More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0175 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_0175  CinA domain protein  100 
 
 		 168 aa  328  2e-89  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0883569 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3667  CinA domain-containing protein  53.85 
 
 		 173 aa  153  1e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4307  CinA domain-containing protein  57.59 
 
 		 162 aa  152  2.9999999999999998e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1870  CinA-like  51.48 
 
 		 203 aa  147  5e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1121  competence/damage-inducible protein CinA  53.59 
 
 		 165 aa  145  3e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.030015  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1514  CinA domain-containing protein  53.05 
 
 		 167 aa  145  3e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.381419 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2934  CinA domain protein  57.93 
 
 		 175 aa  145  3e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.476555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2068  CinA domain-containing protein  50.97 
 
 		 163 aa  145  3e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1079  competence/damage-inducible protein CinA  53.59 
 
 		 165 aa  144  4.0000000000000006e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0607096  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1438  CinA domain-containing protein  55.35 
 
 		 166 aa  141  5e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.010805  hitchhiker  0.0000126181 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1441  CinA protein  55.41 
 
 		 208 aa  140  6e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.297767  normal  0.831105 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0212  competence/damage inducible protein CinA  55.56 
 
 		 168 aa  140  6e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.429483 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3376  competence damage-inducible protein A  53.74 
 
 		 162 aa  139  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3241  competence damage-inducible protein A  53.74 
 
 		 162 aa  139  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.450801  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2586  CinA-like  56.08 
 
 		 208 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.326299  hitchhiker  0.00472571 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0980  competence damage-inducible protein A  49.38 
 
 		 162 aa  139  1.9999999999999998e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0902  competence damage-inducible protein A  54.48 
 
 		 184 aa  139  1.9999999999999998e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1833  CinA-like  54.73 
 
 		 208 aa  139  3e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.911534  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2606  CinA domain protein  51.28 
 
 		 166 aa  137  4.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.590584  normal  0.640743 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3016  CinA domain protein  49.09 
 
 		 166 aa  137  6e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.850522 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2859  CinA domain protein  55.41 
 
 		 206 aa  137  7e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.856791  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2886  CinA-like  54.73 
 
 		 211 aa  137  7.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0554  putative competence-damaged protein, CinA-like  50.96 
 
 		 166 aa  137  7.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.43558 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1484  CinA domain-containing protein  54.9 
 
 		 168 aa  137  7.999999999999999e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.414314  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3402  CinA domain protein  49.04 
 
 		 166 aa  136  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.109005  normal  0.0764099 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4628  CinA domain protein  60.63 
 
 		 426 aa  136  2e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0708  CinA domain-containing protein  55 
 
 		 163 aa  135  2e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0529  CinA domain-containing protein  51.37 
 
 		 184 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4066  hypothetical protein  53.38 
 
 		 203 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.465317 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3947  competence damage-inducible protein A  48.15 
 
 		 165 aa  135  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.388392  normal  0.701681 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2574  CinA-like  54.05 
 
 		 202 aa  134  4e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.112998  normal  0.780367 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3049  CinA-like protein  50.34 
 
 		 165 aa  135  4e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2816  CinA domain-containing protein  55.33 
 
 		 175 aa  134  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.242047 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6535  CinA domain protein  50.96 
 
 		 166 aa  134  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0643691  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4476  CinA-like  50.68 
 
 		 168 aa  134  8e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.184507 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0840  competence damage-inducible protein A  52.05 
 
 		 162 aa  134  9e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0987514  hitchhiker  0.00000024761 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0553  CinA domain-containing protein  50.68 
 
 		 166 aa  133  9e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02550  competence damage-inducible protein A  47.53 
 
 		 165 aa  133  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0187741  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0989  CinA domain protein  47.53 
 
 		 165 aa  133  9.999999999999999e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00650499  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02515  hypothetical protein  47.53 
 
 		 165 aa  133  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0457216  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1911  CinA domain-containing protein  58.04 
 
 		 157 aa  133  9.999999999999999e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.162967  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3043  CinA domain protein  54.67 
 
 		 175 aa  133  9.999999999999999e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.22138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2850  CinA, C-terminal  48.99 
 
 		 165 aa  133  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1012  competence damage-inducible protein A  47.53 
 
 		 165 aa  133  9.999999999999999e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000218203 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2823  competence damage-inducible protein A  47.53 
 
 		 165 aa  133  9.999999999999999e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0804324  hitchhiker  0.00000514203 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0581  CinA domain-containing protein  50.68 
 
 		 175 aa  133  9.999999999999999e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2836  competence damage-inducible protein A  47.53 
 
 		 165 aa  133  9.999999999999999e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.193332  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2984  competence damage-inducible protein A  47.53 
 
 		 165 aa  133  9.999999999999999e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0375437  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2770  hypothetical protein  49.36 
 
 		 166 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.335276  normal  0.296125 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1622  CinA-like  51.39 
 
 		 165 aa  132  1.9999999999999998e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.371737  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10710  CDP-diacylglycerol--glycerol-3-phosphate 3-phosphatidyltransferase  50.64 
 
