150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0206 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_0206  outer membrane autotransporter barrel domain protein  100 
 
 		 1285 aa  2381    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0891162 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2875  outer membrane autotransporter barrel domain protein  66.06 
 
 		 1848 aa  848    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.189813 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0336  Outer membrane autotransporter barrel  41.07 
 
 		 995 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.988518 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5200  autotransporter, putative  40.46 
 
 		 986 aa  399  1e-109  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1566  Outer membrane autotransporter barrel  41.24 
 
 		 1119 aa  382  1e-104  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0758  outer membrane autotransporter barrel  42.66 
 
 		 2396 aa  375  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291921 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5354  outer membrane autotransporter  41.99 
 
 		 2365 aa  371  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0199943  normal  0.02642 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4933  outer membrane autotransporter  41.99 
 
 		 2346 aa  371  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.348524  unclonable  0.000124828 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4364  outer membrane autotransporter  40.39 
 
 		 2371 aa  369  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00430062 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4881  outer membrane autotransporter  40.24 
 
 		 2366 aa  367  1e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.312195  decreased coverage  0.00000000166918 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0480  outer membrane autotransporter barrel domain protein  39.54 
 
 		 1029 aa  366  1e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.876293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1774  serine protease  39.83 
 
 		 1508 aa  353  2e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.903556  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6533  Outer membrane autotransporter barrel  38.94 
 
 		 3822 aa  330  8e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6767  outer membrane autotransporter  38.94 
 
 		 4238 aa  330  9e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6355  outer membrane autotransporter  38.79 
 
 		 4238 aa  329  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.51084 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4115  outer membrane autotransporter  38.77 
 
 		 3954 aa  326  2e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4722  outer membrane autotransporter  39.88 
 
 		 2003 aa  318  3e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3756  Outer membrane autotransporter barrel  35.28 
 
 		 3506 aa  315  4.999999999999999e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0132  outer membrane autotransporter barrel domain protein  36.31 
 
 		 972 aa  285  5.000000000000001e-75  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7274  hypothetical protein  35.57 
 
 		 990 aa  282  3e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0137  outer membrane autotransporter  33.58 
 
 		 1519 aa  280  1e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2455  outer membrane autotransporter barrel domain protein  37.48 
 
 		 919 aa  277  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.739869  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2325  outer membrane autotransporter  35.24 
 
 		 1782 aa  268  2.9999999999999995e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0522858  hitchhiker  0.00737544 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5186  outer membrane autotransporter  40.94 
 
 		 1056 aa  265  3e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4738  outer membrane autotransporter  35.97 
 
 		 1004 aa  261  5.0000000000000005e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4737  outer membrane autotransporter  36.96 
 
 		 1033 aa  260  1e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1478  Outer membrane autotransporter barrel  34.4 
 
 		 650 aa  258  4e-67  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1650  autotransporter, putative  34.37 
 
 		 1055 aa  253  2e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2684  Outer membrane autotransporter barrel  36.22 
 
 		 1028 aa  253  2e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.335444  unclonable  0.0000368637 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2102  outer membrane autotransporter  35.93 
 
 		 1006 aa  253  2e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3929  outer membrane autotransporter barrel domain protein  35.21 
 
 		 1011 aa  253  2e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0779  hypothetical protein  31.41 
 
 		 1881 aa  252  3e-65  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5637  Outer membrane autotransporter barrel  35.86 
 
 		 985 aa  250  1e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.217038  normal  0.176654 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1933  outer membrane autotransporter  40.15 
 
 		 1053 aa  249  2e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0182819 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3082  outer membrane autotransporter  34.2 
 
 		 1164 aa  244  6e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.184876  normal  0.275156 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1611  putative serine protease  33.07 
 
 		 991 aa  244  7.999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3733  Outer membrane autotransporter barrel  34.9 
 
 		 1038 aa  244  1e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.418268  normal  0.311183 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2865  outer membrane autotransporter  35.6 
 
 		 994 aa  240  2e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3734  Outer membrane autotransporter barrel  34.12 
 
 		 1001 aa  237  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.29394 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1649  autotransporter, putative  33.75 
 
 		 1001 aa  232  4e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1123  outer membrane autotransporter  38.18 
 
 		 1062 aa  232  4e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.948475  normal  0.876639 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18630  putative serine protease  31.97 
 
 		 995 aa  230  1e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.169589 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3607  outer membrane autotransporter  34.58 
 
 		 1333 aa  228  8e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2683  Outer membrane autotransporter barrel  32.75 
 
 		 983 aa  226  2e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.525643  hitchhiker  0.000404465 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3061  outer membrane autotransporter  31.49 
 
 		 677 aa  226  3e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.26513 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2277  outer membrane autotransporter  35.19 
 
 		 980 aa  219  2.9999999999999998e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.356388 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3549  outer membrane autotransporter barrel domain protein  34.46 
 
 		 1125 aa  211  9e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1429  serine protease  33.73 
 
 		 1130 aa  205  6e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3532  outer membrane autotransporter  32.63 
 
 		 1152 aa  202  1.9999999999999998e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2572  serine protease  33.82 
 
