More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0283 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_0283  periplasmic binding protein  100 
 
 		 383 aa  778    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.996344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2669  putative ABC transporter, periplasmic iron siderophore/cobalamin-binding protein  53.62 
 
 		 389 aa  426  1e-118  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2751  periplasmic binding protein  53.62 
 
 		 389 aa  426  1e-118  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.369256  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1538  putative ABC transporter periplasmic iron siderophore/cobalamin-binding protein  53.48 
 
 		 381 aa  426  1e-118  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.204367 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7105  ABC Fe3+-hydroxamate transporter, periplasmic ligand binding protein  51.29 
 
 		 401 aa  347  2e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.320123  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4771  periplasmic binding protein  43.77 
 
 		 370 aa  311  1e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2696  periplasmic binding protein  45.82 
 
 		 377 aa  301  1e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.773462  normal  0.636131 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3531  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system periplasmic component-like protein  43.7 
 
 		 382 aa  299  4e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.826718  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1058  periplasmic binding protein  42.53 
 
 		 370 aa  291  1e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.530502  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4418  periplasmic binding protein  38.24 
 
 		 377 aa  285  7e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.468441 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1221  ABC transporter substrate binding protein (iron)  38.84 
 
 		 406 aa  285  8e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3000  periplasmic binding protein  42.94 
 
 		 369 aa  282  8.000000000000001e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.796809  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0154  hypothetical protein  40.58 
 
 		 366 aa  280  4e-74  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000656293 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0816  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  40.58 
 
 		 366 aa  280  4e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0816  periplasmic binding protein  40.58 
 
 		 366 aa  280  4e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0919646  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1015  periplasmic binding protein  40.06 
 
 		 371 aa  278  1e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.543354 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1097  periplasmic binding protein  35.05 
 
 		 373 aa  271  1e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.508447  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2758  periplasmic binding protein  36.93 
 
 		 373 aa  270  2.9999999999999997e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.593995  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1235  periplasmic binding protein  36.09 
 
 		 375 aa  269  7e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3089  periplasmic binding protein  39.77 
 
 		 375 aa  268  1e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3040  periplasmic binding protein  35.84 
 
 		 375 aa  266  5e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.174043  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2249  periplasmic binding protein  36.56 
 
 		 378 aa  264  2e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.254495 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0797  periplasmic binding protein  44.23 
 
 		 367 aa  261  1e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0161104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2027  periplasmic binding protein  36.76 
 
 		 378 aa  259  6e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.683361  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1127  periplasmic binding protein  39.48 
 
 		 368 aa  257  2e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1693  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system periplasmic component-like protein  42.05 
 
 		 370 aa  257  2e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3611  periplasmic binding protein  41.57 
 
 		 380 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.486041  normal  0.0848378 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0573  ABC transporter, substrate binding protein  37.13 
 
 		 374 aa  251  2e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.470776  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1240  periplasmic binding protein  36.69 
 
 		 372 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2140  periplasmic binding protein  34.15 
 
 		 394 aa  245  9.999999999999999e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.07383  normal  0.925288 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3035  periplasmic binding protein  36.98 
 
 		 372 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.938947  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3900  periplasmic binding protein  33.97 
 
 		 386 aa  243  6e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4077  periplasmic binding protein  33.42 
 
 		 383 aa  239  4e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1220  ABC transporter substrate binding protein (iron)  37.06 
 
 		 383 aa  239  5e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0484482  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2567  periplasmic binding protein  37.85 
 
 		 365 aa  238  1e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0204616  normal  0.363885 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3141  periplasmic binding protein  34.41 
 
 		 371 aa  230  3e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2194  ferrichrome/ferrioxamine B periplasmic transporter  36.73 
 
 		 377 aa  227  3e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.301282  normal  0.0100465 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2755  ABC transporter, substrate binding protein  33.33 
 
 		 375 aa  222  8e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.0000138231  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1100  ABC transporter, substrate binding protein  31.87 
 
 		 374 aa  220  3e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0595516  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4137  ferrichrome/ferrioxamine B periplasmic transporter  35.89 
 
 		 365 aa  209  6e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0467  Fe(III) dicitrate ABC transporter, permease  31.21 
 
 		 384 aa  203  3e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2735  putative iron complex transport system substrate-binding protein  30.97 
 
 		 427 aa  196  5.000000000000001e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0180927  decreased coverage  0.0000609348 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0745  periplasmic binding protein  29.32 
 
 		 407 aa  155  1e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.300436 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2718  periplasmic binding protein  29.15 
 
 		 360 aa  149  8e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.410203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1774  periplasmic binding protein  32.09 
 
 		 363 aa  149  1.0000000000000001e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.363885 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7622  ABC transporter substrate binding protein (iron)  29.2 
 
 		 429 aa  142  9.999999999999999e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1702  periplasmic binding protein  27.98 
 
 		 364 aa  139  1e-31  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1644  copper amine oxidase domain protein  32.46 
 
 		 483 aa  138  2e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0382967  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1701  periplasmic binding protein  27.43 
 
 		 365 aa  134  1.9999999999999998e-30  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1216  copper amine oxidase domain-containing protein  31.27 
 
