More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0204 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_0204  transcriptional regulator, PadR-like family  100 
 
 		 111 aa  229  1e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.100896 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4304  hypothetical protein  63.64 
 
 		 119 aa  135  2e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4507  PadR-like family transcriptional regulator  72.45 
 
 		 108 aa  129  1.0000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.718023  normal  0.823935 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0853  PadR family transcriptional regulator  64.29 
 
 		 103 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.293414  normal  0.533668 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0346  PadR-like family transcriptional regulator  54 
 
 		 108 aa  124  5e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3730  hypothetical protein  52.53 
 
 		 107 aa  121  3e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3380  PadR-like family transcriptional regulator  53.54 
 
 		 107 aa  121  3e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.114558  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3448  transcriptional regulator  52.53 
 
 		 109 aa  120  4e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3753  hypothetical protein  52.53 
 
 		 107 aa  120  4e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.722643  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3399  transcriptional regulator  52.53 
 
 		 109 aa  120  4e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.314118  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3802  hypothetical protein  52.53 
 
 		 107 aa  120  4e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.991383  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1513  hypothetical protein  52.53 
 
 		 107 aa  120  4e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0927138 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3483  hypothetical protein  52.53 
 
 		 109 aa  120  5e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.134487  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3711  hypothetical protein  52.53 
 
 		 107 aa  120  5e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.0645400000000003e-18 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3757  hypothetical protein  52.53 
 
 		 109 aa  120  5e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2658  PadR family transcriptional regulator  53.06 
 
 		 113 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0279  PadR-like family transcriptional regulator  53.06 
 
 		 113 aa  118  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.360828  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0055  PadR family transcriptional regulator  53.06 
 
 		 113 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3295  PadR family transcriptional regulator  53.06 
 
 		 113 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.937453  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1832  PadR family transcriptional regulator  53.06 
 
 		 113 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2347  PadR-like family transcriptional regulator  51.52 
 
 		 103 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.68087  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0063  PadR family transcriptional regulator  53.06 
 
 		 113 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2720  PadR family transcriptional regulator  53.06 
 
 		 113 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0062  PadR family transcriptional regulator  52.04 
 
 		 113 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2348  PadR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 119 aa  102  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.14892 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0763  PadR-like family transcriptional regulator  46.39 
 
 		 108 aa  98.6  2e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.31288  normal  0.603278 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1934  PadR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 106 aa  98.6  3e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4256  transcriptional regulator, PadR-like family  45.19 
 
 		 124 aa  98.6  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.102079 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2744  transcriptional regulator, PadR-like family  46.46 
 
 		 135 aa  98.2  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.167996  hitchhiker  0.000000256971 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1963  PadR-like family transcriptional regulator  41.41 
 
 		 103 aa  94.7  4e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5790  transcriptional regulator, PadR-like family  43.75 
 
 		 128 aa  94.4  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.120681  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33800  transcriptional regulator, PadR family  44.44 
 
 		 126 aa  92.8  2e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.377597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0475  transcriptional regulator, PadR family  42.72 
 
 		 109 aa  92.4  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3858  PadR-like family transcriptional regulator  47 
 
 		 110 aa  91.3  4e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0195  PadR-like family transcriptional regulator  42.16 
 
 		 110 aa  91.3  4e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.523005  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1025  transcriptional regulator, PadR-like family  42.72 
 
 		 109 aa  90.9  6e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.282121  normal  0.0207022 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4136  transcriptional regulator, PadR family  46 
 
 		 110 aa  90.5  7e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.345707  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1102  transcriptional regulator, PadR family  46 
 
 		 110 aa  90.1  9e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3469  hypothetical protein  50 
 
 		 109 aa  89.7  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0557218  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4083  PadR family transcriptional regulator  46 
 
 		 110 aa  89.7  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3488  transcriptional regulator, PadR family  50 
 
 		 109 aa  89.7  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00705716  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0467  transcriptional regulator PadR family protein  44.68 
 
 		 118 aa  89  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.560636  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1974  transcriptional regulator, PadR-like family  42.27 
 
 		 117 aa  88.6  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.37722 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3065  transcriptional regulator, PadR-like family  41.67 
 
 		 136 aa  87.8  4e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.599102  normal  0.802869 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0909  transcriptional regulator, PadR-like family  44.34 
 
 		 114 aa  88.2  4e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3814  transcriptional regulator, PadR-like family  46 
 
 		 106 aa  88.2  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.375382  normal  0.563614 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2728  PadR-like family transcriptional regulator  45 
 
 		 110 aa  88.2  4e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.323988  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3940  PadR family transcriptional regulator  45 
 
 		 110 aa  87.4  5e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4248  PadR family transcriptional regulator  45 
 