 		 1129 aa  201  9e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1327  serine protease  33.82 
 
 		 1131 aa  200  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1263  serine protease  33.67 
 
 		 1129 aa  199  3e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0234  serine protease  33.67 
 
 		 1131 aa  199  3e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.411978  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0506  serine protease  33.67 
 
 		 1131 aa  199  3e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1063  serine protease  33.67 
 
 		 1131 aa  199  3e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1408  serine protease  33.82 
 
 		 1131 aa  192  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0123331  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0892  autotransporter, putative  33.85 
 
 		 1016 aa  181  1e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3587  outer membrane autotransporter  34.38 
 
 		 1011 aa  176  1.9999999999999998e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.334084  normal  0.0742158 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00711  YapH protein  31.78 
 
 		 2711 aa  164  9e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0184521  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4066  outer membrane autotransporter barrel domain protein  28.67 
 
 		 1081 aa  144  9e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.392825  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0854  outer membrane autotransporter barrel domain protein  30.14 
 
 		 3629 aa  142  3e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6171  outer membrane autotransporter  32.67 
 
 		 1458 aa  139  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1881  outer membrane autotransporter barrel domain protein  32.15 
 
 		 1532 aa  131  8.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0449  Outer membrane autotransporter barrel  29.71 
 
 		 816 aa  130  1.0000000000000001e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.761733 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2173  Outer membrane autotransporter barrel  28.8 
 
 		 1180 aa  122  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.193519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5638  Outer membrane autotransporter barrel  32.97 
 
 		 488 aa  118  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.190969  normal  0.144242 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1031  outer membrane autotransporter  28.19 
 
 		 1172 aa  115  6e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0914454  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5268  putative outer membrane autotransporter barrel  37.55 
 
 		 1078 aa  111  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.362559 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7237  putative outer membrane autotransporter barrel precursor  28.51 
 
 		 882 aa  110  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1857  outer membrane autotransporter barrel domain protein  40.36 
 
 		 1322 aa  108  7e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000638249 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3411  Outer membrane autotransporter barrel  34.35 
 
 		 1130 aa  104  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2974  Outer membrane autotransporter barrel  28.48 
 
 		 814 aa  104  1e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7520  outer membrane autotransporter domain-containing protein  42.31 
 
 		 1177 aa  101  9e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1554  autotransporter-associated beta strand repeat protein  39.22 
 
 		 2363 aa  99.8  3e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.623464 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2767  outer membrane autotransporter  34.01 
 
 		 1108 aa  99.8  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1203  outer membrane autotransporter  27.81 
 
 		 1769 aa  98.2  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4135  outer membrane autotransporter  27.47 
 
 		 407 aa  96.3  3e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00592356  normal  0.777233 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0046  putative serine protease  28.34 
 
 		 1066 aa  95.1  7e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000707412  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1306  outer membrane autotransporter barrel domain protein  27.82 
 
 		 1489 aa  93.6  2e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4300  Outer membrane autotransporter barrel  44.12 
 
 		 987 aa  93.6  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.359518 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0614  Outer membrane autotransporter barrel  44.72 
 
 		 1741 aa  92.4  4e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0347869 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2817  outer membrane autotransporter  40.64 
 
 		 950 aa  90.9  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2348  outer membrane autotransporter  43.2 
 
 		 1971 aa  90.1  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.714224  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2512  Outer membrane autotransporter barrel  27.68 
 
 		 1019 aa  84  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.150059 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3534  beta strand repeat-containing protein  37.02 
 
 		 2642 aa  81.3  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2736  beta strand repeat-containing protein  43.14 
 
 		 1882 aa  80.5  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.883139  normal  0.0228341 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1004  beta strand repeat-containing protein  28.74 
 
 		 909 aa  79.3  0.0000000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3087  Outer membrane autotransporter barrel  26.74 
 
 		 2407 aa  77.4  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6125  beta strand repeat-containing protein  30.1 
 
 		 1325 aa  75.1  0.000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4232  beta strand repeat-containing protein  32.72 
 
 		 1446 aa  75.1  0.000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.819177  normal  0.109622 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4858  outer membrane autotransporter  39.13 
 
 		 2906 aa  74.3  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3844  outer membrane autotransporter barrel domain protein  24.9 
 
 		 926 aa  73.9  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3186  putative autotransporter  41.12 
 
 		 145 aa  73.6  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.396056  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3532  outer membrane autotransporter  29.79 
 
 		 1571 aa  72.4  0.00000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1114  serine protease  27.83 
 
 		 965 aa  72  0.00000000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0955353  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4267  outer membrane autotransporter  24.49 
 
 		 939 aa  71.6  0.00000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1258  beta strand repeat-containing protein  47.62 
 
 		 550 aa  69.7  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.305666  normal  0.49742 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4307  outer membrane autotransporter  34.52 
 
 		 1099 aa  69.3  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.157591  hitchhiker  0.00000542564 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0586  outer membrane autotransporter  35.51 
 
 		 2926 aa  68.2  0.0000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0135  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.24 
 
 		 910 aa  67.8  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>