 		 478 aa  134  3.9999999999999996e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000673824  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2539  periplasmic binding protein  26.16 
 
 		 368 aa  132  7.999999999999999e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1597  periplasmic binding protein  31.44 
 
 		 409 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.465677  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2617  periplasmic binding protein  27.17 
 
 		 380 aa  126  7e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1314  periplasmic binding protein  26.72 
 
 		 380 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0394754 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1708  periplasmic binding protein  24.93 
 
 		 392 aa  115  8.999999999999998e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2396  iron(III) ABC transporter, solute-binding protein  29.79 
 
 		 375 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.507465 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1042  periplasmic binding protein  28.04 
 
 		 354 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1185  periplasmic binding protein  27.05 
 
 		 354 aa  105  1e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.306422  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2720  periplasmic binding protein  24.49 
 
 		 363 aa  100  4e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00000000254593  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2635  iron chelate ABC transporter periplasmic iron/siderophore-binding protein  24.49 
 
 		 363 aa  100  4e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  3.97529e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1591  periplasmic binding protein  29.85 
 
 		 377 aa  99.8  7e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0970823  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1218  periplasmic binding protein  30.97 
 
 		 358 aa  99  1e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0017043  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1321  periplasmic binding protein  26.98 
 
 		 366 aa  99.4  1e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.77394  normal  0.0125945 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2098  periplasmic binding protein  26.81 
 
 		 402 aa  98.2  2e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0972  periplasmic binding protein  26.86 
 
 		 429 aa  98.2  2e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0024  periplasmic binding protein  27.38 
 
 		 360 aa  97.1  5e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1422  periplasmic binding protein  25.14 
 
 		 333 aa  96.3  8e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.158314 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1316  periplasmic binding protein  25.35 
 
 		 390 aa  95.5  1e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.867732  normal  0.0135564 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0547  periplasmic binding protein  25.58 
 
 		 359 aa  93.2  6e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0426  periplasmic binding protein  26.17 
 
 		 375 aa  93.2  6e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1645  periplasmic binding protein  24.79 
 
 		 354 aa  92.4  1e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.399451  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2326  periplasmic binding protein  25.5 
 
 		 346 aa  91.3  3e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.300944 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0428  periplasmic binding protein  24.49 
 
 		 375 aa  90.9  3e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1868  iron(III) dicitrate-binding protein  26.15 
 
 		 401 aa  90.5  4e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.311818 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0025  FMN-binding domain protein  24.86 
 
 		 517 aa  90.1  6e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1870  iron(III) dicitrate-binding protein  26.6 
 
 		 403 aa  89.7  8e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.874813  normal  0.198975 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1869  iron(III) dicitrate-binding protein  26.57 
 
 		 401 aa  89  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.444655  normal  0.203849 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1534  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.17 
 
 		 351 aa  88.6  2e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000374232  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2847  periplasmic binding protein  25.21 
 
 		 354 aa  88.6  2e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5522  periplasmic binding protein  30.21 
 
 		 361 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.979273  normal  0.0605852 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1492  periplasmic binding protein  25.28 
 
 		 362 aa  87.4  3e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.104614  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0148  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  25.99 
 
 		 349 aa  86.3  8e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0440522  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0248  periplasmic binding protein  25.41 
 
 		 375 aa  85.5  0.000000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0774691  normal  0.65467 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5706  periplasmic binding protein  24.68 
 
 		 351 aa  84.3  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0428  periplasmic binding protein  25.14 
 
 		 375 aa  84  0.000000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1424  periplasmic binding protein  23.45 
 
 		 354 aa  83.2  0.000000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0409  periplasmic binding protein  24.86 
 
 		 375 aa  83.2  0.000000000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.14115  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1195  periplasmic binding protein  24.66 
 
 		 374 aa  82.8  0.000000000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1286  ABC transporter, solute-binding protein  23.14 
 
 		 370 aa  82  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0890  ABC-transporter periplasmic-binding component  24.15 
 
 		 344 aa  82.8  0.00000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00338938  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0029  periplasmic binding protein  24.78 
 
 		 361 aa  82.4  0.00000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0513  ABC transporter, solute-binding protein  23.35 
 
 		 365 aa  82  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0528  periplasmic binding protein  26.5 
 
 		 361 aa  81.6  0.00000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.147263  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1419  periplasmic binding protein  25.57 
 
 		 375 aa  80.9  0.00000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.364808  normal  0.918075 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1047  Fe3+-hydroxamate binding protein  27.59 
 
 		 370 aa  80.1  0.00000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.271921  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1132  periplasmic binding protein  24.5 
 
 		 378 aa  80.1  0.00000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0148173  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0500  ABC Fe3+-siderophore transporter, substrate binding subunit  23.63 
 
 		 362 aa  79.7  0.00000000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1056  periplasmic binding protein  26.69 
 
 		 341 aa  79.3  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1559  iron chelatin ABC transporter, substrate binding protein  24.64 
 
 		 337 aa  78.2  0.0000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.307142  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0495  periplasmic binding protein  25.4 
 
 		 372 aa  78.2  0.0000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0117562  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>