 		 110 aa  87.4  5e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4050  transcriptional regulator, PadR family  45 
 
 		 110 aa  87.4  6e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4156  transcriptional regulator, PadR family  45 
 
 		 110 aa  87.4  6e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.20651  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3584  PadR-like family transcriptional regulator  45.63 
 
 		 112 aa  87  8e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3281  PadR-like family transcriptional regulator  45.63 
 
 		 112 aa  87  8e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.206991 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3772  PadR family transcriptional regulator  45 
 
 		 110 aa  86.7  9e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3787  PadR family transcriptional regulator  45 
 
 		 110 aa  86.7  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0782  transcriptional regulator, PadR-like family  35.85 
 
 		 108 aa  85.5  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3563  PadR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 125 aa  85.9  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4588  transcriptional regulator, PadR-like family  42.86 
 
 		 125 aa  85.5  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00658109  normal  0.0547899 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0895  transcriptional regulator PadR family protein  41.75 
 
 		 110 aa  84.7  4e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.036663  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0175  transcriptional regulator, PadR-like family  43.43 
 
 		 110 aa  84.3  5e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09563  hypothetical protein  47.78 
 
 		 114 aa  84.3  5e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.193917  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29180  predicted transcriptional regulator  43.16 
 
 		 151 aa  84.3  5e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0216  transcriptional regulator, PadR-like family  35.58 
 
 		 109 aa  83.2  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3947  PadR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 105 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09510  transcriptional regulator, PadR family  41.18 
 
 		 107 aa  83.2  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.498358  normal  0.224928 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0435  transcriptional regulator, PadR-like family  39.39 
 
 		 110 aa  82.8  0.000000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000949974  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4316  transcriptional regulator, PadR family  39.22 
 
 		 105 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2361  PadR family transcriptional regulator  46.07 
 
 		 120 aa  82.8  0.000000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4279  transcriptional regulator  40 
 
 		 105 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0918  transcriptional regulator, PadR family  40 
 
 		 105 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3958  PadR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 111 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2592  transcriptional regulator, PadR-like family  43.56 
 
 		 135 aa  82.8  0.000000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.16378  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4335  transcriptional regulator, PadR family  40 
 
 		 105 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1313  transcriptional regulator, PadR-like family  38.68 
 
 		 113 aa  82.4  0.000000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.107904  normal  0.0202461 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4059  PadR-like family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 105 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3449  hypothetical protein  40.95 
 
 		 106 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000660793  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3470  hypothetical protein  40.95 
 
 		 106 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000124701  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0913  transcriptional regulator, PadR-like family  39.22 
 
 		 109 aa  81.6  0.000000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.197337  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3242  hypothetical protein  40.95 
 
 		 106 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.758669  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3215  PadR family transcriptional regulator  40.95 
 
 		 106 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3152  PadR family transcriptional regulator  40.95 
 
 		 106 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1497  PadR family transcriptional regulator  38 
 
 		 107 aa  81.6  0.000000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.452189  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3495  hypothetical protein  40.95 
 
 		 106 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3456  hypothetical protein  40.95 
 
 		 106 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3375  transcriptional regulator, PadR-like family  39.18 
 
 		 114 aa  81.3  0.000000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000695283  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0045  transcriptional regulator, PadR-like family  47.47 
 
 		 110 aa  80.9  0.000000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3150  PadR-like family transcriptional regulator  40.95 
 
 		 106 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00478917  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1805  hypothetical protein  42.16 
 
 		 106 aa  80.5  0.000000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3441  hypothetical protein  42.16 
 
 		 106 aa  80.5  0.000000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0211  transcriptional regulator, PadR-like family  36.79 
 
 		 114 aa  79.7  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.635433  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05700  transcriptional regulator, PadR family  41 
 
 		 114 aa  79.3  0.00000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.182738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1070  transcriptional regulator, PadR-like family  42.05 
 
 		 104 aa  80.1  0.00000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.188637  hitchhiker  0.000000498444 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1194  transcriptional regulator, PadR-like family  40.78 
 
 		 111 aa  78.6  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4516  PadR-like family transcriptional regulator  40.45 
 
 		 114 aa  78.6  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2678  transcriptional regulator, PadR-like family  37.25 
 
 		 111 aa  79  0.00000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1068  transcriptional regulator, PadR family  34.29 
 
 		 110 aa  77.8  0.00000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00406829  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2816  transcriptional regulator, PadR-like family  37 
 
 		 121 aa  77.8  0.00000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.270433  normal  0.376795 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4828  30S ribosomal protein S14 homolog-related  41.86 
 
 		 114 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5114  PadR family transcriptional regulator  34 
 
 		 121 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4845  PadR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 188 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>