 		 371 aa  132  1.9999999999999998e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00012453  unclonable  0.00000000162574 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3710  CinA-like  50.68 
 
 		 166 aa  131  3e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.909582  normal  0.123523 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2757  CinA domain-containing protein  50.68 
 
 		 166 aa  132  3e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.439876  normal  0.642955 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1473  CinA domain protein  48.73 
 
 		 166 aa  132  3e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3175  competence damage-inducible protein A  50 
 
 		 166 aa  132  3e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.618843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1482  CinA domain-containing protein  56.55 
 
 		 157 aa  131  3.9999999999999996e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3921  CinA domain-containing protein  51.88 
 
 		 169 aa  131  3.9999999999999996e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2949  competence damage-inducible protein A  50 
 
 		 165 aa  131  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2195  CinA protein  45.78 
 
 		 165 aa  131  5e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000000407296  hitchhiker  0.00000443632 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2981  competence damage-inducible protein A  50 
 
 		 165 aa  131  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.355767  decreased coverage  0.0000723064 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3139  competence damage-inducible protein A  50 
 
 		 165 aa  131  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000242069 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2833  putative competence-damaged inducible protein  55.56 
 
 		 161 aa  130  6e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07490  CDP-diacylglycerol--glycerol-3-phosphate 3-phosphatidyltransferase  52.63 
 
 		 436 aa  130  6.999999999999999e-30  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.042487  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0985  competence/damage-inducible protein CinA  45.89 
 
 		 411 aa  130  7.999999999999999e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000422375  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0243  CinA domain-containing protein  48.17 
 
 		 178 aa  130  7.999999999999999e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.912222  normal  0.255402 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0596  CinA domain-containing protein  50 
 
 		 166 aa  130  9e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.774081  normal  0.307484 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0354  CinA domain-containing protein  55 
 
 		 179 aa  130  1.0000000000000001e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2607  CinA domain-containing protein  50.33 
 
 		 166 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.095939 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0712  CinA domain protein  51.77 
 
 		 162 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0145  CinA-like  50 
 
 		 166 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.774466  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0628  CinA domain-containing protein  50 
 
 		 166 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3032  competence damage-inducible protein A  49.32 
 
 		 165 aa  130  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.162361  hitchhiker  0.00262793 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3016  competence damage-inducible protein A  49.32 
 
 		 165 aa  129  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.047861  decreased coverage  0.0000000741829 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1462  CinA domain-containing protein  54.86 
 
 		 161 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.100792  normal  0.368331 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0571  CinA-like protein  51.37 
 
 		 160 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.230075 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3177  competence damage-inducible protein A  46.3 
 
 		 165 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.266216  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0429  CinA domain-containing protein  57.04 
 
 		 156 aa  129  2.0000000000000002e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.962415  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00153  competence/damage-inducible protein CinA domain protein  52.67 
 
 		 164 aa  129  3e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5926  CinA domain-containing protein  49.04 
 
 		 166 aa  128  3e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3134  CinA domain-containing protein  51.57 
 
 		 164 aa  128  4.0000000000000003e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.582332 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0430  competence/damage-inducible protein CinA  46.88 
 
 		 414 aa  128  5.0000000000000004e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0525  CinA domain protein  52.2 
 
 		 163 aa  127  6e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4031  CinA domain-containing protein  50.68 
 
 		 160 aa  127  6e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.306417  unclonable  0.0000000000000327829 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1767  hypothetical protein  49.36 
 
 		 164 aa  127  7.000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0364  CinA domain protein  40.67 
 
 		 159 aa  127  7.000000000000001e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3280  competence damage-inducible protein A  54.68 
 
 		 422 aa  127  8.000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.659727 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0385  competence/damage inducible protein CinA  51.06 
 
 		 159 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1767  hypothetical protein  50.68 
 
 		 164 aa  127  1.0000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0995  competence damage-inducible protein A  47.97 
 
 		 172 aa  126  1.0000000000000001e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.108193  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2083  CinA domain-containing protein  50 
 
 		 166 aa  126  1.0000000000000001e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2602  CinA domain-containing protein  47.88 
 
 		 163 aa  126  1.0000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.471357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4089  CinA domain-containing protein  49.32 
 
 		 160 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0076  CinA-like  53.02 
 
 		 167 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0221  CinA domain-containing protein  51.92 
 
 		 164 aa  125  2.0000000000000002e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2999  competence damage-inducible protein A  53.24 
 
 		 422 aa  126  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.495389  normal  0.315568 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3119  competence/damage-inducible protein CinA  51.41 
 
 		 415 aa  125  3e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3442  cinA family protein  46.01 
 
 		 166 aa  124  5e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.983742  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0399  cinA family protein  46.01 
 
 		 166 aa  124  5e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.433149  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3477  competence/damage-inducible protein CinA  46.01 
 
 		 166 aa  124  5e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.813884  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3479  cinA family protein  46.01 
 
 		 166 aa  124  5e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.292867  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>