3e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0442  peptide deformylase  44.85 
 
 		 174 aa  142  3e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.33127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00200  peptide deformylase  46.99 
 
 		 168 aa  142  3e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0942846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0261  peptide deformylase  49.34 
 
 		 173 aa  141  6e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.632283 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0020  peptide deformylase  46.99 
 
 		 168 aa  141  6e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.139599  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0021  peptide deformylase  45.45 
 
 		 172 aa  141  6e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.243681  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0245  polypeptide deformylase  43.71 
 
 		 171 aa  140  8e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1929  peptide deformylase  45.83 
 
 		 170 aa  140  9.999999999999999e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2323  peptide deformylase  50 
 
 		 169 aa  140  9.999999999999999e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.180908  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04055  peptide deformylase  49.26 
 
 		 152 aa  139  1.9999999999999998e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0193  peptide deformylase  45.18 
 
 		 169 aa  139  3e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1865  peptide deformylase  45.24 
 
 		 170 aa  139  3e-32  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0142  peptide deformylase  46.88 
 
 		 173 aa  139  3e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00942793  normal  0.794986 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2273  peptide deformylase  48.12 
 
 		 177 aa  137  6e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00664016 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1778  peptide deformylase  40.61 
 
 		 171 aa  137  7e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.818545  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3014  peptide deformylase  45.12 
 
 		 167 aa  136  1e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0015  peptide deformylase  44.05 
 
 		 167 aa  136  2e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5113  peptide deformylase  45.73 
 
 		 173 aa  136  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0220791  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2867  peptide deformylase  46.95 
 
 		 170 aa  135  3.0000000000000003e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0020  polypeptide deformylase  44.05 
 
 		 171 aa  135  4e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0014  peptide deformylase  48.21 
 
 		 177 aa  134  6.0000000000000005e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.220664 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0049  peptide deformylase  44.85 
 
 		 178 aa  134  6.0000000000000005e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.84969  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0020  peptide deformylase  46.95 
 
 		 167 aa  134  8e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.133709 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0019  polypeptide deformylase  46.95 
 
 		 167 aa  134  8e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3396  peptide deformylase  47.27 
 
 		 170 aa  133  9.999999999999999e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.64649  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3408  peptide deformylase  46.06 
 
 		 168 aa  133  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.709814  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4051  peptide deformylase  47.27 
 
 		 170 aa  133  9.999999999999999e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.586324  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3860  peptide deformylase  44.91 
 
 		 169 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00771  peptide deformylase  43.05 
 
 		 203 aa  133  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0342378  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0021  peptide deformylase  46.06 
 
 		 167 aa  132  1.9999999999999998e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.3876 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0070  peptide deformylase  43.33 
 
 		 201 aa  132  3e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.805375  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0043  peptide deformylase  46.01 
 
 		 167 aa  131  3.9999999999999996e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0029  peptide deformylase  46.06 
 
 		 168 aa  131  5e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.948652  hitchhiker  0.00406786 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0027  peptide deformylase  46.06 
 
 		 168 aa  131  5e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0851581 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0035  peptide deformylase  46.06 
 
 		 168 aa  131  5e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000196537 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0032  peptide deformylase  45.45 
 
 		 168 aa  131  6e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2079  peptide deformylase  42.24 
 
 		 171 aa  130  7.999999999999999e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00801  peptide deformylase  42.21 
 
 		 201 aa  130  9e-30  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.876685  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0350  peptide deformylase  45.12 
 
 		 171 aa  130  1.0000000000000001e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.100367 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0043  peptide deformylase  43.71 
 
 		 167 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.598782  normal  0.134681 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00791  peptide deformylase  42.21 
 
 		 201 aa  130  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.503942  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0439  peptide deformylase  46.99 
 
 		 170 aa  130  1.0000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.401937  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4570  peptide deformylase  43.75 
 
 		 173 aa  130  1.0000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1645  polypeptide deformylase  43.42 
 
 		 169 aa  129  2.0000000000000002e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0070  peptide deformylase  44.58 
 
 		 169 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3338  peptide deformylase  47.13 
 
 		 167 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03091  peptide deformylase  44 
 
 		 201 aa  129  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0024  peptide deformylase  45.12 
 
 		 170 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0416  peptide deformylase  44.24 
 
 		 167 aa  129  2.0000000000000002e-29  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0038  peptide deformylase  43.11 
 
 		 169 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.346284 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>